PFRMAT AL TARGET T0142 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 2 PARENT 1ako V 9 M 1 H 10 K 2 T 11 F 3 V 12 V 4 S 13 S 5 W 14 F 6 N 15 N 7 S 16 I 8 G 17 N 9 H 18 G 10 E 19 L 11 R 20 R 12 A 21 A 13 P 22 R 14 T 23 P 15 N 24 H 16 L 25 Q 17 E 26 L 18 E 27 E 19 L 28 A 20 L 29 I 21 G 30 V 22 L 31 E 23 G 34 Q 26 P 37 P 27 D 38 D 28 A 41 V 29 V 42 I 30 A 43 G 31 V 44 L 32 Q 45 Q 33 G 46 E 34 F 47 T 35 G 48 K 36 F 49 V 37 Q 50 H 38 T 51 D 39 D 52 D 40 K 53 M 41 P 54 F 42 Q 55 P 43 Q 56 L 44 G 57 E 45 P 58 E 46 A 59 V 47 C 60 A 48 S 70 K 49 K 71 L 50 G 72 G 51 Y 73 Y 52 T 74 N 53 K 75 V 54 L 76 F 55 K 77 Y 56 N 78 H 57 T 79 G 58 I 80 Q 59 T 81 K 60 E 82 G 61 T 83 H 62 M 84 Y 63 G 85 G 64 L 86 V 65 T 87 A 66 V 88 L 67 Y 89 L 68 C 90 T 69 L 91 K 70 E 92 E 71 K 93 T 72 H 94 P 73 L 95 I 74 D 96 A 75 T 104 V 76 I 105 R 77 I 106 R 78 V 107 G 79 T 108 F 80 V 109 P 81 D 110 G 82 D 111 D 83 Q 112 D 84 K 114 Q 88 S 115 R 89 G 116 R 90 G 117 I 91 I 118 I 92 V 119 M 93 T 120 A 94 S 121 E 95 F 122 I 96 T 123 P 97 I 124 S 98 Y 125 L 99 N 126 L 100 K 127 G 101 R 128 N 102 F 129 V 103 S 130 T 104 F 131 V 105 T 132 I 106 T 133 N 107 S 134 G 108 R 135 Y 109 M 136 F 110 S 137 P 111 D 138 Q 112 E 139 G 113 D 140 E 114 V 141 S 115 T 142 R 116 S 143 F 122 T 144 P 123 N 145 A 124 T 146 K 125 K 147 A 126 Y 148 Q 127 A 149 F 128 Y 150 Y 129 D 151 Q 130 T 152 N 131 R 153 L 132 L 154 Q 133 D 155 N 134 Y 156 Y 135 S 157 L 136 K 158 E 137 K 159 T 138 D 160 L 140 D 161 K 141 P 162 R 142 S 163 D 143 D 164 N 144 F 165 P 145 L 166 V 146 F 167 L 147 W 168 I 148 I 169 M 149 G 170 G 150 D 171 D 151 L 172 M 152 N 173 N 153 V 174 L 159 R 175 D 160 V 176 I 161 E 177 G 162 T 178 I 163 N 179 G 164 A 180 E 165 T 181 E 166 H 182 N 167 A 183 R 168 K 184 K 169 S 185 R 170 L 186 W 171 V 187 L 172 D 188 R 173 Q 189 T 174 N 190 G 175 N 191 K 176 I 192 C 177 D 193 S 178 G 194 F 179 L 195 L 180 M 196 P 181 A 197 E 182 F 198 E 183 D 199 R 184 Q 200 E 185 L 201 W 186 K 202 M 187 K 203 D 188 A 204 R 189 K 205 L 190 E 206 M 191 Q 207 W 193 K 208 G 194 L 209 L 195 F 210 V 196 D 211 D 197 G 212 T 198 W 213 F 199 T 214 R 200 E 215 H 201 P 216 A 202 K 227 N 203 P 228 P 204 N 229 Q 205 T 230 T 206 D 231 A 207 E 232 D 208 Y 233 R 209 D 234 F 210 L 235 S 211 S 236 W 212 I 255 E 243 Q 256 T 244 P 257 G 245 L 258 I 246 S 259 D 247 Y 260 Y 248 N 261 E 249 S 262 I 250 L 263 R 251 T 264 S 252 N 265 M 253 Y 266 E 254 K 267 K 255 Q 268 P 256 T 269 S 257 E 270 D 258 H 271 H 259 R 272 A 260 P 273 P 261 V 274 V 262 L 275 W 263 A 276 A 264 K 277 T 265 F 278 F 266 R 279 R 267 V 280 R 268 TER END