# TARGET T0092 # Using neural net overrep-2500-IDaa13-5-10-7-10-5-10-11-ehl2-seeded9-stride-trained.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 10 # 7 10 # 5 10 # 11 3 (1 EHL2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0092.t2k.a2m.gz # with weighted counts, using EntropyWeight(1.4 bits/column, 10) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 80.4533 # # CHAIN 1 Pos AA E H C 10N 1S 5N 5N 5N 1 M 0.15 0.23 0.63 2 V 0.13 0.21 0.66 3 K 0.07 0.25 0.68 4 D 0.04 0.40 0.56 5 T 0.04 0.53 0.43 6 L 0.05 0.59 0.37 7 F 0.04 0.61 0.35 8 S 0.02 0.68 0.30 9 T 0.01 0.72 0.27 10 P 0.01 0.75 0.24 11 I 0.01 0.83 0.17 12 A 0.01 0.86 0.13 13 K 0.01 0.86 0.12 14 L 0.02 0.84 0.14 15 G 0.03 0.80 0.17 16 D 0.04 0.77 0.19 17 F 0.08 0.70 0.22 18 I 0.11 0.58 0.31 19 F 0.13 0.38 0.50 20 D 0.06 0.23 0.71 21 E 0.05 0.26 0.69 22 N 0.03 0.24 0.73 23 V 0.01 0.76 0.23 24 A 0.01 0.81 0.18 25 E 0.02 0.86 0.13 26 V 0.03 0.80 0.17 27 F 0.03 0.75 0.22 28 P 0.02 0.76 0.22 29 D 0.02 0.77 0.21 30 M 0.03 0.72 0.26 31 I 0.03 0.66 0.31 32 Q 0.03 0.61 0.36 33 R 0.03 0.55 0.43 34 S 0.03 0.41 0.56 35 V 0.05 0.39 0.56 36 P 0.07 0.42 0.51 37 G 0.08 0.39 0.53 38 Y 0.05 0.53 0.42 39 S 0.03 0.61 0.36 40 N 0.02 0.68 0.29 41 I 0.02 0.79 0.19 42 I 0.02 0.86 0.12 43 T 0.01 0.89 0.10 44 A 0.01 0.93 0.06 45 I 0.00 0.95 0.05 46 G 0.00 0.94 0.05 47 M 0.00 0.94 0.06 48 L 0.01 0.91 0.08 49 A 0.01 0.87 0.12 50 E 0.01 0.81 0.18 51 R 0.01 0.53 0.45 52 F 0.02 0.29 0.69 53 V 0.03 0.25 0.72 54 T 0.03 0.10 0.88 55 A 0.03 0.07 0.90 56 D 0.05 0.03 0.93 57 S 0.39 0.02 0.59 58 N 0.84 0.01 0.15 59 V 0.93 0.01 0.06 60 Y 0.91 0.01 0.08 61 D 0.72 0.02 0.26 62 L 0.40 0.04 0.56 63 G 0.21 0.06 0.73 64 C 0.10 0.08 0.81 65 S 0.03 0.12 0.85 66 R 0.02 0.42 0.56 67 G 0.01 0.73 0.26 68 A 0.01 0.91 0.09 69 A 0.01 0.95 0.05 70 T 0.00 0.97 0.03 71 L 0.00 0.98 0.02 72 S 0.00 0.98 0.02 73 A 0.00 0.98 0.02 74 R 0.00 0.97 0.02 75 R 0.00 0.96 0.04 76 N 0.00 0.92 0.08 77 I 0.00 0.79 0.21 78 N 0.00 0.08 0.92 79 Q 0.02 0.06 0.92 80 P 0.05 0.03 0.92 81 N 0.09 0.01 0.90 82 V 0.40 0.01 0.59 83 K 0.81 0.00 0.19 84 I 0.93 0.00 0.07 85 I 0.98 0.00 0.02 86 G 0.98 0.00 0.02 87 I 0.89 0.00 0.11 88 D 0.58 0.00 0.42 89 N 0.10 0.02 0.88 90 S 0.01 0.04 0.95 91 Q 0.00 0.94 0.05 92 P 0.00 0.98 0.02 93 M 0.00 0.99 0.01 94 V 0.00 0.99 0.01 95 E 0.00 1.00 0.00 96 R 0.00 1.00 0.00 97 C 0.00 0.99 0.01 98 R 0.00 0.99 0.01 99 Q 0.00 0.98 0.02 100 H 0.00 0.95 0.05 101 I 0.00 0.91 0.09 102 A 0.00 0.86 0.14 103 A 0.01 0.78 0.21 104 Y 0.01 0.48 0.51 105 H 0.01 0.08 0.91 106 S 0.03 0.11 0.85 107 E 0.10 0.08 0.82 108 I 0.13 0.06 0.81 109 P 0.24 0.01 0.75 110 V 0.70 0.00 0.29 111 E 0.92 0.00 0.08 112 I 0.97 0.00 0.03 113 L 0.95 0.00 0.05 114 C 0.87 0.01 0.13 115 N 0.57 0.01 0.42 116 D 0.25 0.01 0.75 117 I 0.11 0.21 0.68 118 R 0.09 0.26 0.65 119 H 0.09 0.30 0.61 120 V 0.06 0.15 0.79 121 E 0.05 0.08 0.87 122 I 0.05 0.10 0.86 123 K 0.02 0.05 0.93 124 N 0.07 0.06 0.87 125 A 0.18 0.05 0.77 126 S 0.42 0.04 0.54 127 M 0.93 0.04 0.03 128 V 0.95 0.04 0.01 129 I 0.94 0.04 0.01 130 L 0.88 0.09 0.04 131 N 0.39 0.40 0.21 132 F 0.20 0.50 0.30 133 T 0.10 0.70 0.21 134 L 0.07 0.68 0.25 135 Q 0.06 0.53 0.41 136 F 0.03 0.40 0.57 137 L 0.02 0.13 0.85 138 P 0.01 0.03 0.96 139 P 0.00 0.80 0.20 140 E 0.00 0.80 0.19 141 D 0.00 0.83 0.17 142 R 0.00 0.98 0.02 143 I 0.00 0.99 0.01 144 A 0.00 0.99 0.01 145 L 0.00 0.99 0.01 146 L 0.00 0.99 0.01 147 T 0.00 0.99 0.01 148 K 0.00 0.99 0.01 149 I 0.00 0.99 0.01 150 Y 0.00 0.98 0.02 151 E 0.00 0.95 0.05 152 G 0.01 0.89 0.10 153 L 0.03 0.62 0.35 154 N 0.01 0.03 0.95 155 P 0.01 0.03 0.97 156 N 0.01 0.00 0.99 157 G 0.34 0.00 0.66 158 V 0.85 0.00 0.15 159 L 0.98 0.00 0.02 160 V 0.99 0.00 0.01 161 L 0.97 0.00 0.03 162 S 0.83 0.00 0.16 163 E 0.50 0.01 0.48 164 K 0.26 0.04 0.70 165 F 0.22 0.08 0.69 166 R 0.13 0.10 0.77 167 F 0.05 0.12 0.83 168 E 0.03 0.19 0.78 169 D 0.03 0.32 0.65 170 T 0.04 0.37 0.60 171 K 0.04 0.42 0.54 172 I 0.02 0.65 0.33 173 N 0.01 0.82 0.17 174 H 0.01 0.90 0.10 175 L 0.01 0.90 0.08 176 L 0.01 0.91 0.08 177 I 0.01 0.91 0.08 178 D 0.01 0.93 0.06 179 L 0.01 0.91 0.08 180 H 0.02 0.88 0.11 181 H 0.02 0.85 0.13 182 Q 0.03 0.80 0.18 183 F 0.04 0.76 0.20 184 K 0.05 0.63 0.32 185 R 0.06 0.48 0.45 186 A 0.06 0.34 0.60 187 N 0.04 0.21 0.75 188 G 0.03 0.17 0.80 189 Y 0.03 0.33 0.64 190 S 0.08 0.39 0.53 191 E 0.16 0.38 0.46 192 L 0.20 0.36 0.45 193 E 0.14 0.37 0.49 194 V 0.08 0.58 0.33 195 S 0.11 0.61 0.28 196 Q 0.19 0.57 0.24 197 K 0.26 0.47 0.27 198 R 0.32 0.37 0.31 199 T 0.24 0.29 0.48 200 A 0.14 0.13 0.73 201 L 0.08 0.08 0.84 202 E 0.07 0.07 0.86 203 N 0.15 0.09 0.76 204 V 0.27 0.10 0.63 205 M 0.28 0.11 0.62 206 R 0.25 0.08 0.67 207 T 0.14 0.05 0.81 208 D 0.10 0.03 0.87 209 S 0.04 0.04 0.93 210 I 0.00 0.94 0.06 211 E 0.00 0.96 0.04 212 T 0.00 0.97 0.03 213 H 0.00 0.99 0.01 214 K 0.00 0.99 0.01 215 V 0.00 0.99 0.01 216 R 0.00 0.99 0.01 217 L 0.00 0.99 0.01 218 K 0.00 0.98 0.02 219 N 0.00 0.96 0.04 220 V 0.00 0.89 0.11 221 G 0.00 0.03 0.97 222 F 0.04 0.00 0.96 223 S 0.52 0.01 0.47 224 Q 0.84 0.01 0.14 225 V 0.87 0.03 0.10 226 E 0.86 0.04 0.10 227 L 0.77 0.07 0.15 228 W 0.61 0.12 0.27 229 F 0.39 0.23 0.39 230 Q 0.24 0.27 0.48 231 C 0.24 0.21 0.55 232 F 0.15 0.17 0.67 233 N 0.14 0.12 0.74 234 F 0.18 0.20 0.62 235 G 0.35 0.21 0.44 236 S 0.64 0.25 0.11 237 M 0.79 0.16 0.05 238 I 0.75 0.18 0.07 239 A 0.70 0.16 0.14 240 V 0.41 0.14 0.45 241 K 0.06 0.02 0.92