PFRMAT AL TARGET T0149 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 35 PARENT 1cp2A REMARK SCORE 1.4742e-05 I 4 M 1 A 5 R 2 V 6 Q 3 T 7 V 4 L 8 A 5 L 9 I 6 T 10 Y 7 G 11 G 8 F 12 K 9 L 13 G 10 G 14 G 11 A 15 I 12 G 16 G 13 K 17 K 14 T 18 S 15 T 19 T 16 L 20 T 17 L 21 T 18 R 22 Q 19 H 23 N 20 I 24 L 21 L 25 T 22 N 26 S 23 E 27 G 24 Q 28 L 25 H 29 M 28 G 30 G 29 Y 31 K 30 K 32 T 31 I 33 I 32 A 34 M 33 V 35 V 34 I 36 V 35 E 37 G 36 N 38 C 37 E 39 D 38 F 40 P 39 E 42 K 40 V 43 A 41 S 44 D 42 V 45 S 43 D 46 T 44 D 47 R 45 Q 48 L 46 L 49 L 47 I 50 L 48 G 51 G 49 D 52 G 50 R 53 L 51 A 54 A 52 T 55 I 80 Q 56 R 81 I 57 C 82 K 58 V 83 T 59 E 84 L 60 S 85 T 61 G 86 N 62 G 87 G 63 P 88 C 64 E 89 I 65 P 90 C 66 G 91 C 67 V 92 S 68 G 93 R 69 C 94 S 70 A 95 N 71 G 96 E 72 R 97 L 73 G 98 E 74 I 99 D 75 I 100 A 76 T 101 L 77 S 102 L 78 I 103 D 79 N 104 L 80 M 105 L 81 L 106 D 82 E 107 N 83 Q 108 L 84 L 109 D 85 G 110 K 86 A 111 G 87 Y 112 N 88 T 113 I 89 D 114 Q 90 D 115 F 91 L 116 D 92 D 117 R 93 Y 118 L 94 V 119 V 95 F 120 I 96 Y 121 E 97 D 122 C 98 V 123 T 99 L 124 G 100 G 125 M 101 D 126 A 102 V 127 D 103 V 128 P 104 C 129 G 105 G 130 P 106 G 131 I 107 F 132 I 108 A 133 Q 109 M 134 T 110 P 135 F 111 I 136 F 112 R 137 S 113 E 138 H 114 G 139 E 115 K 140 D 124 A 141 G 125 Q 142 V 126 E 143 I 127 I 144 A 128 Y 145 L 129 I 146 V 130 V 147 D 131 A 148 A 132 S 149 V 133 G 150 H 134 E 151 A 135 M 152 D 136 M 153 E 137 A 154 Q 138 L 155 M 139 Y 156 N 140 A 157 Q 141 A 158 F 142 N 159 T 143 N 160 I 144 I 161 A 145 S 162 Q 146 K 163 S 147 G 164 Q 148 I 165 V 149 Q 166 G 150 K 167 Y 151 Y 168 A 152 A 169 D 153 G 177 R 154 G 178 I 155 I 179 L 156 I 180 L 157 C 181 T 158 N 182 K 159 S 183 T 160 R 184 D 161 K 185 V 162 V 186 A 163 A 187 G 164 N 188 E 165 E 189 A 166 Y 190 E 167 E 191 K 168 L 192 L 169 L 193 H 170 D 194 E 171 A 195 R 172 F 196 L 173 A 197 A 174 K 198 R 175 E 199 I 176 L 200 N 177 G 201 A 178 S 202 R 179 Q 203 A 180 L 204 P 181 I 205 V 182 H 206 Y 183 F 207 T 184 V 208 V 185 P 209 T 186 R 210 H 187 S 211 G 188 P 212 D 189 M 213 I 190 V 214 D 191 T 215 L 192 K 216 G 193 A 217 L 194 E 218 L 195 I 219 F 196 N 220 N 197 K 221 T 198 Q 222 N 199 T 223 G 200 V 224 F 201 I 225 M 202 E 226 L 203 Y 227 E 204 D 228 E 205 P 229 N 206 T 230 V 207 C 231 V 208 E 232 S 209 Q 233 T 210 A 234 S 238 E 235 E 239 E 236 V 240 Y 237 S 241 R 238 R 242 E 239 V 243 L 240 M 244 A 241 E 245 R 242 N 246 K 243 L 247 V 244 L 248 D 245 H 294 A 246 S 295 N 247 T 296 E 248 M 297 L 249 V 298 F 250 F 299 V 251 I 300 I 252 G 301 P 253 I 302 K 254 Q 303 P 255 L 304 M 256 P 305 T 257 E 306 Q 258 E 307 E 259 E 308 R 260 I 309 L 261 R 310 E 262 A 311 E 263 A 312 I 264 F 313 L 265 A 314 M 266 G 315 Q 267 L 316 Y 268 R 317 G 269 TER END