# TARGET T0157 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0157.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 56 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.027 0.008 0.005 0.004 0.095 0.026 0.836 2 S 0.102 0.013 0.011 0.003 0.055 0.137 0.679 3 G 0.280 0.017 0.030 0.003 0.210 0.129 0.331 4 T 0.779 0.005 0.005 0.001 0.073 0.008 0.130 5 L 0.949 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.046 6 L 0.992 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.006 7 A 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 8 F 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 9 D 0.837 0.003 0.001 0.001 0.010 0.002 0.148 10 F 0.257 0.002 0.018 0.002 0.157 0.152 0.411 11 G 0.067 0.006 0.034 0.003 0.316 0.477 0.098 12 T 0.127 0.006 0.035 0.002 0.355 0.241 0.234 13 K 0.295 0.016 0.010 0.003 0.269 0.033 0.375 14 S 0.746 0.049 0.004 0.003 0.033 0.009 0.156 15 I 0.849 0.008 0.004 0.003 0.014 0.007 0.116 16 G 0.908 0.002 0.004 0.004 0.029 0.009 0.044 17 V 0.943 0.005 0.003 0.004 0.008 0.004 0.034 18 A 0.940 0.005 0.002 0.004 0.005 0.004 0.041 19 V 0.866 0.005 0.002 0.004 0.017 0.010 0.096 20 G 0.624 0.017 0.007 0.009 0.120 0.031 0.193 21 Q 0.245 0.016 0.015 0.014 0.221 0.055 0.435 22 R 0.070 0.010 0.123 0.082 0.193 0.316 0.206 23 I 0.028 0.007 0.148 0.144 0.133 0.427 0.113 24 T 0.047 0.007 0.148 0.180 0.147 0.332 0.140 25 G 0.120 0.010 0.101 0.242 0.143 0.131 0.253 26 T 0.230 0.035 0.079 0.248 0.120 0.079 0.210 27 A 0.303 0.023 0.062 0.208 0.099 0.064 0.241 28 R 0.255 0.017 0.041 0.133 0.126 0.082 0.347 29 P 0.229 0.014 0.061 0.151 0.078 0.119 0.348 30 L 0.214 0.015 0.178 0.193 0.068 0.092 0.242 31 P 0.307 0.006 0.183 0.166 0.078 0.057 0.202 32 A 0.403 0.011 0.206 0.127 0.045 0.048 0.160 33 I 0.543 0.050 0.062 0.115 0.052 0.027 0.152 34 K 0.481 0.023 0.048 0.112 0.049 0.042 0.244 35 A 0.221 0.016 0.069 0.179 0.100 0.147 0.268 36 Q 0.060 0.010 0.063 0.137 0.177 0.356 0.197 37 D 0.020 0.006 0.032 0.055 0.294 0.306 0.288 38 G 0.027 0.008 0.018 0.081 0.267 0.119 0.480 39 T 0.026 0.013 0.019 0.168 0.168 0.063 0.544 40 P 0.024 0.016 0.055 0.480 0.082 0.105 0.238 41 D 0.016 0.009 0.035 0.594 0.057 0.079 0.209 42 W 0.002 0.001 0.015 0.939 0.014 0.012 0.016 43 N 0.002 0.001 0.007 0.970 0.005 0.007 0.008 44 I 0.001 0.001 0.004 0.980 0.003 0.008 0.005 45 I 0.001 0.001 0.002 0.987 0.002 0.006 0.002 46 E 0.001 0.001 0.001 0.986 0.002 0.008 0.002 47 R 0.001 0.001 0.002 0.976 0.002 0.015 0.003 48 L 0.001 0.001 0.003 0.969 0.003 0.018 0.006 49 L 0.002 0.001 0.005 0.959 0.006 0.016 0.011 50 K 0.002 0.001 0.013 0.929 0.006 0.044 0.007 51 E 0.003 0.001 0.013 0.791 0.014 0.161 0.016 52 W 0.018 0.008 0.015 0.540 0.103 0.201 0.116 53 Q 0.046 0.015 0.005 0.030 0.182 0.092 0.630 54 P 0.042 0.001 0.001 0.002 0.094 0.008 0.852 55 D 0.177 0.001 0.001 0.001 0.636 0.005 0.180 56 E 0.973 0.004 0.001 0.001 0.005 0.001 0.017 57 I 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 58 I 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 59 V 0.977 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 60 G 0.580 0.001 0.001 0.001 0.097 0.014 0.307 61 L 0.272 0.009 0.003 0.002 0.287 0.013 0.416 62 P 0.220 0.053 0.010 0.002 0.129 0.017 0.568 63 L 0.280 0.149 0.031 0.006 0.145 0.082 0.307 64 N 0.150 0.043 0.031 0.005 0.136 0.129 0.507 65 M 0.046 0.011 0.032 0.005 0.216 0.481 0.210 66 D 0.010 0.010 0.022 0.007 0.268 0.596 0.088 67 G 0.006 0.004 0.010 0.005 0.607 0.183 0.185 68 T 0.018 0.019 0.007 0.017 0.282 0.073 0.585 69 E 0.058 0.133 0.008 0.121 0.196 0.059 0.425 70 Q 0.023 0.010 0.008 0.268 0.161 0.034 0.496 71 P 0.009 0.006 0.026 0.745 0.038 0.058 0.118 72 L 0.002 0.002 0.012 0.927 0.011 0.020 0.027 73 T 0.001 0.001 0.003 0.967 0.008 0.005 0.015 74 A 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.002 0.003 75 R 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.005 0.002 76 A 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 77 R 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 78 K 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 79 F 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.002 0.001 80 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.002 0.001 81 N 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 82 R 0.001 0.001 0.001 0.985 0.001 0.013 0.001 83 I 0.001 0.001 0.002 0.977 0.001 0.017 0.002 84 H 0.001 0.001 0.021 0.910 0.005 0.059 0.004 85 G 0.001 0.001 0.042 0.775 0.013 0.160 0.007 86 R 0.001 0.002 0.041 0.557 0.050 0.313 0.036 87 F 0.005 0.069 0.013 0.190 0.241 0.285 0.198 88 G 0.003 0.003 0.002 0.003 0.103 0.284 0.603 89 V 0.006 0.002 0.001 0.001 0.375 0.005 0.612 90 E 0.249 0.005 0.001 0.001 0.141 0.002 0.602 91 V 0.861 0.005 0.001 0.001 0.002 0.001 0.131 92 K 0.991 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.005 93 L 0.989 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 94 H 0.950 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.041 95 D 0.590 0.002 0.002 0.003 0.047 0.005 0.352 96 E 0.051 0.002 0.018 0.011 0.200 0.075 0.643 97 R 0.028 0.006 0.018 0.030 0.509 0.140 0.270 98 L 0.029 0.010 0.044 0.161 0.303 0.166 0.286 99 S 0.015 0.019 0.023 0.323 0.175 0.073 0.372 100 T 0.027 0.004 0.006 0.758 0.076 0.023 0.106 101 V 0.006 0.001 0.002 0.961 0.010 0.007 0.014 102 E 0.002 0.001 0.001 0.986 0.002 0.004 0.004 103 A 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.005 0.002 104 R 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.004 0.001 105 S 0.002 0.001 0.001 0.989 0.001 0.006 0.002 106 G 0.001 0.001 0.001 0.983 0.002 0.011 0.002 107 L 0.003 0.001 0.002 0.974 0.005 0.011 0.005 108 F 0.003 0.001 0.009 0.955 0.004 0.020 0.009 109 E 0.002 0.001 0.015 0.846 0.013 0.112 0.012 110 Q 0.001 0.001 0.005 0.130 0.013 0.849 0.002 111 G 0.001 0.001 0.002 0.006 0.014 0.972 0.006 112 G 0.015 0.019 0.005 0.016 0.069 0.032 0.844 113 Y 0.057 0.060 0.013 0.025 0.055 0.035 0.755 114 R 0.030 0.004 0.176 0.297 0.145 0.144 0.204 115 A 0.024 0.006 0.237 0.344 0.119 0.113 0.157 116 L 0.021 0.004 0.167 0.398 0.133 0.107 0.170 117 N 0.022 0.007 0.083 0.476 0.064 0.156 0.192 118 K 0.006 0.003 0.062 0.493 0.049 0.269 0.119 119 G 0.011 0.002 0.033 0.505 0.064 0.309 0.076 120 K 0.023 0.006 0.023 0.525 0.114 0.081 0.228 121 V 0.042 0.011 0.015 0.681 0.064 0.026 0.160 122 D 0.043 0.005 0.010 0.744 0.031 0.028 0.139 123 S 0.006 0.001 0.003 0.959 0.012 0.008 0.011 124 A 0.003 0.001 0.001 0.984 0.003 0.005 0.004 125 S 0.001 0.001 0.001 0.987 0.002 0.006 0.002 126 A 0.001 0.001 0.001 0.988 0.001 0.006 0.002 127 V 0.001 0.001 0.001 0.992 0.002 0.003 0.001 128 I 0.001 0.001 0.001 0.991 0.003 0.003 0.001 129 I 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.003 0.002 130 L 0.001 0.001 0.002 0.981 0.001 0.011 0.003 131 E 0.001 0.001 0.006 0.940 0.003 0.046 0.004 132 S 0.001 0.001 0.005 0.916 0.015 0.050 0.014 133 Y 0.001 0.001 0.010 0.882 0.020 0.047 0.039 134 F 0.002 0.005 0.024 0.743 0.042 0.111 0.073 135 E 0.004 0.004 0.054 0.491 0.068 0.278 0.101 136 Q 0.004 0.002 0.027 0.243 0.127 0.473 0.124 137 G 0.006 0.011 0.013 0.073 0.006 0.326 0.565 138 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999