# TARGET T0151 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0151.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 147 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.002 0.001 0.008 0.002 0.007 0.003 0.976 2 A 0.107 0.014 0.056 0.028 0.026 0.126 0.642 3 G 0.166 0.057 0.067 0.016 0.120 0.171 0.402 4 D 0.271 0.031 0.024 0.011 0.121 0.064 0.478 5 T 0.348 0.004 0.005 0.006 0.176 0.017 0.444 6 T 0.767 0.003 0.003 0.006 0.109 0.010 0.102 7 I 0.973 0.002 0.001 0.002 0.002 0.001 0.020 8 T 0.988 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.007 9 I 0.983 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 10 V 0.910 0.002 0.002 0.003 0.009 0.003 0.071 11 G 0.701 0.009 0.010 0.010 0.081 0.007 0.182 12 N 0.540 0.018 0.029 0.024 0.083 0.017 0.289 13 L 0.315 0.019 0.098 0.031 0.097 0.177 0.263 14 T 0.196 0.024 0.057 0.027 0.171 0.328 0.197 15 A 0.082 0.066 0.025 0.017 0.396 0.186 0.227 16 D 0.041 0.008 0.007 0.005 0.298 0.031 0.609 17 P 0.025 0.005 0.139 0.019 0.151 0.560 0.101 18 E 0.068 0.007 0.160 0.025 0.144 0.490 0.107 19 L 0.392 0.087 0.117 0.038 0.094 0.074 0.197 20 R 0.632 0.029 0.016 0.020 0.050 0.022 0.231 21 F 0.639 0.150 0.005 0.007 0.047 0.029 0.123 22 T 0.139 0.030 0.005 0.002 0.029 0.029 0.766 23 P 0.025 0.004 0.008 0.001 0.133 0.684 0.145 24 S 0.006 0.007 0.006 0.001 0.250 0.701 0.029 25 G 0.011 0.002 0.001 0.001 0.805 0.072 0.108 26 A 0.072 0.007 0.002 0.001 0.173 0.014 0.731 27 A 0.662 0.084 0.001 0.001 0.059 0.003 0.190 28 V 0.953 0.005 0.001 0.001 0.005 0.001 0.035 29 A 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 30 N 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.010 31 F 0.985 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.012 32 T 0.979 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.015 33 V 0.930 0.004 0.002 0.002 0.010 0.003 0.048 34 A 0.721 0.004 0.008 0.006 0.056 0.028 0.177 35 S 0.508 0.025 0.006 0.005 0.208 0.032 0.215 36 T 0.318 0.016 0.005 0.002 0.178 0.022 0.458 37 P 0.278 0.012 0.045 0.012 0.169 0.104 0.380 38 R 0.288 0.029 0.053 0.022 0.172 0.102 0.334 39 I 0.276 0.021 0.055 0.031 0.155 0.066 0.395 40 Y 0.335 0.063 0.023 0.034 0.177 0.058 0.310 41 D 0.148 0.069 0.026 0.034 0.116 0.080 0.528 42 R 0.037 0.008 0.026 0.027 0.165 0.528 0.209 43 Q 0.020 0.006 0.020 0.027 0.190 0.615 0.122 44 T 0.023 0.006 0.019 0.030 0.357 0.371 0.194 45 G 0.042 0.009 0.016 0.048 0.330 0.166 0.390 46 E 0.225 0.050 0.022 0.086 0.168 0.047 0.402 47 W 0.486 0.050 0.024 0.111 0.053 0.040 0.236 48 K 0.490 0.028 0.041 0.091 0.066 0.043 0.241 49 D 0.360 0.014 0.056 0.076 0.126 0.079 0.289 50 G 0.259 0.014 0.024 0.020 0.238 0.042 0.403 51 E 0.391 0.012 0.026 0.007 0.121 0.032 0.410 52 A 0.635 0.005 0.006 0.003 0.070 0.010 0.271 53 L 0.765 0.007 0.005 0.002 0.062 0.007 0.150 54 F 0.896 0.006 0.006 0.005 0.013 0.007 0.068 55 L 0.897 0.008 0.005 0.008 0.011 0.004 0.068 56 R 0.871 0.003 0.006 0.009 0.025 0.003 0.083 57 C 0.920 0.003 0.004 0.011 0.010 0.004 0.048 58 N 0.949 0.003 0.002 0.009 0.005 0.003 0.029 59 I 0.795 0.015 0.011 0.021 0.015 0.019 0.123 60 W 0.471 0.014 0.013 0.038 0.069 0.061 0.334 61 R 0.064 0.005 0.098 0.314 0.207 0.127 0.184 62 E 0.020 0.006 0.060 0.613 0.144 0.060 0.098 63 A 0.009 0.003 0.036 0.850 0.023 0.040 0.039 64 A 0.004 0.001 0.006 0.965 0.007 0.009 0.009 65 E 0.002 0.001 0.002 0.980 0.004 0.007 0.004 66 N 0.001 0.001 0.002 0.986 0.002 0.008 0.002 67 V 0.001 0.001 0.002 0.983 0.002 0.010 0.002 68 A 0.001 0.001 0.006 0.972 0.002 0.018 0.002 69 E 0.001 0.001 0.008 0.924 0.003 0.059 0.004 70 S 0.002 0.001 0.020 0.844 0.008 0.114 0.011 71 L 0.013 0.012 0.030 0.686 0.065 0.109 0.085 72 T 0.022 0.008 0.065 0.491 0.082 0.207 0.124 73 R 0.022 0.004 0.035 0.192 0.172 0.504 0.071 74 G 0.035 0.004 0.016 0.018 0.289 0.442 0.195 75 A 0.064 0.003 0.003 0.001 0.289 0.055 0.584 76 R 0.643 0.008 0.003 0.001 0.123 0.024 0.199 77 V 0.956 0.002 0.001 0.001 0.005 0.002 0.035 78 I 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.008 79 V 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 80 S 0.961 0.001 0.001 0.001 0.006 0.002 0.029 81 G 0.897 0.001 0.001 0.001 0.028 0.007 0.065 82 R 0.907 0.005 0.001 0.001 0.021 0.002 0.064 83 L 0.884 0.008 0.001 0.001 0.012 0.004 0.090 84 K 0.894 0.008 0.002 0.001 0.029 0.011 0.054 85 Q 0.859 0.009 0.003 0.001 0.038 0.014 0.077 86 R 0.617 0.004 0.006 0.001 0.096 0.039 0.236 87 S 0.681 0.017 0.006 0.002 0.087 0.023 0.184 88 F 0.700 0.013 0.007 0.003 0.072 0.022 0.184 89 E 0.694 0.057 0.006 0.003 0.072 0.033 0.135 90 T 0.357 0.023 0.010 0.002 0.051 0.053 0.505 91 R 0.094 0.003 0.012 0.002 0.120 0.684 0.085 92 E 0.031 0.004 0.010 0.001 0.158 0.776 0.021 93 G 0.065 0.001 0.003 0.001 0.606 0.164 0.161 94 E 0.378 0.013 0.001 0.001 0.093 0.005 0.511 95 K 0.871 0.049 0.001 0.001 0.006 0.001 0.074 96 R 0.893 0.003 0.001 0.001 0.010 0.001 0.093 97 T 0.940 0.003 0.001 0.001 0.010 0.001 0.045 98 V 0.926 0.002 0.001 0.001 0.007 0.001 0.062 99 I 0.962 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.027 100 E 0.988 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.010 101 V 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 102 E 0.979 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.017 103 V 0.926 0.004 0.001 0.001 0.007 0.005 0.056 104 D 0.800 0.008 0.006 0.004 0.077 0.028 0.077 105 E 0.713 0.007 0.008 0.010 0.091 0.025 0.146 106 I 0.629 0.019 0.012 0.024 0.072 0.052 0.193 107 G 0.655 0.031 0.010 0.034 0.061 0.051 0.158 108 P 0.578 0.021 0.016 0.051 0.074 0.064 0.196 109 S 0.315 0.021 0.026 0.128 0.125 0.106 0.279 110 L 0.228 0.019 0.041 0.140 0.188 0.121 0.264 111 R 0.110 0.011 0.037 0.218 0.202 0.102 0.320 112 Y 0.088 0.016 0.043 0.248 0.176 0.158 0.270 113 A 0.053 0.011 0.043 0.287 0.133 0.222 0.252 114 T 0.041 0.021 0.047 0.264 0.147 0.204 0.275 115 A 0.034 0.019 0.043 0.273 0.182 0.191 0.258 116 K 0.034 0.017 0.039 0.241 0.154 0.260 0.254 117 V 0.040 0.021 0.033 0.185 0.182 0.230 0.309 118 N 0.049 0.027 0.031 0.141 0.202 0.177 0.373 119 K 0.062 0.028 0.034 0.133 0.199 0.145 0.399 120 A 0.067 0.031 0.045 0.139 0.197 0.177 0.344 121 S 0.064 0.026 0.045 0.122 0.173 0.187 0.383 122 R 0.074 0.028 0.049 0.122 0.191 0.176 0.360 123 S 0.075 0.028 0.056 0.127 0.182 0.191 0.341 124 G 0.070 0.027 0.054 0.124 0.219 0.183 0.323 125 G 0.067 0.032 0.049 0.122 0.206 0.165 0.358 126 F 0.072 0.033 0.052 0.122 0.178 0.204 0.339 127 G 0.061 0.030 0.045 0.116 0.187 0.215 0.348 128 S 0.060 0.031 0.047 0.111 0.211 0.187 0.352 129 G 0.068 0.027 0.045 0.119 0.201 0.215 0.325 130 S 0.058 0.036 0.047 0.119 0.182 0.184 0.374 131 R 0.057 0.027 0.046 0.130 0.206 0.171 0.364 132 P 0.060 0.025 0.048 0.152 0.157 0.228 0.330 133 A 0.049 0.027 0.048 0.150 0.193 0.167 0.366 134 P 0.044 0.026 0.048 0.168 0.188 0.166 0.361 135 A 0.048 0.023 0.055 0.202 0.140 0.222 0.310 136 Q 0.046 0.020 0.059 0.193 0.161 0.227 0.294 137 T 0.045 0.025 0.055 0.184 0.181 0.160 0.351 138 S 0.044 0.021 0.059 0.212 0.183 0.166 0.315 139 S 0.038 0.018 0.063 0.241 0.130 0.205 0.305 140 A 0.030 0.021 0.061 0.230 0.139 0.186 0.333 141 S 0.033 0.016 0.058 0.196 0.155 0.233 0.310 142 G 0.030 0.019 0.054 0.184 0.151 0.206 0.356 143 D 0.031 0.027 0.052 0.166 0.187 0.146 0.391 144 D 0.035 0.016 0.047 0.148 0.159 0.177 0.419 145 P 0.037 0.020 0.066 0.161 0.149 0.192 0.375 146 W 0.039 0.024 0.072 0.170 0.161 0.144 0.390 147 G 0.040 0.019 0.079 0.182 0.166 0.176 0.338 148 S 0.036 0.024 0.086 0.171 0.135 0.168 0.380 149 A 0.023 0.028 0.088 0.145 0.160 0.179 0.376 150 P 0.018 0.017 0.077 0.121 0.126 0.223 0.418 151 A 0.017 0.012 0.076 0.103 0.153 0.370 0.268 152 S 0.020 0.014 0.072 0.081 0.200 0.307 0.307 153 G 0.025 0.017 0.058 0.064 0.278 0.112 0.446 154 S 0.042 0.034 0.082 0.085 0.140 0.120 0.497 155 F 0.053 0.041 0.090 0.079 0.137 0.105 0.496 156 G 0.053 0.042 0.091 0.071 0.157 0.102 0.485 157 G 0.036 0.025 0.128 0.098 0.133 0.142 0.438 158 G 0.019 0.015 0.156 0.093 0.106 0.149 0.462 159 D 0.012 0.011 0.193 0.077 0.128 0.258 0.321 160 D 0.016 0.007 0.126 0.065 0.179 0.389 0.218 161 E 0.024 0.027 0.073 0.061 0.314 0.151 0.351 162 P 0.029 0.060 0.019 0.048 0.280 0.040 0.524 163 P 0.029 0.026 0.010 0.030 0.030 0.058 0.817 164 F 0.003 0.004 0.004 0.010 0.012 0.009 0.957