Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30 40 50 | | | | | 1 DHVSDSFL..ETNVPLLVLIEAAK.....NGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLA..C..... 2 DHVSDSFL..ETNVPLLVLIEAAK.....NGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLA..C..... 3 DHVSDSFL..ETNVPLLVLIEAAK.....NGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLA..C..... 4 DHVSDSFL..ETNVPLLVLIEAAK.....NGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLA..C..... 5 DHVSDSFL..ETNVPLLVLIEAAK.....NGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLA..C..... 6 DHVSDSFL..ETNVPLLVLIEAAK.....NGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLA..C..... 7 DHVSDSFL..ETNVPLLVLIEAAK.....NGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLA..C..... 8 DHVSDSFL..ETNVPLLVLIEAAK.....NGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLA..C..... 9 DHVSDSFL..ETNVPLLVLIVAAK.....SGNEAEVEKYAKVFQEHANKLVEVANLA..C..... 10 DHISDSFL..ETNVPLLVLIEAAK.....SGNEKEVKEYAQVFREHANKLVEVANLA..C..... 11 DHISDSFL..ETNVPLLVLIEAAK.....SGNEKEVKEYAQVFREHANKLVEVANLA..C..... 12 DHISDSFL..ETNVPLLVLIEAAK.....SGNEKEVKEYAQVFREHANKLVEVANLA..C..... 13 DHISDSFL..ETNVPLLVLIEAAK.....SGNEKEVKEYAQVFREHANKLVEVANLA..C..... 14 DHISDSFL..ETNVPLLVLIEAAK.....SGNEKEVKEYAQVFREHANKLVEVANLA..C..... 15 DHVSDSFL..ETTTPLLDLIEAAK.....SGNEKKVREKSEIFTKHAEKLVEVANLV..C..... 16 DHVSDSFL..ETTTPLLDLIEAAK.....SGNEKKVREKSEIFTKHAEKLVEVANLV..C..... 17 QEVSDVFS..DTTTPIKLLAVAATapsdtPNREEVFEERAANFENHAARLGATAEKA..A..... 18 QEVSDVFS..DTTTPIKLLAVAATapsdtPNREEVFEERAANFENHAARLGATAEKA..A..... 19 DHISDAFL..DTRTPLILLIEAAK.....EGHEENTRYRSKMFQEHANEIVSVARLS..C..... 20 QEVSDVFS..DTTTPIKLLAVAATapsdtPNREEVFEERAANFENHAARLGATAEKA..A..... 21 DHISDAFL..DTRTPLILLIEAAK.....EGHEENTRYRSKMFQEHANEIVSVARLS..C..... 22 DHVSDSFL..DTTVPLLVLIEAAK.....NGREKEIKEYAAIFHEHTSRLVEVANLA..C..... 23 NRIVQDFM..DVSTPLKQFTEAVLqpegtPGREQNFNQKSNNLQAFSDRASKTSRMVaaG..... 24 NRIVQDFM..DVSTPLKQFTEAVLqpegtPGREQNFNQKSNNLQAFSDRASKTSRMVaaG..... 25 NRIVQDFM..DVSTPLKQFTEAVLqpegtPGREQNFNQKSNNLQAFSDRASKTSRMVaaG..... 26 QEVSDVFS..DTTTPIKLLAVAATappdaPNREEVFDERAANFENHSGRLGATAEKA..A..... 27 DRVVDDFA..DITTPLKQFVEAVHadpydPNREQNFVDKSQRLTDHSQSMTTTARLVasC..... 28 DRVVDDFA..DITTPLKQFVEAVHadpydPNREQNFVDKSQRLTDHSQSMTTTARLVasC..... 29 QEVSDVFS..DTTTPIKLLAVAATappdaPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKA..A..... 30 QEVSDVFS..DTTTPIKLLAVAATappdaPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKA..A..... 31 DRVVEDFA..DISTPLKQFVDAVYasptiVNRELSFEEKAHNLDDHSSRCANTALLVakC..... 32 ------FH..ADHVVLKALKVTGV.....EGNLEALAEYACKLSEQKEQLVETCRLL..R..... 33 EQISEVLRanEDQVLLSSMKACAV.....SGDIDGVEKYMHKFREHADHMQEVCRLL..H..... 34 EDFNESLK..ICSKLVKSFHVLAT.....NYDIDNLNQRSSKFHDCCDHIFDICKLL..Q..... 35 ------YH..ADHVVLKALKLTGV.....EGNLEALAEYACKLSEQKEQLVETCRLL..R..... 36 ------YH..ADHVVLKALKLTGV.....EGNLEALAEYACKLSEQKEQLVETCRLL..R..... 37 DHVSDSFL..ETTTPLIDLIDAAK.....SGNEKKVREKAEIFTKHAEKLVEVANLV..C..... 38 --------..--------------.....-ERMEDFTDSAYTSHEHRERILELSTQA..Rm17kk 60 70 80 90 100 110 | | | | | | 1 SISN.NEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAA.LALAAKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTDA 2 SISN.NEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAA.LALAAKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTDA 3 SISN.NEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAA.LALAAKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTDA 4 SISN.NEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAA.LALAAKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTDA 5 SISN.NEEGVKLVRMAASQLETLCPQVINAA.LALAAKPNSKVAQDNMDLFKDQWEKQVRVLTDA 6 SISN.NEEGVKLVRISAGQLESLCPQVINAA.LALAAKPNSKMAQENMDLYKEQWERQVRVLTDA 7 SISN.NEEGVKLVRMSASQLEAGCPQVINAAtWALAPKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTDA 8 SISN.NEEGVKLVRMSASQLEAGCPQVINAAtWALAPKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTDA 9 SMSN.NEEGVKMVRMAATQIENLCPQVINAA.RILVARPRSKAAQDNMDVFKDQWETQVRLLTEA 10 SISN.NEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAA.LTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEA 11 SISN.NEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAA.LTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEA 12 SISN.NEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAA.LTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEA 13 SISN.NEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAA.LTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEA 14 SISN.NEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAA.LTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEA 15 SMSN.NEDGVKMVRYAAAQIESLCPQVINAA.SILTVRPNSKVAQENMTTYRQAWEVQVRILTEA 16 SMSN.NEDGVKMVRYAAAQIESLCPQVINAA.SILTVRPNSKVAQENMTTYRQAWEVQVRILTEA 17 AVGTaNKTTVEGIQATVKSARELTPQVVSAA.RILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGL 18 AVGTaNKTTVEGIQATVKSARELTPQVVSAA.RILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGL 19 QLSS.DVESVSVIQHTAAQLEKLAPQVAQAA.ILLCHQPTSKTAQENMETYKNAWFDKVRLLTTA 20 AVGTaNKTTVEGIQATVKSARELTPQVVSAA.RILLRNPGNQAAYEHFETMKNHWIDNVEKMTGL 21 QLSS.DVESVSVIQHTAAQLEKLAPQVAQAA.ILLCHQPTSKTAQENMETYKNAWFDKVRLLTTA 22 SMST.NEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAA.LALAARPKSQAVKNTMEMYKRTWENHIHVLTEA 23 GACG.NKKIAEILLSSAAQVDSLTPQLISAG.RIRMNYPGSKAADEHLQNLKQQYADTVLRMRTL 24 GACG.NKKIAEILLSSAAQVDSLTPQLISAG.RIRMNYPGSKAADEHLQNLKQQYADTVLRMRTL 25 GACG.NKKIAEILLSSAAQVDSLTPQLISAG.RIRMNYPGSKAADEHLQNLKQQYADTVLRMRTL 26 AVGTaNKSTVEGIQASVKTARELTPQVISAA.RILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGL 27 GPSK.SKKTVEAILDTAEKVEQLTPQLVNAG.RVRLHNPGSE---QHFENIHKQYADALHRLRSH 28 GPSK.SKKTVEAILDTAEKVEQLTPQLVNAG.RVRLHNPGSE---QHFENIHKQYADALHRLRSH 29 AVGTaNKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAA.RILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGL 30 AVGTaNKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAA.RILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGL 31 GPCK.NKKTVEAIIEAANQVNAMTPQVIKAG.KIRLHN-DSDSANLHFDNLRREYSDVLNRLRSH 32 HISG.TEPLEITCIHAEETFQVTGQQIISAA.ETLTLHPSSKIAKENLDVFCEAWESQMSDMATL 33 HISI.TDALHVHTGHVERNMRALAPLTILAG.RTLCVHPSSRIARENLEVFCDTWGQAVNDLSRV 34 HIAP.TERLQVQAKCLAINLRIYGPQVFIAA.KILWKYSNSSAANENFESFSDMWKWLTNEISMI 35 HISG.TEPLEITCIHAEETFQVTGQQIISAA.ETLTLHPSSKIAKENLDVFCEAWESQISDMSTL 36 HISG.TEPLEITCIHAEETFQVTGQQIISAA.ETLTLHPSSKIAKENLDVFCEAWESQISDMSTL 37 SMSN.NEDGVKMVRYAA--------------.--------------------------------- 38 TKSI.AEELELSILKISHSLNELKKEIISAA.ETLTLHPSSKIAKENLDVFCEAWESQISDMSTL 120 130 140 150 160 170 | | | | | | 1 VDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIAL.....QEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMD 2 VDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIAL.....QEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMD 3 VDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIAL.....QEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMD 4 VDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIAL.....QEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMD 5 VDDITSIDDFLCVSENHILEDVNKCVIAL.....QEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVVHVVTSEMD 6 VDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIAL.....QERDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMD 7 VDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIAL.....QEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMD 8 VDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIAL.....QEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMD 9 VDEITTIDDFLAVSESHILEDVNRCVMAL.....HQQDPETLDLTANSVKGRSARICTVVNSEML 10 VDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIAL.....QEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEME 11 VDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIAL.....QEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEME 12 VDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIAL.....QEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEME 13 VDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIAL.....QEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEME 14 VDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIAL.....QEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEME 15 VDDITTIDDFLAVSENHILEDVNKCVMAL.....QVGDARDLRATAGAIQGRSSRVCNVVEAEMD 16 VDDITTIDDFLAVSENHILEDVNKCVMAL.....QVGDARDLRATAGAIQGRSSRVCNVVEAEMD 17 VDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAM.....ANMQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVE 18 VDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAM.....ANMQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVE 19 LDNITTLDDFLAVSEAHIVEDCERGIKGIta9deNAANCETVDCAAGSIRGRALRVCDVVDAEMD 20 VDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAM.....ANMQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVE 21 LDNITTLDDFLAVSEAHIVEDCERGIKGIta9deNAANCETVDCAAGSIRGRALRVCDVVDAEMD 22 VDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIAL.....RDQDADNLDRAAGAIRGRAARVAHIVTGEMD 23 CDQATDPADFIKTSEEHMQVYAKLCEDAI.....HARQPQKMVDNTSNIARLINRVLLVAKQEAD 24 CDQATDPADFIKTSEEHMQVYAKLCEDAI.....HARQPQKMVDNTSNIARLINRVLLVAKQEAD 25 CDQATDPADFIKTSEEHMQVYAKLCEDAI.....HARQPQKMVDNTSNIARLINRVLLVAKQEAD 26 VDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAM.....ANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVE 27 VDDAIDTGEFVRASETAMRRYTNHCEGAI.....NGADAHGLVNNSSQIARLGNRVLMTAQNEAD 28 VDDAIDTGEFVRASETAMRRYTNHCEGAI.....NGADAHGLVNNSSQIARLGNRVLMTAQNEAD 29 VDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAM.....ANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVE 30 VDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAM.....ANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVE 31 VDDAIDTSDFIRASEQAMRQYTVYCENAI.....RNNEPQQMVDNTSQIARFGNRVLMTAKNEAD 32 LREISDV----------------------.....------------------------------- 33 AKE--------------------------.....------------------------------- 34 AKKIL------------------------.....------------------------------- 35 LREINDV----------------------.....------------------------------- 36 LREINDV----------------------.....------------------------------- 37 -----------------------------.....------------------------------- 38 LREINDV----------------------.....------------------------------- 180 190 200 210 220 230 | | | | | | 1 NYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEA.....LSSDPAQPMDENEFIDASRLVYDG 2 NYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEA.....LSSDPAQPMDENEFIDASRLVYDG 3 NYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEA.....LSSDPAQPMDENEFIDASRLVYDG 4 NYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEA.....LSSDPAQPMDENEFIDASRLVYDG 5 NYMPGVYTEKVLEATKLLTETVMPRFTEQVEAAVEA.....LSANNGQPVDENEFIDASRLVYDG 6 NYEPGIYTEKVLEATKLLTNTVMPRFTEQVEAAVEA.....LSGDTNQTMDENEFIDASRLVYDG 7 NYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEA.....LSSDPAQPMDENEFIDASRLVYDG 8 NYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEA.....LSSDPAQPMDENEFIDASRLVYDG 9 NYEPGLYTDKVKEAVNILKNEVIPHFSNMVEIAVDA.....LSSQPPKDTEENEFVDASRMVYDG 10 NYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEA.....LSANVPQPFEENEFIDASRLVYDG 11 NYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEA.....LSANVPQPFEENEFIDASRLVYDG 12 NYETGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEA.....LSANVPQPFEENEFIDASRLVYDG 13 NYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEA.....LSANVPQPFEENEFIDASRLVYYG 14 NYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEA.....LSANVPQPFEENEFIDASRLVYYG 15 NYEPCIYTKRVLEAVKVLRDQVMMKFDQRVGAAVGA.....LSNNSNKDVDENDFIDASRLVYDG 16 NYEPCIYTKRVLEAVKVLRDQVMMKFDQRVGAAVGA.....LSNNSNKDVDENDFIDASRLVYDG 17 NSEDPKFREAVKAASDELSKTI-SPMVMDAKAVAGN.....ISDPGLQ----KSFLDSGYRILGA 18 NSEDPKFREAVKAASDELSKTI-SPMVMDAKAVAGN.....ISDPGLQ----KSFLDSGYRILGA 19 FLQNSEYTETVKQAVRILKTQRVDQFAERASALANRqe6glTWDPKTKEEEMNEFINACTLVHDA 20 NSEDPKFREAVKAASDELSKTI-SPMVMDAKAVAGN.....ISDPGLQ----KSFLDSGYRILGA 21 FLQNSEYTETVKQAVRILKTQRVDQFAERASALANRqe6glTWDPKTKEEEMNEFINACTLVHDA 22 SYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALEA.....LSKSSLNVLDDNQFVDISKKIYDT 23 NSEDPVFTERLNAAANRLERSL-PAMVGDAKLVATN.....IADPRAA----AAWKNSFQRLLGD 24 NSEDPVFTERLNAAANRLERSL-PAMVGDAKLVATN.....IADPAAA----AAWKNSFQRLLGD 25 NSEDPVFTERLNAAANRLERSL-PAMVGDAKLVATN.....IADPAAA----AAWKNSFQRLLGD 26 NSEDPKFREAVKAASDELSKTI-SPMVMDAKAVAGN.....ISDPDLQ----KSFLDSGYRILGA 27 NSEEPSFVSRVRNAADQLHNAI-PPMVNNAKQIAQN.....PHDQYAA----QNWRGTNDHLLNS 28 NSEEPSFVSRVRNAADQLHNAI-PPMVNNAKQIAQN.....PHDQYAA----QNWRGTNDHLLNS 29 NSEDPKFREAVKAASDELSKTI-SPMVMDAKAVAGN.....ISDPGLQ----KSFLDSGYRILGA 30 NSEDPKFREAVKAASDELSKTI-SPMVMDAKAVAGN.....ISDPGLQ----KSFLDSGYRILGA 31 NSEEPSFVHRVNNAARRLHSAI-PPMVNQAKQVALN.....PRHGGNA----QSWRDANEHLLSA 32 ------------------------------------.....------------------------ 33 ------------------------------------.....------------------------ 34 ------------------------------------.....------------------------ 35 ------------------------------------.....------------------------ 36 ------------------------------------.....------------------------ 37 ------------------------------------.....------------------------ 38 ------------------------------------.....------------------------ 240 | 1 IRDIRKAVLM 2 IRDIRKAVLM 3 IRDIRKAVLM 4 IRDIRKAVLM 5 VRDIRKAVLM 6 VRDIRKAVLM 7 IRDIRKAVLM 8 IRDIRKAVLM 9 VREIRRAVLM 10 VRDIRKAVLM 11 VRDIRKAVLM 12 VRDIRKAVLM 13 VRDIRKAVLM 14 VRDIRKAVLM 15 VREIRRAVLM 16 VREIRRAVLM 17 VAKVREAF-- 18 VAKVREAF-- 19 VKDIRHALLM 20 VAKVREAF-- 21 VKDIRHALLM 22 IHDIRCSVMM 23 VREVRDAI-- 24 VREVRDAI-- 25 VREVRDAI-- 26 VAKVREAF-- 27 VRAVGDAI-- 28 VRAVGDAI-- 29 VAKVREAF-- 30 VAKVREAF-- 31 VRQVGDAI-- 32 ---------- 33 ---------- 34 ---------- 35 ---------- 36 ---------- 37 ---------- 38 ----------