# TARGET T0156 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0156.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 47 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.008 0.002 0.024 0.031 0.016 0.015 0.903 2 A 0.061 0.032 0.092 0.146 0.021 0.079 0.569 3 I 0.066 0.025 0.161 0.138 0.114 0.123 0.373 4 S 0.087 0.007 0.143 0.158 0.132 0.250 0.224 5 F 0.100 0.017 0.093 0.153 0.164 0.219 0.254 6 R 0.088 0.022 0.011 0.049 0.306 0.041 0.483 7 P 0.077 0.025 0.007 0.022 0.175 0.049 0.646 8 T 0.084 0.034 0.044 0.316 0.161 0.073 0.288 9 A 0.032 0.009 0.076 0.544 0.077 0.065 0.197 10 D 0.030 0.012 0.108 0.648 0.034 0.080 0.088 11 L 0.016 0.007 0.069 0.765 0.029 0.051 0.064 12 V 0.009 0.006 0.053 0.763 0.037 0.048 0.083 13 D 0.007 0.002 0.043 0.783 0.035 0.079 0.050 14 D 0.005 0.003 0.028 0.754 0.037 0.127 0.046 15 I 0.004 0.005 0.026 0.692 0.041 0.159 0.072 16 G 0.004 0.003 0.053 0.598 0.051 0.218 0.074 17 P 0.005 0.002 0.070 0.658 0.056 0.148 0.061 18 D 0.005 0.004 0.082 0.631 0.055 0.166 0.058 19 V 0.028 0.012 0.053 0.456 0.080 0.211 0.160 20 R 0.061 0.012 0.061 0.320 0.104 0.200 0.241 21 S 0.153 0.018 0.066 0.293 0.116 0.150 0.203 22 C 0.251 0.022 0.061 0.210 0.068 0.088 0.300 23 D 0.219 0.015 0.096 0.146 0.108 0.103 0.314 24 L 0.250 0.010 0.095 0.128 0.121 0.116 0.279 25 Q 0.270 0.027 0.095 0.116 0.115 0.095 0.284 26 F 0.336 0.053 0.040 0.082 0.111 0.032 0.346 27 R 0.261 0.022 0.047 0.070 0.084 0.071 0.444 28 Q 0.204 0.034 0.059 0.073 0.122 0.160 0.349 29 F 0.121 0.031 0.068 0.061 0.194 0.169 0.356 30 G 0.055 0.014 0.065 0.033 0.250 0.274 0.308 31 G 0.026 0.005 0.069 0.022 0.222 0.494 0.163 32 R 0.050 0.010 0.074 0.011 0.230 0.389 0.235 33 S 0.189 0.014 0.039 0.006 0.235 0.103 0.414 34 Q 0.434 0.027 0.020 0.003 0.197 0.047 0.271 35 F 0.594 0.066 0.013 0.002 0.058 0.020 0.248 36 A 0.682 0.019 0.006 0.001 0.061 0.024 0.207 37 G 0.631 0.006 0.005 0.001 0.119 0.015 0.225 38 P 0.761 0.009 0.005 0.001 0.052 0.016 0.157 39 I 0.903 0.004 0.003 0.001 0.015 0.011 0.064 40 S 0.962 0.002 0.001 0.001 0.007 0.003 0.025 41 T 0.970 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.023 42 V 0.965 0.003 0.001 0.001 0.003 0.001 0.028 43 R 0.930 0.007 0.001 0.001 0.006 0.001 0.055 44 C 0.725 0.027 0.002 0.001 0.025 0.008 0.212 45 F 0.206 0.017 0.014 0.003 0.232 0.183 0.345 46 Q 0.038 0.007 0.020 0.006 0.413 0.285 0.230 47 D 0.019 0.007 0.023 0.022 0.253 0.421 0.255 48 N 0.026 0.007 0.029 0.104 0.236 0.377 0.220 49 A 0.061 0.017 0.037 0.480 0.116 0.086 0.202 50 L 0.076 0.026 0.030 0.674 0.039 0.054 0.100 51 L 0.061 0.006 0.022 0.840 0.014 0.024 0.034 52 K 0.055 0.002 0.018 0.878 0.009 0.016 0.022 53 S 0.037 0.001 0.020 0.901 0.012 0.017 0.012 54 V 0.021 0.001 0.032 0.908 0.008 0.019 0.011 55 L 0.013 0.001 0.046 0.905 0.006 0.020 0.009 56 S 0.018 0.001 0.050 0.832 0.009 0.079 0.012 57 Q 0.025 0.004 0.045 0.576 0.047 0.255 0.047 58 P 0.032 0.018 0.016 0.088 0.288 0.090 0.469 59 S 0.031 0.018 0.022 0.010 0.129 0.065 0.725 60 A 0.017 0.004 0.040 0.008 0.172 0.685 0.074 61 G 0.044 0.002 0.035 0.002 0.218 0.629 0.071 62 G 0.425 0.008 0.006 0.001 0.069 0.016 0.474 63 V 0.905 0.006 0.001 0.001 0.008 0.002 0.078 64 L 0.971 0.003 0.001 0.001 0.003 0.001 0.022 65 V 0.971 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.024 66 I 0.959 0.005 0.001 0.001 0.004 0.001 0.031 67 D 0.682 0.008 0.001 0.001 0.029 0.011 0.269 68 G 0.101 0.005 0.007 0.002 0.278 0.298 0.311 69 A 0.016 0.004 0.009 0.002 0.528 0.301 0.140 70 G 0.019 0.007 0.008 0.007 0.648 0.083 0.227 71 S 0.051 0.033 0.025 0.103 0.247 0.078 0.463 72 L 0.085 0.030 0.087 0.476 0.083 0.092 0.147 73 H 0.078 0.010 0.100 0.572 0.059 0.075 0.107 74 T 0.043 0.004 0.077 0.744 0.046 0.035 0.052 75 A 0.042 0.003 0.028 0.812 0.027 0.028 0.059 76 L 0.031 0.008 0.015 0.819 0.018 0.053 0.055 77 V 0.011 0.002 0.008 0.872 0.014 0.057 0.034 78 G 0.004 0.001 0.004 0.931 0.019 0.020 0.022 79 D 0.002 0.001 0.001 0.978 0.007 0.004 0.008 80 V 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.003 0.004 81 I 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.003 0.001 82 A 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.004 0.001 83 E 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 84 L 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 85 A 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.004 0.002 86 R 0.001 0.001 0.002 0.984 0.001 0.010 0.002 87 S 0.001 0.001 0.007 0.923 0.004 0.061 0.004 88 T 0.001 0.001 0.005 0.206 0.011 0.774 0.004 89 G 0.001 0.001 0.002 0.012 0.046 0.899 0.040 90 W 0.032 0.005 0.001 0.002 0.091 0.009 0.861 91 T 0.298 0.003 0.001 0.001 0.142 0.004 0.551 92 G 0.934 0.002 0.001 0.001 0.032 0.002 0.029 93 L 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 94 I 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 95 V 0.978 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.017 96 H 0.652 0.004 0.006 0.006 0.069 0.025 0.239 97 G 0.218 0.002 0.043 0.013 0.319 0.092 0.311 98 A 0.266 0.013 0.134 0.054 0.203 0.113 0.217 99 V 0.277 0.057 0.108 0.144 0.123 0.088 0.203 100 R 0.220 0.060 0.027 0.123 0.209 0.052 0.309 101 D 0.063 0.024 0.005 0.182 0.119 0.034 0.572 102 A 0.001 0.001 0.016 0.939 0.009 0.021 0.013 103 A 0.001 0.001 0.017 0.942 0.008 0.025 0.006 104 A 0.001 0.001 0.017 0.952 0.006 0.018 0.006 105 L 0.003 0.002 0.012 0.948 0.008 0.015 0.012 106 R 0.006 0.002 0.012 0.871 0.012 0.082 0.016 107 G 0.006 0.002 0.017 0.579 0.015 0.363 0.018 108 I 0.002 0.002 0.009 0.179 0.090 0.678 0.041 109 D 0.005 0.005 0.006 0.018 0.102 0.676 0.188 110 I 0.051 0.016 0.006 0.026 0.097 0.018 0.786 111 G 0.216 0.020 0.012 0.038 0.061 0.021 0.634 112 I 0.569 0.011 0.053 0.077 0.067 0.047 0.176 113 K 0.738 0.020 0.033 0.068 0.026 0.031 0.084 114 A 0.678 0.011 0.026 0.070 0.028 0.029 0.158 115 L 0.581 0.007 0.030 0.052 0.078 0.055 0.198 116 G 0.426 0.007 0.023 0.027 0.153 0.064 0.300 117 T 0.377 0.044 0.023 0.026 0.179 0.038 0.313 118 N 0.211 0.054 0.011 0.026 0.159 0.025 0.514 119 P 0.072 0.016 0.047 0.071 0.115 0.190 0.490 120 R 0.047 0.012 0.069 0.099 0.198 0.353 0.221 121 K 0.074 0.015 0.089 0.125 0.196 0.249 0.251 122 S 0.093 0.018 0.063 0.142 0.145 0.148 0.390 123 T 0.168 0.041 0.052 0.113 0.165 0.112 0.349 124 K 0.189 0.031 0.057 0.122 0.156 0.152 0.294 125 T 0.116 0.025 0.060 0.112 0.180 0.224 0.284 126 G 0.108 0.024 0.054 0.053 0.184 0.218 0.360 127 A 0.147 0.017 0.055 0.027 0.212 0.167 0.376 128 G 0.273 0.018 0.041 0.016 0.232 0.146 0.274 129 E 0.348 0.031 0.025 0.008 0.129 0.053 0.406 130 R 0.423 0.034 0.008 0.005 0.103 0.023 0.403 131 D 0.333 0.011 0.005 0.002 0.150 0.026 0.472 132 V 0.515 0.010 0.004 0.004 0.150 0.006 0.311 133 E 0.710 0.013 0.003 0.003 0.030 0.003 0.239 134 I 0.883 0.017 0.002 0.002 0.008 0.002 0.086 135 T 0.883 0.020 0.005 0.002 0.013 0.007 0.070 136 L 0.745 0.015 0.013 0.002 0.029 0.035 0.161 137 G 0.109 0.003 0.022 0.002 0.097 0.723 0.045 138 G 0.197 0.003 0.017 0.001 0.172 0.515 0.095 139 V 0.669 0.007 0.001 0.001 0.059 0.006 0.258 140 T 0.838 0.038 0.001 0.001 0.011 0.002 0.111 141 F 0.707 0.080 0.001 0.001 0.016 0.002 0.194 142 V 0.191 0.009 0.003 0.001 0.030 0.008 0.759 143 P 0.003 0.001 0.012 0.001 0.061 0.919 0.004 144 G 0.005 0.001 0.014 0.001 0.036 0.938 0.005 145 D 0.408 0.011 0.016 0.001 0.069 0.044 0.452 146 I 0.919 0.008 0.001 0.001 0.009 0.004 0.060 147 A 0.982 0.005 0.001 0.001 0.002 0.001 0.011 148 Y 0.983 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.012 149 S 0.964 0.007 0.001 0.001 0.004 0.001 0.024 150 D 0.523 0.005 0.001 0.001 0.014 0.008 0.449 151 D 0.019 0.001 0.006 0.001 0.065 0.895 0.014 152 D 0.008 0.001 0.005 0.001 0.062 0.916 0.008 153 G 0.195 0.007 0.005 0.001 0.295 0.115 0.383 154 I 0.674 0.023 0.001 0.001 0.034 0.008 0.260 155 I 0.904 0.033 0.001 0.001 0.010 0.002 0.051 156 V 0.896 0.012 0.001 0.001 0.002 0.002 0.088 157 V 0.176 0.003 0.001 0.001 0.006 0.002 0.813