# TARGET T0151 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0151.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 132 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.004 0.002 0.004 0.003 0.986 2 A 0.071 0.018 0.043 0.037 0.021 0.133 0.677 3 G 0.092 0.040 0.048 0.025 0.192 0.183 0.420 4 D 0.139 0.023 0.046 0.026 0.186 0.145 0.434 5 T 0.213 0.007 0.012 0.013 0.231 0.048 0.475 6 T 0.599 0.005 0.008 0.014 0.163 0.020 0.191 7 I 0.942 0.004 0.001 0.005 0.005 0.002 0.041 8 T 0.976 0.001 0.001 0.006 0.003 0.001 0.013 9 I 0.975 0.004 0.001 0.003 0.002 0.001 0.015 10 V 0.897 0.003 0.003 0.006 0.010 0.005 0.077 11 G 0.702 0.008 0.014 0.015 0.074 0.009 0.176 12 N 0.600 0.014 0.025 0.024 0.070 0.017 0.250 13 L 0.466 0.020 0.069 0.027 0.077 0.125 0.215 14 T 0.303 0.023 0.045 0.026 0.160 0.251 0.193 15 A 0.128 0.068 0.021 0.017 0.373 0.165 0.229 16 D 0.056 0.008 0.006 0.005 0.269 0.028 0.628 17 P 0.036 0.005 0.144 0.024 0.163 0.509 0.119 18 E 0.090 0.008 0.170 0.033 0.153 0.430 0.116 19 L 0.384 0.070 0.135 0.045 0.095 0.077 0.193 20 R 0.612 0.025 0.021 0.026 0.056 0.028 0.232 21 F 0.639 0.140 0.007 0.009 0.050 0.032 0.122 22 T 0.154 0.032 0.007 0.002 0.034 0.031 0.741 23 P 0.027 0.004 0.010 0.001 0.133 0.685 0.141 24 S 0.006 0.006 0.007 0.001 0.214 0.741 0.026 25 G 0.013 0.003 0.002 0.001 0.751 0.107 0.124 26 A 0.077 0.007 0.002 0.001 0.169 0.015 0.729 27 A 0.648 0.072 0.001 0.001 0.073 0.004 0.201 28 V 0.951 0.006 0.001 0.001 0.006 0.001 0.036 29 A 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 30 N 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.008 31 F 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 32 T 0.986 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.011 33 V 0.950 0.003 0.001 0.001 0.006 0.002 0.038 34 A 0.777 0.004 0.005 0.003 0.042 0.017 0.153 35 S 0.544 0.020 0.006 0.003 0.184 0.028 0.215 36 T 0.336 0.015 0.007 0.002 0.210 0.024 0.408 37 P 0.273 0.012 0.042 0.009 0.184 0.096 0.383 38 R 0.290 0.032 0.052 0.018 0.179 0.108 0.321 39 I 0.253 0.022 0.053 0.025 0.183 0.078 0.386 40 Y 0.277 0.072 0.022 0.026 0.219 0.074 0.310 41 D 0.122 0.054 0.022 0.020 0.122 0.097 0.563 42 R 0.027 0.008 0.024 0.016 0.160 0.615 0.149 43 Q 0.017 0.005 0.023 0.024 0.157 0.681 0.093 44 T 0.037 0.007 0.020 0.029 0.386 0.337 0.183 45 G 0.094 0.018 0.012 0.037 0.269 0.116 0.454 46 E 0.296 0.092 0.016 0.043 0.150 0.045 0.356 47 W 0.400 0.070 0.025 0.060 0.071 0.055 0.320 48 K 0.347 0.031 0.045 0.035 0.094 0.070 0.379 49 D 0.197 0.010 0.061 0.035 0.175 0.105 0.417 50 G 0.240 0.024 0.040 0.022 0.240 0.042 0.393 51 E 0.390 0.025 0.028 0.008 0.091 0.026 0.432 52 A 0.530 0.005 0.007 0.003 0.075 0.014 0.365 53 L 0.686 0.005 0.006 0.002 0.122 0.012 0.167 54 F 0.895 0.008 0.004 0.004 0.014 0.006 0.069 55 L 0.916 0.005 0.003 0.005 0.007 0.002 0.062 56 R 0.905 0.003 0.002 0.005 0.016 0.002 0.067 57 C 0.909 0.003 0.003 0.010 0.011 0.004 0.060 58 N 0.922 0.003 0.003 0.012 0.009 0.005 0.045 59 I 0.748 0.019 0.012 0.030 0.019 0.024 0.148 60 W 0.459 0.016 0.013 0.046 0.070 0.065 0.331 61 R 0.068 0.004 0.087 0.367 0.186 0.130 0.156 62 E 0.024 0.006 0.066 0.632 0.122 0.063 0.088 63 A 0.010 0.003 0.038 0.855 0.021 0.040 0.033 64 A 0.004 0.001 0.006 0.965 0.006 0.009 0.008 65 E 0.002 0.001 0.003 0.979 0.004 0.008 0.004 66 N 0.001 0.001 0.002 0.982 0.002 0.010 0.002 67 V 0.001 0.001 0.003 0.981 0.002 0.011 0.003 68 A 0.001 0.001 0.010 0.967 0.002 0.018 0.002 69 E 0.001 0.001 0.013 0.920 0.003 0.059 0.004 70 S 0.002 0.001 0.027 0.835 0.008 0.117 0.010 71 L 0.015 0.013 0.033 0.643 0.079 0.121 0.096 72 T 0.026 0.007 0.067 0.430 0.095 0.212 0.162 73 R 0.028 0.004 0.040 0.189 0.196 0.461 0.081 74 G 0.051 0.004 0.017 0.019 0.293 0.417 0.199 75 A 0.083 0.003 0.003 0.001 0.289 0.047 0.574 76 R 0.669 0.007 0.002 0.001 0.108 0.018 0.196 77 V 0.959 0.002 0.001 0.001 0.005 0.001 0.033 78 I 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.008 79 V 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 80 S 0.963 0.001 0.001 0.001 0.006 0.002 0.028 81 G 0.903 0.001 0.001 0.001 0.025 0.006 0.064 82 R 0.905 0.005 0.001 0.001 0.021 0.002 0.065 83 L 0.878 0.008 0.002 0.001 0.014 0.005 0.094 84 K 0.886 0.009 0.003 0.001 0.032 0.013 0.057 85 Q 0.852 0.009 0.004 0.001 0.039 0.017 0.080 86 R 0.619 0.004 0.008 0.001 0.100 0.048 0.220 87 S 0.693 0.018 0.006 0.002 0.087 0.026 0.168 88 F 0.715 0.012 0.006 0.002 0.072 0.024 0.168 89 E 0.716 0.052 0.005 0.003 0.070 0.031 0.122 90 T 0.368 0.023 0.008 0.002 0.050 0.047 0.502 91 R 0.108 0.003 0.012 0.001 0.126 0.645 0.104 92 E 0.031 0.004 0.010 0.001 0.158 0.776 0.020 93 G 0.062 0.001 0.003 0.001 0.603 0.183 0.147 94 E 0.351 0.013 0.001 0.001 0.099 0.005 0.531 95 K 0.849 0.058 0.001 0.001 0.007 0.001 0.084 96 R 0.882 0.003 0.001 0.001 0.011 0.001 0.102 97 T 0.941 0.005 0.001 0.001 0.009 0.001 0.044 98 V 0.931 0.002 0.001 0.001 0.005 0.001 0.060 99 I 0.965 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.026 100 E 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.009 101 V 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 102 E 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 103 V 0.960 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.034 104 D 0.901 0.004 0.002 0.001 0.019 0.005 0.068 105 E 0.704 0.005 0.005 0.004 0.083 0.014 0.186 106 I 0.225 0.013 0.009 0.008 0.176 0.027 0.543 107 G 0.133 0.029 0.007 0.008 0.176 0.030 0.617 108 P 0.052 0.011 0.015 0.011 0.099 0.091 0.721 109 S 0.007 0.004 0.011 0.010 0.081 0.043 0.844