# TARGET T0148 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0148.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 17 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.015 0.004 0.002 0.002 0.228 0.748 2 P 0.090 0.046 0.005 0.006 0.093 0.761 3 S 0.238 0.053 0.011 0.009 0.129 0.561 4 F 0.314 0.012 0.023 0.011 0.189 0.451 5 D 0.440 0.025 0.017 0.012 0.155 0.350 6 I 0.485 0.022 0.016 0.016 0.126 0.335 7 V 0.593 0.014 0.010 0.013 0.106 0.265 8 S 0.600 0.009 0.010 0.012 0.125 0.244 9 E 0.484 0.031 0.016 0.015 0.192 0.262 10 I 0.177 0.031 0.013 0.020 0.232 0.526 11 T 0.100 0.011 0.004 0.024 0.127 0.734 12 L 0.012 0.002 0.031 0.836 0.077 0.044 13 H 0.002 0.001 0.019 0.936 0.032 0.010 14 E 0.002 0.001 0.021 0.950 0.021 0.005 15 V 0.002 0.001 0.007 0.966 0.015 0.009 16 R 0.001 0.001 0.002 0.971 0.011 0.015 17 N 0.001 0.001 0.003 0.970 0.012 0.013 18 A 0.001 0.001 0.004 0.960 0.015 0.019 19 V 0.001 0.001 0.005 0.966 0.014 0.013 20 E 0.002 0.001 0.007 0.945 0.023 0.022 21 N 0.002 0.001 0.008 0.922 0.030 0.037 22 A 0.005 0.003 0.011 0.914 0.029 0.038 23 N 0.010 0.003 0.019 0.802 0.070 0.096 24 R 0.014 0.002 0.038 0.710 0.105 0.132 25 V 0.050 0.011 0.053 0.518 0.150 0.218 26 L 0.104 0.017 0.051 0.413 0.184 0.231 27 S 0.136 0.005 0.028 0.195 0.230 0.407 28 T 0.212 0.011 0.026 0.153 0.207 0.392 29 R 0.334 0.023 0.042 0.180 0.175 0.247 30 Y 0.478 0.040 0.042 0.149 0.136 0.155 31 D 0.357 0.029 0.058 0.118 0.283 0.155 32 F 0.165 0.014 0.095 0.068 0.584 0.074 33 R 0.059 0.006 0.057 0.037 0.746 0.095 34 G 0.060 0.002 0.013 0.007 0.768 0.150 35 V 0.347 0.018 0.006 0.003 0.362 0.264 36 E 0.664 0.023 0.003 0.002 0.092 0.217 37 A 0.892 0.005 0.002 0.001 0.032 0.069 38 V 0.934 0.004 0.003 0.001 0.021 0.037 39 I 0.956 0.004 0.002 0.001 0.010 0.028 40 E 0.975 0.002 0.002 0.001 0.008 0.014 41 L 0.964 0.005 0.001 0.001 0.010 0.019 42 N 0.729 0.016 0.005 0.001 0.201 0.048 43 E 0.056 0.005 0.019 0.003 0.906 0.011 44 K 0.022 0.002 0.016 0.002 0.947 0.012 45 N 0.048 0.002 0.005 0.001 0.919 0.026 46 E 0.627 0.008 0.001 0.001 0.208 0.155 47 T 0.945 0.012 0.001 0.001 0.008 0.035 48 I 0.986 0.003 0.001 0.001 0.003 0.008 49 K 0.979 0.001 0.001 0.001 0.005 0.014 50 I 0.955 0.004 0.001 0.001 0.012 0.028 51 T 0.819 0.006 0.003 0.002 0.051 0.120 52 T 0.411 0.013 0.011 0.005 0.260 0.300 53 E 0.072 0.009 0.033 0.013 0.578 0.294 54 S 0.014 0.004 0.065 0.076 0.639 0.202 55 D 0.009 0.003 0.108 0.462 0.361 0.057 56 F 0.014 0.004 0.045 0.668 0.208 0.061 57 Q 0.028 0.012 0.038 0.723 0.111 0.087 58 L 0.025 0.004 0.048 0.848 0.038 0.036 59 E 0.029 0.002 0.057 0.871 0.023 0.017 60 Q 0.018 0.002 0.047 0.896 0.017 0.020 61 L 0.011 0.001 0.017 0.946 0.008 0.016 62 I 0.004 0.001 0.005 0.978 0.005 0.008 63 E 0.001 0.001 0.004 0.980 0.008 0.007 64 I 0.001 0.001 0.005 0.985 0.005 0.004 65 L 0.001 0.001 0.006 0.972 0.011 0.010 66 I 0.001 0.001 0.005 0.984 0.007 0.003 67 G 0.001 0.001 0.003 0.983 0.010 0.004 68 S 0.001 0.001 0.003 0.981 0.010 0.005 69 C 0.001 0.001 0.009 0.968 0.015 0.006 70 I 0.001 0.001 0.014 0.958 0.018 0.009 71 K 0.002 0.001 0.009 0.930 0.031 0.028 72 R 0.003 0.001 0.010 0.837 0.040 0.111 73 G 0.004 0.002 0.001 0.024 0.049 0.919 74 I 0.009 0.023 0.002 0.014 0.092 0.860 75 E 0.010 0.006 0.007 0.023 0.105 0.848 76 H 0.012 0.004 0.692 0.138 0.092 0.062 77 S 0.021 0.002 0.808 0.076 0.058 0.036 78 S 0.030 0.002 0.812 0.086 0.050 0.020 79 L 0.125 0.013 0.369 0.220 0.142 0.131 80 D 0.182 0.034 0.065 0.110 0.202 0.407 81 I 0.125 0.017 0.084 0.123 0.306 0.345 82 P 0.060 0.004 0.090 0.152 0.407 0.288 83 A 0.082 0.014 0.115 0.215 0.387 0.188 84 E 0.160 0.020 0.054 0.232 0.305 0.228 85 S 0.201 0.016 0.033 0.171 0.268 0.310 86 E 0.234 0.017 0.043 0.148 0.341 0.216 87 H 0.247 0.023 0.046 0.091 0.422 0.171 88 H 0.197 0.017 0.039 0.052 0.495 0.199 89 G 0.128 0.004 0.026 0.012 0.612 0.218 90 K 0.245 0.007 0.024 0.007 0.464 0.253 91 L 0.595 0.015 0.010 0.003 0.195 0.182 92 Y 0.841 0.004 0.003 0.002 0.058 0.092 93 S 0.930 0.002 0.001 0.001 0.016 0.050 94 K 0.963 0.002 0.001 0.001 0.008 0.026 95 E 0.979 0.001 0.001 0.001 0.005 0.015 96 I 0.978 0.001 0.001 0.001 0.005 0.015 97 K 0.962 0.002 0.001 0.003 0.011 0.022 98 L 0.859 0.008 0.008 0.014 0.042 0.069 99 K 0.523 0.008 0.025 0.049 0.180 0.215 100 Q 0.188 0.013 0.058 0.105 0.341 0.296 101 G 0.067 0.018 0.029 0.080 0.342 0.464 102 I 0.039 0.032 0.026 0.180 0.267 0.456 103 E 0.024 0.014 0.018 0.296 0.168 0.480 104 T 0.001 0.001 0.008 0.922 0.026 0.042 105 E 0.001 0.001 0.004 0.964 0.017 0.015 106 M 0.001 0.001 0.002 0.987 0.006 0.005 107 A 0.001 0.001 0.001 0.997 0.002 0.001 108 K 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 109 K 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 110 I 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 111 T 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 112 K 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 113 L 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 114 V 0.001 0.001 0.001 0.994 0.003 0.002 115 K 0.001 0.001 0.002 0.985 0.008 0.006 116 D 0.001 0.001 0.003 0.950 0.029 0.017 117 S 0.001 0.001 0.005 0.890 0.044 0.059 118 K 0.004 0.001 0.004 0.080 0.155 0.756 119 I 0.019 0.001 0.005 0.034 0.168 0.774 120 K 0.215 0.014 0.013 0.046 0.155 0.557 121 V 0.649 0.024 0.013 0.069 0.072 0.172 122 Q 0.855 0.006 0.013 0.041 0.032 0.053 123 T 0.883 0.007 0.014 0.023 0.030 0.043 124 Q 0.860 0.005 0.012 0.022 0.058 0.043 125 I 0.687 0.008 0.027 0.039 0.199 0.041 126 Q 0.390 0.011 0.037 0.037 0.438 0.087 127 G 0.150 0.006 0.012 0.008 0.672 0.151 128 E 0.363 0.013 0.010 0.006 0.369 0.239 129 Q 0.718 0.014 0.002 0.005 0.083 0.177 130 V 0.842 0.011 0.002 0.005 0.037 0.102 131 R 0.831 0.016 0.002 0.004 0.048 0.100 132 V 0.784 0.024 0.003 0.004 0.061 0.123 133 T 0.386 0.007 0.008 0.007 0.199 0.392 134 G 0.085 0.011 0.043 0.049 0.577 0.234 135 K 0.019 0.014 0.081 0.135 0.555 0.196 136 S 0.015 0.026 0.034 0.235 0.290 0.400 137 R 0.001 0.001 0.008 0.948 0.025 0.017 138 D 0.001 0.001 0.002 0.981 0.010 0.006 139 D 0.001 0.001 0.001 0.992 0.003 0.002 140 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 141 Q 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 142 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 143 V 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 144 I 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 145 Q 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 146 L 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.001 147 V 0.001 0.001 0.002 0.984 0.007 0.006 148 K 0.001 0.001 0.009 0.937 0.032 0.021 149 S 0.001 0.001 0.018 0.625 0.183 0.173 150 A 0.002 0.001 0.028 0.177 0.370 0.421 151 E 0.009 0.009 0.052 0.132 0.470 0.328 152 L 0.016 0.014 0.047 0.070 0.559 0.295 153 G 0.013 0.005 0.043 0.020 0.455 0.464 154 Q 0.050 0.016 0.041 0.013 0.397 0.484 155 P 0.103 0.007 0.035 0.013 0.249 0.593 156 F 0.322 0.030 0.035 0.022 0.192 0.399 157 Q 0.484 0.014 0.028 0.022 0.141 0.311 158 F 0.609 0.022 0.023 0.023 0.106 0.217 159 N 0.549 0.010 0.014 0.016 0.129 0.281 160 N 0.368 0.014 0.016 0.018 0.193 0.390 161 F 0.160 0.019 0.024 0.026 0.184 0.587 162 R 0.062 0.024 0.012 0.016 0.111 0.775 163 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.025 0.971