# TARGET T0157 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0157.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 56 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.020 0.003 0.002 0.003 0.121 0.850 2 S 0.104 0.016 0.007 0.005 0.210 0.659 3 G 0.335 0.006 0.012 0.004 0.235 0.407 4 T 0.819 0.003 0.005 0.002 0.057 0.114 5 L 0.944 0.006 0.001 0.001 0.012 0.036 6 L 0.963 0.002 0.001 0.001 0.007 0.027 7 A 0.932 0.003 0.001 0.001 0.012 0.051 8 F 0.833 0.012 0.001 0.001 0.038 0.115 9 D 0.545 0.021 0.002 0.002 0.325 0.105 10 F 0.237 0.009 0.005 0.003 0.619 0.126 11 G 0.118 0.008 0.005 0.003 0.751 0.115 12 T 0.288 0.029 0.004 0.003 0.543 0.134 13 K 0.479 0.008 0.003 0.005 0.147 0.358 14 S 0.771 0.020 0.004 0.006 0.080 0.120 15 I 0.884 0.007 0.003 0.008 0.045 0.053 16 G 0.916 0.003 0.004 0.010 0.032 0.035 17 V 0.951 0.003 0.002 0.007 0.016 0.022 18 A 0.929 0.005 0.003 0.009 0.023 0.031 19 V 0.858 0.008 0.004 0.013 0.040 0.077 20 G 0.487 0.011 0.013 0.022 0.196 0.270 21 Q 0.100 0.016 0.016 0.020 0.491 0.357 22 R 0.030 0.004 0.117 0.109 0.650 0.091 23 I 0.015 0.003 0.156 0.111 0.662 0.053 24 T 0.032 0.012 0.187 0.119 0.581 0.069 25 G 0.108 0.016 0.107 0.139 0.399 0.230 26 T 0.338 0.019 0.047 0.118 0.210 0.268 27 A 0.608 0.035 0.024 0.092 0.103 0.138 28 R 0.617 0.025 0.008 0.055 0.098 0.197 29 P 0.388 0.008 0.018 0.127 0.119 0.340 30 L 0.275 0.012 0.106 0.260 0.144 0.204 31 P 0.283 0.004 0.114 0.198 0.148 0.252 32 A 0.438 0.009 0.117 0.214 0.105 0.117 33 I 0.593 0.021 0.042 0.153 0.072 0.119 34 K 0.639 0.011 0.027 0.157 0.072 0.095 35 A 0.476 0.007 0.038 0.222 0.114 0.143 36 Q 0.176 0.009 0.038 0.185 0.275 0.317 37 D 0.046 0.005 0.020 0.064 0.421 0.443 38 G 0.038 0.004 0.011 0.065 0.325 0.556 39 T 0.050 0.020 0.023 0.205 0.278 0.423 40 P 0.027 0.009 0.046 0.556 0.169 0.192 41 D 0.017 0.005 0.050 0.716 0.077 0.135 42 W 0.002 0.001 0.022 0.956 0.010 0.008 43 N 0.001 0.001 0.010 0.975 0.008 0.006 44 I 0.001 0.001 0.007 0.986 0.003 0.003 45 I 0.001 0.001 0.002 0.994 0.001 0.001 46 E 0.001 0.001 0.002 0.994 0.002 0.001 47 R 0.001 0.001 0.001 0.992 0.004 0.002 48 L 0.001 0.001 0.002 0.988 0.006 0.003 49 L 0.001 0.001 0.007 0.973 0.014 0.005 50 K 0.001 0.001 0.019 0.946 0.026 0.008 51 E 0.002 0.001 0.026 0.842 0.083 0.047 52 W 0.006 0.003 0.031 0.414 0.204 0.343 53 Q 0.006 0.001 0.003 0.005 0.143 0.842 54 P 0.072 0.002 0.003 0.002 0.187 0.735 55 D 0.564 0.004 0.002 0.001 0.093 0.336 56 E 0.981 0.001 0.001 0.001 0.004 0.014 57 I 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 58 I 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 59 V 0.958 0.001 0.001 0.001 0.009 0.033 60 G 0.787 0.005 0.001 0.001 0.038 0.169 61 L 0.477 0.012 0.001 0.001 0.140 0.369 62 P 0.371 0.017 0.003 0.002 0.215 0.392 63 L 0.407 0.161 0.003 0.003 0.180 0.246 64 N 0.071 0.052 0.005 0.003 0.836 0.032 65 M 0.014 0.002 0.009 0.007 0.942 0.025 66 D 0.006 0.002 0.004 0.004 0.959 0.024 67 G 0.011 0.015 0.003 0.007 0.898 0.066 68 T 0.047 0.047 0.001 0.015 0.151 0.739 69 E 0.161 0.195 0.007 0.085 0.160 0.392 70 Q 0.070 0.013 0.009 0.157 0.189 0.563 71 P 0.039 0.021 0.017 0.462 0.145 0.317 72 L 0.008 0.006 0.011 0.862 0.034 0.080 73 T 0.003 0.001 0.003 0.967 0.008 0.018 74 A 0.001 0.001 0.002 0.991 0.003 0.003 75 R 0.001 0.001 0.002 0.993 0.002 0.002 76 A 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 77 R 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 78 K 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 79 F 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 80 A 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 81 N 0.001 0.001 0.001 0.992 0.004 0.003 82 R 0.001 0.001 0.001 0.994 0.003 0.002 83 I 0.001 0.001 0.002 0.991 0.005 0.002 84 H 0.001 0.001 0.009 0.971 0.017 0.002 85 G 0.001 0.001 0.016 0.928 0.043 0.012 86 R 0.001 0.001 0.015 0.882 0.064 0.038 87 F 0.006 0.011 0.013 0.545 0.121 0.305 88 G 0.004 0.001 0.001 0.002 0.058 0.936 89 V 0.069 0.002 0.001 0.001 0.067 0.861 90 E 0.525 0.002 0.001 0.001 0.028 0.443 91 V 0.962 0.002 0.001 0.001 0.003 0.032 92 K 0.974 0.001 0.001 0.001 0.003 0.021 93 L 0.949 0.002 0.002 0.002 0.009 0.035 94 H 0.802 0.002 0.007 0.007 0.053 0.128 95 D 0.352 0.014 0.013 0.010 0.253 0.359 96 E 0.082 0.015 0.027 0.042 0.549 0.286 97 R 0.018 0.007 0.066 0.097 0.616 0.195 98 L 0.027 0.020 0.083 0.289 0.437 0.144 99 S 0.026 0.016 0.042 0.385 0.275 0.256 100 T 0.006 0.002 0.006 0.882 0.024 0.079 101 V 0.001 0.001 0.002 0.990 0.004 0.003 102 E 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 103 A 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 104 R 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 105 S 0.001 0.001 0.001 0.997 0.002 0.001 106 G 0.001 0.001 0.001 0.996 0.003 0.001 107 L 0.001 0.001 0.002 0.990 0.005 0.002 108 F 0.001 0.001 0.006 0.984 0.007 0.003 109 E 0.001 0.001 0.007 0.956 0.018 0.018 110 Q 0.001 0.001 0.007 0.842 0.032 0.117 111 G 0.002 0.001 0.001 0.015 0.047 0.933 112 G 0.008 0.010 0.003 0.015 0.148 0.816 113 Y 0.013 0.008 0.012 0.031 0.216 0.720 114 R 0.015 0.007 0.394 0.221 0.257 0.106 115 A 0.024 0.003 0.480 0.229 0.185 0.079 116 L 0.015 0.002 0.452 0.304 0.160 0.067 117 N 0.023 0.012 0.126 0.535 0.163 0.140 118 K 0.019 0.010 0.065 0.504 0.204 0.197 119 G 0.013 0.005 0.022 0.448 0.166 0.345 120 K 0.010 0.006 0.030 0.564 0.119 0.272 121 V 0.009 0.008 0.019 0.680 0.081 0.203 122 D 0.006 0.003 0.007 0.838 0.025 0.121 123 S 0.001 0.001 0.001 0.994 0.002 0.003 124 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 125 S 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 126 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 127 V 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 128 I 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 129 I 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.002 130 L 0.001 0.001 0.001 0.994 0.002 0.003 131 E 0.001 0.001 0.001 0.988 0.005 0.005 132 S 0.001 0.001 0.003 0.945 0.022 0.029 133 Y 0.001 0.001 0.011 0.964 0.016 0.009 134 F 0.001 0.001 0.024 0.916 0.042 0.017 135 E 0.001 0.001 0.043 0.853 0.075 0.029 136 Q 0.001 0.001 0.015 0.532 0.143 0.309 137 G 0.001 0.001 0.003 0.042 0.109 0.845 138 Y 0.001 0.001 0.001 0.002 0.020 0.977