# TARGET T0132 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0132.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 89 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.022 0.007 0.005 0.019 0.143 0.804 2 S 0.049 0.027 0.026 0.044 0.233 0.620 3 A 0.060 0.023 0.039 0.046 0.282 0.550 4 N 0.083 0.032 0.042 0.039 0.348 0.455 5 F 0.102 0.028 0.022 0.024 0.342 0.482 6 T 0.099 0.019 0.012 0.010 0.346 0.513 7 D 0.088 0.023 0.044 0.018 0.385 0.441 8 K 0.122 0.011 0.046 0.015 0.321 0.486 9 N 0.290 0.022 0.063 0.024 0.237 0.363 10 G 0.400 0.039 0.022 0.023 0.138 0.378 11 R 0.313 0.037 0.017 0.019 0.142 0.472 12 Q 0.151 0.028 0.019 0.022 0.258 0.522 13 S 0.066 0.015 0.029 0.021 0.586 0.284 14 K 0.039 0.006 0.071 0.024 0.750 0.110 15 G 0.086 0.004 0.040 0.017 0.708 0.146 16 V 0.571 0.013 0.012 0.006 0.262 0.137 17 L 0.855 0.007 0.001 0.003 0.031 0.103 18 L 0.949 0.004 0.001 0.002 0.009 0.035 19 L 0.963 0.003 0.001 0.002 0.008 0.024 20 R 0.945 0.001 0.001 0.002 0.014 0.036 21 T 0.903 0.002 0.002 0.003 0.026 0.064 22 L 0.871 0.008 0.002 0.004 0.033 0.081 23 A 0.650 0.027 0.002 0.007 0.074 0.239 24 M 0.326 0.019 0.008 0.012 0.185 0.450 25 P 0.098 0.018 0.303 0.039 0.361 0.182 26 S 0.060 0.009 0.438 0.035 0.341 0.117 27 D 0.065 0.018 0.467 0.035 0.319 0.096 28 T 0.133 0.090 0.112 0.036 0.343 0.286 29 N 0.064 0.045 0.027 0.028 0.705 0.131 30 A 0.019 0.008 0.062 0.056 0.791 0.065 31 N 0.020 0.003 0.037 0.035 0.841 0.063 32 G 0.105 0.010 0.029 0.041 0.730 0.084 33 D 0.543 0.035 0.006 0.062 0.125 0.227 34 I 0.700 0.092 0.004 0.059 0.062 0.082 35 F 0.436 0.020 0.008 0.156 0.150 0.230 36 G 0.168 0.009 0.013 0.420 0.156 0.234 37 G 0.042 0.008 0.010 0.598 0.092 0.250 38 W 0.003 0.001 0.004 0.976 0.006 0.011 39 I 0.003 0.001 0.004 0.984 0.004 0.004 40 M 0.001 0.001 0.003 0.990 0.003 0.002 41 S 0.001 0.001 0.004 0.988 0.005 0.002 42 Q 0.001 0.001 0.004 0.989 0.005 0.002 43 M 0.001 0.001 0.001 0.992 0.004 0.003 44 D 0.001 0.001 0.001 0.991 0.003 0.005 45 M 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 46 G 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.002 47 G 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 48 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 49 I 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 50 L 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 51 A 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 52 K 0.001 0.001 0.002 0.992 0.004 0.002 53 E 0.001 0.001 0.003 0.979 0.010 0.006 54 I 0.005 0.003 0.006 0.907 0.056 0.024 55 A 0.020 0.014 0.013 0.267 0.471 0.216 56 H 0.009 0.002 0.011 0.035 0.741 0.202 57 G 0.054 0.007 0.010 0.014 0.713 0.202 58 R 0.396 0.012 0.005 0.006 0.272 0.309 59 V 0.868 0.005 0.001 0.002 0.037 0.088 60 V 0.954 0.003 0.001 0.001 0.010 0.032 61 T 0.977 0.003 0.001 0.001 0.005 0.014 62 V 0.961 0.001 0.001 0.001 0.011 0.024 63 A 0.914 0.003 0.001 0.001 0.027 0.054 64 V 0.736 0.005 0.014 0.005 0.171 0.069 65 E 0.321 0.003 0.044 0.011 0.468 0.153 66 S 0.525 0.007 0.022 0.007 0.321 0.119 67 M 0.831 0.021 0.007 0.002 0.095 0.044 68 N 0.895 0.003 0.002 0.001 0.046 0.053 69 F 0.911 0.002 0.003 0.001 0.050 0.033 70 I 0.828 0.007 0.003 0.001 0.079 0.083 71 K 0.854 0.005 0.001 0.001 0.050 0.088 72 P 0.837 0.006 0.002 0.001 0.048 0.106 73 I 0.713 0.022 0.002 0.001 0.066 0.196 74 S 0.496 0.026 0.003 0.002 0.404 0.069 75 V 0.138 0.010 0.006 0.001 0.782 0.063 76 G 0.057 0.001 0.002 0.001 0.884 0.056 77 D 0.554 0.009 0.001 0.001 0.378 0.057 78 V 0.949 0.005 0.001 0.001 0.010 0.036 79 V 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 80 C 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 81 C 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 82 Y 0.987 0.001 0.001 0.001 0.004 0.009 83 G 0.975 0.001 0.001 0.001 0.007 0.017 84 Q 0.982 0.001 0.001 0.001 0.008 0.009 85 C 0.970 0.001 0.001 0.001 0.014 0.014 86 L 0.948 0.001 0.001 0.001 0.029 0.020 87 K 0.869 0.008 0.002 0.002 0.084 0.035 88 V 0.513 0.007 0.008 0.006 0.374 0.093 89 G 0.164 0.005 0.010 0.009 0.654 0.158 90 R 0.296 0.011 0.008 0.004 0.474 0.207 91 S 0.697 0.025 0.002 0.001 0.123 0.152 92 S 0.858 0.003 0.001 0.001 0.030 0.108 93 I 0.969 0.001 0.001 0.001 0.005 0.025 94 K 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 95 I 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 96 K 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 97 V 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 98 E 0.977 0.001 0.001 0.001 0.004 0.018 99 V 0.931 0.002 0.001 0.001 0.013 0.053 100 W 0.877 0.005 0.002 0.003 0.032 0.080 101 V 0.736 0.011 0.015 0.013 0.100 0.125 102 K 0.464 0.013 0.035 0.036 0.252 0.201 103 K 0.240 0.023 0.045 0.041 0.423 0.228 104 V 0.173 0.015 0.059 0.090 0.491 0.172 105 A 0.106 0.020 0.065 0.139 0.494 0.176 106 S 0.070 0.014 0.039 0.104 0.579 0.195 107 E 0.059 0.008 0.027 0.061 0.601 0.245 108 P 0.085 0.015 0.029 0.041 0.519 0.311 109 I 0.109 0.026 0.035 0.045 0.504 0.281 110 G 0.139 0.008 0.031 0.037 0.368 0.416 111 E 0.357 0.020 0.029 0.047 0.220 0.328 112 R 0.575 0.017 0.017 0.040 0.131 0.220 113 Y 0.727 0.008 0.008 0.027 0.076 0.153 114 C 0.793 0.009 0.006 0.018 0.054 0.120 115 V 0.832 0.008 0.005 0.012 0.048 0.096 116 T 0.840 0.005 0.006 0.009 0.053 0.086 117 D 0.905 0.002 0.005 0.004 0.032 0.051 118 A 0.950 0.001 0.002 0.002 0.017 0.027 119 V 0.982 0.001 0.001 0.001 0.006 0.009 120 F 0.990 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 121 T 0.988 0.001 0.001 0.001 0.004 0.008 122 F 0.977 0.001 0.001 0.001 0.005 0.016 123 V 0.945 0.001 0.001 0.001 0.013 0.040 124 A 0.858 0.006 0.001 0.001 0.033 0.102 125 V 0.658 0.091 0.001 0.001 0.053 0.197 126 D 0.123 0.068 0.001 0.001 0.759 0.048 127 N 0.004 0.001 0.004 0.001 0.984 0.007 128 N 0.003 0.001 0.003 0.001 0.987 0.006 129 G 0.019 0.017 0.003 0.001 0.945 0.016 130 R 0.173 0.046 0.001 0.001 0.171 0.609 131 S 0.453 0.216 0.003 0.001 0.059 0.269 132 R 0.392 0.054 0.005 0.001 0.114 0.435 133 T 0.261 0.056 0.006 0.002 0.130 0.544 134 I 0.140 0.035 0.007 0.002 0.180 0.635 135 P 0.166 0.028 0.014 0.003 0.321 0.469 136 R 0.114 0.024 0.010 0.003 0.382 0.467 137 E 0.080 0.009 0.007 0.003 0.298 0.604 138 N 0.112 0.040 0.005 0.004 0.188 0.650 139 N 0.150 0.026 0.005 0.005 0.155 0.659 140 Q 0.128 0.037 0.006 0.012 0.141 0.675 141 E 0.042 0.013 0.002 0.011 0.111 0.821 142 L 0.015 0.003 0.002 0.053 0.105 0.823 143 E 0.001 0.001 0.010 0.912 0.032 0.043 144 K 0.001 0.001 0.008 0.938 0.032 0.020 145 A 0.001 0.001 0.010 0.954 0.027 0.008 146 L 0.003 0.001 0.007 0.936 0.032 0.021 147 A 0.002 0.001 0.007 0.908 0.044 0.037 148 L 0.002 0.001 0.010 0.912 0.040 0.036 149 I 0.003 0.001 0.015 0.842 0.076 0.062 150 S 0.004 0.001 0.018 0.849 0.077 0.051 151 E 0.007 0.002 0.027 0.745 0.100 0.119 152 Q 0.010 0.004 0.032 0.322 0.177 0.455 153 P 0.012 0.006 0.025 0.191 0.148 0.618 154 L 0.001 0.001 0.003 0.019 0.049 0.927