# TARGET T0151 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0151.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 4 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 L 0.057 0.003 0.004 0.004 0.132 0.800 2 R 0.243 0.012 0.006 0.006 0.084 0.651 3 Y 0.602 0.020 0.006 0.007 0.054 0.311 4 A 0.738 0.007 0.007 0.006 0.043 0.200 5 T 0.905 0.008 0.003 0.003 0.023 0.058 6 A 0.891 0.004 0.003 0.002 0.024 0.076 7 K 0.899 0.008 0.002 0.003 0.028 0.060 8 V 0.831 0.011 0.007 0.006 0.057 0.088 9 N 0.638 0.009 0.010 0.011 0.130 0.202 10 K 0.434 0.022 0.034 0.025 0.276 0.210 11 A 0.296 0.022 0.030 0.029 0.339 0.283 12 S 0.160 0.034 0.031 0.048 0.364 0.362 13 R 0.085 0.025 0.036 0.052 0.403 0.398 14 S 0.071 0.033 0.070 0.057 0.401 0.368 15 G 0.033 0.011 0.117 0.056 0.414 0.370 16 G 0.025 0.013 0.126 0.029 0.469 0.338 17 F 0.022 0.026 0.091 0.029 0.457 0.375 18 G 0.027 0.013 0.045 0.025 0.462 0.427 19 S 0.048 0.027 0.046 0.032 0.447 0.401 20 G 0.078 0.034 0.060 0.046 0.464 0.318 21 S 0.086 0.036 0.147 0.076 0.410 0.246 22 R 0.078 0.022 0.150 0.064 0.398 0.289 23 P 0.076 0.019 0.166 0.064 0.395 0.281 24 A 0.061 0.025 0.119 0.070 0.379 0.346 25 P 0.066 0.022 0.117 0.073 0.432 0.290 26 A 0.077 0.023 0.110 0.091 0.417 0.282 27 Q 0.094 0.034 0.114 0.077 0.388 0.293 28 T 0.165 0.054 0.112 0.086 0.306 0.277 29 S 0.173 0.037 0.075 0.065 0.295 0.355 30 S 0.121 0.048 0.075 0.064 0.296 0.395 31 A 0.098 0.057 0.074 0.045 0.433 0.293 32 S 0.057 0.023 0.146 0.051 0.542 0.182 33 G 0.041 0.022 0.099 0.058 0.570 0.209 34 D 0.050 0.055 0.045 0.035 0.558 0.258 35 D 0.032 0.030 0.029 0.028 0.553 0.328 36 P 0.024 0.037 0.145 0.065 0.526 0.203 37 W 0.025 0.019 0.241 0.069 0.507 0.140 38 G 0.038 0.021 0.207 0.064 0.498 0.173 39 S 0.057 0.065 0.098 0.046 0.431 0.303 40 A 0.062 0.031 0.058 0.059 0.359 0.431 41 P 0.065 0.054 0.111 0.064 0.397 0.308 42 A 0.059 0.048 0.112 0.069 0.498 0.213 43 S 0.070 0.026 0.096 0.058 0.485 0.265 44 G 0.043 0.017 0.058 0.033 0.519 0.330 45 S 0.036 0.041 0.061 0.024 0.617 0.220 46 F 0.032 0.038 0.051 0.023 0.527 0.328 47 G 0.024 0.030 0.031 0.013 0.511 0.390 48 G 0.023 0.047 0.016 0.011 0.438 0.466 49 G 0.022 0.039 0.018 0.009 0.520 0.391 50 D 0.017 0.019 0.084 0.022 0.614 0.244 51 D 0.023 0.013 0.118 0.022 0.565 0.259 52 E 0.042 0.034 0.093 0.020 0.446 0.364 53 P 0.039 0.029 0.030 0.015 0.195 0.691 54 P 0.016 0.017 0.009 0.014 0.121 0.823 55 F 0.001 0.002 0.001 0.002 0.021 0.974