# TARGET T0093 # Using neural net overrep-2500-IDaa13-5-10-7-10-5-10-11-ehl2-seeded9-stride-trained.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 10 # 7 10 # 5 10 # 11 3 (1 EHL2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0093-family.a2m.gz # with weighted counts, using EntropyWeight(1.4 bits/column, 10) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 9.47182 # # CHAIN 1 Pos AA E H C 10N 1S 5N 5N 5N 1 M 0.31 0.01 0.68 2 L 0.64 0.00 0.36 3 D 0.87 0.00 0.13 4 I 0.98 0.00 0.02 5 V 1.00 0.00 0.00 6 L 0.99 0.00 0.01 7 Y 0.96 0.00 0.04 8 E 0.61 0.00 0.39 9 P 0.16 0.02 0.82 10 E 0.07 0.04 0.89 11 I 0.06 0.06 0.89 12 P 0.03 0.06 0.91 13 Q 0.04 0.05 0.91 14 N 0.05 0.10 0.85 15 T 0.03 0.53 0.45 16 G 0.03 0.77 0.20 17 N 0.02 0.91 0.06 18 I 0.03 0.95 0.02 19 I 0.02 0.97 0.01 20 R 0.03 0.96 0.01 21 L 0.02 0.96 0.02 22 C 0.02 0.96 0.03 23 A 0.01 0.92 0.07 24 N 0.01 0.87 0.12 25 T 0.04 0.50 0.46 26 G 0.04 0.03 0.93 27 F 0.13 0.00 0.86 28 R 0.73 0.00 0.27 29 L 0.93 0.00 0.07 30 H 0.94 0.00 0.05 31 L 0.92 0.00 0.08 32 I 0.77 0.01 0.22 33 E 0.54 0.01 0.45 34 P 0.37 0.03 0.60 35 L 0.31 0.05 0.63 36 G 0.32 0.06 0.63 37 F 0.42 0.02 0.56 38 T 0.33 0.02 0.64 39 W 0.12 0.11 0.77 40 D 0.03 0.14 0.83 41 D 0.00 0.87 0.13 42 K 0.01 0.91 0.09 43 R 0.02 0.92 0.06 44 L 0.04 0.89 0.07 45 R 0.04 0.89 0.07 46 R 0.03 0.89 0.08 47 S 0.03 0.84 0.14 48 G 0.04 0.38 0.59 49 L 0.03 0.18 0.80 50 D 0.04 0.14 0.82 51 Y 0.07 0.52 0.41 52 H 0.11 0.48 0.41 53 E 0.18 0.47 0.35 54 F 0.35 0.21 0.44 55 A 0.55 0.07 0.38 56 E 0.71 0.03 0.26 57 I 0.88 0.03 0.10 58 K 0.92 0.02 0.07 59 R 0.88 0.01 0.10 60 H 0.66 0.02 0.32 61 K 0.31 0.01 0.68 62 T 0.07 0.02 0.91 63 F 0.00 0.94 0.06 64 E 0.00 0.97 0.03 65 A 0.00 0.97 0.03 66 F 0.01 0.92 0.07 67 L 0.01 0.90 0.09 68 E 0.02 0.84 0.14 69 S 0.01 0.74 0.24 70 E 0.03 0.44 0.53 71 K 0.03 0.24 0.73 72 P 0.02 0.17 0.81 73 K 0.05 0.10 0.84 74 R 0.22 0.05 0.73 75 L 0.69 0.02 0.29 76 F 0.90 0.01 0.09 77 A 0.95 0.01 0.04 78 L 0.95 0.01 0.04 79 T 0.90 0.01 0.09 80 T 0.74 0.01 0.25 81 K 0.35 0.02 0.62 82 G 0.14 0.05 0.81 83 C 0.17 0.09 0.74 84 P 0.22 0.16 0.62 85 A 0.28 0.18 0.53 86 H 0.30 0.21 0.49 87 S 0.29 0.21 0.51 88 Q 0.24 0.23 0.53 89 V 0.29 0.20 0.51 90 K 0.30 0.18 0.52 91 F 0.28 0.14 0.58 92 K 0.15 0.14 0.71 93 L 0.08 0.13 0.80 94 G 0.11 0.07 0.82 95 D 0.31 0.02 0.67 96 Y 0.79 0.02 0.19 97 L 0.94 0.01 0.05 98 M 0.90 0.02 0.08 99 F 0.77 0.04 0.19 100 G 0.26 0.06 0.68 101 P 0.09 0.17 0.73 102 E 0.06 0.35 0.59 103 T 0.03 0.41 0.56 104 R 0.02 0.28 0.70 105 G 0.02 0.10 0.88 106 I 0.02 0.11 0.86 107 P 0.02 0.17 0.81 108 M 0.00 0.96 0.04 109 S 0.00 0.95 0.05 110 I 0.00 0.94 0.06 111 L 0.01 0.88 0.11 112 N 0.01 0.85 0.14 113 E 0.01 0.76 0.23 114 M 0.01 0.19 0.79 115 P 0.02 0.10 0.88 116 M 0.04 0.12 0.84 117 E 0.09 0.08 0.83 118 Q 0.21 0.07 0.72 119 K 0.61 0.04 0.35 120 I 0.76 0.03 0.21 121 R 0.76 0.03 0.21 122 I 0.54 0.02 0.43 123 P 0.37 0.02 0.62 124 M 0.20 0.03 0.77 125 T 0.06 0.04 0.89 126 A 0.03 0.12 0.85 127 N 0.03 0.16 0.82 128 S 0.07 0.26 0.67 129 R 0.13 0.34 0.53 130 S 0.18 0.45 0.37 131 M 0.15 0.64 0.21 132 N 0.07 0.77 0.16 133 L 0.02 0.91 0.07 134 S 0.01 0.96 0.03 135 N 0.01 0.98 0.02 136 S 0.01 0.99 0.01 137 V 0.01 0.99 0.01 138 A 0.01 0.98 0.00 139 V 0.01 0.99 0.00 140 T 0.01 0.99 0.00 141 V 0.01 0.99 0.00 142 Y 0.01 0.98 0.00 143 E 0.03 0.95 0.02 144 A 0.07 0.87 0.07 145 W 0.08 0.76 0.16 146 R 0.05 0.76 0.19 147 Q 0.03 0.71 0.27 148 L 0.02 0.48 0.50 149 G 0.02 0.35 0.64 150 Y 0.01 0.24 0.75 151 K 0.02 0.35 0.63 152 G 0.04 0.36 0.60 153 A 0.06 0.48 0.46 154 V 0.11 0.41 0.48 155 N 0.14 0.33 0.53 156 L 0.10 0.21 0.69 157 P 0.07 0.17 0.76 158 E 0.06 0.13 0.81 159 V 0.04 0.08 0.89 160 K 0.02 0.02 0.96