# TARGET T0137 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0137.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 111 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 2 E 0.068 0.027 0.016 0.007 0.005 0.044 0.831 3 A 0.050 0.005 0.049 0.008 0.268 0.353 0.266 4 F 0.187 0.033 0.049 0.007 0.122 0.269 0.333 5 L 0.377 0.022 0.008 0.003 0.067 0.043 0.479 6 G 0.599 0.010 0.003 0.003 0.130 0.027 0.228 7 T 0.776 0.007 0.002 0.001 0.029 0.005 0.180 8 W 0.887 0.004 0.001 0.001 0.010 0.003 0.095 9 K 0.943 0.004 0.001 0.001 0.013 0.002 0.035 10 M 0.921 0.008 0.002 0.002 0.008 0.002 0.058 11 E 0.825 0.005 0.007 0.005 0.034 0.011 0.114 12 K 0.707 0.009 0.014 0.009 0.045 0.018 0.199 13 S 0.453 0.008 0.041 0.025 0.090 0.086 0.296 14 E 0.361 0.018 0.039 0.051 0.191 0.108 0.233 15 G 0.259 0.063 0.016 0.090 0.138 0.044 0.389 16 F 0.011 0.004 0.023 0.847 0.022 0.021 0.072 17 D 0.001 0.001 0.007 0.972 0.005 0.007 0.007 18 K 0.001 0.001 0.003 0.987 0.002 0.005 0.002 19 I 0.001 0.001 0.001 0.991 0.002 0.004 0.001 20 M 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.005 0.001 21 E 0.001 0.001 0.008 0.974 0.001 0.017 0.001 22 R 0.001 0.001 0.035 0.872 0.005 0.086 0.002 23 L 0.001 0.001 0.026 0.142 0.005 0.826 0.001 24 G 0.001 0.002 0.004 0.003 0.010 0.969 0.012 25 V 0.004 0.015 0.001 0.002 0.125 0.010 0.843 26 D 0.011 0.005 0.001 0.005 0.062 0.003 0.914 27 F 0.001 0.001 0.016 0.944 0.014 0.012 0.013 28 V 0.001 0.001 0.006 0.981 0.003 0.007 0.003 29 T 0.001 0.001 0.002 0.991 0.002 0.003 0.001 30 R 0.001 0.001 0.001 0.994 0.002 0.002 0.002 31 K 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.004 0.001 32 M 0.001 0.001 0.002 0.984 0.001 0.012 0.001 33 G 0.001 0.001 0.005 0.960 0.002 0.029 0.003 34 N 0.001 0.001 0.014 0.781 0.006 0.192 0.005 35 L 0.002 0.001 0.014 0.503 0.027 0.426 0.027 36 V 0.013 0.011 0.009 0.187 0.336 0.121 0.322 37 K 0.053 0.008 0.004 0.007 0.227 0.030 0.671 38 P 0.111 0.003 0.005 0.002 0.163 0.043 0.673 39 N 0.641 0.002 0.005 0.001 0.219 0.022 0.111 40 L 0.977 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.019 41 I 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 42 V 0.981 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 43 T 0.911 0.002 0.001 0.001 0.009 0.002 0.076 44 D 0.629 0.008 0.003 0.001 0.049 0.018 0.292 45 L 0.229 0.010 0.018 0.001 0.215 0.262 0.265 46 G 0.071 0.011 0.026 0.001 0.259 0.507 0.125 47 G 0.043 0.004 0.028 0.001 0.261 0.580 0.084 48 G 0.126 0.009 0.017 0.001 0.306 0.321 0.222 49 K 0.748 0.011 0.003 0.001 0.054 0.021 0.163 50 Y 0.935 0.005 0.001 0.001 0.005 0.001 0.054 51 K 0.980 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.015 52 M 0.970 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.026 53 R 0.945 0.004 0.001 0.001 0.007 0.002 0.042 54 S 0.820 0.007 0.002 0.001 0.021 0.006 0.145 55 E 0.585 0.009 0.007 0.001 0.148 0.072 0.178 56 S 0.330 0.009 0.009 0.001 0.218 0.091 0.342 57 T 0.162 0.012 0.011 0.001 0.366 0.240 0.208 58 F 0.225 0.020 0.011 0.002 0.344 0.125 0.274 59 K 0.468 0.023 0.008 0.001 0.245 0.035 0.220 60 T 0.631 0.014 0.003 0.001 0.037 0.010 0.305 61 T 0.884 0.004 0.002 0.001 0.038 0.009 0.062 62 E 0.945 0.006 0.002 0.001 0.007 0.005 0.035 63 C 0.957 0.004 0.001 0.001 0.006 0.002 0.029 64 S 0.926 0.002 0.001 0.001 0.012 0.001 0.057 65 F 0.903 0.008 0.001 0.001 0.012 0.002 0.075 66 K 0.800 0.018 0.001 0.001 0.015 0.005 0.159 67 L 0.548 0.018 0.009 0.002 0.070 0.094 0.258 68 G 0.198 0.021 0.024 0.005 0.336 0.203 0.213 69 E 0.194 0.019 0.026 0.007 0.416 0.067 0.271 70 K 0.458 0.014 0.020 0.008 0.131 0.096 0.273 71 F 0.575 0.029 0.017 0.009 0.060 0.048 0.262 72 K 0.636 0.036 0.013 0.007 0.059 0.015 0.234 73 E 0.644 0.009 0.012 0.006 0.083 0.022 0.224 74 V 0.718 0.061 0.011 0.005 0.057 0.016 0.132 75 T 0.434 0.052 0.011 0.003 0.046 0.026 0.429 76 P 0.212 0.007 0.017 0.004 0.130 0.395 0.235 77 D 0.035 0.005 0.010 0.003 0.151 0.753 0.043 78 S 0.028 0.003 0.009 0.001 0.502 0.341 0.117 79 R 0.190 0.016 0.003 0.001 0.247 0.022 0.521 80 E 0.736 0.075 0.002 0.001 0.022 0.005 0.161 81 V 0.913 0.004 0.001 0.001 0.008 0.001 0.073 82 A 0.944 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.043 83 S 0.948 0.006 0.001 0.001 0.005 0.001 0.039 84 L 0.972 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.024 85 I 0.985 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.012 86 T 0.948 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.047 87 V 0.791 0.003 0.004 0.001 0.014 0.093 0.094 88 E 0.263 0.005 0.014 0.001 0.116 0.555 0.045 89 N 0.005 0.001 0.006 0.001 0.132 0.852 0.005 90 G 0.011 0.001 0.003 0.001 0.073 0.884 0.029 91 V 0.821 0.017 0.001 0.001 0.013 0.009 0.140 92 M 0.983 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 93 K 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.010 94 H 0.983 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.013 95 E 0.975 0.002 0.001 0.001 0.003 0.002 0.017 96 Q 0.960 0.003 0.001 0.001 0.005 0.002 0.029 97 D 0.787 0.004 0.004 0.002 0.028 0.019 0.157 98 D 0.490 0.008 0.009 0.002 0.155 0.129 0.207 99 K 0.143 0.007 0.021 0.002 0.265 0.436 0.125 100 T 0.062 0.006 0.020 0.001 0.471 0.296 0.144 101 K 0.253 0.009 0.012 0.001 0.350 0.094 0.282 102 V 0.705 0.013 0.003 0.001 0.041 0.016 0.221 103 T 0.903 0.006 0.001 0.001 0.009 0.002 0.079 104 Y 0.956 0.003 0.001 0.001 0.004 0.001 0.035 105 I 0.964 0.002 0.002 0.001 0.004 0.001 0.028 106 E 0.981 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.016 107 R 0.980 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.016 108 V 0.984 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 109 V 0.947 0.003 0.001 0.001 0.003 0.004 0.041 110 E 0.617 0.005 0.011 0.001 0.103 0.178 0.085 111 G 0.016 0.001 0.008 0.001 0.141 0.824 0.009 112 N 0.039 0.001 0.010 0.001 0.168 0.735 0.048 113 E 0.787 0.004 0.001 0.001 0.033 0.010 0.165 114 L 0.973 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 115 K 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.009 116 A 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 117 T 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 118 V 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 119 K 0.969 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.027 120 V 0.898 0.002 0.003 0.001 0.033 0.026 0.038 121 D 0.032 0.001 0.008 0.001 0.129 0.822 0.008 122 E 0.022 0.001 0.015 0.001 0.082 0.862 0.019 123 V 0.884 0.004 0.001 0.001 0.010 0.008 0.094 124 V 0.972 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 125 C 0.971 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.023 126 V 0.961 0.002 0.003 0.001 0.006 0.003 0.024 127 R 0.874 0.001 0.019 0.003 0.015 0.006 0.082 128 T 0.869 0.001 0.019 0.005 0.023 0.011 0.072 129 Y 0.880 0.011 0.011 0.009 0.016 0.008 0.064 130 S 0.858 0.004 0.005 0.006 0.031 0.008 0.088 131 K 0.622 0.021 0.004 0.014 0.068 0.025 0.246 132 V 0.216 0.056 0.002 0.007 0.006 0.021 0.691 133 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999