# TARGET T0090 # Using neural net overrep-2500-IDaa13-5-10-7-10-5-10-11-ehl2-seeded9-stride-trained.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 10 # 7 10 # 5 10 # 11 3 (1 EHL2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0090.t2k.a2m.gz # with weighted counts, using EntropyWeight(1.4 bits/column, 10) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 77.6843 # # CHAIN 1 Pos AA E H C 10N 1S 5N 5N 5N 1 M 0.05 0.26 0.68 2 L 0.05 0.23 0.72 3 K 0.04 0.24 0.72 4 P 0.04 0.34 0.62 5 D 0.03 0.55 0.42 6 N 0.06 0.56 0.38 7 L 0.08 0.57 0.35 8 P 0.10 0.55 0.35 9 V 0.14 0.48 0.39 10 T 0.13 0.37 0.50 11 F 0.11 0.28 0.61 12 G 0.07 0.18 0.76 13 K 0.05 0.23 0.72 14 N 0.08 0.24 0.68 15 D 0.17 0.25 0.58 16 V 0.32 0.30 0.39 17 E 0.46 0.24 0.30 18 I 0.48 0.23 0.29 19 I 0.40 0.21 0.39 20 A 0.23 0.17 0.60 21 R 0.16 0.25 0.59 22 E 0.30 0.23 0.47 23 T 0.50 0.18 0.32 24 L 0.54 0.13 0.32 25 Y 0.44 0.13 0.43 26 R 0.17 0.14 0.69 27 G 0.10 0.12 0.78 28 F 0.29 0.16 0.55 29 F 0.55 0.12 0.33 30 S 0.58 0.11 0.30 31 L 0.51 0.18 0.31 32 D 0.37 0.21 0.41 33 L 0.36 0.20 0.43 34 Y 0.42 0.16 0.42 35 R 0.37 0.13 0.49 36 F 0.23 0.14 0.64 37 R 0.16 0.16 0.68 38 H 0.22 0.18 0.60 39 R 0.29 0.17 0.54 40 L 0.25 0.17 0.59 41 F 0.15 0.15 0.70 42 N 0.09 0.20 0.71 43 G 0.10 0.23 0.67 44 Q 0.19 0.23 0.58 45 M 0.28 0.20 0.51 46 S 0.32 0.17 0.51 47 H 0.37 0.21 0.42 48 E 0.42 0.22 0.36 49 V 0.44 0.23 0.33 50 R 0.46 0.17 0.37 51 R 0.44 0.17 0.40 52 E 0.46 0.15 0.39 53 I 0.46 0.13 0.41 54 F 0.36 0.07 0.58 55 E 0.21 0.05 0.74 56 R 0.17 0.03 0.80 57 G 0.16 0.02 0.82 58 H 0.27 0.00 0.72 59 A 0.79 0.00 0.20 60 A 0.95 0.00 0.05 61 V 0.99 0.00 0.01 62 L 0.99 0.00 0.01 63 L 0.98 0.00 0.02 64 P 0.96 0.00 0.04 65 F 0.90 0.00 0.10 66 D 0.79 0.00 0.21 67 P 0.37 0.01 0.63 68 V 0.04 0.01 0.95 69 R 0.01 0.01 0.98 70 D 0.07 0.00 0.92 71 E 0.63 0.00 0.37 72 V 0.97 0.00 0.03 73 V 0.99 0.00 0.01 74 L 1.00 0.00 0.00 75 I 0.99 0.00 0.01 76 E 0.94 0.00 0.06 77 Q 0.79 0.00 0.21 78 I 0.43 0.01 0.55 79 R 0.19 0.03 0.78 80 I 0.08 0.04 0.88 81 A 0.07 0.06 0.87 82 A 0.11 0.06 0.83 83 Y 0.13 0.09 0.79 84 D 0.12 0.06 0.82 85 T 0.10 0.08 0.82 86 S 0.06 0.07 0.87 87 E 0.05 0.07 0.88 88 T 0.05 0.05 0.90 89 P 0.12 0.04 0.84 90 W 0.43 0.04 0.54 91 L 0.75 0.02 0.23 92 L 0.82 0.02 0.17 93 E 0.75 0.02 0.23 94 M 0.57 0.02 0.41 95 V 0.33 0.04 0.63 96 A 0.28 0.06 0.66 97 G 0.47 0.07 0.46 98 M 0.65 0.05 0.30 99 I 0.50 0.05 0.45 100 E 0.10 0.03 0.87 101 E 0.01 0.04 0.95 102 G 0.01 0.04 0.95 103 E 0.09 0.05 0.86 104 S 0.07 0.10 0.82 105 V 0.00 0.98 0.02 106 E 0.00 0.99 0.01 107 D 0.00 1.00 0.00 108 V 0.00 1.00 0.00 109 A 0.00 1.00 0.00 110 R 0.00 1.00 0.00 111 R 0.00 1.00 0.00 112 E 0.00 1.00 0.00 113 A 0.00 1.00 0.00 114 I 0.00 1.00 0.00 115 E 0.00 0.99 0.01 116 E 0.00 0.98 0.02 117 A 0.00 0.94 0.06 118 G 0.00 0.05 0.95 119 L 0.04 0.01 0.95 120 I 0.33 0.01 0.66 121 V 0.29 0.13 0.58 122 K 0.33 0.19 0.48 123 R 0.46 0.17 0.38 124 T 0.62 0.14 0.24 125 K 0.75 0.10 0.16 126 P 0.73 0.10 0.17 127 V 0.66 0.12 0.22 128 L 0.62 0.10 0.28 129 S 0.58 0.10 0.32 130 F 0.62 0.08 0.30 131 L 0.53 0.07 0.40 132 A 0.34 0.06 0.60 133 S 0.12 0.07 0.81 134 P 0.07 0.08 0.85 135 G 0.06 0.08 0.86 136 G 0.08 0.11 0.81 137 T 0.09 0.11 0.80 138 S 0.15 0.10 0.75 139 E 0.33 0.07 0.60 140 R 0.67 0.02 0.31 141 S 0.84 0.00 0.16 142 S 0.95 0.00 0.05 143 I 0.99 0.00 0.01 144 M 0.99 0.00 0.00 145 V 1.00 0.00 0.00 146 G 0.99 0.00 0.01 147 E 0.96 0.00 0.04 148 V 0.82 0.00 0.18 149 D 0.38 0.02 0.60 150 A 0.08 0.04 0.88 151 T 0.04 0.08 0.88 152 T 0.18 0.12 0.70 153 A 0.23 0.10 0.67 154 S 0.24 0.08 0.67 155 G 0.13 0.06 0.81 156 I 0.06 0.17 0.77 157 H 0.08 0.25 0.68 158 G 0.12 0.21 0.68 159 L 0.14 0.14 0.72 160 A 0.13 0.08 0.79 161 D 0.05 0.07 0.88 162 E 0.02 0.38 0.60 163 N 0.04 0.46 0.51 164 E 0.12 0.38 0.50 165 D 0.29 0.23 0.48 166 I 0.50 0.13 0.36 167 R 0.61 0.09 0.30 168 V 0.68 0.09 0.23 169 H 0.79 0.05 0.16 170 V 0.73 0.04 0.23 171 V 0.49 0.02 0.50 172 S 0.16 0.01 0.83 173 R 0.01 0.81 0.18 174 E 0.00 0.86 0.14 175 Q 0.00 0.89 0.11 176 A 0.01 0.78 0.21 177 Y 0.01 0.83 0.16 178 Q 0.01 0.84 0.15 179 W 0.01 0.83 0.16 180 V 0.01 0.81 0.18 181 E 0.01 0.75 0.24 182 E 0.01 0.71 0.27 183 G 0.02 0.52 0.46 184 K 0.05 0.49 0.46 185 I 0.06 0.45 0.48 186 D 0.05 0.43 0.52 187 N 0.03 0.38 0.59 188 A 0.02 0.55 0.44 189 A 0.02 0.74 0.23 190 S 0.03 0.86 0.10 191 V 0.04 0.92 0.04 192 I 0.03 0.96 0.02 193 A 0.02 0.97 0.01 194 L 0.01 0.98 0.01 195 Q 0.01 0.98 0.01 196 W 0.00 0.98 0.02 197 L 0.00 0.95 0.04 198 Q 0.01 0.89 0.11 199 L 0.01 0.82 0.17 200 H 0.01 0.64 0.36 201 H 0.00 0.75 0.25 202 Q 0.00 0.85 0.15 203 A 0.02 0.82 0.16 204 L 0.03 0.79 0.17 205 K 0.05 0.71 0.25 206 N 0.02 0.64 0.34 207 E 0.02 0.51 0.47 208 W 0.02 0.27 0.71 209 A 0.01 0.02 0.97