# TARGET T0156 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0156.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 47 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.027 0.008 0.058 0.124 0.316 0.467 2 A 0.029 0.013 0.085 0.185 0.281 0.406 3 I 0.029 0.016 0.149 0.150 0.342 0.314 4 S 0.028 0.009 0.138 0.151 0.361 0.314 5 F 0.023 0.013 0.089 0.126 0.331 0.418 6 R 0.035 0.015 0.025 0.133 0.282 0.511 7 P 0.023 0.019 0.005 0.061 0.106 0.785 8 T 0.016 0.005 0.005 0.730 0.050 0.193 9 A 0.010 0.001 0.004 0.908 0.026 0.052 10 D 0.008 0.002 0.006 0.944 0.017 0.024 11 L 0.004 0.001 0.007 0.964 0.013 0.011 12 V 0.003 0.001 0.005 0.942 0.020 0.030 13 D 0.003 0.001 0.005 0.935 0.031 0.026 14 D 0.002 0.001 0.007 0.924 0.039 0.028 15 I 0.004 0.003 0.009 0.849 0.072 0.063 16 G 0.007 0.003 0.022 0.529 0.232 0.208 17 P 0.009 0.002 0.025 0.507 0.278 0.179 18 D 0.022 0.005 0.027 0.442 0.277 0.226 19 V 0.039 0.008 0.037 0.360 0.261 0.295 20 R 0.112 0.014 0.044 0.209 0.223 0.399 21 S 0.186 0.021 0.046 0.236 0.203 0.308 22 C 0.118 0.015 0.053 0.257 0.200 0.356 23 D 0.121 0.006 0.068 0.182 0.233 0.388 24 L 0.146 0.008 0.079 0.192 0.217 0.358 25 Q 0.197 0.022 0.052 0.146 0.213 0.369 26 F 0.215 0.025 0.039 0.100 0.215 0.406 27 R 0.167 0.016 0.043 0.075 0.259 0.439 28 Q 0.104 0.024 0.051 0.068 0.319 0.434 29 F 0.069 0.015 0.058 0.065 0.465 0.328 30 G 0.059 0.009 0.056 0.047 0.596 0.233 31 G 0.066 0.013 0.060 0.041 0.614 0.206 32 R 0.112 0.009 0.057 0.039 0.545 0.238 33 S 0.356 0.013 0.045 0.034 0.308 0.243 34 Q 0.731 0.013 0.016 0.016 0.090 0.134 35 F 0.837 0.017 0.005 0.008 0.046 0.086 36 A 0.814 0.009 0.003 0.004 0.042 0.129 37 G 0.828 0.004 0.003 0.003 0.042 0.119 38 P 0.879 0.002 0.003 0.002 0.034 0.081 39 I 0.954 0.002 0.001 0.001 0.013 0.030 40 S 0.981 0.001 0.001 0.001 0.006 0.012 41 T 0.987 0.001 0.001 0.001 0.003 0.009 42 V 0.977 0.001 0.001 0.001 0.005 0.017 43 R 0.943 0.002 0.001 0.001 0.020 0.033 44 C 0.799 0.008 0.002 0.001 0.067 0.123 45 F 0.279 0.015 0.004 0.002 0.514 0.186 46 Q 0.018 0.002 0.013 0.005 0.891 0.071 47 D 0.005 0.002 0.026 0.023 0.892 0.052 48 N 0.021 0.007 0.038 0.214 0.663 0.056 49 A 0.049 0.004 0.018 0.681 0.156 0.092 50 L 0.126 0.014 0.014 0.768 0.031 0.047 51 L 0.102 0.004 0.016 0.862 0.009 0.006 52 K 0.102 0.001 0.016 0.867 0.007 0.006 53 S 0.143 0.002 0.015 0.828 0.007 0.005 54 V 0.063 0.001 0.009 0.913 0.007 0.007 55 L 0.071 0.001 0.011 0.893 0.013 0.012 56 S 0.069 0.002 0.014 0.883 0.018 0.015 57 Q 0.076 0.004 0.020 0.718 0.085 0.097 58 P 0.082 0.029 0.009 0.165 0.210 0.504 59 S 0.027 0.027 0.006 0.016 0.832 0.092 60 A 0.012 0.003 0.006 0.004 0.920 0.055 61 G 0.017 0.001 0.003 0.001 0.929 0.049 62 G 0.570 0.007 0.001 0.001 0.378 0.043 63 V 0.972 0.005 0.001 0.001 0.005 0.019 64 L 0.992 0.002 0.001 0.001 0.001 0.005 65 V 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 66 I 0.951 0.008 0.001 0.001 0.007 0.034 67 D 0.358 0.016 0.002 0.001 0.485 0.139 68 G 0.018 0.002 0.005 0.002 0.850 0.124 69 A 0.007 0.004 0.004 0.001 0.850 0.135 70 G 0.018 0.058 0.005 0.005 0.757 0.156 71 S 0.036 0.029 0.003 0.019 0.257 0.656 72 L 0.093 0.045 0.087 0.238 0.376 0.161 73 H 0.079 0.008 0.125 0.224 0.395 0.169 74 T 0.148 0.013 0.214 0.301 0.254 0.071 75 A 0.149 0.024 0.149 0.408 0.142 0.128 76 L 0.154 0.042 0.082 0.503 0.082 0.136 77 V 0.029 0.004 0.078 0.772 0.051 0.066 78 G 0.002 0.001 0.027 0.919 0.021 0.031 79 D 0.001 0.001 0.023 0.942 0.018 0.016 80 V 0.001 0.001 0.008 0.984 0.005 0.003 81 I 0.001 0.001 0.003 0.990 0.004 0.002 82 A 0.001 0.001 0.002 0.989 0.007 0.002 83 E 0.001 0.001 0.001 0.989 0.008 0.002 84 L 0.001 0.001 0.001 0.989 0.008 0.001 85 A 0.001 0.001 0.004 0.984 0.010 0.002 86 R 0.001 0.001 0.012 0.964 0.018 0.005 87 S 0.001 0.001 0.016 0.951 0.023 0.009 88 T 0.001 0.001 0.010 0.836 0.047 0.105 89 G 0.002 0.001 0.001 0.003 0.047 0.948 90 W 0.048 0.002 0.001 0.001 0.068 0.881 91 T 0.535 0.003 0.001 0.001 0.047 0.414 92 G 0.976 0.001 0.001 0.001 0.003 0.020 93 L 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 94 I 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 95 V 0.917 0.003 0.001 0.001 0.019 0.059 96 H 0.379 0.005 0.005 0.002 0.229 0.381 97 G 0.113 0.008 0.044 0.011 0.526 0.298 98 A 0.185 0.024 0.109 0.023 0.443 0.215 99 V 0.305 0.027 0.116 0.045 0.345 0.163 100 R 0.282 0.083 0.046 0.083 0.243 0.264 101 D 0.139 0.030 0.023 0.222 0.187 0.399 102 A 0.001 0.001 0.059 0.893 0.041 0.006 103 A 0.001 0.001 0.040 0.930 0.028 0.002 104 A 0.001 0.001 0.036 0.942 0.020 0.001 105 L 0.001 0.001 0.021 0.958 0.016 0.003 106 R 0.001 0.001 0.021 0.960 0.013 0.005 107 G 0.006 0.001 0.049 0.866 0.056 0.022 108 I 0.009 0.001 0.032 0.588 0.151 0.220 109 D 0.003 0.001 0.001 0.004 0.098 0.892 110 I 0.035 0.003 0.001 0.003 0.141 0.817 111 G 0.250 0.011 0.008 0.005 0.191 0.535 112 I 0.790 0.017 0.024 0.009 0.081 0.079 113 K 0.851 0.005 0.037 0.010 0.045 0.051 114 A 0.767 0.008 0.048 0.017 0.071 0.089 115 L 0.484 0.006 0.031 0.023 0.195 0.262 116 G 0.299 0.011 0.014 0.011 0.255 0.409 117 T 0.303 0.061 0.011 0.014 0.223 0.387 118 N 0.247 0.054 0.017 0.014 0.313 0.355 119 P 0.170 0.027 0.034 0.020 0.405 0.343 120 R 0.118 0.021 0.048 0.022 0.501 0.289 121 K 0.124 0.012 0.040 0.017 0.500 0.307 122 S 0.210 0.035 0.031 0.014 0.422 0.288 123 T 0.254 0.030 0.031 0.013 0.347 0.325 124 K 0.297 0.019 0.030 0.013 0.329 0.313 125 T 0.261 0.017 0.025 0.011 0.305 0.380 126 G 0.358 0.015 0.015 0.007 0.265 0.339 127 A 0.418 0.017 0.025 0.009 0.261 0.270 128 G 0.410 0.018 0.019 0.008 0.240 0.306 129 E 0.539 0.020 0.017 0.005 0.213 0.205 130 R 0.546 0.010 0.009 0.004 0.206 0.224 131 D 0.510 0.005 0.006 0.003 0.193 0.283 132 V 0.677 0.015 0.003 0.004 0.103 0.199 133 E 0.855 0.005 0.002 0.003 0.040 0.094 134 I 0.931 0.005 0.002 0.003 0.025 0.033 135 T 0.913 0.006 0.003 0.003 0.042 0.033 136 L 0.674 0.012 0.006 0.006 0.261 0.042 137 G 0.128 0.001 0.015 0.012 0.769 0.075 138 G 0.092 0.003 0.007 0.004 0.760 0.134 139 V 0.533 0.051 0.004 0.003 0.259 0.150 140 T 0.696 0.025 0.001 0.002 0.055 0.221 141 F 0.707 0.075 0.001 0.003 0.053 0.161 142 V 0.345 0.078 0.003 0.003 0.506 0.064 143 P 0.186 0.008 0.008 0.003 0.724 0.071 144 G 0.146 0.002 0.005 0.001 0.786 0.060 145 D 0.714 0.007 0.002 0.001 0.244 0.032 146 I 0.933 0.010 0.001 0.001 0.018 0.038 147 A 0.958 0.007 0.001 0.001 0.010 0.022 148 Y 0.964 0.002 0.001 0.001 0.013 0.018 149 S 0.921 0.005 0.003 0.002 0.033 0.036 150 D 0.718 0.006 0.005 0.004 0.219 0.047 151 D 0.299 0.006 0.015 0.007 0.609 0.065 152 D 0.137 0.004 0.008 0.002 0.776 0.073 153 G 0.458 0.008 0.005 0.001 0.424 0.104 154 I 0.866 0.007 0.001 0.001 0.034 0.092 155 I 0.929 0.010 0.001 0.001 0.011 0.049 156 V 0.832 0.015 0.001 0.001 0.015 0.136 157 V 0.068 0.004 0.001 0.001 0.027 0.901