# TARGET T0151 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0151.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 133 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.037 0.008 0.031 0.038 0.317 0.568 2 A 0.055 0.011 0.079 0.041 0.433 0.382 3 G 0.102 0.016 0.078 0.025 0.400 0.379 4 D 0.243 0.020 0.038 0.011 0.365 0.323 5 T 0.396 0.021 0.011 0.003 0.255 0.315 6 T 0.649 0.005 0.003 0.001 0.102 0.240 7 I 0.939 0.002 0.001 0.001 0.012 0.046 8 T 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 9 I 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 10 V 0.984 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 11 G 0.948 0.002 0.001 0.001 0.006 0.043 12 N 0.881 0.003 0.002 0.002 0.039 0.073 13 L 0.724 0.010 0.005 0.003 0.087 0.171 14 T 0.501 0.030 0.006 0.005 0.254 0.204 15 A 0.227 0.068 0.009 0.009 0.361 0.326 16 D 0.080 0.011 0.006 0.005 0.516 0.382 17 P 0.045 0.002 0.163 0.052 0.570 0.168 18 E 0.359 0.013 0.181 0.054 0.293 0.099 19 L 0.716 0.034 0.063 0.027 0.119 0.041 20 R 0.720 0.008 0.021 0.020 0.088 0.142 21 F 0.812 0.063 0.007 0.007 0.050 0.061 22 T 0.467 0.027 0.014 0.008 0.446 0.039 23 P 0.068 0.002 0.017 0.008 0.872 0.034 24 S 0.012 0.001 0.008 0.001 0.962 0.015 25 G 0.028 0.009 0.006 0.001 0.927 0.029 26 A 0.319 0.012 0.002 0.001 0.266 0.401 27 A 0.849 0.013 0.001 0.001 0.034 0.104 28 V 0.953 0.002 0.001 0.001 0.006 0.039 29 A 0.983 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 30 N 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 31 F 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 32 T 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 33 V 0.976 0.001 0.001 0.001 0.004 0.018 34 A 0.951 0.002 0.001 0.001 0.015 0.031 35 S 0.827 0.015 0.001 0.001 0.045 0.111 36 T 0.435 0.010 0.006 0.003 0.240 0.305 37 P 0.137 0.018 0.101 0.017 0.478 0.249 38 R 0.137 0.014 0.144 0.023 0.432 0.250 39 I 0.142 0.032 0.213 0.041 0.400 0.171 40 Y 0.203 0.070 0.067 0.043 0.298 0.318 41 D 0.090 0.034 0.050 0.056 0.608 0.162 42 R 0.021 0.006 0.078 0.112 0.689 0.093 43 Q 0.017 0.006 0.044 0.100 0.706 0.127 44 T 0.024 0.007 0.023 0.092 0.695 0.158 45 G 0.083 0.016 0.017 0.116 0.379 0.389 46 E 0.223 0.053 0.039 0.144 0.277 0.264 47 W 0.299 0.017 0.068 0.122 0.272 0.222 48 K 0.219 0.015 0.094 0.188 0.277 0.208 49 D 0.150 0.009 0.037 0.150 0.318 0.336 50 G 0.146 0.010 0.034 0.221 0.232 0.356 51 E 0.205 0.027 0.032 0.128 0.215 0.393 52 A 0.270 0.009 0.041 0.096 0.227 0.356 53 L 0.483 0.010 0.030 0.089 0.142 0.246 54 F 0.689 0.009 0.014 0.081 0.065 0.142 55 L 0.832 0.008 0.005 0.046 0.029 0.081 56 R 0.879 0.002 0.005 0.042 0.018 0.054 57 C 0.878 0.004 0.009 0.038 0.019 0.052 58 N 0.843 0.006 0.014 0.043 0.031 0.063 59 I 0.668 0.007 0.030 0.069 0.093 0.132 60 W 0.218 0.009 0.056 0.210 0.218 0.289 61 R 0.044 0.003 0.089 0.338 0.321 0.205 62 E 0.010 0.003 0.152 0.538 0.204 0.094 63 A 0.011 0.005 0.089 0.779 0.082 0.033 64 A 0.009 0.001 0.022 0.902 0.044 0.021 65 E 0.009 0.001 0.012 0.921 0.032 0.026 66 N 0.013 0.003 0.012 0.913 0.030 0.028 67 V 0.014 0.001 0.009 0.891 0.042 0.042 68 A 0.015 0.003 0.029 0.879 0.052 0.023 69 E 0.012 0.003 0.024 0.850 0.067 0.044 70 S 0.008 0.001 0.027 0.775 0.078 0.111 71 L 0.014 0.009 0.030 0.573 0.134 0.240 72 T 0.021 0.013 0.020 0.260 0.578 0.109 73 R 0.039 0.009 0.012 0.118 0.678 0.143 74 G 0.015 0.001 0.003 0.006 0.779 0.195 75 A 0.191 0.009 0.003 0.004 0.589 0.204 76 R 0.750 0.013 0.001 0.002 0.075 0.159 77 V 0.938 0.003 0.001 0.001 0.018 0.040 78 I 0.980 0.001 0.001 0.001 0.005 0.013 79 V 0.980 0.002 0.001 0.001 0.005 0.013 80 S 0.952 0.001 0.001 0.001 0.014 0.033 81 G 0.877 0.002 0.001 0.001 0.037 0.082 82 R 0.867 0.006 0.002 0.002 0.051 0.072 83 L 0.802 0.009 0.005 0.003 0.075 0.106 84 K 0.801 0.011 0.005 0.004 0.091 0.089 85 Q 0.748 0.007 0.010 0.005 0.127 0.103 86 R 0.573 0.006 0.009 0.005 0.197 0.210 87 S 0.664 0.012 0.006 0.005 0.155 0.159 88 F 0.799 0.016 0.009 0.007 0.093 0.076 89 E 0.830 0.065 0.004 0.004 0.054 0.043 90 T 0.376 0.015 0.012 0.011 0.564 0.023 91 R 0.030 0.002 0.031 0.020 0.909 0.009 92 E 0.016 0.002 0.015 0.004 0.953 0.011 93 G 0.045 0.003 0.003 0.001 0.904 0.044 94 E 0.401 0.006 0.001 0.001 0.113 0.479 95 K 0.903 0.019 0.001 0.001 0.016 0.062 96 R 0.935 0.004 0.001 0.001 0.013 0.048 97 T 0.933 0.004 0.001 0.001 0.015 0.048 98 V 0.923 0.003 0.001 0.001 0.018 0.056 99 I 0.954 0.001 0.001 0.001 0.008 0.037 100 E 0.986 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 101 V 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 102 E 0.984 0.002 0.001 0.001 0.003 0.010 103 V 0.954 0.003 0.005 0.005 0.015 0.017 104 D 0.778 0.002 0.023 0.016 0.101 0.079 105 E 0.526 0.015 0.040 0.066 0.243 0.109 106 I 0.182 0.020 0.037 0.151 0.315 0.296 107 G 0.115 0.009 0.024 0.088 0.457 0.306 108 P 0.055 0.004 0.251 0.259 0.320 0.111 109 S 0.138 0.013 0.321 0.282 0.194 0.053 110 L 0.128 0.010 0.372 0.369 0.103 0.019 111 R 0.151 0.004 0.230 0.409 0.118 0.088 112 Y 0.228 0.018 0.170 0.375 0.117 0.091 113 A 0.147 0.015 0.080 0.300 0.150 0.307 114 T 0.057 0.007 0.032 0.152 0.164 0.587 115 A 0.003 0.003 0.006 0.031 0.066 0.892