# TARGET T0152 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0152.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 28 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 2 T 0.090 0.054 0.005 0.053 0.005 0.028 0.764 3 K 0.110 0.030 0.011 0.069 0.216 0.064 0.499 4 P 0.115 0.015 0.024 0.096 0.140 0.093 0.517 5 T 0.107 0.020 0.032 0.103 0.244 0.107 0.386 6 S 0.087 0.023 0.037 0.139 0.198 0.097 0.418 7 A 0.046 0.015 0.027 0.120 0.172 0.101 0.519 8 G 0.025 0.008 0.031 0.217 0.219 0.157 0.343 9 Q 0.017 0.012 0.045 0.294 0.159 0.112 0.361 10 A 0.014 0.016 0.065 0.468 0.085 0.088 0.264 11 D 0.011 0.007 0.079 0.562 0.059 0.112 0.170 12 D 0.014 0.006 0.081 0.531 0.061 0.135 0.172 13 A 0.015 0.009 0.073 0.556 0.076 0.127 0.143 14 L 0.019 0.007 0.069 0.531 0.093 0.099 0.181 15 V 0.018 0.005 0.087 0.550 0.058 0.148 0.134 16 R 0.026 0.006 0.084 0.459 0.073 0.236 0.115 17 L 0.046 0.010 0.081 0.384 0.088 0.207 0.184 18 A 0.077 0.017 0.064 0.255 0.133 0.111 0.343 19 R 0.108 0.046 0.046 0.215 0.117 0.079 0.390 20 E 0.088 0.022 0.018 0.060 0.177 0.042 0.593 21 R 0.053 0.010 0.018 0.022 0.114 0.081 0.701 22 F 0.062 0.041 0.027 0.027 0.163 0.089 0.591 23 D 0.045 0.034 0.022 0.020 0.179 0.048 0.652 24 L 0.024 0.008 0.018 0.015 0.143 0.062 0.729 25 P 0.026 0.016 0.024 0.017 0.169 0.093 0.656 26 D 0.026 0.033 0.035 0.025 0.225 0.055 0.601 27 Q 0.040 0.024 0.059 0.041 0.139 0.104 0.592 28 V 0.061 0.018 0.112 0.046 0.140 0.179 0.445 29 R 0.122 0.029 0.110 0.046 0.183 0.141 0.368 30 R 0.191 0.049 0.076 0.042 0.130 0.083 0.429 31 L 0.242 0.058 0.042 0.037 0.147 0.066 0.409 32 A 0.228 0.030 0.021 0.024 0.136 0.063 0.498 33 R 0.163 0.028 0.025 0.021 0.209 0.069 0.485 34 P 0.154 0.023 0.023 0.017 0.149 0.077 0.559 35 P 0.126 0.048 0.029 0.017 0.200 0.056 0.524 36 V 0.105 0.032 0.032 0.018 0.143 0.024 0.645 37 P 0.057 0.011 0.216 0.052 0.120 0.283 0.261 38 S 0.055 0.012 0.204 0.034 0.115 0.396 0.185 39 L 0.065 0.036 0.210 0.031 0.170 0.275 0.213 40 E 0.068 0.014 0.095 0.015 0.239 0.281 0.287 41 P 0.064 0.008 0.056 0.007 0.361 0.272 0.233 42 P 0.293 0.019 0.026 0.003 0.152 0.124 0.383 43 Y 0.769 0.013 0.002 0.001 0.020 0.008 0.187 44 G 0.917 0.007 0.001 0.001 0.009 0.003 0.061 45 L 0.865 0.010 0.002 0.002 0.011 0.003 0.107 46 R 0.695 0.005 0.002 0.002 0.031 0.004 0.260 47 V 0.624 0.013 0.002 0.002 0.038 0.008 0.314 48 A 0.071 0.008 0.001 0.001 0.054 0.003 0.861 49 Q 0.033 0.003 0.001 0.001 0.030 0.002 0.931 50 L 0.001 0.001 0.185 0.652 0.039 0.105 0.017 51 T 0.001 0.002 0.196 0.679 0.029 0.075 0.018 52 D 0.001 0.002 0.140 0.782 0.017 0.029 0.029 53 A 0.001 0.001 0.008 0.976 0.003 0.006 0.005 54 E 0.001 0.001 0.007 0.972 0.002 0.012 0.006 55 M 0.001 0.001 0.009 0.961 0.002 0.024 0.003 56 L 0.001 0.001 0.005 0.973 0.004 0.013 0.004 57 A 0.001 0.001 0.013 0.962 0.003 0.019 0.003 58 E 0.001 0.001 0.014 0.897 0.005 0.080 0.003 59 W 0.001 0.001 0.027 0.797 0.009 0.157 0.010 60 M 0.001 0.007 0.028 0.573 0.055 0.304 0.031 61 N 0.004 0.008 0.016 0.277 0.159 0.393 0.142 62 R 0.002 0.003 0.007 0.110 0.286 0.049 0.543 63 P 0.002 0.003 0.074 0.708 0.040 0.119 0.056 64 H 0.006 0.008 0.069 0.718 0.032 0.120 0.048 65 L 0.007 0.003 0.045 0.875 0.016 0.022 0.032 66 A 0.012 0.001 0.021 0.920 0.008 0.013 0.025 67 A 0.013 0.002 0.035 0.890 0.010 0.033 0.018 68 A 0.009 0.002 0.047 0.855 0.012 0.061 0.013 69 W 0.009 0.005 0.048 0.783 0.026 0.106 0.023 70 E 0.008 0.003 0.047 0.577 0.053 0.268 0.045 71 Y 0.006 0.002 0.023 0.398 0.177 0.248 0.146 72 D 0.005 0.009 0.018 0.206 0.250 0.144 0.368 73 W 0.004 0.016 0.014 0.130 0.166 0.087 0.583 74 P 0.001 0.003 0.009 0.148 0.042 0.031 0.765 75 A 0.001 0.001 0.018 0.890 0.017 0.026 0.048 76 S 0.001 0.001 0.013 0.937 0.011 0.019 0.019 77 R 0.001 0.001 0.011 0.950 0.007 0.016 0.015 78 W 0.001 0.001 0.004 0.967 0.004 0.015 0.008 79 R 0.001 0.001 0.003 0.956 0.005 0.029 0.006 80 Q 0.001 0.001 0.003 0.952 0.005 0.032 0.007 81 H 0.001 0.001 0.004 0.942 0.008 0.022 0.021 82 L 0.002 0.001 0.007 0.950 0.008 0.018 0.014 83 N 0.002 0.001 0.013 0.943 0.006 0.027 0.009 84 A 0.001 0.001 0.017 0.932 0.007 0.036 0.007 85 Q 0.002 0.001 0.023 0.890 0.012 0.058 0.013 86 L 0.004 0.002 0.023 0.731 0.028 0.189 0.023 87 E 0.008 0.003 0.019 0.370 0.133 0.365 0.101 88 G 0.007 0.004 0.016 0.036 0.339 0.176 0.421 89 T 0.011 0.007 0.047 0.019 0.330 0.345 0.241 90 Y 0.038 0.010 0.067 0.010 0.253 0.353 0.269 91 S 0.213 0.018 0.030 0.004 0.176 0.053 0.506 92 L 0.491 0.008 0.010 0.002 0.127 0.019 0.343 93 P 0.703 0.013 0.015 0.003 0.049 0.012 0.205 94 L 0.911 0.005 0.004 0.001 0.010 0.002 0.066 95 I 0.952 0.003 0.002 0.001 0.006 0.001 0.036 96 G 0.963 0.005 0.001 0.001 0.002 0.001 0.027 97 S 0.902 0.005 0.002 0.001 0.006 0.008 0.076 98 W 0.734 0.005 0.009 0.002 0.040 0.103 0.106 99 H 0.028 0.001 0.010 0.002 0.114 0.829 0.015 100 G 0.015 0.001 0.005 0.001 0.227 0.724 0.028 101 T 0.530 0.008 0.001 0.001 0.114 0.016 0.330 102 D 0.816 0.042 0.001 0.001 0.015 0.003 0.123 103 G 0.927 0.005 0.001 0.001 0.007 0.001 0.058 104 G 0.946 0.004 0.003 0.001 0.009 0.002 0.035 105 Y 0.922 0.001 0.006 0.001 0.017 0.003 0.050 106 L 0.960 0.001 0.003 0.002 0.006 0.003 0.026 107 E 0.957 0.003 0.002 0.003 0.004 0.002 0.029 108 L 0.937 0.003 0.002 0.002 0.008 0.002 0.045 109 Y 0.791 0.010 0.004 0.004 0.034 0.005 0.151 110 W 0.451 0.033 0.009 0.007 0.076 0.009 0.415 111 A 0.167 0.013 0.153 0.051 0.104 0.092 0.420 112 A 0.048 0.006 0.268 0.047 0.147 0.295 0.189 113 K 0.020 0.005 0.349 0.072 0.126 0.277 0.151 114 D 0.024 0.010 0.193 0.080 0.161 0.165 0.366 115 L 0.046 0.014 0.164 0.094 0.179 0.222 0.281 116 I 0.071 0.032 0.146 0.104 0.159 0.164 0.323 117 S 0.098 0.028 0.122 0.096 0.191 0.120 0.344 118 H 0.132 0.024 0.131 0.083 0.104 0.204 0.322 119 Y 0.149 0.034 0.139 0.063 0.137 0.134 0.344 120 Y 0.147 0.016 0.078 0.044 0.207 0.082 0.426 121 D 0.136 0.036 0.042 0.036 0.109 0.128 0.513 122 A 0.047 0.044 0.014 0.015 0.088 0.033 0.758 123 D 0.017 0.009 0.013 0.003 0.082 0.048 0.828 124 P 0.003 0.002 0.035 0.004 0.126 0.804 0.027 125 Y 0.006 0.002 0.040 0.002 0.098 0.819 0.034 126 D 0.117 0.028 0.016 0.002 0.136 0.027 0.674 127 L 0.530 0.028 0.005 0.002 0.108 0.013 0.314 128 G 0.898 0.015 0.004 0.003 0.014 0.009 0.058 129 L 0.928 0.004 0.004 0.005 0.004 0.006 0.049 130 H 0.926 0.002 0.004 0.007 0.009 0.008 0.044 131 A 0.904 0.004 0.008 0.007 0.012 0.009 0.054 132 A 0.781 0.005 0.014 0.008 0.035 0.013 0.146 133 I 0.614 0.018 0.016 0.006 0.084 0.018 0.244 134 A 0.470 0.064 0.007 0.004 0.115 0.012 0.329 135 D 0.178 0.021 0.044 0.014 0.125 0.052 0.566 136 L 0.027 0.006 0.358 0.113 0.143 0.264 0.089 137 S 0.011 0.005 0.419 0.129 0.109 0.253 0.072 138 K 0.014 0.010 0.362 0.165 0.124 0.207 0.117 139 V 0.015 0.009 0.120 0.144 0.193 0.369 0.148 140 N 0.011 0.008 0.071 0.062 0.236 0.312 0.299 141 R 0.007 0.005 0.083 0.114 0.303 0.251 0.238 142 G 0.017 0.023 0.082 0.144 0.231 0.240 0.263 143 F 0.018 0.022 0.100 0.379 0.150 0.109 0.222 144 G 0.007 0.003 0.067 0.655 0.034 0.051 0.183 145 P 0.001 0.001 0.026 0.901 0.017 0.028 0.025 146 L 0.001 0.001 0.012 0.947 0.008 0.017 0.013 147 L 0.001 0.001 0.003 0.972 0.007 0.009 0.009 148 L 0.001 0.001 0.001 0.983 0.003 0.007 0.006 149 P 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.005 0.002 150 R 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 151 I 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 152 V 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.004 0.001 153 A 0.001 0.001 0.001 0.985 0.001 0.011 0.001 154 S 0.001 0.001 0.004 0.956 0.002 0.035 0.003 155 V 0.001 0.001 0.008 0.907 0.008 0.064 0.010 156 F 0.004 0.004 0.020 0.721 0.026 0.186 0.039 157 A 0.005 0.002 0.036 0.403 0.108 0.354 0.091 158 N 0.006 0.005 0.031 0.180 0.266 0.363 0.149 159 E 0.006 0.005 0.016 0.014 0.302 0.049 0.607 160 P 0.006 0.005 0.136 0.023 0.164 0.552 0.115 161 R 0.031 0.006 0.142 0.012 0.142 0.551 0.116 162 C 0.239 0.016 0.069 0.009 0.128 0.043 0.496 163 R 0.644 0.010 0.010 0.006 0.055 0.012 0.262 164 R 0.883 0.006 0.004 0.004 0.014 0.005 0.084 165 I 0.930 0.006 0.002 0.003 0.007 0.003 0.050 166 M 0.897 0.004 0.002 0.004 0.012 0.003 0.078 167 F 0.781 0.015 0.002 0.004 0.033 0.005 0.160 168 D 0.330 0.011 0.002 0.006 0.097 0.011 0.542 169 P 0.040 0.007 0.012 0.021 0.252 0.083 0.583 170 D 0.014 0.009 0.020 0.038 0.286 0.115 0.517 171 H 0.004 0.004 0.134 0.329 0.158 0.260 0.112 172 R 0.002 0.002 0.085 0.503 0.072 0.233 0.103 173 N 0.003 0.002 0.037 0.669 0.053 0.071 0.165 174 T 0.003 0.002 0.008 0.908 0.016 0.021 0.041 175 A 0.005 0.001 0.006 0.953 0.005 0.014 0.015 176 T 0.002 0.001 0.004 0.976 0.003 0.010 0.005 177 R 0.002 0.001 0.002 0.988 0.002 0.004 0.002 178 R 0.002 0.001 0.002 0.989 0.001 0.005 0.002 179 L 0.001 0.001 0.001 0.982 0.002 0.013 0.002 180 C 0.002 0.001 0.003 0.967 0.005 0.018 0.005 181 E 0.002 0.001 0.019 0.921 0.006 0.047 0.005 182 W 0.002 0.001 0.027 0.818 0.014 0.131 0.007 183 A 0.002 0.001 0.026 0.425 0.060 0.449 0.037 184 G 0.006 0.002 0.006 0.039 0.085 0.768 0.093 185 C 0.124 0.019 0.006 0.016 0.090 0.039 0.706 186 K 0.460 0.041 0.010 0.012 0.047 0.008 0.423 187 F 0.441 0.026 0.024 0.012 0.034 0.015 0.448 188 L 0.364 0.015 0.135 0.018 0.085 0.052 0.330 189 G 0.527 0.007 0.087 0.013 0.091 0.058 0.217 190 E 0.584 0.018 0.040 0.009 0.064 0.026 0.259 191 H 0.557 0.032 0.009 0.006 0.057 0.009 0.329 192 D 0.322 0.042 0.007 0.006 0.135 0.025 0.463 193 T 0.118 0.024 0.007 0.006 0.184 0.031 0.631 194 T 0.017 0.005 0.021 0.010 0.154 0.591 0.202 195 N 0.017 0.004 0.017 0.008 0.229 0.610 0.115 196 R 0.109 0.023 0.016 0.028 0.426 0.074 0.325 197 R 0.269 0.045 0.016 0.073 0.086 0.046 0.464 198 M 0.684 0.031 0.012 0.061 0.032 0.015 0.164 199 A 0.850 0.011 0.010 0.054 0.015 0.009 0.052 200 L 0.844 0.006 0.017 0.068 0.012 0.013 0.041 201 Y 0.765 0.005 0.027 0.118 0.021 0.021 0.044 202 A 0.758 0.005 0.024 0.116 0.016 0.030 0.051 203 L 0.573 0.010 0.037 0.138 0.048 0.089 0.107 204 E 0.416 0.011 0.031 0.117 0.134 0.083 0.209 205 A 0.178 0.014 0.086 0.235 0.139 0.073 0.277 206 P 0.150 0.011 0.142 0.319 0.100 0.120 0.158 207 T 0.110 0.007 0.162 0.310 0.114 0.163 0.135 208 T 0.087 0.014 0.080 0.262 0.181 0.176 0.200 209 A 0.062 0.022 0.032 0.163 0.009 0.187 0.525 210 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.996