PFRMAT AL TARGET T0142 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 23 PARENT 1i9yA G 1 Y 534 S 2 D 535 P 3 P 536 P 4 I 537 A 5 K 556 Q 6 N 557 L 7 V 558 S 8 K 559 V 9 I 560 H 10 F 561 T 11 V 562 V 12 A 563 S 13 S 564 W 14 Y 565 N 15 N 566 S 16 L 567 G 17 N 568 H 18 G 569 E 19 C 570 R 20 S 571 A 21 A 572 P 22 T 573 T 23 T 574 N 24 K 575 L 25 L 576 E 26 E 577 E 27 N 578 L 28 W 579 L 29 L 580 G 30 F 581 L 31 P 582 N 32 E 583 S 33 N 584 G 34 T 585 E 35 P 586 T 36 L 587 P 37 A 588 D 38 D 589 V 39 I 590 I 40 Y 591 A 41 V 592 V 42 V 593 A 43 G 594 V 44 F 595 Q 45 Q 596 G 46 E 597 F 47 I 598 G 48 V 599 F 49 A 609 Q 50 D 610 T 51 P 611 D 52 A 612 K 53 K 613 P 54 R 614 Q 55 R 615 Q 56 E 616 G 57 W 617 P 58 E 618 A 59 S 619 C 60 C 620 V 61 V 621 K 62 K 622 N 63 R 623 F 64 L 624 Q 65 L 625 S 66 N 626 L 67 G 627 L 68 T 630 T 69 S 631 S 70 G 632 K 71 P 633 G 72 G 634 Y 73 Y 635 T 74 V 636 K 75 Q 637 L 76 L 638 K 77 R 639 N 78 S 640 T 79 G 641 I 80 Q 642 T 81 L 643 E 82 V 644 T 83 G 645 M 84 T 646 G 85 A 647 L 86 L 648 T 87 M 649 V 88 I 650 Y 89 F 651 C 90 C 652 K 93 K 653 H 94 E 654 L 95 S 655 D 96 C 656 Q 97 L 657 N 98 P 658 T 99 S 659 L 100 I 660 K 101 K 661 N 102 N 662 E 103 V 663 T 104 E 664 I 105 G 665 I 106 T 666 V 107 V 667 T 108 K 668 V 109 K 669 K 113 G 677 K 114 N 678 S 115 K 679 G 116 G 680 G 117 A 681 I 118 V 682 V 119 A 683 T 120 I 684 S 121 R 685 F 122 F 686 T 123 D 687 I 124 Y 688 Y 125 E 689 N 126 D 690 K 127 T 691 R 128 G 692 F 129 L 693 S 130 C 694 F 131 F 695 T 132 I 696 T 133 T 697 S 134 S 698 R 135 H 699 M 136 L 700 S 137 A 701 D 138 A 702 E 139 G 703 D 140 Y 704 V 141 T 705 T 142 N 706 S 143 Y 707 T 144 D 708 N 145 E 709 T 146 R 710 K 147 D 711 Y 148 H 712 A 149 D 713 Y 150 Y 714 D 151 R 715 T 152 T 716 R 153 I 717 L 154 A 718 D 155 S 719 Y 156 G 720 K 159 S 728 D 160 I 729 D 161 F 730 P 162 N 731 S 163 H 732 D 164 D 733 F 165 Y 734 L 166 V 735 F 167 V 736 W 168 W 737 I 169 F 738 G 170 G 739 D 171 D 740 L 172 F 741 N 173 N 742 V 174 Y 743 R 175 R 744 V 176 I 745 E 177 S 746 T 178 L 747 N 179 T 748 A 180 Y 749 T 181 E 750 H 182 E 751 A 183 V 752 K 184 V 753 S 185 P 754 L 186 C 755 V 187 I 756 D 188 A 757 Q 189 Q 758 N 190 G 759 N 191 K 760 I 192 L 761 D 193 S 762 G 194 Y 763 L 195 L 764 M 196 F 765 A 197 E 766 F 198 Y 767 D 199 D 768 Q 200 Q 769 L 201 L 770 K 202 N 771 K 203 K 772 A 204 Q 773 K 205 M 774 E 206 L 775 Q 207 G 777 K 208 K 778 L 209 V 779 F 210 F 780 D 211 P 781 G 212 F 782 W 213 F 783 T 214 S 784 E 215 E 785 P 216 L 786 Q 217 P 787 V 218 I 788 T 219 T 789 F 220 F 790 K 221 P 791 P 222 P 792 T 223 T 793 Y 224 Y 794 K 225 K 795 F 226 F 796 K 227 D 797 P 228 D 801 N 229 I 802 T 230 Y 803 D 231 D 804 E 232 T 805 Y 233 S 806 D 234 D 807 L 235 K 808 S 236 H 809 A 237 R 810 T 238 V 811 P 239 P 812 S 240 A 813 W 241 W 814 T 242 T 815 D 243 D 816 R 244 R 817 A 245 I 818 L 246 L 819 Y 247 Y 820 K 248 R 821 S 249 G 822 G 250 E 823 T 251 L 824 Q 256 V 825 P 257 P 826 L 258 H 827 S 259 S 828 Y 260 Y 829 N 261 Q 830 S 262 S 831 L 263 V 832 N 265 P 833 Y 266 L 834 K 267 Y 835 Q 268 Y 836 T 269 S 837 E 270 D 838 H 271 H 839 R 272 R 840 P 273 P 841 V 274 I 842 L 275 Y 843 A 276 A 844 K 277 T 845 F 278 Y 846 R 279 E 847 V 280 A 848 T 281 N 849 L 282 I 850 TER END