PFRMAT AL TARGET T0142 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 3 PARENT 1bix G 1 E 46 S 2 D 47 P 3 P 48 P 4 G 57 A 5 K 58 Q 6 P 59 L 7 A 60 S 8 T 61 V 9 L 62 H 10 K 63 T 11 I 64 V 12 C 65 S 13 S 66 W 14 W 67 N 15 N 68 S 16 V 69 G 17 D 70 H 18 G 71 E 19 L 72 R 20 R 73 A 21 A 74 P 22 W 75 T 23 I 76 N 24 K 77 L 25 K 78 E 26 K 79 E 27 G 80 L 28 L 81 L 29 D 82 G 30 W 83 L 31 V 84 N 32 K 85 S 33 E 86 E 35 E 87 T 36 A 88 P 37 P 89 D 38 D 90 V 39 I 91 I 40 L 92 A 41 C 93 V 42 L 94 Q 45 Q 95 G 46 E 96 D 52 C 99 K 53 S 100 P 54 E 101 Q 55 N 102 Q 56 K 103 G 57 L 104 P 58 P 105 A 59 A 106 C 60 E 107 V 61 L 108 K 62 Q 109 N 63 E 110 F 64 L 111 Q 65 P 112 S 66 G 113 L 67 L 114 L 68 S 115 T 69 H 116 S 70 Q 117 K 71 Y 118 G 72 W 119 Y 73 S 120 T 74 A 121 K 75 P 122 L 76 S 123 K 77 D 124 N 78 K 125 T 79 E 126 I 80 G 127 T 81 Y 128 E 82 S 129 T 83 G 130 M 84 V 131 G 85 G 132 L 86 L 133 T 87 L 134 V 88 S 135 Y 89 R 136 C 90 Q 137 D 96 D 148 Q 97 E 149 N 98 E 150 T 99 H 151 L 100 D 152 K 101 Q 153 N 102 G 155 E 103 R 156 T 104 V 157 I 105 I 158 I 106 V 159 V 107 A 160 T 108 E 161 V 109 F 162 D 110 D 163 R 128 S 164 F 129 F 165 S 130 V 166 F 131 L 167 T 132 V 168 T 133 T 169 S 134 A 170 R 135 Y 171 M 136 V 172 S 137 P 173 D 138 N 174 E 139 A 175 D 140 L 179 V 141 V 180 T 142 R 181 S 143 L 182 T 144 E 183 N 145 Y 184 T 146 R 185 K 147 Q 186 Y 148 R 187 A 149 W 188 Y 150 D 189 D 151 E 190 T 152 A 191 R 153 F 192 L 154 R 193 D 155 K 194 Y 156 F 195 S 157 L 196 K 158 K 197 K 159 G 198 D 160 L 199 D 161 A 200 P 162 S 201 S 163 R 202 D 164 K 203 F 165 P 204 L 166 L 205 F 167 V 206 W 168 L 207 I 169 C 208 G 170 G 209 D 171 D 210 L 172 L 211 N 173 N 212 V 174 V 213 R 175 A 214 V 176 H 215 E 177 E 216 T 178 E 217 N 179 D 219 A 180 L 220 T 181 R 221 H 182 N 222 A 183 P 223 K 184 K 224 S 185 G 225 L 186 N 226 Q 200 E 242 L 201 L 243 K 202 L 244 K 203 Q 245 A 204 A 246 K 205 P 248 E 206 L 249 Q 207 A 250 K 208 D 251 L 209 S 252 F 210 F 253 D 211 R 254 W 213 H 255 T 214 L 256 E 215 Y 257 P 216 P 258 Q 217 N 259 V 218 T 260 T 219 P 261 F 220 Y 262 K 221 A 263 P 222 Y 264 T 223 T 265 Y 224 F 266 K 225 W 267 F 226 T 268 K 227 Y 269 T 230 M 270 D 231 M 271 E 232 N 272 Y 233 A 273 D 234 R 274 L 235 S 275 S 236 K 276 A 237 N 277 T 238 V 278 P 239 G 279 S 240 W 280 W 241 R 281 T 242 L 282 D 243 D 283 R 244 Y 284 A 245 F 285 L 246 L 286 Y 247 L 287 K 248 S 288 S 249 H 289 G 250 S 290 I 255 P 293 Q 256 A 294 P 257 L 295 L 258 C 296 S 259 D 297 Y 260 S 298 N 261 K 299 S 262 I 300 L 263 R 301 T 264 S 302 N 265 K 303 Y 266 A 304 K 267 L 305 Q 268 G 306 T 269 S 307 E 270 D 308 H 271 H 309 R 272 C 310 P 273 P 311 V 274 I 312 L 275 T 313 A 276 L 314 K 277 Y 315 F 278 L 316 R 279 A 317 V 280 L 318 TER END