# TARGET T0093 # Using neural net overrep-2500-IDaa13-5-10-7-10-5-10-11-ehl2-seeded9-stride-trained.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 10 # 7 10 # 5 10 # 11 3 (1 EHL2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0093.t2k.a2m.gz # with weighted counts, using EntropyWeight(1.4 bits/column, 10) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 48.1181 # # CHAIN 1 Pos AA E H C 10N 1S 5N 5N 5N 1 M 0.05 0.00 0.95 2 L 0.61 0.00 0.39 3 D 0.93 0.00 0.07 4 I 0.99 0.00 0.01 5 V 0.99 0.00 0.01 6 L 0.96 0.00 0.04 7 Y 0.74 0.00 0.25 8 E 0.30 0.01 0.69 9 P 0.20 0.03 0.76 10 E 0.16 0.06 0.79 11 I 0.04 0.02 0.93 12 P 0.04 0.07 0.89 13 Q 0.05 0.14 0.82 14 N 0.04 0.40 0.55 15 T 0.00 0.96 0.04 16 G 0.00 0.99 0.01 17 N 0.00 1.00 0.00 18 I 0.00 1.00 0.00 19 I 0.00 1.00 0.00 20 R 0.00 1.00 0.00 21 L 0.00 1.00 0.00 22 C 0.00 1.00 0.00 23 A 0.00 0.99 0.01 24 N 0.00 0.97 0.03 25 T 0.01 0.68 0.31 26 G 0.01 0.01 0.98 27 F 0.05 0.00 0.95 28 R 0.53 0.00 0.46 29 L 0.90 0.00 0.10 30 H 0.97 0.00 0.02 31 L 0.97 0.00 0.03 32 I 0.87 0.00 0.13 33 E 0.47 0.01 0.52 34 P 0.12 0.02 0.86 35 L 0.04 0.14 0.81 36 G 0.05 0.26 0.69 37 F 0.08 0.20 0.72 38 T 0.12 0.18 0.70 39 W 0.11 0.16 0.73 40 D 0.06 0.22 0.73 41 D 0.03 0.26 0.70 42 K 0.02 0.73 0.25 43 R 0.07 0.75 0.19 44 L 0.12 0.76 0.12 45 R 0.13 0.77 0.10 46 R 0.12 0.79 0.09 47 S 0.12 0.76 0.13 48 G 0.11 0.62 0.27 49 L 0.07 0.34 0.60 50 D 0.06 0.29 0.65 51 Y 0.11 0.37 0.52 52 H 0.18 0.34 0.48 53 E 0.26 0.29 0.45 54 F 0.33 0.20 0.47 55 A 0.35 0.14 0.51 56 E 0.36 0.09 0.55 57 I 0.59 0.13 0.28 58 K 0.70 0.08 0.22 59 R 0.68 0.06 0.26 60 H 0.43 0.07 0.50 61 K 0.19 0.06 0.75 62 T 0.06 0.08 0.87 63 F 0.00 0.97 0.03 64 E 0.00 0.97 0.03 65 A 0.00 0.97 0.03 66 F 0.00 0.94 0.06 67 L 0.00 0.93 0.06 68 E 0.01 0.89 0.10 69 S 0.01 0.83 0.16 70 E 0.02 0.57 0.41 71 K 0.03 0.39 0.59 72 P 0.03 0.25 0.72 73 K 0.06 0.13 0.81 74 R 0.22 0.02 0.75 75 L 0.76 0.01 0.23 76 F 0.92 0.01 0.07 77 A 0.95 0.01 0.05 78 L 0.92 0.01 0.07 79 T 0.79 0.01 0.20 80 T 0.47 0.02 0.51 81 K 0.11 0.02 0.87 82 G 0.04 0.05 0.91 83 C 0.08 0.11 0.81 84 P 0.11 0.16 0.73 85 A 0.17 0.14 0.70 86 H 0.12 0.40 0.48 87 S 0.12 0.40 0.48 88 Q 0.13 0.37 0.50 89 V 0.18 0.11 0.71 90 K 0.19 0.07 0.75 91 F 0.10 0.05 0.85 92 K 0.05 0.04 0.91 93 L 0.05 0.02 0.93 94 G 0.22 0.01 0.78 95 D 0.71 0.00 0.28 96 Y 0.94 0.00 0.06 97 L 0.99 0.00 0.01 98 M 0.98 0.00 0.02 99 F 0.91 0.01 0.08 100 G 0.45 0.02 0.53 101 P 0.13 0.10 0.77 102 E 0.04 0.34 0.62 103 T 0.02 0.53 0.45 104 R 0.01 0.43 0.55 105 G 0.01 0.01 0.98 106 I 0.05 0.02 0.93 107 P 0.03 0.03 0.94 108 M 0.00 0.95 0.05 109 S 0.00 0.96 0.04 110 I 0.00 0.95 0.05 111 L 0.00 0.91 0.09 112 N 0.00 0.91 0.09 113 E 0.00 0.88 0.11 114 M 0.00 0.13 0.87 115 P 0.01 0.04 0.95 116 M 0.02 0.04 0.94 117 E 0.02 0.00 0.97 118 Q 0.40 0.00 0.59 119 K 0.92 0.00 0.08 120 I 0.97 0.00 0.03 121 R 0.96 0.00 0.04 122 I 0.76 0.01 0.23 123 P 0.40 0.01 0.59 124 M 0.14 0.02 0.84 125 T 0.03 0.03 0.94 126 A 0.02 0.15 0.83 127 N 0.02 0.25 0.73 128 S 0.03 0.33 0.65 129 R 0.05 0.48 0.47 130 S 0.06 0.67 0.27 131 M 0.04 0.87 0.09 132 N 0.02 0.93 0.06 133 L 0.00 0.98 0.01 134 S 0.00 0.99 0.01 135 N 0.00 1.00 0.00 136 S 0.00 1.00 0.00 137 V 0.00 1.00 0.00 138 A 0.00 1.00 0.00 139 V 0.00 1.00 0.00 140 T 0.00 1.00 0.00 141 V 0.00 1.00 0.00 142 Y 0.00 1.00 0.00 143 E 0.00 1.00 0.00 144 A 0.00 0.99 0.00 145 W 0.00 0.97 0.02 146 R 0.01 0.94 0.05 147 Q 0.01 0.87 0.12 148 L 0.01 0.73 0.26 149 G 0.01 0.54 0.45 150 Y 0.01 0.34 0.65 151 K 0.02 0.40 0.58 152 G 0.04 0.32 0.65 153 A 0.08 0.35 0.57 154 V 0.15 0.27 0.58 155 N 0.17 0.20 0.62 156 L 0.10 0.09 0.81 157 P 0.08 0.12 0.81 158 E 0.07 0.10 0.84 159 V 0.05 0.06 0.88 160 K 0.02 0.02 0.96