# TARGET T0151 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0151.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 147 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.030 0.007 0.045 0.047 0.321 0.550 2 A 0.043 0.009 0.107 0.057 0.404 0.380 3 G 0.085 0.019 0.095 0.038 0.365 0.398 4 D 0.211 0.028 0.039 0.014 0.356 0.353 5 T 0.306 0.020 0.010 0.003 0.279 0.382 6 T 0.606 0.005 0.003 0.001 0.114 0.271 7 I 0.950 0.002 0.001 0.001 0.010 0.038 8 T 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 9 I 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 10 V 0.984 0.001 0.001 0.001 0.002 0.014 11 G 0.934 0.002 0.001 0.001 0.007 0.056 12 N 0.841 0.003 0.003 0.002 0.053 0.097 13 L 0.669 0.013 0.006 0.003 0.110 0.199 14 T 0.457 0.038 0.008 0.005 0.302 0.189 15 A 0.202 0.075 0.012 0.011 0.409 0.292 16 D 0.066 0.012 0.005 0.005 0.599 0.313 17 P 0.031 0.001 0.133 0.055 0.638 0.142 18 E 0.312 0.011 0.153 0.069 0.364 0.092 19 L 0.667 0.047 0.060 0.038 0.149 0.039 20 R 0.680 0.010 0.022 0.034 0.099 0.155 21 F 0.778 0.058 0.010 0.013 0.067 0.074 22 T 0.456 0.026 0.019 0.014 0.414 0.071 23 P 0.091 0.003 0.021 0.012 0.809 0.063 24 S 0.017 0.003 0.014 0.003 0.932 0.032 25 G 0.035 0.011 0.009 0.001 0.889 0.055 26 A 0.305 0.013 0.002 0.001 0.318 0.361 27 A 0.808 0.010 0.001 0.001 0.045 0.136 28 V 0.946 0.003 0.001 0.001 0.007 0.044 29 A 0.978 0.001 0.001 0.001 0.003 0.018 30 N 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 31 F 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 32 T 0.988 0.001 0.001 0.001 0.003 0.008 33 V 0.972 0.001 0.001 0.001 0.006 0.021 34 A 0.943 0.003 0.001 0.001 0.019 0.034 35 S 0.803 0.017 0.001 0.001 0.055 0.122 36 T 0.370 0.012 0.007 0.004 0.304 0.303 37 P 0.093 0.014 0.122 0.026 0.540 0.206 38 R 0.103 0.012 0.172 0.033 0.470 0.209 39 I 0.126 0.033 0.228 0.057 0.421 0.135 40 Y 0.183 0.061 0.076 0.066 0.302 0.312 41 D 0.106 0.052 0.057 0.083 0.536 0.165 42 R 0.025 0.009 0.075 0.116 0.705 0.070 43 Q 0.016 0.006 0.045 0.114 0.710 0.108 44 T 0.020 0.007 0.026 0.097 0.727 0.123 45 G 0.061 0.010 0.016 0.139 0.452 0.322 46 E 0.203 0.060 0.022 0.144 0.241 0.330 47 W 0.267 0.025 0.056 0.145 0.283 0.224 48 K 0.222 0.020 0.069 0.247 0.246 0.196 49 D 0.149 0.020 0.038 0.271 0.244 0.278 50 G 0.066 0.009 0.017 0.313 0.225 0.370 51 E 0.059 0.009 0.011 0.099 0.193 0.629 52 A 0.149 0.015 0.027 0.097 0.212 0.499 53 L 0.365 0.014 0.037 0.096 0.171 0.317 54 F 0.545 0.008 0.040 0.115 0.104 0.188 55 L 0.775 0.012 0.012 0.060 0.047 0.094 56 R 0.841 0.004 0.010 0.055 0.027 0.062 57 C 0.848 0.005 0.017 0.044 0.025 0.061 58 N 0.842 0.006 0.021 0.041 0.030 0.061 59 I 0.685 0.008 0.041 0.066 0.086 0.114 60 W 0.195 0.008 0.084 0.251 0.199 0.263 61 R 0.035 0.003 0.120 0.408 0.265 0.168 62 E 0.006 0.002 0.174 0.568 0.169 0.080 63 A 0.006 0.004 0.098 0.805 0.063 0.023 64 A 0.005 0.001 0.022 0.918 0.037 0.016 65 E 0.005 0.001 0.012 0.929 0.030 0.023 66 N 0.007 0.002 0.011 0.930 0.026 0.023 67 V 0.007 0.001 0.008 0.906 0.039 0.038 68 A 0.008 0.003 0.031 0.888 0.051 0.019 69 E 0.008 0.002 0.028 0.848 0.074 0.040 70 S 0.006 0.001 0.034 0.758 0.092 0.108 71 L 0.011 0.009 0.036 0.572 0.147 0.224 72 T 0.016 0.012 0.023 0.235 0.611 0.103 73 R 0.030 0.007 0.013 0.100 0.706 0.143 74 G 0.014 0.001 0.003 0.005 0.783 0.194 75 A 0.195 0.008 0.003 0.003 0.583 0.207 76 R 0.771 0.012 0.001 0.001 0.068 0.146 77 V 0.943 0.003 0.001 0.001 0.016 0.037 78 I 0.982 0.001 0.001 0.001 0.005 0.012 79 V 0.983 0.001 0.001 0.001 0.004 0.011 80 S 0.963 0.001 0.001 0.001 0.010 0.026 81 G 0.906 0.002 0.001 0.001 0.024 0.066 82 R 0.886 0.005 0.001 0.001 0.040 0.068 83 L 0.815 0.007 0.003 0.002 0.066 0.107 84 K 0.806 0.011 0.004 0.003 0.084 0.093 85 Q 0.749 0.007 0.007 0.004 0.124 0.110 86 R 0.560 0.006 0.008 0.004 0.192 0.230 87 S 0.636 0.013 0.005 0.004 0.159 0.182 88 F 0.782 0.017 0.009 0.007 0.097 0.088 89 E 0.819 0.072 0.004 0.005 0.053 0.047 90 T 0.372 0.016 0.011 0.012 0.571 0.019 91 R 0.031 0.001 0.024 0.019 0.917 0.008 92 E 0.015 0.001 0.011 0.003 0.961 0.009 93 G 0.044 0.003 0.002 0.001 0.910 0.040 94 E 0.411 0.006 0.001 0.001 0.105 0.477 95 K 0.908 0.017 0.001 0.001 0.015 0.059 96 R 0.936 0.003 0.001 0.001 0.013 0.048 97 T 0.926 0.006 0.001 0.001 0.017 0.051 98 V 0.905 0.003 0.001 0.001 0.021 0.070 99 I 0.952 0.001 0.001 0.001 0.008 0.040 100 E 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 101 V 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 102 E 0.984 0.001 0.001 0.001 0.003 0.010 103 V 0.960 0.002 0.002 0.002 0.012 0.022 104 D 0.825 0.001 0.006 0.006 0.068 0.094 105 E 0.816 0.004 0.007 0.012 0.078 0.084 106 I 0.851 0.012 0.006 0.014 0.057 0.061 107 G 0.832 0.011 0.008 0.021 0.062 0.066 108 P 0.658 0.012 0.023 0.054 0.120 0.133 109 S 0.345 0.018 0.055 0.096 0.264 0.223 110 L 0.155 0.007 0.077 0.132 0.391 0.238 111 R 0.076 0.010 0.072 0.115 0.450 0.277 112 Y 0.067 0.027 0.067 0.112 0.425 0.303 113 A 0.058 0.020 0.068 0.127 0.426 0.301 114 T 0.058 0.015 0.072 0.144 0.375 0.336 115 A 0.054 0.022 0.079 0.143 0.341 0.362 116 K 0.052 0.025 0.068 0.106 0.360 0.389 117 V 0.054 0.025 0.069 0.101 0.367 0.384 118 N 0.048 0.027 0.061 0.084 0.344 0.436 119 K 0.056 0.029 0.067 0.075 0.348 0.425 120 A 0.054 0.027 0.072 0.077 0.356 0.414 121 S 0.050 0.030 0.074 0.074 0.382 0.390 122 R 0.056 0.035 0.082 0.073 0.390 0.364 123 S 0.056 0.028 0.075 0.070 0.387 0.383 124 G 0.059 0.032 0.082 0.064 0.393 0.369 125 G 0.061 0.038 0.070 0.068 0.393 0.370 126 F 0.067 0.041 0.084 0.072 0.394 0.343 127 G 0.062 0.030 0.070 0.071 0.409 0.357 128 S 0.074 0.041 0.065 0.069 0.400 0.351 129 G 0.069 0.042 0.052 0.077 0.374 0.386 130 S 0.061 0.040 0.050 0.067 0.402 0.381 131 R 0.053 0.038 0.069 0.083 0.414 0.343 132 P 0.047 0.028 0.076 0.086 0.410 0.353 133 A 0.043 0.030 0.082 0.087 0.438 0.320 134 P 0.037 0.032 0.079 0.109 0.417 0.326 135 A 0.033 0.031 0.081 0.117 0.409 0.329 136 Q 0.029 0.025 0.080 0.121 0.413 0.331 137 T 0.032 0.029 0.072 0.123 0.388 0.357 138 S 0.034 0.032 0.084 0.129 0.383 0.338 139 S 0.032 0.026 0.085 0.139 0.391 0.327 140 A 0.031 0.026 0.102 0.140 0.399 0.302 141 S 0.028 0.022 0.090 0.130 0.401 0.329 142 G 0.028 0.024 0.076 0.116 0.389 0.367 143 D 0.026 0.032 0.060 0.103 0.374 0.404 144 D 0.023 0.026 0.058 0.084 0.397 0.413 145 P 0.020 0.024 0.075 0.090 0.418 0.373 146 W 0.019 0.027 0.085 0.089 0.433 0.347 147 G 0.022 0.030 0.089 0.090 0.403 0.367 148 S 0.024 0.032 0.068 0.087 0.372 0.418 149 A 0.022 0.034 0.070 0.092 0.389 0.393 150 P 0.019 0.032 0.051 0.067 0.500 0.331 151 A 0.018 0.022 0.063 0.080 0.496 0.321 152 S 0.016 0.019 0.070 0.085 0.492 0.318 153 G 0.021 0.023 0.071 0.089 0.484 0.312 154 S 0.024 0.045 0.083 0.110 0.374 0.364 155 F 0.024 0.030 0.072 0.125 0.333 0.416 156 G 0.034 0.032 0.053 0.107 0.335 0.440 157 G 0.034 0.032 0.063 0.142 0.347 0.382 158 G 0.023 0.030 0.079 0.130 0.514 0.224 159 D 0.011 0.008 0.226 0.140 0.516 0.099 160 D 0.012 0.003 0.190 0.099 0.574 0.122 161 E 0.020 0.016 0.159 0.106 0.507 0.191 162 P 0.028 0.031 0.058 0.046 0.310 0.526 163 P 0.013 0.010 0.029 0.022 0.184 0.742 164 F 0.001 0.004 0.007 0.006 0.069 0.913