# TARGET T0151 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0151.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 132 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.040 0.011 0.053 0.066 0.372 0.457 2 A 0.050 0.009 0.123 0.063 0.448 0.307 3 G 0.084 0.012 0.119 0.040 0.421 0.324 4 D 0.215 0.022 0.061 0.020 0.405 0.276 5 T 0.349 0.021 0.016 0.005 0.302 0.307 6 T 0.629 0.005 0.005 0.002 0.121 0.238 7 I 0.947 0.001 0.001 0.001 0.012 0.038 8 T 0.988 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 9 I 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 10 V 0.984 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 11 G 0.948 0.002 0.001 0.001 0.006 0.043 12 N 0.881 0.003 0.002 0.002 0.039 0.073 13 L 0.743 0.010 0.004 0.002 0.082 0.159 14 T 0.520 0.030 0.006 0.005 0.248 0.191 15 A 0.235 0.066 0.008 0.009 0.363 0.320 16 D 0.082 0.011 0.006 0.005 0.531 0.365 17 P 0.044 0.001 0.176 0.052 0.574 0.153 18 E 0.339 0.013 0.201 0.052 0.295 0.099 19 L 0.708 0.034 0.071 0.025 0.120 0.042 20 R 0.721 0.008 0.022 0.017 0.086 0.146 21 F 0.821 0.070 0.006 0.005 0.043 0.056 22 T 0.462 0.029 0.013 0.007 0.456 0.033 23 P 0.053 0.001 0.016 0.008 0.896 0.026 24 S 0.009 0.001 0.007 0.001 0.969 0.012 25 G 0.025 0.009 0.006 0.001 0.937 0.023 26 A 0.305 0.011 0.001 0.001 0.247 0.435 27 A 0.861 0.012 0.001 0.001 0.028 0.098 28 V 0.960 0.002 0.001 0.001 0.005 0.033 29 A 0.986 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 30 N 0.991 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 31 F 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 32 T 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 33 V 0.977 0.001 0.001 0.001 0.004 0.018 34 A 0.951 0.002 0.001 0.001 0.015 0.030 35 S 0.840 0.013 0.001 0.001 0.045 0.099 36 T 0.461 0.009 0.007 0.003 0.234 0.286 37 P 0.154 0.021 0.076 0.014 0.477 0.259 38 R 0.150 0.014 0.108 0.019 0.434 0.275 39 I 0.173 0.034 0.156 0.034 0.398 0.205 40 Y 0.232 0.072 0.051 0.034 0.281 0.329 41 D 0.106 0.037 0.044 0.045 0.607 0.162 42 R 0.025 0.007 0.078 0.086 0.710 0.094 43 Q 0.021 0.007 0.043 0.067 0.739 0.122 44 T 0.034 0.009 0.022 0.058 0.721 0.157 45 G 0.110 0.017 0.013 0.065 0.356 0.438 46 E 0.296 0.056 0.030 0.083 0.254 0.281 47 W 0.388 0.019 0.052 0.069 0.242 0.230 48 K 0.294 0.017 0.074 0.114 0.267 0.234 49 D 0.188 0.009 0.029 0.093 0.297 0.384 50 G 0.193 0.012 0.028 0.150 0.222 0.395 51 E 0.256 0.031 0.025 0.090 0.200 0.399 52 A 0.307 0.009 0.031 0.067 0.215 0.371 53 L 0.514 0.010 0.024 0.059 0.137 0.257 54 F 0.727 0.009 0.011 0.051 0.059 0.142 55 L 0.852 0.008 0.003 0.031 0.026 0.080 56 R 0.896 0.002 0.004 0.029 0.016 0.055 57 C 0.890 0.004 0.009 0.028 0.018 0.051 58 N 0.844 0.006 0.015 0.036 0.032 0.067 59 I 0.667 0.007 0.032 0.060 0.099 0.134 60 W 0.217 0.009 0.056 0.190 0.229 0.298 61 R 0.043 0.003 0.085 0.310 0.339 0.220 62 E 0.009 0.003 0.147 0.533 0.209 0.098 63 A 0.011 0.005 0.089 0.786 0.077 0.032 64 A 0.008 0.001 0.024 0.908 0.040 0.018 65 E 0.008 0.001 0.013 0.927 0.029 0.023 66 N 0.012 0.003 0.014 0.921 0.028 0.023 67 V 0.012 0.001 0.011 0.904 0.038 0.034 68 A 0.012 0.002 0.040 0.877 0.050 0.019 69 E 0.010 0.002 0.033 0.849 0.066 0.040 70 S 0.008 0.001 0.035 0.770 0.080 0.106 71 L 0.016 0.011 0.030 0.537 0.145 0.261 72 T 0.023 0.015 0.018 0.200 0.632 0.112 73 R 0.043 0.009 0.010 0.078 0.723 0.137 74 G 0.018 0.001 0.003 0.005 0.804 0.170 75 A 0.242 0.010 0.002 0.003 0.563 0.179 76 R 0.789 0.012 0.001 0.001 0.059 0.138 77 V 0.947 0.003 0.001 0.001 0.014 0.035 78 I 0.982 0.001 0.001 0.001 0.005 0.012 79 V 0.982 0.001 0.001 0.001 0.004 0.012 80 S 0.960 0.001 0.001 0.001 0.011 0.028 81 G 0.899 0.002 0.001 0.001 0.028 0.069 82 R 0.891 0.005 0.001 0.002 0.040 0.061 83 L 0.827 0.007 0.004 0.003 0.065 0.094 84 K 0.819 0.010 0.004 0.003 0.082 0.081 85 Q 0.760 0.006 0.009 0.005 0.121 0.098 86 R 0.587 0.006 0.009 0.005 0.193 0.201 87 S 0.668 0.012 0.006 0.005 0.154 0.156 88 F 0.801 0.016 0.009 0.007 0.092 0.075 89 E 0.832 0.066 0.004 0.004 0.052 0.041 90 T 0.369 0.015 0.011 0.010 0.574 0.021 91 R 0.031 0.001 0.026 0.018 0.914 0.009 92 E 0.016 0.002 0.012 0.003 0.957 0.010 93 G 0.045 0.003 0.003 0.001 0.907 0.043 94 E 0.419 0.006 0.001 0.001 0.107 0.468 95 K 0.908 0.018 0.001 0.001 0.016 0.058 96 R 0.935 0.003 0.001 0.001 0.013 0.048 97 T 0.936 0.004 0.001 0.001 0.014 0.045 98 V 0.927 0.003 0.001 0.001 0.017 0.053 99 I 0.956 0.001 0.001 0.001 0.008 0.036 100 E 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 101 V 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 102 E 0.983 0.001 0.001 0.001 0.002 0.014 103 V 0.975 0.002 0.001 0.001 0.006 0.016 104 D 0.886 0.002 0.002 0.001 0.042 0.067 105 E 0.804 0.005 0.003 0.002 0.084 0.103 106 I 0.540 0.018 0.007 0.003 0.138 0.293 107 G 0.222 0.023 0.006 0.004 0.208 0.536 108 P 0.069 0.015 0.009 0.007 0.137 0.763 109 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.978