PFRMAT AL TARGET T0154 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 28 PARENT 1g8fA REMARK SCORE 4.8295e+00 T 2 P 2 I 3 A 3 P 4 P 4 A 5 H 5 F 6 G 6 H 7 G 7 P 8 I 8 G 9 L 9 E 10 Q 10 L 11 D 11 N 12 L 12 V 13 I 13 Y 14 A 14 S 15 R 15 A 16 D 16 P 17 A 17 G 18 L 18 D 19 K 19 V 20 K 20 A 21 N 21 D 22 E 22 V 23 L 23 S 24 L 24 R 25 S 25 A 26 E 26 L 27 A 27 R 28 Q 28 L 29 S 29 T 30 S 30 G 31 D 31 R 32 I 32 R 33 L 33 V 34 V 34 M 35 W 35 L 36 N 36 V 37 L 37 P 38 P 55 T 39 L 56 M 40 T 57 G 41 G 58 A 42 F 59 L 43 L 60 H 44 N 61 E 45 E 62 G 46 N 63 H 47 D 64 L 48 Y 65 A 49 S 66 L 50 S 67 V 51 V 68 R 52 A 91 A 53 F 92 A 54 A 93 K 55 N 94 R 56 Q 95 V 57 I 96 P 58 K 97 G 59 P 98 S 60 D 99 V 61 T 100 V 62 R 101 V 63 I 102 V 64 A 103 S 65 L 104 I 66 F 105 F 67 S 157 V 68 L 158 N 69 E 159 P 70 A 160 M 71 I 161 Q 72 Q 162 F 73 L 163 G 74 P 164 A 75 Q 165 G 76 H 166 E 77 Y 167 D 78 D 168 L 79 Y 169 D 80 P 170 A 81 G 171 Y 82 L 172 P 83 R 173 R 84 K 174 T 85 T 175 P 86 P 176 D 87 A 177 D 88 Q 178 D 89 L 179 L 90 R 180 A 91 L 181 Q 92 E 182 L 93 F 183 R 94 Q 184 A 95 S 185 E 96 R 186 G 97 Q 187 V 98 W 188 E 99 D 189 I 100 R 190 A 101 V 191 F 102 V 192 T 103 A 193 P 104 F 194 T 105 Q 195 T 106 I 245 A 107 I 246 A 108 K 247 M 109 R 248 Y 110 Y 249 P 111 P 250 D 112 N 251 G 113 G 252 L 114 I 253 R 115 A 254 T 116 F 255 T 117 L 256 A 125 S 257 E 126 L 258 L 127 L 259 E 128 P 260 G 129 L 261 G 130 A 262 P 131 M 263 R 132 R 264 P 133 M 265 T 134 S 266 H 135 G 267 F 136 D 268 A 137 R 269 G 138 E 270 V 139 A 271 L 140 V 272 T 141 W 273 V 142 H 274 V 143 A 275 L 144 I 276 K 145 I 277 L 146 R 278 L 147 K 279 Q 148 N 280 I 149 Y 281 V 150 G 282 R 151 A 283 P 152 S 284 D 153 G 301 R 154 V 302 V 155 D 303 F 156 F 304 F 157 Y 305 G 158 G 306 E 159 P 307 K 160 Y 308 D 161 D 309 Y 162 A 310 Q 163 Q 311 Q 164 E 312 L 167 L 313 I 168 V 314 R 169 E 315 Q 170 S 316 L 171 Y 317 V 172 K 318 A 173 H 319 D 174 E 320 F 175 L 321 N 176 D 322 L 177 I 323 D 178 E 324 V 179 V 325 A 180 V 326 V 181 F 328 V 182 R 329 G 183 M 330 V 184 V 331 P 185 T 332 T 186 Y 333 V 187 L 334 R 188 P 335 E 189 D 336 A 190 E 337 D 191 D 338 G 192 R 339 L 193 Y 340 A 194 A 341 M 195 T 349 S 196 K 350 S 197 T 351 R 198 R 352 N 199 T 353 R 200 L 354 Y 201 N 355 L 202 I 356 D 203 S 357 P 204 G 358 A 205 T 359 Q 206 E 360 R 207 L 361 A 208 R 362 A 209 R 363 A 210 R 364 V 211 L 365 A 212 R 366 L 213 V 367 S 214 P 378 A 215 E 379 A 216 V 380 L 217 V 381 T 218 K 382 A 219 I 383 A 220 L 384 A 221 R 385 H 222 E 386 A 223 S 387 A 224 N 388 T 225 P 389 A 226 P 390 G 227 R 391 A 228 P 392 Q 229 S 407 A 230 R 408 A 231 E 409 L 232 Q 410 D 233 L 411 A 234 S 412 A 235 I 413 R 236 A 414 A 237 L 415 V 238 L 416 L 239 S 417 D 240 T 418 A 241 F 419 A 242 L 420 P 243 Q 421 G 244 F 422 V 245 G 423 A 246 G 424 V 247 G 425 D 248 R 426 Y 249 Y 427 L 250 Y 428 E 251 K 429 L 252 I 430 R 253 F 431 D 254 E 432 I 255 H 433 G 256 N 434 L 257 N 435 G 258 K 436 P 259 T 437 M 260 E 438 P 261 I 447 L 262 G 448 N 263 S 449 G 264 G 450 S 265 S 451 G 266 G 452 R 267 L 453 L 268 I 454 L 269 I 455 V 270 P 456 A 271 D 457 A 272 Q 458 R 273 W 459 L 274 E 460 G 275 Q 470 T 276 N 471 T 277 V 472 R 278 Y 473 L 279 L 474 L 280 L 475 D 281 D 476 N 282 T 477 I 283 S 478 A 284 S 479 I 285 S 480 E 286 A 481 I 287 D 482 G 288 I 483 T 289 Q 484 F 290 L 485 A 291 E 486 G 292 S 487 T 293 A 488 D 294 D 489 R 295 E 490 P 296 P 491 D 297 I 492 G 298 S 493 Y 299 H 494 R 300 I 495 A 301 V 496 I 302 Q 497 L 303 K 498 E 304 V 499 S 305 G 507 H 306 F 508 W 307 F 509 R 308 V 510 N 309 F 511 TER END