# TARGET T0136 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0136.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 282 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 2 P 0.029 0.047 0.006 0.016 0.006 0.034 0.862 3 A 0.027 0.009 0.031 0.030 0.300 0.126 0.478 4 D 0.043 0.008 0.070 0.049 0.290 0.270 0.271 5 G 0.200 0.015 0.057 0.036 0.189 0.123 0.380 6 V 0.703 0.014 0.014 0.016 0.068 0.022 0.163 7 V 0.885 0.014 0.004 0.010 0.016 0.007 0.064 8 T 0.885 0.006 0.007 0.013 0.009 0.010 0.068 9 G 0.934 0.002 0.005 0.007 0.011 0.010 0.032 10 R 0.898 0.002 0.006 0.013 0.011 0.009 0.060 11 G 0.896 0.002 0.003 0.015 0.010 0.008 0.065 12 T 0.891 0.010 0.003 0.017 0.012 0.021 0.046 13 I 0.805 0.015 0.015 0.010 0.016 0.038 0.101 14 L 0.020 0.002 0.025 0.008 0.057 0.877 0.011 15 G 0.010 0.001 0.004 0.001 0.038 0.940 0.007 16 R 0.598 0.002 0.001 0.001 0.029 0.003 0.367 17 P 0.833 0.002 0.001 0.001 0.032 0.001 0.133 18 V 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 19 H 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 20 A 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 21 A 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 22 S 0.978 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.019 23 Q 0.776 0.002 0.001 0.001 0.077 0.008 0.136 24 D 0.159 0.006 0.006 0.002 0.222 0.033 0.572 25 F 0.076 0.012 0.061 0.012 0.287 0.372 0.180 26 T 0.146 0.047 0.087 0.020 0.259 0.280 0.160 27 V 0.373 0.049 0.075 0.030 0.135 0.151 0.186 28 M 0.337 0.037 0.034 0.055 0.121 0.182 0.235 29 G 0.185 0.024 0.034 0.051 0.174 0.330 0.202 30 G 0.127 0.010 0.028 0.043 0.237 0.282 0.273 31 S 0.148 0.032 0.029 0.048 0.228 0.209 0.305 32 A 0.080 0.053 0.018 0.087 0.299 0.135 0.328 33 G 0.013 0.007 0.007 0.158 0.256 0.042 0.518 34 E 0.001 0.001 0.014 0.893 0.027 0.041 0.023 35 T 0.001 0.001 0.008 0.947 0.007 0.030 0.007 36 Q 0.001 0.001 0.003 0.974 0.004 0.015 0.004 37 S 0.001 0.001 0.001 0.985 0.004 0.006 0.004 38 T 0.001 0.001 0.001 0.990 0.003 0.004 0.003 39 K 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.004 0.002 40 V 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 41 V 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 42 E 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 43 T 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 44 M 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.002 0.001 45 E 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 46 Q 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 47 A 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.003 0.001 48 L 0.001 0.001 0.001 0.979 0.001 0.017 0.001 49 L 0.001 0.001 0.003 0.907 0.003 0.085 0.002 50 T 0.001 0.001 0.003 0.427 0.024 0.533 0.012 51 G 0.001 0.001 0.001 0.026 0.085 0.760 0.126 52 T 0.012 0.004 0.001 0.002 0.150 0.005 0.828 53 P 0.141 0.005 0.001 0.001 0.095 0.003 0.755 54 F 0.861 0.004 0.001 0.001 0.014 0.001 0.119 55 L 0.984 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.009 56 F 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 57 F 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 58 Y 0.954 0.002 0.001 0.001 0.006 0.001 0.036 59 D 0.609 0.004 0.004 0.003 0.053 0.012 0.315 60 S 0.124 0.008 0.014 0.006 0.328 0.072 0.448 61 G 0.039 0.008 0.022 0.009 0.402 0.236 0.283 62 G 0.034 0.018 0.068 0.017 0.315 0.274 0.274 63 A 0.078 0.046 0.048 0.034 0.252 0.064 0.478 64 R 0.088 0.048 0.084 0.085 0.156 0.110 0.429 65 I 0.051 0.016 0.074 0.176 0.136 0.171 0.376 66 Q 0.023 0.013 0.059 0.228 0.146 0.166 0.366 67 E 0.015 0.010 0.054 0.538 0.095 0.141 0.147 68 G 0.018 0.007 0.030 0.658 0.078 0.083 0.127 69 I 0.006 0.002 0.021 0.889 0.027 0.031 0.025 70 D 0.008 0.002 0.024 0.901 0.015 0.028 0.023 71 S 0.004 0.001 0.020 0.928 0.010 0.026 0.012 72 L 0.002 0.001 0.012 0.919 0.012 0.036 0.017 73 S 0.001 0.001 0.006 0.894 0.014 0.070 0.015 74 G 0.001 0.001 0.003 0.866 0.020 0.077 0.033 75 Y 0.001 0.001 0.001 0.973 0.007 0.012 0.006 76 G 0.001 0.001 0.001 0.991 0.003 0.003 0.003 77 K 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.002 0.001 78 M 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 79 F 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 80 F 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 81 A 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.005 0.001 82 N 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.007 0.001 83 V 0.001 0.001 0.003 0.976 0.001 0.018 0.002 84 K 0.001 0.001 0.006 0.886 0.003 0.101 0.003 85 L 0.002 0.003 0.014 0.637 0.045 0.259 0.040 86 S 0.004 0.004 0.035 0.207 0.088 0.535 0.127 87 G 0.013 0.009 0.036 0.081 0.348 0.270 0.243 88 V 0.030 0.007 0.021 0.022 0.293 0.264 0.364 89 V 0.166 0.008 0.002 0.005 0.361 0.018 0.440 90 P 0.321 0.005 0.001 0.002 0.098 0.008 0.565 91 Q 0.914 0.005 0.001 0.001 0.009 0.002 0.068 92 I 0.976 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.019 93 A 0.976 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.020 94 I 0.964 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.030 95 I 0.858 0.005 0.001 0.001 0.017 0.004 0.113 96 A 0.486 0.006 0.002 0.002 0.176 0.022 0.306 97 G 0.175 0.010 0.005 0.001 0.428 0.040 0.340 98 P 0.047 0.018 0.045 0.007 0.390 0.222 0.270 99 C 0.076 0.044 0.058 0.007 0.308 0.274 0.234 100 A 0.114 0.041 0.063 0.013 0.267 0.226 0.275 101 G 0.125 0.018 0.050 0.023 0.313 0.255 0.215 102 G 0.167 0.022 0.066 0.098 0.133 0.301 0.213 103 A 0.273 0.022 0.084 0.097 0.090 0.203 0.231 104 S 0.477 0.016 0.086 0.104 0.083 0.145 0.089 105 Y 0.649 0.020 0.048 0.072 0.049 0.055 0.107 106 S 0.628 0.037 0.038 0.063 0.048 0.043 0.144 107 P 0.493 0.040 0.024 0.028 0.071 0.061 0.283 108 A 0.287 0.017 0.031 0.019 0.109 0.120 0.417 109 L 0.121 0.017 0.167 0.039 0.211 0.292 0.153 110 T 0.086 0.008 0.155 0.028 0.232 0.357 0.132 111 D 0.139 0.005 0.130 0.034 0.206 0.232 0.254 112 F 0.711 0.015 0.021 0.021 0.076 0.029 0.127 113 I 0.885 0.008 0.007 0.012 0.008 0.011 0.068 114 I 0.937 0.003 0.003 0.011 0.008 0.007 0.030 115 M 0.895 0.016 0.004 0.010 0.008 0.007 0.061 116 T 0.484 0.007 0.009 0.004 0.039 0.025 0.432 117 K 0.052 0.004 0.024 0.004 0.141 0.705 0.069 118 K 0.036 0.003 0.017 0.001 0.109 0.757 0.076 119 A 0.203 0.004 0.002 0.001 0.077 0.008 0.706 120 H 0.607 0.002 0.001 0.001 0.252 0.006 0.131 121 M 0.958 0.019 0.001 0.001 0.004 0.002 0.017 122 F 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 123 I 0.971 0.001 0.001 0.001 0.005 0.002 0.021 124 T 0.782 0.007 0.001 0.002 0.040 0.003 0.166 125 G 0.142 0.002 0.001 0.008 0.225 0.007 0.615 126 P 0.003 0.001 0.034 0.784 0.081 0.058 0.041 127 Q 0.002 0.002 0.035 0.914 0.017 0.022 0.008 128 V 0.004 0.001 0.023 0.951 0.005 0.011 0.005 129 I 0.008 0.001 0.012 0.964 0.002 0.007 0.006 130 K 0.025 0.001 0.016 0.919 0.008 0.024 0.007 131 S 0.043 0.001 0.033 0.846 0.012 0.053 0.011 132 V 0.042 0.003 0.032 0.794 0.028 0.074 0.026 133 T 0.065 0.008 0.034 0.637 0.032 0.180 0.042 134 G 0.051 0.003 0.029 0.302 0.080 0.400 0.135 135 E 0.047 0.010 0.024 0.153 0.233 0.106 0.428 136 D 0.105 0.029 0.026 0.083 0.165 0.051 0.540 137 V 0.076 0.046 0.033 0.084 0.146 0.046 0.568 138 T 0.035 0.015 0.018 0.045 0.087 0.032 0.768 139 A 0.006 0.002 0.348 0.298 0.054 0.212 0.080 140 D 0.005 0.002 0.380 0.255 0.078 0.224 0.057 141 E 0.005 0.006 0.432 0.234 0.082 0.151 0.090 142 L 0.013 0.008 0.101 0.270 0.173 0.204 0.232 143 G 0.027 0.009 0.032 0.163 0.124 0.335 0.310 144 G 0.027 0.015 0.025 0.245 0.183 0.114 0.390 145 A 0.026 0.015 0.016 0.486 0.073 0.031 0.352 146 E 0.016 0.003 0.020 0.823 0.025 0.025 0.088 147 A 0.029 0.003 0.018 0.873 0.012 0.021 0.044 148 H 0.042 0.003 0.012 0.863 0.015 0.020 0.044 149 M 0.043 0.002 0.016 0.865 0.020 0.022 0.031 150 A 0.036 0.003 0.025 0.852 0.018 0.034 0.032 151 I 0.028 0.005 0.031 0.738 0.037 0.128 0.034 152 S 0.017 0.001 0.011 0.246 0.068 0.617 0.040 153 G 0.039 0.005 0.004 0.030 0.168 0.521 0.233 154 N 0.195 0.023 0.005 0.011 0.067 0.016 0.683 155 I 0.621 0.021 0.009 0.012 0.033 0.009 0.295 156 H 0.726 0.005 0.017 0.013 0.066 0.013 0.160 157 F 0.843 0.009 0.016 0.011 0.024 0.010 0.086 158 V 0.834 0.012 0.007 0.008 0.021 0.009 0.109 159 A 0.630 0.021 0.006 0.010 0.074 0.017 0.242 160 E 0.197 0.017 0.008 0.014 0.195 0.040 0.530 161 D 0.017 0.008 0.013 0.034 0.342 0.054 0.532 162 D 0.005 0.004 0.028 0.325 0.218 0.076 0.345 163 D 0.001 0.001 0.035 0.873 0.026 0.053 0.012 164 A 0.001 0.001 0.023 0.919 0.012 0.035 0.010 165 A 0.001 0.001 0.009 0.957 0.005 0.018 0.009 166 E 0.001 0.001 0.002 0.978 0.005 0.010 0.005 167 L 0.001 0.001 0.001 0.978 0.003 0.013 0.004 168 I 0.001 0.001 0.001 0.976 0.002 0.016 0.005 169 A 0.001 0.001 0.001 0.986 0.003 0.006 0.004 170 K 0.001 0.001 0.001 0.991 0.002 0.004 0.001 171 K 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.007 0.001 172 L 0.001 0.001 0.002 0.987 0.001 0.008 0.001 173 L 0.001 0.001 0.005 0.978 0.001 0.013 0.002 174 S 0.001 0.001 0.014 0.896 0.003 0.083 0.003 175 F 0.001 0.001 0.022 0.792 0.009 0.166 0.010 176 L 0.002 0.006 0.027 0.577 0.155 0.092 0.141 177 P 0.003 0.004 0.119 0.408 0.076 0.192 0.199 178 Q 0.003 0.003 0.204 0.323 0.075 0.273 0.119 179 N 0.003 0.005 0.205 0.259 0.111 0.253 0.163 180 N 0.008 0.009 0.106 0.162 0.180 0.239 0.295 181 T 0.017 0.007 0.073 0.115 0.161 0.252 0.374 182 E 0.022 0.018 0.061 0.092 0.246 0.133 0.427 183 E 0.026 0.016 0.030 0.089 0.225 0.053 0.562 184 A 0.030 0.011 0.025 0.058 0.060 0.044 0.772 185 S 0.044 0.010 0.038 0.052 0.052 0.053 0.750 186 F 0.098 0.039 0.074 0.081 0.085 0.064 0.560 187 V 0.091 0.057 0.057 0.106 0.120 0.052 0.516 188 N 0.043 0.011 0.050 0.070 0.113 0.115 0.599 189 P 0.023 0.009 0.041 0.033 0.153 0.213 0.528 190 N 0.023 0.032 0.042 0.030 0.281 0.113 0.479 191 N 0.017 0.026 0.025 0.031 0.287 0.041 0.573 192 D 0.013 0.011 0.031 0.042 0.116 0.078 0.709 193 V 0.011 0.012 0.070 0.075 0.146 0.199 0.488 194 S 0.012 0.017 0.095 0.133 0.184 0.208 0.352 195 P 0.009 0.010 0.074 0.124 0.128 0.070 0.585 196 N 0.012 0.010 0.178 0.312 0.097 0.135 0.256 197 T 0.037 0.013 0.263 0.277 0.081 0.159 0.170 198 E 0.045 0.023 0.283 0.252 0.070 0.150 0.177 199 L 0.060 0.019 0.218 0.306 0.065 0.118 0.215 200 R 0.071 0.013 0.232 0.221 0.075 0.205 0.184 201 D 0.077 0.008 0.161 0.128 0.120 0.198 0.307 202 I 0.109 0.061 0.058 0.090 0.110 0.045 0.527 203 V 0.114 0.142 0.014 0.037 0.131 0.019 0.543 204 P 0.057 0.023 0.027 0.025 0.109 0.103 0.655 205 I 0.013 0.016 0.056 0.023 0.254 0.198 0.439 206 D 0.010 0.018 0.053 0.021 0.272 0.134 0.493 207 G 0.008 0.006 0.064 0.028 0.213 0.427 0.253 208 K 0.010 0.009 0.042 0.021 0.327 0.326 0.266 209 K 0.016 0.045 0.013 0.017 0.462 0.031 0.417 210 G 0.022 0.065 0.005 0.017 0.004 0.023 0.864 211 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999