# TARGET T0158 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0158.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 234 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.037 0.003 0.002 0.005 0.141 0.812 2 K 0.236 0.027 0.004 0.013 0.091 0.629 3 P 0.330 0.018 0.005 0.015 0.073 0.559 4 E 0.379 0.012 0.008 0.029 0.089 0.483 5 N 0.428 0.017 0.007 0.024 0.078 0.446 6 K 0.397 0.018 0.015 0.040 0.119 0.411 7 L 0.259 0.015 0.020 0.032 0.200 0.473 8 P 0.158 0.011 0.016 0.029 0.241 0.544 9 V 0.090 0.019 0.012 0.021 0.228 0.630 10 L 0.063 0.024 0.011 0.023 0.226 0.653 11 D 0.049 0.014 0.028 0.041 0.306 0.563 12 L 0.036 0.017 0.120 0.125 0.384 0.318 13 I 0.024 0.010 0.068 0.215 0.332 0.350 14 S 0.023 0.006 0.041 0.234 0.275 0.421 15 A 0.017 0.008 0.033 0.471 0.189 0.283 16 E 0.016 0.008 0.038 0.671 0.109 0.157 17 M 0.035 0.005 0.063 0.688 0.113 0.095 18 K 0.049 0.004 0.069 0.693 0.101 0.084 19 T 0.044 0.005 0.070 0.715 0.087 0.080 20 V 0.046 0.005 0.056 0.735 0.086 0.072 21 V 0.040 0.004 0.077 0.666 0.119 0.096 22 N 0.038 0.005 0.056 0.560 0.165 0.176 23 T 0.045 0.009 0.037 0.354 0.203 0.352 24 L 0.044 0.015 0.024 0.158 0.220 0.539 25 Q 0.041 0.013 0.052 0.159 0.268 0.468 26 P 0.032 0.010 0.076 0.161 0.281 0.441 27 D 0.030 0.009 0.083 0.171 0.269 0.439 28 L 0.037 0.014 0.053 0.124 0.274 0.498 29 P 0.037 0.015 0.045 0.117 0.284 0.502 30 P 0.043 0.017 0.050 0.139 0.280 0.471 31 W 0.038 0.019 0.069 0.173 0.297 0.404 32 P 0.037 0.015 0.077 0.165 0.339 0.367 33 A 0.043 0.009 0.061 0.158 0.318 0.411 34 T 0.055 0.019 0.040 0.182 0.274 0.430 35 G 0.050 0.025 0.023 0.184 0.248 0.470 36 T 0.040 0.011 0.020 0.186 0.236 0.506 37 I 0.019 0.004 0.106 0.522 0.202 0.146 38 A 0.015 0.004 0.128 0.517 0.206 0.129 39 E 0.017 0.004 0.126 0.549 0.181 0.124 40 Q 0.020 0.008 0.056 0.612 0.129 0.176 41 R 0.023 0.007 0.048 0.613 0.123 0.185 42 Q 0.027 0.005 0.061 0.673 0.110 0.125 43 Y 0.032 0.004 0.057 0.688 0.104 0.115 44 Y 0.043 0.006 0.071 0.636 0.127 0.117 45 T 0.056 0.005 0.080 0.605 0.137 0.117 46 L 0.069 0.006 0.072 0.576 0.144 0.134 47 E 0.068 0.009 0.045 0.567 0.134 0.177 48 R 0.073 0.011 0.034 0.437 0.159 0.287 49 R 0.059 0.010 0.034 0.373 0.180 0.344 50 F 0.052 0.013 0.036 0.268 0.216 0.415 51 W 0.040 0.011 0.039 0.164 0.280 0.466 52 N 0.035 0.013 0.034 0.095 0.348 0.475 53 A 0.030 0.015 0.049 0.094 0.392 0.420 54 G 0.027 0.016 0.047 0.077 0.374 0.459 55 A 0.034 0.013 0.090 0.079 0.431 0.352 56 P 0.048 0.013 0.085 0.077 0.405 0.373 57 E 0.085 0.019 0.076 0.064 0.377 0.379 58 M 0.164 0.019 0.041 0.052 0.314 0.408 59 A 0.325 0.021 0.027 0.047 0.207 0.373 60 T 0.483 0.020 0.021 0.044 0.149 0.283 61 R 0.568 0.014 0.021 0.036 0.142 0.218 62 A 0.607 0.008 0.015 0.029 0.129 0.212 63 Y 0.683 0.008 0.009 0.018 0.099 0.183 64 M 0.723 0.014 0.005 0.012 0.085 0.161 65 V 0.686 0.015 0.004 0.012 0.094 0.188 66 P 0.547 0.025 0.007 0.013 0.136 0.272 67 T 0.240 0.031 0.014 0.020 0.359 0.335 68 K 0.079 0.014 0.026 0.022 0.627 0.233 69 Y 0.053 0.010 0.077 0.026 0.726 0.108 70 G 0.056 0.008 0.063 0.021 0.719 0.132 71 Q 0.179 0.011 0.017 0.007 0.476 0.309 72 V 0.539 0.027 0.003 0.003 0.121 0.307 73 E 0.771 0.008 0.002 0.002 0.043 0.175 74 T 0.942 0.003 0.001 0.001 0.013 0.039 75 R 0.957 0.002 0.001 0.001 0.010 0.030 76 L 0.944 0.001 0.001 0.001 0.014 0.038 77 F 0.911 0.005 0.001 0.001 0.019 0.064 78 C 0.706 0.016 0.002 0.002 0.081 0.193 79 P 0.327 0.017 0.008 0.003 0.342 0.303 80 Q 0.071 0.014 0.025 0.005 0.594 0.291 81 P 0.027 0.007 0.038 0.004 0.715 0.209 82 D 0.019 0.008 0.017 0.003 0.626 0.327 83 S 0.035 0.015 0.009 0.002 0.234 0.705 84 P 0.156 0.017 0.005 0.002 0.189 0.630 85 A 0.389 0.005 0.004 0.002 0.076 0.524 86 T 0.940 0.004 0.001 0.001 0.007 0.047 87 L 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 88 F 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 89 Y 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 90 L 0.939 0.002 0.001 0.001 0.006 0.052 91 H 0.396 0.006 0.002 0.007 0.063 0.526 92 G 0.042 0.004 0.002 0.008 0.168 0.776 93 G 0.032 0.007 0.026 0.077 0.383 0.475 94 G 0.058 0.011 0.109 0.241 0.413 0.169 95 F 0.059 0.020 0.295 0.355 0.220 0.050 96 I 0.072 0.010 0.220 0.444 0.198 0.056 97 L 0.064 0.019 0.170 0.315 0.302 0.130 98 G 0.024 0.013 0.018 0.071 0.394 0.480 99 N 0.007 0.010 0.033 0.059 0.631 0.259 100 L 0.003 0.007 0.232 0.238 0.470 0.050 101 D 0.003 0.004 0.285 0.244 0.425 0.039 102 T 0.005 0.010 0.277 0.283 0.347 0.079 103 H 0.007 0.005 0.046 0.356 0.200 0.386 104 D 0.004 0.006 0.024 0.505 0.106 0.355 105 R 0.001 0.002 0.017 0.897 0.036 0.047 106 I 0.001 0.001 0.008 0.971 0.010 0.010 107 M 0.001 0.001 0.002 0.994 0.002 0.001 108 R 0.001 0.001 0.001 0.995 0.003 0.001 109 L 0.001 0.001 0.001 0.997 0.002 0.001 110 L 0.001 0.001 0.001 0.998 0.002 0.001 111 A 0.001 0.001 0.002 0.994 0.004 0.001 112 S 0.001 0.001 0.004 0.990 0.005 0.001 113 Y 0.001 0.001 0.006 0.976 0.011 0.007 114 S 0.002 0.002 0.007 0.780 0.052 0.158 115 Q 0.002 0.001 0.001 0.001 0.052 0.944 116 C 0.070 0.001 0.001 0.001 0.063 0.865 117 T 0.851 0.002 0.001 0.001 0.016 0.130 118 V 0.991 0.002 0.001 0.001 0.001 0.006 119 I 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 120 G 0.984 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 121 I 0.887 0.003 0.001 0.001 0.019 0.090 122 D 0.465 0.004 0.007 0.002 0.196 0.326 123 Y 0.154 0.015 0.088 0.009 0.406 0.328 124 T 0.151 0.037 0.075 0.012 0.382 0.342 125 L 0.118 0.024 0.074 0.020 0.420 0.344 126 S 0.036 0.016 0.014 0.006 0.617 0.312 127 P 0.027 0.007 0.017 0.010 0.607 0.332 128 E 0.035 0.008 0.039 0.025 0.619 0.274 129 A 0.052 0.034 0.015 0.018 0.568 0.313 130 R 0.032 0.019 0.012 0.025 0.269 0.644 131 F 0.021 0.010 0.012 0.041 0.210 0.705 132 P 0.017 0.012 0.053 0.305 0.231 0.382 133 Q 0.006 0.006 0.062 0.618 0.136 0.171 134 A 0.004 0.004 0.045 0.808 0.056 0.082 135 I 0.001 0.001 0.017 0.957 0.015 0.010 136 E 0.001 0.001 0.009 0.974 0.010 0.007 137 E 0.001 0.001 0.006 0.976 0.007 0.010 138 I 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 139 V 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 140 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 141 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 142 C 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 143 C 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 144 Y 0.001 0.001 0.001 0.997 0.002 0.001 145 F 0.001 0.001 0.002 0.989 0.006 0.003 146 H 0.001 0.001 0.005 0.960 0.024 0.010 147 Q 0.001 0.001 0.004 0.953 0.025 0.019 148 Q 0.001 0.001 0.007 0.887 0.053 0.051 149 A 0.002 0.002 0.095 0.781 0.092 0.028 150 E 0.004 0.001 0.287 0.559 0.124 0.025 151 D 0.005 0.001 0.306 0.549 0.111 0.028 152 Y 0.011 0.002 0.116 0.401 0.261 0.210 153 Q 0.012 0.002 0.006 0.009 0.169 0.802 154 I 0.057 0.041 0.002 0.002 0.135 0.764 155 N 0.099 0.040 0.007 0.005 0.509 0.340 156 M 0.030 0.005 0.368 0.019 0.550 0.028 157 S 0.046 0.001 0.309 0.011 0.598 0.033 158 R 0.282 0.002 0.300 0.014 0.370 0.032 159 I 0.898 0.003 0.004 0.006 0.025 0.063 160 G 0.968 0.006 0.001 0.003 0.007 0.015 161 F 0.974 0.004 0.001 0.003 0.006 0.012 162 A 0.850 0.003 0.005 0.014 0.043 0.085 163 G 0.154 0.007 0.060 0.075 0.290 0.414 164 D 0.027 0.007 0.180 0.163 0.361 0.263 165 S 0.013 0.026 0.124 0.240 0.322 0.275 166 A 0.001 0.002 0.033 0.892 0.047 0.025 167 G 0.001 0.001 0.008 0.967 0.018 0.007 168 A 0.001 0.001 0.003 0.989 0.006 0.002 169 M 0.001 0.001 0.002 0.994 0.003 0.001 170 L 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 171 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 172 L 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 173 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 174 S 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 175 A 0.001 0.001 0.002 0.994 0.003 0.001 176 L 0.001 0.001 0.002 0.984 0.008 0.005 177 W 0.001 0.001 0.004 0.939 0.026 0.030 178 L 0.001 0.002 0.015 0.877 0.059 0.045 179 R 0.005 0.008 0.050 0.702 0.146 0.089 180 D 0.008 0.004 0.068 0.567 0.223 0.130 181 K 0.007 0.004 0.057 0.551 0.191 0.189 182 Q 0.005 0.005 0.036 0.161 0.354 0.439 183 I 0.010 0.006 0.050 0.095 0.463 0.376 184 D 0.017 0.010 0.057 0.079 0.442 0.395 185 C 0.028 0.021 0.034 0.062 0.447 0.407 186 G 0.027 0.005 0.016 0.046 0.237 0.669 187 K 0.080 0.021 0.023 0.076 0.190 0.611 188 V 0.182 0.016 0.061 0.187 0.210 0.345 189 A 0.313 0.007 0.072 0.191 0.151 0.267 190 G 0.691 0.006 0.031 0.133 0.050 0.088 191 V 0.892 0.006 0.008 0.058 0.013 0.023 192 L 0.923 0.003 0.003 0.040 0.009 0.022 193 L 0.894 0.002 0.004 0.048 0.013 0.039 194 W 0.702 0.009 0.009 0.082 0.045 0.152 195 Y 0.339 0.012 0.026 0.081 0.199 0.342 196 G 0.169 0.007 0.066 0.047 0.371 0.341 197 L 0.118 0.022 0.116 0.076 0.455 0.213 198 Y 0.102 0.035 0.132 0.101 0.428 0.203 199 G 0.080 0.013 0.060 0.072 0.500 0.275 200 L 0.039 0.009 0.176 0.141 0.455 0.180 201 R 0.041 0.015 0.146 0.150 0.453 0.195 202 D 0.048 0.018 0.117 0.147 0.452 0.219 203 S 0.041 0.013 0.027 0.140 0.325 0.454 204 V 0.036 0.015 0.018 0.153 0.229 0.551 205 T 0.026 0.011 0.051 0.402 0.251 0.259 206 R 0.029 0.010 0.061 0.438 0.227 0.235 207 R 0.034 0.007 0.149 0.506 0.210 0.094 208 L 0.038 0.009 0.110 0.545 0.182 0.115 209 L 0.027 0.007 0.094 0.534 0.186 0.152 210 G 0.026 0.010 0.065 0.446 0.290 0.162 211 G 0.020 0.005 0.054 0.358 0.359 0.203 212 V 0.011 0.005 0.064 0.219 0.434 0.266 213 W 0.019 0.011 0.064 0.076 0.524 0.306 214 D 0.026 0.008 0.090 0.077 0.466 0.333 215 G 0.050 0.021 0.082 0.080 0.408 0.360 216 L 0.029 0.026 0.037 0.068 0.358 0.482 217 T 0.016 0.010 0.006 0.066 0.114 0.788 218 Q 0.002 0.001 0.023 0.858 0.050 0.067 219 Q 0.001 0.001 0.021 0.924 0.033 0.020 220 D 0.001 0.001 0.024 0.949 0.017 0.008 221 L 0.001 0.001 0.007 0.981 0.006 0.005 222 Q 0.001 0.001 0.002 0.990 0.004 0.003 223 M 0.001 0.001 0.003 0.990 0.004 0.003 224 Y 0.001 0.001 0.003 0.989 0.005 0.002 225 E 0.001 0.001 0.008 0.981 0.007 0.003 226 E 0.001 0.001 0.012 0.970 0.011 0.006 227 A 0.001 0.001 0.014 0.941 0.020 0.023 228 Y 0.012 0.011 0.011 0.737 0.067 0.162 229 L 0.017 0.022 0.023 0.301 0.222 0.415 230 S 0.011 0.010 0.038 0.129 0.489 0.322 231 N 0.008 0.006 0.048 0.059 0.635 0.244 232 D 0.009 0.010 0.051 0.043 0.619 0.268 233 A 0.014 0.039 0.047 0.048 0.558 0.294 234 D 0.014 0.020 0.040 0.039 0.570 0.317 235 R 0.011 0.013 0.184 0.080 0.591 0.122 236 E 0.010 0.010 0.157 0.081 0.589 0.153 237 S 0.024 0.018 0.150 0.058 0.615 0.135 238 P 0.052 0.017 0.103 0.081 0.444 0.303 239 Y 0.092 0.043 0.068 0.084 0.371 0.343 240 Y 0.140 0.054 0.053 0.083 0.305 0.364 241 C 0.082 0.012 0.028 0.054 0.277 0.546 242 L 0.057 0.015 0.124 0.099 0.334 0.371 243 F 0.069 0.031 0.145 0.136 0.335 0.284 244 N 0.042 0.015 0.133 0.103 0.344 0.362 245 N 0.010 0.007 0.289 0.107 0.379 0.208 246 D 0.004 0.005 0.437 0.136 0.305 0.113 247 L 0.004 0.006 0.342 0.119 0.419 0.110 248 T 0.003 0.004 0.368 0.059 0.522 0.044 249 R 0.005 0.002 0.177 0.035 0.675 0.106 250 E 0.009 0.005 0.109 0.029 0.623 0.226 251 V 0.035 0.084 0.014 0.019 0.436 0.411 252 P 0.032 0.004 0.003 0.004 0.126 0.831 253 P 0.464 0.008 0.015 0.010 0.101 0.402 254 C 0.925 0.004 0.005 0.003 0.017 0.046 255 F 0.982 0.001 0.001 0.002 0.003 0.011 256 I 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 257 A 0.973 0.001 0.001 0.002 0.004 0.019 258 G 0.886 0.004 0.004 0.008 0.024 0.075 259 A 0.405 0.003 0.015 0.014 0.205 0.359 260 E 0.153 0.010 0.020 0.013 0.417 0.387 261 F 0.052 0.011 0.021 0.018 0.377 0.522 262 D 0.053 0.015 0.028 0.037 0.443 0.424 263 P 0.030 0.010 0.091 0.094 0.456 0.320 264 L 0.029 0.011 0.085 0.141 0.370 0.363 265 L 0.018 0.004 0.157 0.386 0.300 0.135 266 D 0.013 0.004 0.102 0.523 0.204 0.154 267 D 0.008 0.005 0.077 0.688 0.115 0.106 268 S 0.004 0.002 0.013 0.900 0.026 0.055 269 R 0.001 0.001 0.002 0.985 0.005 0.007 270 L 0.001 0.001 0.001 0.993 0.003 0.003 271 L 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.002 272 Y 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.001 273 Q 0.001 0.001 0.001 0.996 0.003 0.001 274 T 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.001 275 L 0.001 0.001 0.001 0.994 0.003 0.001 276 A 0.001 0.001 0.004 0.989 0.004 0.003 277 A 0.001 0.001 0.005 0.962 0.017 0.016 278 H 0.002 0.001 0.005 0.811 0.042 0.139 279 Q 0.002 0.001 0.001 0.003 0.037 0.958 280 Q 0.032 0.004 0.001 0.001 0.066 0.898 281 P 0.287 0.006 0.001 0.001 0.056 0.650 282 C 0.912 0.004 0.001 0.001 0.013 0.070 283 E 0.962 0.001 0.001 0.001 0.005 0.031 284 F 0.974 0.001 0.001 0.001 0.004 0.020 285 K 0.954 0.001 0.001 0.001 0.012 0.031 286 L 0.800 0.008 0.002 0.001 0.049 0.140 287 Y 0.356 0.021 0.007 0.003 0.488 0.125 288 P 0.045 0.003 0.011 0.003 0.859 0.080 289 G 0.030 0.003 0.016 0.004 0.870 0.077 290 T 0.202 0.050 0.018 0.010 0.656 0.065 291 L 0.366 0.031 0.013 0.025 0.261 0.304 292 H 0.431 0.038 0.018 0.053 0.201 0.259 293 A 0.439 0.018 0.044 0.090 0.214 0.195 294 F 0.360 0.020 0.085 0.164 0.159 0.212 295 L 0.385 0.017 0.142 0.175 0.158 0.124 296 H 0.277 0.018 0.128 0.185 0.220 0.172 297 Y 0.111 0.012 0.080 0.185 0.325 0.286 298 S 0.036 0.006 0.118 0.139 0.503 0.198 299 R 0.014 0.007 0.137 0.152 0.489 0.202 300 M 0.013 0.015 0.112 0.202 0.436 0.223 301 M 0.009 0.006 0.034 0.259 0.348 0.345 302 K 0.002 0.001 0.038 0.768 0.106 0.086 303 T 0.002 0.002 0.045 0.885 0.048 0.019 304 A 0.001 0.001 0.022 0.939 0.025 0.013 305 D 0.001 0.001 0.006 0.974 0.010 0.009 306 E 0.001 0.001 0.003 0.982 0.007 0.007 307 A 0.001 0.001 0.003 0.987 0.004 0.006 308 L 0.001 0.001 0.001 0.991 0.003 0.005 309 R 0.001 0.001 0.001 0.993 0.002 0.003 310 D 0.001 0.001 0.001 0.994 0.002 0.003 311 G 0.001 0.001 0.001 0.994 0.002 0.003 312 A 0.001 0.001 0.002 0.990 0.004 0.004 313 Q 0.001 0.001 0.002 0.985 0.007 0.005 314 F 0.001 0.001 0.004 0.979 0.010 0.006 315 F 0.001 0.001 0.005 0.971 0.014 0.009 316 T 0.001 0.001 0.029 0.908 0.037 0.024 317 A 0.001 0.001 0.024 0.760 0.086 0.129 318 Q 0.001 0.001 0.012 0.414 0.095 0.478 319 L 0.001 0.001 0.001 0.011 0.019 0.969