# TARGET T0159 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0159.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 45 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 A 0.001 0.001 0.002 0.002 0.002 0.001 0.992 2 D 0.026 0.026 0.036 0.069 0.008 0.076 0.759 3 L 0.017 0.015 0.059 0.076 0.241 0.082 0.511 4 P 0.012 0.005 0.203 0.086 0.118 0.173 0.403 5 G 0.015 0.005 0.270 0.072 0.124 0.292 0.221 6 K 0.020 0.012 0.256 0.059 0.165 0.312 0.177 7 G 0.042 0.007 0.055 0.019 0.307 0.156 0.414 8 I 0.105 0.007 0.011 0.007 0.370 0.051 0.449 9 T 0.486 0.037 0.005 0.003 0.095 0.018 0.355 10 V 0.803 0.015 0.001 0.002 0.009 0.002 0.168 11 N 0.860 0.004 0.001 0.002 0.012 0.002 0.119 12 P 0.839 0.011 0.003 0.003 0.013 0.005 0.127 13 V 0.713 0.011 0.007 0.005 0.040 0.015 0.209 14 Q 0.481 0.016 0.008 0.006 0.137 0.024 0.327 15 S 0.205 0.021 0.008 0.009 0.218 0.041 0.498 16 T 0.074 0.014 0.006 0.012 0.230 0.054 0.610 17 I 0.009 0.004 0.115 0.575 0.107 0.114 0.077 18 T 0.003 0.003 0.080 0.734 0.042 0.088 0.050 19 E 0.001 0.001 0.034 0.888 0.019 0.042 0.016 20 E 0.001 0.001 0.006 0.954 0.010 0.015 0.013 21 T 0.001 0.001 0.002 0.960 0.008 0.015 0.012 22 F 0.001 0.001 0.002 0.973 0.003 0.013 0.008 23 Q 0.001 0.001 0.001 0.984 0.002 0.009 0.003 24 T 0.001 0.001 0.001 0.991 0.002 0.004 0.002 25 L 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.002 0.002 26 L 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 27 V 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 28 S 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 29 R 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 30 A 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 31 L 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.004 0.001 32 E 0.001 0.001 0.004 0.972 0.001 0.021 0.001 33 K 0.001 0.001 0.007 0.887 0.006 0.094 0.005 34 L 0.001 0.001 0.008 0.280 0.016 0.690 0.005 35 G 0.001 0.001 0.004 0.010 0.050 0.880 0.054 36 Y 0.064 0.009 0.002 0.003 0.081 0.013 0.828 37 T 0.393 0.027 0.003 0.001 0.070 0.008 0.497 38 V 0.530 0.020 0.006 0.003 0.027 0.010 0.404 39 N 0.639 0.008 0.008 0.005 0.063 0.018 0.259 40 K 0.654 0.010 0.010 0.009 0.098 0.017 0.202 41 P 0.532 0.009 0.009 0.009 0.057 0.018 0.365 42 S 0.438 0.023 0.011 0.019 0.080 0.020 0.409 43 E 0.414 0.027 0.021 0.032 0.081 0.039 0.386 44 V 0.236 0.014 0.032 0.052 0.131 0.141 0.393 45 D 0.230 0.013 0.024 0.059 0.202 0.134 0.339 46 Y 0.372 0.017 0.014 0.128 0.161 0.038 0.271 47 N 0.401 0.012 0.009 0.155 0.076 0.030 0.318 48 V 0.443 0.016 0.016 0.312 0.039 0.024 0.150 49 G 0.419 0.014 0.022 0.425 0.029 0.026 0.064 50 Y 0.382 0.006 0.019 0.511 0.017 0.019 0.046 51 T 0.380 0.002 0.019 0.516 0.016 0.019 0.048 52 S 0.311 0.005 0.023 0.535 0.037 0.039 0.050 53 L 0.184 0.005 0.035 0.647 0.029 0.050 0.050 54 A 0.084 0.003 0.029 0.663 0.044 0.125 0.051 55 S 0.034 0.002 0.015 0.316 0.117 0.463 0.052 56 G 0.021 0.002 0.006 0.060 0.256 0.478 0.177 57 D 0.082 0.026 0.009 0.043 0.162 0.088 0.590 58 A 0.437 0.046 0.017 0.082 0.052 0.025 0.341 59 T 0.506 0.008 0.032 0.075 0.066 0.036 0.276 60 F 0.604 0.017 0.064 0.095 0.052 0.031 0.137 61 T 0.587 0.019 0.044 0.111 0.040 0.027 0.173 62 A 0.112 0.005 0.284 0.390 0.034 0.074 0.101 63 V 0.069 0.002 0.359 0.339 0.053 0.110 0.067 64 N 0.044 0.008 0.401 0.295 0.051 0.140 0.062 65 W 0.063 0.032 0.190 0.370 0.096 0.110 0.138 66 T 0.051 0.025 0.103 0.268 0.138 0.101 0.314 67 P 0.034 0.010 0.112 0.300 0.147 0.203 0.194 68 L 0.020 0.009 0.081 0.298 0.151 0.231 0.210 69 H 0.015 0.012 0.053 0.344 0.153 0.125 0.299 70 D 0.005 0.002 0.053 0.670 0.062 0.094 0.114 71 N 0.003 0.001 0.045 0.839 0.024 0.062 0.026 72 M 0.003 0.002 0.041 0.865 0.019 0.041 0.030 73 Y 0.006 0.003 0.026 0.891 0.014 0.023 0.038 74 E 0.012 0.001 0.019 0.896 0.011 0.028 0.033 75 A 0.020 0.002 0.018 0.863 0.013 0.052 0.032 76 A 0.025 0.005 0.018 0.804 0.038 0.065 0.046 77 G 0.031 0.005 0.023 0.674 0.055 0.111 0.102 78 G 0.012 0.004 0.023 0.419 0.064 0.412 0.065 79 D 0.004 0.001 0.009 0.109 0.066 0.781 0.031 80 K 0.019 0.002 0.005 0.040 0.282 0.325 0.328 81 K 0.111 0.020 0.006 0.021 0.109 0.029 0.704 82 F 0.620 0.038 0.009 0.026 0.029 0.013 0.265 83 Y 0.701 0.016 0.020 0.034 0.024 0.010 0.195 84 R 0.659 0.014 0.038 0.040 0.036 0.017 0.197 85 E 0.542 0.009 0.033 0.033 0.075 0.032 0.276 86 G 0.290 0.010 0.073 0.028 0.113 0.053 0.433 87 V 0.306 0.012 0.090 0.053 0.132 0.101 0.307 88 F 0.258 0.032 0.078 0.074 0.143 0.115 0.300 89 V 0.186 0.026 0.052 0.095 0.193 0.065 0.384 90 N 0.094 0.013 0.048 0.125 0.170 0.335 0.214 91 G 0.116 0.010 0.050 0.083 0.163 0.415 0.163 92 A 0.390 0.017 0.031 0.072 0.113 0.077 0.300 93 A 0.593 0.022 0.024 0.067 0.086 0.046 0.161 94 Q 0.717 0.009 0.020 0.062 0.046 0.053 0.093 95 G 0.756 0.006 0.017 0.043 0.024 0.078 0.075 96 Y 0.820 0.007 0.005 0.017 0.031 0.021 0.099 97 L 0.753 0.013 0.008 0.012 0.030 0.012 0.172 98 I 0.560 0.030 0.005 0.011 0.078 0.009 0.307 99 D 0.219 0.008 0.009 0.012 0.058 0.014 0.679 100 K 0.030 0.005 0.375 0.229 0.059 0.215 0.087 101 K 0.024 0.011 0.343 0.304 0.097 0.135 0.086 102 T 0.013 0.007 0.535 0.245 0.052 0.069 0.079 103 A 0.018 0.004 0.248 0.333 0.071 0.247 0.079 104 D 0.014 0.014 0.142 0.209 0.091 0.455 0.076 105 Q 0.016 0.020 0.042 0.032 0.394 0.075 0.420 106 Y 0.015 0.011 0.031 0.012 0.176 0.387 0.369 107 K 0.020 0.013 0.038 0.005 0.179 0.471 0.274 108 I 0.048 0.095 0.013 0.006 0.112 0.065 0.661 109 T 0.037 0.102 0.007 0.006 0.256 0.056 0.536 110 N 0.042 0.063 0.004 0.022 0.492 0.021 0.356 111 I 0.004 0.005 0.252 0.550 0.025 0.076 0.089 112 A 0.007 0.002 0.441 0.300 0.030 0.174 0.045 113 Q 0.004 0.011 0.579 0.257 0.026 0.089 0.034 114 L 0.008 0.032 0.207 0.462 0.091 0.075 0.126 115 K 0.009 0.007 0.060 0.467 0.052 0.186 0.219 116 D 0.014 0.009 0.027 0.323 0.113 0.191 0.323 117 P 0.019 0.007 0.029 0.345 0.136 0.099 0.364 118 K 0.037 0.016 0.060 0.365 0.141 0.073 0.307 119 I 0.102 0.039 0.142 0.360 0.066 0.097 0.193 120 A 0.109 0.013 0.176 0.327 0.059 0.138 0.178 121 K 0.112 0.015 0.147 0.333 0.086 0.191 0.115 122 L 0.115 0.014 0.052 0.145 0.284 0.106 0.284 123 F 0.076 0.019 0.045 0.076 0.260 0.087 0.438 124 D 0.040 0.018 0.033 0.035 0.143 0.055 0.676 125 T 0.023 0.009 0.164 0.061 0.089 0.450 0.203 126 N 0.019 0.007 0.211 0.040 0.129 0.458 0.136 127 G 0.025 0.023 0.230 0.033 0.251 0.162 0.277 128 D 0.032 0.019 0.122 0.054 0.202 0.308 0.264 129 G 0.054 0.024 0.082 0.054 0.163 0.338 0.285 130 K 0.083 0.016 0.061 0.037 0.180 0.324 0.297 131 A 0.292 0.027 0.030 0.021 0.192 0.114 0.324 132 D 0.606 0.063 0.019 0.015 0.062 0.022 0.213 133 L 0.699 0.061 0.015 0.012 0.021 0.025 0.167 134 T 0.590 0.018 0.014 0.012 0.063 0.105 0.198 135 G 0.307 0.015 0.009 0.007 0.198 0.158 0.306 136 C 0.090 0.029 0.003 0.006 0.144 0.011 0.717 137 N 0.054 0.033 0.005 0.007 0.092 0.025 0.784 138 P 0.030 0.020 0.036 0.040 0.212 0.403 0.259 139 G 0.014 0.017 0.043 0.077 0.185 0.392 0.272 140 W 0.011 0.010 0.055 0.242 0.289 0.196 0.197 141 G 0.013 0.014 0.045 0.377 0.125 0.198 0.227 142 C 0.008 0.010 0.037 0.695 0.053 0.096 0.100 143 E 0.009 0.003 0.016 0.840 0.030 0.041 0.062 144 G 0.007 0.003 0.010 0.909 0.018 0.026 0.027 145 A 0.003 0.003 0.006 0.947 0.007 0.017 0.017 146 I 0.001 0.001 0.002 0.970 0.004 0.012 0.010 147 N 0.001 0.001 0.002 0.981 0.002 0.011 0.004 148 H 0.001 0.001 0.002 0.978 0.003 0.012 0.004 149 Q 0.001 0.001 0.003 0.971 0.006 0.012 0.007 150 L 0.002 0.001 0.006 0.957 0.007 0.017 0.011 151 A 0.002 0.001 0.015 0.914 0.006 0.053 0.010 152 A 0.003 0.001 0.030 0.751 0.015 0.179 0.022 153 Y 0.003 0.003 0.031 0.243 0.046 0.638 0.036 154 E 0.010 0.008 0.027 0.049 0.088 0.655 0.164 155 L 0.030 0.030 0.028 0.017 0.123 0.103 0.668 156 T 0.050 0.019 0.071 0.011 0.224 0.251 0.374 157 N 0.020 0.003 0.035 0.005 0.359 0.476 0.102 158 T 0.102 0.008 0.021 0.003 0.289 0.277 0.301 159 V 0.789 0.023 0.001 0.001 0.018 0.005 0.161 160 T 0.882 0.016 0.001 0.001 0.007 0.002 0.092 161 H 0.818 0.028 0.003 0.002 0.015 0.004 0.131 162 N 0.546 0.011 0.006 0.004 0.067 0.021 0.345 163 Q 0.140 0.021 0.022 0.012 0.283 0.107 0.415 164 G 0.042 0.021 0.010 0.019 0.362 0.059 0.488 165 N 0.013 0.006 0.008 0.057 0.205 0.034 0.677 166 Y 0.001 0.001 0.020 0.895 0.038 0.024 0.021 167 A 0.001 0.001 0.007 0.956 0.011 0.016 0.008 168 A 0.001 0.001 0.004 0.976 0.004 0.009 0.006 169 M 0.001 0.001 0.001 0.986 0.003 0.005 0.004 170 M 0.001 0.001 0.001 0.990 0.003 0.005 0.002 171 A 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.005 0.002 172 D 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.003 0.002 173 T 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.003 0.002 174 I 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.004 0.001 175 S 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.007 0.002 176 R 0.001 0.001 0.001 0.979 0.002 0.013 0.005 177 Y 0.001 0.001 0.003 0.942 0.007 0.033 0.012 178 K 0.001 0.003 0.019 0.719 0.012 0.226 0.021 179 E 0.001 0.001 0.005 0.090 0.033 0.858 0.013 180 G 0.001 0.001 0.002 0.006 0.074 0.851 0.066 181 K 0.010 0.002 0.001 0.001 0.301 0.003 0.683 182 P 0.168 0.004 0.001 0.001 0.134 0.002 0.692 183 V 0.956 0.003 0.001 0.001 0.007 0.001 0.034 184 F 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 185 Y 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 186 Y 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 187 T 0.798 0.001 0.001 0.001 0.021 0.002 0.176 188 W 0.505 0.004 0.003 0.002 0.161 0.009 0.315 189 T 0.178 0.036 0.013 0.009 0.215 0.030 0.520 190 P 0.097 0.049 0.097 0.066 0.199 0.101 0.390 191 Y 0.029 0.012 0.343 0.176 0.137 0.134 0.169 192 W 0.012 0.004 0.433 0.172 0.089 0.214 0.075 193 V 0.010 0.003 0.521 0.205 0.038 0.146 0.076 194 S 0.010 0.007 0.657 0.126 0.031 0.110 0.060 195 N 0.035 0.003 0.473 0.133 0.066 0.191 0.100 196 E 0.051 0.018 0.368 0.138 0.112 0.181 0.132 197 L 0.065 0.089 0.032 0.062 0.333 0.048 0.371 198 K 0.024 0.007 0.012 0.007 0.078 0.045 0.826 199 P 0.012 0.006 0.036 0.015 0.130 0.678 0.123 200 G 0.013 0.004 0.064 0.015 0.154 0.667 0.083 201 K 0.063 0.014 0.031 0.023 0.454 0.079 0.337 202 D 0.233 0.087 0.018 0.020 0.072 0.053 0.518 203 V 0.474 0.041 0.049 0.056 0.049 0.059 0.272 204 V 0.529 0.028 0.075 0.088 0.036 0.078 0.165 205 W 0.447 0.064 0.082 0.095 0.058 0.089 0.165 206 L 0.278 0.021 0.038 0.065 0.110 0.068 0.421 207 Q 0.107 0.028 0.035 0.060 0.279 0.082 0.409 208 V 0.059 0.042 0.014 0.072 0.433 0.039 0.343 209 P 0.021 0.014 0.044 0.106 0.092 0.098 0.625 210 F 0.014 0.019 0.117 0.105 0.134 0.322 0.290 211 S 0.018 0.026 0.201 0.131 0.130 0.235 0.259 212 A 0.016 0.020 0.142 0.133 0.190 0.154 0.344 213 L 0.022 0.020 0.089 0.106 0.222 0.153 0.388 214 P 0.021 0.016 0.086 0.071 0.184 0.195 0.427 215 G 0.026 0.026 0.130 0.083 0.164 0.227 0.344 216 D 0.045 0.020 0.128 0.102 0.166 0.219 0.320 217 K 0.053 0.030 0.107 0.097 0.186 0.162 0.365 218 N 0.063 0.029 0.077 0.078 0.188 0.119 0.445 219 A 0.060 0.032 0.103 0.127 0.186 0.181 0.310 220 D 0.070 0.037 0.100 0.155 0.132 0.167 0.339 221 T 0.070 0.030 0.081 0.117 0.181 0.277 0.244 222 K 0.054 0.038 0.046 0.081 0.161 0.290 0.331 223 L 0.051 0.052 0.023 0.050 0.278 0.095 0.449 224 P 0.044 0.036 0.029 0.050 0.225 0.177 0.439 225 N 0.038 0.036 0.043 0.064 0.231 0.187 0.400 226 G 0.023 0.015 0.116 0.101 0.187 0.225 0.333 227 A 0.030 0.015 0.180 0.113 0.167 0.308 0.187 228 N 0.031 0.019 0.246 0.119 0.140 0.256 0.189 229 Y 0.039 0.020 0.133 0.092 0.261 0.179 0.275 230 G 0.039 0.020 0.066 0.117 0.236 0.220 0.301 231 F 0.062 0.035 0.021 0.130 0.231 0.069 0.452 232 P 0.053 0.015 0.022 0.119 0.081 0.067 0.644 233 V 0.027 0.009 0.097 0.458 0.061 0.195 0.154 234 S 0.041 0.008 0.105 0.528 0.074 0.144 0.101 235 T 0.053 0.008 0.077 0.601 0.060 0.069 0.131 236 M 0.139 0.011 0.013 0.689 0.019 0.018 0.111 237 H 0.190 0.004 0.009 0.705 0.032 0.012 0.048 238 I 0.237 0.003 0.009 0.710 0.010 0.010 0.021 239 V 0.159 0.004 0.021 0.758 0.006 0.027 0.024 240 A 0.072 0.006 0.037 0.749 0.025 0.075 0.036 241 N 0.054 0.003 0.037 0.699 0.044 0.075 0.089 242 K 0.012 0.001 0.057 0.647 0.046 0.187 0.049 243 A 0.008 0.005 0.057 0.529 0.053 0.289 0.059 244 W 0.005 0.007 0.117 0.608 0.047 0.112 0.103 245 A 0.002 0.002 0.179 0.699 0.024 0.072 0.023 246 E 0.001 0.001 0.162 0.610 0.025 0.182 0.020 247 K 0.001 0.002 0.064 0.715 0.049 0.128 0.041 248 N 0.004 0.004 0.012 0.355 0.190 0.091 0.344 249 P 0.001 0.002 0.047 0.673 0.032 0.173 0.072 250 A 0.002 0.003 0.043 0.780 0.022 0.118 0.032 251 A 0.001 0.001 0.017 0.943 0.008 0.016 0.015 252 A 0.002 0.001 0.004 0.979 0.003 0.004 0.008 253 K 0.002 0.001 0.004 0.979 0.003 0.007 0.005 254 L 0.001 0.001 0.005 0.977 0.003 0.010 0.003 255 F 0.001 0.001 0.012 0.961 0.004 0.016 0.005 256 A 0.001 0.001 0.017 0.897 0.005 0.077 0.003 257 I 0.001 0.001 0.025 0.681 0.010 0.275 0.007 258 M 0.009 0.007 0.021 0.285 0.297 0.226 0.155 259 Q 0.017 0.025 0.011 0.028 0.180 0.231 0.507 260 L 0.021 0.077 0.003 0.009 0.193 0.013 0.684 261 P 0.009 0.005 0.001 0.005 0.025 0.003 0.951 262 V 0.001 0.001 0.115 0.815 0.018 0.040 0.012 263 A 0.001 0.001 0.061 0.892 0.013 0.028 0.005 264 D 0.001 0.001 0.049 0.913 0.006 0.020 0.011 265 I 0.001 0.001 0.004 0.974 0.004 0.010 0.008 266 N 0.001 0.001 0.003 0.955 0.006 0.027 0.008 267 A 0.001 0.001 0.002 0.970 0.003 0.019 0.005 268 Q 0.001 0.001 0.002 0.976 0.005 0.008 0.008 269 N 0.003 0.001 0.002 0.980 0.003 0.007 0.004 270 A 0.003 0.001 0.003 0.974 0.003 0.014 0.004 271 I 0.001 0.001 0.004 0.972 0.004 0.013 0.006 272 M 0.002 0.001 0.006 0.959 0.006 0.020 0.006 273 H 0.002 0.001 0.011 0.871 0.010 0.097 0.009 274 A 0.001 0.002 0.015 0.535 0.062 0.340 0.045 275 G 0.002 0.003 0.024 0.134 0.152 0.481 0.205 276 A 0.005 0.009 0.060 0.094 0.199 0.275 0.359 277 A 0.006 0.013 0.133 0.053 0.273 0.229 0.294 278 S 0.006 0.005 0.101 0.033 0.365 0.192 0.297 279 E 0.010 0.008 0.068 0.043 0.214 0.266 0.392 280 G 0.021 0.063 0.027 0.034 0.395 0.077 0.383 281 D 0.022 0.079 0.006 0.035 0.178 0.013 0.667 282 I 0.001 0.001 0.092 0.829 0.011 0.027 0.039 283 Q 0.001 0.001 0.056 0.902 0.008 0.022 0.012 284 G 0.001 0.001 0.032 0.941 0.005 0.014 0.008 285 H 0.001 0.001 0.006 0.970 0.005 0.006 0.012 286 V 0.001 0.001 0.001 0.981 0.004 0.006 0.007 287 D 0.001 0.001 0.001 0.985 0.002 0.009 0.002 288 G 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.005 0.001 289 W 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.007 0.001 290 I 0.001 0.001 0.002 0.988 0.002 0.007 0.001 291 K 0.001 0.001 0.003 0.966 0.001 0.029 0.001 292 A 0.001 0.001 0.003 0.907 0.007 0.078 0.004 293 H 0.001 0.002 0.012 0.604 0.073 0.075 0.232 294 Q 0.001 0.001 0.129 0.779 0.005 0.084 0.003 295 Q 0.001 0.001 0.214 0.683 0.007 0.093 0.002 296 Q 0.001 0.001 0.242 0.638 0.014 0.095 0.009 297 F 0.005 0.006 0.093 0.737 0.019 0.095 0.044 298 D 0.008 0.002 0.250 0.551 0.023 0.136 0.029 299 G 0.012 0.001 0.279 0.464 0.039 0.180 0.025 300 W 0.007 0.005 0.231 0.505 0.029 0.180 0.044 301 V 0.025 0.032 0.039 0.457 0.168 0.058 0.221 302 N 0.028 0.005 0.030 0.404 0.052 0.059 0.421 303 E 0.011 0.002 0.075 0.760 0.024 0.065 0.063 304 A 0.015 0.003 0.092 0.732 0.029 0.067 0.062 305 L 0.026 0.004 0.096 0.723 0.038 0.058 0.056 306 A 0.050 0.004 0.059 0.613 0.070 0.094 0.110 307 A 0.055 0.006 0.055 0.416 0.069 0.236 0.163 308 Q 0.028 0.012 0.030 0.240 0.006 0.229 0.455 309 K 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.996