PFRMAT AL TARGET T0136 AUTHOR UCSC SAM_T02 server METHOD This pairwise alignment was produced using the SAM_T02 method METHOD METHOD ---------------- Citation (SAM-T02) ---------------------- METHOD K. Karplus, R. Karchin, C. Barrett, S. Tu, M. Cline, METHOD M. Diekhans, L. Grate, J. Casper, R. Hughey METHOD What is the value added by human intervention in METHOD protein structure prediction? Proteins 45(S5):86-91,2001 METHOD MODEL 47 PARENT 7odcA REMARK SCORE 3.7833e-01 H 57 S 2 S 58 S 3 F 59 F 4 D 60 T 5 E 61 K 6 V 62 D 7 G 63 E 8 A 64 T 19 F 65 A 20 R 66 K 21 K 67 D 22 H 68 I 23 R 69 L 24 T 70 D 25 T 71 Q 26 L 72 K 27 F 73 I 28 G 74 N 29 P 81 D 36 A 82 K 37 D 83 D 38 G 84 A 39 V 85 F 40 A 100 Y 41 S 101 V 42 Q 102 A 43 D 103 D 44 F 104 L 45 L 151 G 46 S 152 D 47 G 153 I 48 Y 154 L 49 G 155 K 50 K 156 K 51 M 157 H 52 F 158 L 53 F 159 R 54 A 160 W 55 N 161 L 56 V 162 K 57 K 163 A 58 L 164 L 59 S 165 P 60 G 166 R 61 V 167 V 62 V 168 T 63 P 169 P 64 Q 170 F 65 I 171 Y 66 A 172 A 67 I 173 V 68 I 174 K 69 A 175 C 70 G 176 N 71 P 177 D 72 C 178 S 73 A 179 R 74 G 180 A 75 G 181 I 76 A 182 V 77 S 183 S 78 Y 184 T 79 S 185 L 80 P 186 A 81 A 187 A 82 L 188 I 83 T 189 G 84 D 190 T 85 H 199 G 86 M 200 F 87 F 201 D 88 I 202 C 89 T 203 A 90 G 204 S 91 P 205 K 92 Q 206 T 93 V 207 E 94 I 208 I 95 K 209 Q 96 S 210 L 97 V 211 V 98 T 212 Q 99 G 213 G 100 E 214 L 101 D 215 G 102 V 216 V 103 T 217 P 104 A 218 A 105 D 219 E 106 E 220 Q 116 L 221 V 117 G 222 S 118 G 223 Q 119 A 224 I 120 E 225 K 121 H 227 Y 122 M 228 A 123 A 229 A 124 I 230 S 125 S 231 N 126 G 232 G 127 N 233 V 128 I 234 Q 129 H 235 M 130 F 236 M 131 V 237 T 132 A 238 F 133 E 239 D 134 D 240 S 135 D 241 E 136 D 242 I 137 A 243 E 138 A 244 L 139 E 245 M 140 L 246 K 141 I 247 V 142 A 248 A 143 K 249 R 144 K 250 A 145 L 251 H 146 L 252 P 147 N 258 K 148 N 259 A 149 T 260 K 150 E 261 L 151 E 262 V 152 A 263 L 153 S 264 R 154 F 265 I 155 V 266 A 156 N 267 T 157 K 288 K 169 G 289 F 170 Y 290 G 171 D 291 A 172 V 292 T 173 R 293 L 174 D 294 K 175 V 295 T 176 I 296 S 177 A 297 R 178 K 298 L 179 I 299 L 180 V 300 L 181 D 301 E 182 W 302 R 183 G 303 A 184 D 304 K 185 Y 305 E 186 L 306 L 187 G 329 D 190 I 330 V 191 V 331 I 192 A 332 G 193 N 333 V 194 Q 334 S 195 P 335 F 196 S 336 H 197 V 337 V 198 M 338 G 199 S 339 S 200 G 340 G 201 C 341 C 202 L 342 T 203 D 343 D 204 I 344 P 205 N 345 D 206 A 346 T 207 S 347 F 208 D 348 V 209 K 349 Q 210 A 350 A 211 A 351 V 212 E 352 S 213 F 353 D 214 V 354 A 215 N 355 R 216 F 356 C 217 C 357 V 218 D 358 F 219 S 359 D 220 I 362 F 227 L 367 L 231 V 368 L 232 D 369 D 233 V 370 I 234 P 371 G 235 G 372 G 236 F 373 G 237 L 374 F 238 P 375 P 239 G 376 G 240 V 377 S 241 Q 378 E 242 Q 379 D 243 E 380 T 244 Y 381 K 245 G 382 L 246 G 383 K 247 I 384 F 248 I 385 E 249 R 386 E 250 H 387 I 251 G 388 T 252 A 389 S 253 K 390 V 254 M 391 I 255 L 392 N 256 Y 393 P 257 A 394 A 258 Y 395 L 259 S 396 D 260 E 397 K 261 A 398 Y 262 T 399 F 263 V 400 G 268 P 401 V 269 K 402 R 270 I 403 I 271 T 404 I 272 V 405 A 273 V 406 E 274 L 407 P 275 R 408 G 276 K 409 R 277 A 410 Y 278 Y 411 Y 279 G 412 V 280 G 413 A 281 S 414 S 282 Y 415 A 283 L 416 F 284 A 417 T 285 M 418 L 286 C 419 A 287 A 445 V 288 N 446 N 289 V 447 I 290 I 448 I 291 F 449 A 292 R 450 K 293 K 451 K 294 E 452 T 295 D 457 K 418 TER END