# TARGET T0155 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0155.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 49 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.041 0.002 0.003 0.005 0.114 0.836 2 A 0.301 0.015 0.016 0.009 0.168 0.490 3 D 0.462 0.011 0.014 0.005 0.128 0.380 4 R 0.859 0.004 0.012 0.004 0.046 0.075 5 I 0.950 0.006 0.003 0.002 0.016 0.024 6 E 0.954 0.006 0.001 0.001 0.016 0.022 7 L 0.916 0.005 0.006 0.001 0.050 0.022 8 R 0.521 0.003 0.030 0.003 0.356 0.087 9 G 0.398 0.002 0.017 0.001 0.464 0.117 10 L 0.848 0.004 0.003 0.001 0.085 0.059 11 T 0.938 0.004 0.001 0.001 0.019 0.038 12 V 0.974 0.002 0.001 0.001 0.006 0.018 13 H 0.969 0.001 0.001 0.001 0.009 0.019 14 G 0.947 0.002 0.001 0.001 0.015 0.034 15 R 0.906 0.003 0.001 0.001 0.030 0.058 16 H 0.743 0.004 0.003 0.002 0.087 0.160 17 G 0.446 0.015 0.003 0.003 0.186 0.347 18 V 0.202 0.046 0.003 0.005 0.193 0.551 19 Y 0.093 0.011 0.004 0.014 0.184 0.695 20 D 0.012 0.002 0.060 0.720 0.134 0.072 21 H 0.005 0.001 0.054 0.870 0.061 0.009 22 E 0.005 0.001 0.085 0.824 0.081 0.005 23 R 0.004 0.001 0.068 0.813 0.092 0.021 24 V 0.009 0.003 0.075 0.719 0.150 0.044 25 A 0.011 0.004 0.092 0.532 0.227 0.134 26 G 0.011 0.001 0.005 0.009 0.285 0.689 27 Q 0.091 0.007 0.003 0.001 0.234 0.664 28 R 0.431 0.007 0.001 0.001 0.115 0.445 29 F 0.928 0.002 0.001 0.001 0.013 0.056 30 V 0.982 0.001 0.001 0.001 0.003 0.014 31 I 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 32 D 0.985 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 33 V 0.968 0.001 0.001 0.001 0.003 0.028 34 T 0.971 0.001 0.001 0.001 0.005 0.023 35 V 0.948 0.002 0.001 0.001 0.010 0.039 36 W 0.935 0.005 0.002 0.001 0.019 0.038 37 I 0.808 0.018 0.002 0.001 0.053 0.118 38 D 0.382 0.012 0.004 0.005 0.257 0.341 39 L 0.024 0.003 0.135 0.183 0.552 0.103 40 A 0.006 0.001 0.289 0.255 0.409 0.040 41 E 0.005 0.004 0.344 0.296 0.328 0.023 42 A 0.010 0.007 0.181 0.443 0.261 0.098 43 A 0.020 0.014 0.087 0.524 0.217 0.138 44 N 0.032 0.014 0.158 0.344 0.290 0.162 45 S 0.033 0.008 0.107 0.256 0.335 0.261 46 D 0.021 0.011 0.109 0.185 0.435 0.239 47 D 0.023 0.020 0.105 0.221 0.400 0.231 48 L 0.027 0.010 0.223 0.291 0.335 0.114 49 A 0.034 0.008 0.268 0.269 0.328 0.095 50 D 0.033 0.004 0.277 0.282 0.293 0.110 51 T 0.059 0.014 0.089 0.278 0.289 0.270 52 Y 0.063 0.038 0.020 0.245 0.200 0.433 53 D 0.019 0.019 0.003 0.075 0.081 0.803 54 Y 0.001 0.001 0.007 0.956 0.016 0.021 55 V 0.001 0.001 0.003 0.978 0.013 0.006 56 R 0.001 0.001 0.003 0.986 0.008 0.002 57 L 0.001 0.001 0.002 0.988 0.007 0.003 58 A 0.001 0.001 0.001 0.992 0.004 0.003 59 S 0.001 0.001 0.001 0.989 0.005 0.004 60 R 0.001 0.001 0.002 0.992 0.003 0.003 61 A 0.001 0.001 0.001 0.994 0.002 0.002 62 A 0.001 0.001 0.004 0.992 0.003 0.001 63 E 0.001 0.001 0.003 0.985 0.008 0.003 64 I 0.001 0.001 0.005 0.972 0.013 0.010 65 V 0.001 0.001 0.010 0.959 0.019 0.011 66 A 0.001 0.001 0.009 0.953 0.025 0.013 67 G 0.001 0.001 0.007 0.487 0.145 0.360 68 P 0.001 0.001 0.006 0.045 0.258 0.689 69 P 0.004 0.005 0.019 0.200 0.266 0.506 70 R 0.006 0.004 0.070 0.709 0.131 0.080 71 K 0.012 0.004 0.061 0.774 0.075 0.074 72 L 0.013 0.003 0.052 0.898 0.012 0.023 73 I 0.008 0.001 0.015 0.955 0.005 0.016 74 E 0.004 0.001 0.008 0.963 0.008 0.016 75 T 0.001 0.001 0.010 0.972 0.007 0.010 76 V 0.001 0.001 0.007 0.986 0.004 0.004 77 G 0.001 0.001 0.004 0.985 0.006 0.004 78 A 0.001 0.001 0.002 0.979 0.010 0.008 79 E 0.001 0.001 0.003 0.982 0.010 0.005 80 I 0.001 0.001 0.004 0.984 0.008 0.004 81 A 0.001 0.001 0.027 0.935 0.029 0.008 82 D 0.001 0.001 0.027 0.928 0.034 0.011 83 H 0.001 0.001 0.041 0.911 0.033 0.014 84 V 0.001 0.002 0.040 0.866 0.063 0.028 85 M 0.004 0.005 0.128 0.544 0.223 0.097 86 D 0.006 0.004 0.084 0.248 0.447 0.210 87 D 0.009 0.002 0.136 0.037 0.696 0.120 88 Q 0.014 0.002 0.089 0.014 0.691 0.189 89 R 0.101 0.011 0.102 0.007 0.560 0.219 90 V 0.349 0.007 0.016 0.003 0.402 0.224 91 H 0.479 0.003 0.007 0.001 0.158 0.351 92 A 0.952 0.003 0.001 0.001 0.010 0.035 93 V 0.980 0.001 0.001 0.001 0.004 0.016 94 E 0.986 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 95 V 0.980 0.001 0.001 0.001 0.004 0.015 96 A 0.950 0.002 0.001 0.001 0.010 0.038 97 V 0.816 0.006 0.002 0.001 0.044 0.131 98 H 0.448 0.023 0.003 0.002 0.108 0.417 99 K 0.148 0.032 0.006 0.002 0.453 0.359 100 P 0.028 0.005 0.037 0.007 0.618 0.305 101 Q 0.027 0.012 0.033 0.006 0.619 0.302 102 A 0.042 0.031 0.032 0.010 0.634 0.251 103 P 0.077 0.034 0.014 0.012 0.345 0.517 104 I 0.090 0.039 0.038 0.022 0.402 0.410 105 P 0.089 0.020 0.075 0.023 0.457 0.336 106 Q 0.094 0.012 0.149 0.030 0.475 0.240 107 T 0.139 0.020 0.125 0.028 0.470 0.219 108 F 0.197 0.024 0.187 0.042 0.409 0.140 109 D 0.169 0.016 0.101 0.026 0.422 0.265 110 D 0.202 0.006 0.024 0.007 0.357 0.406 111 V 0.373 0.006 0.003 0.001 0.205 0.412 112 A 0.614 0.003 0.001 0.001 0.068 0.314 113 V 0.974 0.001 0.001 0.001 0.004 0.020 114 V 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 115 I 0.981 0.001 0.001 0.001 0.002 0.015 116 R 0.945 0.002 0.001 0.001 0.010 0.042 117 R 0.811 0.007 0.002 0.002 0.043 0.134 118 S 0.535 0.020 0.007 0.006 0.263 0.169 119 R 0.238 0.017 0.015 0.005 0.476 0.248 120 R 0.099 0.008 0.013 0.003 0.652 0.225 121 G 0.093 0.024 0.020 0.002 0.634 0.228 122 G 0.173 0.023 0.012 0.002 0.396 0.393 123 R 0.306 0.013 0.021 0.004 0.311 0.345 124 G 0.415 0.032 0.022 0.004 0.258 0.270 125 W 0.581 0.035 0.014 0.004 0.202 0.165 126 V 0.669 0.028 0.011 0.004 0.133 0.156 127 V 0.501 0.054 0.008 0.004 0.163 0.270 128 P 0.226 0.051 0.012 0.004 0.606 0.101 129 A 0.048 0.007 0.055 0.008 0.800 0.081 130 G 0.015 0.006 0.059 0.008 0.822 0.090 131 G 0.052 0.042 0.049 0.009 0.693 0.156 132 A 0.065 0.045 0.012 0.017 0.209 0.653 133 V 0.008 0.024 0.003 0.008 0.062 0.897