Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30 40 50 60 | | | | | | 1 --LPPTMEDLDIRQVAGTWHSMAMAASDISLLDSETAPLRVYVQELRPTPRDNLEII.....LRK 2 --------DLDIRQVAGTWHSMAMAASDISLLDSETAPLRVYVQELRPTPQDNLEII.....LRK 3 --LPPTMEDLDIRQVAGTWHSMAMAASDISLLDSETAPLRVYVQELRPTPRDNLEII.....LRK 4 --------DLDIRQVAGMWHSMAMAASDISLLDSETAPLRVYVQELRPTPQDNLEII.....LRK 5 -DIPQTMQDLDLQEVAGRWHSVAMVASDISLLDSESAPLRVYVEELRPTPEGNLEII.....LRE 6 -DIPQTMQDLDLQEVAGRWHSVAMVASDISLLDSESVPLRVYVEELRPTPEGNLEII.....LRE 7 -DIPQTMQDLDLQEVAGRWHSVAMVASDISLLDSEEAPLRVYVEELRPTPEGNLEII.....LRE 8 --IPQTMQDLDLQEVAGKWHSVAMAASDISLLDSESAPLRVYIEKLRPTPEDNLEII.....LRE 9 --IPQTMQDLDLQEVAGKWHSVAMAASDISLLDSEEAPLRVYIEKLRPTPEDNLEII.....LRE 10 --IPQTMQDLDLQEVAGKWHSVAMAASDISLLDSEEAPLRVYIEKLRPTPEDNLEII.....LRE 11 ---PLTMDGLDLQKVAGTWHSMAMAASDISLLDSEYAPLRVYVQELRPTPRDNLEII.....LRK 12 --------GLDLQKVAGTWHSMAMAASDISLLDSETAPLRVYVQELRPTPRDNLEII.....LRK 13 --------GLDLQKVAGMWHSMAMAASDISLLDSETAPLRVYVQELRPTPRDNLEII.....LRK 14 --------GLDLQKVAGMWHSMAMAASDISLLDSETAPLRVYVQELRPTPRDNLEII.....LRK 15 ---PLTMDGLDLQKVAGMWHSMAMAASDISLLDSETAPLRVYVQELRPTPRDNLEII.....LRK 16 ---PLTMDGLDLQKVAGMWHSMAMAASDISLLDSETAPLRVYVQ-LRPTPRDNLEII.....LRK 17 -VIPRTMEDLDLQKVAGTWHSMAMAASDISLLDSETAPLRVYIQELRPTPQDNLEIV.....LRK 18 -VIPRTMEDLDLQKVAGTWHSMAMAASDISLLDSETAPLRVYIQELRPTPQDNLEIV.....LRK 19 -VVPRTMEDLDLQKVAGTWHSMAMAASDISLLDSETAPLRVYIQELRPTPQDNLEIV.....LRK 20 IIVTQTMKGLDIQKVAGTWHSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGNLEIL.....LQK 21 -IVTQTMKGLDIQKVAGTWYSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGDLEIL.....LQK 22 -IVTQTMKGLDIQKVAGTWYSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGDLEIL.....LQK 23 -IVTQTMKGLDIQKVAGTWYSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGDLEIL.....LQK 24 ---TQTMKGLDIQKVAGTWYSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGDLEIL.....LQK 25 ------------QKVAGTWYSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGDLEIL.....LQK 26 -IVTQTMKGLDIQKVAGTWYSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGDLEIL.....LQK 27 -IVTQTMKGLDIQKVAGTWYSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGDLEIL.....LQK 28 -IVTQTMKGLDIQKVAGTWYSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGDLEIL.....LQK 29 -IVTQTMKGLDIQKVAGTWYSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGDLEIL.....LQK 30 -IVTQTMKGLDIQKVAGTWYSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGDLEIL.....LQK 31 -IVTQTMKGLDIQKVAGTWYSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGNLEIL.....LQK 32 -IVTQTMKGLDIQKVAGTWYSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGNLEIL.....LQK 33 -IVTQTMKGLDIQKVAGTWYSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGNLEIL.....LQK 34 -IVTQTMKGLDIQKVAGTWHSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGNLEIL.....LQK 35 -IVTQTMKGLDIQKVAGTWHSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEGNLEIL.....LQK 36 VSVIRTMEDLDIQRVAGTWHSVAMAASDISLLDTEEAPLRVNVEELRPTPQGDLEIF.....LQK 37 VEVTPIMTELDTQKVAGTWHTVAMAVSBVSLLBAKSSPLKAYVZGLKPTPEGDLEIL.....LQK 38 VEVTPIMTELDTQKVAGTWHTVAMAVSDVSLLDAKSSPLKAYVEGLKPTPEGDLEIL.....LCK 39 VEVTPIMTELDTQKVAGTWHTVAMAVSDVSLLDAKSSPLKAYVEGLKPTPEGDLEIL.....LQK 40 VEVTPIMTELDTQKVAGTWHTVAMAVSDVSLLDAKSSPLKAYVEGLKPTPEGDLEIL.....LQK 41 VEVTPIMTDLDTQKVAGTWHTVAMAVSDVSLLDAKSSPLKAYVEGLKPTPEGDLEIL.....LQK 42 -NSPQTMQDVELPKLAGTWHSMAMAASDFSLLETKEAPLRIYISSLQPTPEGNLEIVlr...8kq 43 MDIPQTKQDLELPKLAGTWHSMAMATNNISLMATLKAPLRVHITSLLPTPEDNLEIV.....LHR 44 MDIPQTKQDLELPKLAGTWHSMAMATNNISLMATLKAPLRVHITSLLPTPEDNLEIV.....LHR 45 -DIPQTKQDLELPKLAGTWHSMAMATNNISLMATLKAPLRVHITSLLPTPEDNLEIV.....LHR 46 -------------------------------LELPKAPLRVHITSLLPTPEDNLEIV.....LHR 47 VENIRSKNDLGVEKFVGSWYLREAAKTMEFSIP----LFDMDIKEVNLTPEGNLELV.....LLE 48 --------------------------------------FDMDIKEVNLTPEGNLELV.....LLE 49 VENIRSKNDLGVEKFVGSWYLREAAKTMEFSIP----LFDMDIKEVNLTPEGNLELV.....LLE 50 -ENIHSKEELVVEKLIGPWYRVEEAKAMEFSIP----LFDMNIKEVNRTPEGNLELI.....VLE 70 80 90 100 110 | | | | | 1 RENHACIEGNIMAQRTEDPAVFMV.DYQGEK...KISVLDTDYTHYMFFCMEAPAPg...TENGM 2 RENHACIEGNIMAQRTEDPAVFMV.DYQGEK...KISVLDTDYTHYMFFCMEAPAPg...MENGM 3 RENHACIEGNIMAQRTEDPAVFMV.DYQGEK...KISVLDTDYTHYMFFCMEAPAPg...TENGM 4 RENHACIEGNIMAQRTEDPAVFTV.DYQGEK...KISVLDTDYTHYMFFCMEAPAPg...TENGM 5 GANHVCVERNIVAQKTEDPAVFTV.NYQGER...KISVLDTDYAHYMFFCVGPCLPs...AEHGM 6 GANHACVERNIVAQKTEDPAVFTV.NYQGER...KISVLDTDYAHYMFFCVGPPLPs...AEHGM 7 GANHACVERNIVAQKTESPAEFKT.EDSAVF...TVNYQPGERKNYLFLCMKDVGPclpsAEHGM 8 GENKGCAEKKIFAEKTESPAEFKI.NYLDED...TVFALDTDYKNYLFLCMKNAAT....PGQSL 9 GENKGCAEKKIFAEKTESPAEFKI.NYLDED...TVFALDSDYKNYLFLCMKNAAT....PGQSL 10 GENKGCAEKKIFAEKTQSPAQFKI.NALDED...TVFYLDTDYKNYLFLCMKNAAT....PGQSL 11 WEQKRCVQKKILAQKTELPAEFKI.SYLDEN...ELIVLDTDYENYLFFCLENADA....PGQNL 12 WEHGRCVQKKVWAEKTELLAEFKI.SYLDEN...ELIVLDTDYENYLFFCLENTDA....PGQNL 13 WEDNRCVEKKVLAEKTECVAKFNI.NYLDEN...ELIVLDTDYENYLFFCLENTDA....PGQNL 14 WEDNRCVEKKVLAEKTECAAKFNI.NYLDEN...ELIVLDTDYENYLFFCLENTDA....PGQNL 15 WEDNRCVEKKVLAEKTECAAKFNI.NYLDEN...ELIVLDTDYENYLFFCLENADA....PDQNL 16 WEDNRCVEKKVLAEKTECAAKFNI.NYLDEN...ELIVLDTDYENYLFFCLENADA....PDQNL 17 WEDNRCVEKKVFAEKTELAAYFSI.NYVEEN...QIFLLDTDYDNYLFFCMENANA....PQQSL 18 WEDNRCVEKKVFAEKTELAAXFSI.NYVEEN...QIFLLDTDYDNYLFFCMENANA....PQQSL 19 WEDGRCAEQKVLAEKTEVPAEFKI.NYVEEN...QIFLLDTDYDNYLFFCEMNADA....PQQSL 20 WENGECAQKKIIAEKTKIPAVFKI.DALNEN...KVLVLDTDYKKYLLFCMENSAE....PEQSL 21 WENDECAQKKIIAEKTKIPAVFKL.DAINEN...KVLVLDTDYKKYLLFCMENSAE....PEQSL 22 WENDECAQKKIIAEKTKIPAVFKI.DALNEN...KVLVLDTDYKKYLLVCMENSAE....PEQSL 23 WENDECAQKKIIAEKTKIPAVFKI.DALNEN...KVLVLDTDYKKYLLFCMENSAE....PEQSL 24 WENDECAQKKIIAEKTKIPAVFKI.DALNEN...KVLVLDTDYKKYLLFCMENSAE....PEQSL 25 WENDECAQKKIIAEKTKIPAVFKI.DALNEN...KVLVLDTDYKKYLLFCMENSAE....PEQSL 26 WENGECAQKKIIAEKTKIPAVFKI.DALNEN...KVLVLDTDYKKYLLFCMENSAE....PEQSL 27 WENGECAQKKIIAEKTKIPAVFKI.DALNEN...KVLVLDTDYKKYLLFCMENSAE....PEQSL 28 WENGECAQKKIIAEKTKIPAVFKI.DALNEN...KVLVLDTDYKKYLLFCMENSAE....PEQSL 29 WENGECAQKKIIAEKTKIPAVFKI.DALNEN...KVLVLDTDYKKYLLFCMENSAE....PEQSL 30 WENGECAQKKIIAEKTKIPAVFKI.DALNEN...KVLVLDTDYKKYLLFCMENSAE....PEQSL 31 WENGECAQKKIIAEKTKIPAVFKI.DALNEN...KVLVLDTDYKKYLLFCMENSAE....PEQSL 32 WENGECAQKKIIAEKTKIPAVFKI.DALNEN...KVLVLDTDYKKYLLFCMENSAE....PEQSL 33 WENGECAQKKIIAEKTKIPAVFKI.DALNEN...KVLVLDTDYKKYLLFCMENSAE....PEQSL 34 WENGECAQKKIIAEKTKIPAVFKI.DALNEN...KVLVLDTDYKKYLLFCMENSAE....PEQSL 35 WENGECAQKKIIAEKTKIPAVFKI.DALNEN...KVLVLDTDYKKYLLFCMENSAE....PEQSL 36 -------------EKTEIPAVFXX.NFLN--...------SDYTNYLLFCME----....--VSL 37 LENDECAQLVAKKEKTNIPAVFKTlEVINEN...RVLVLDTD--------------....----- 38 RENDKCAQEVLLAKKTDIPAVFKI.NALDEN...QLFLLDTDYDSHLLLCMENASQ....-EHSL 39 RENDKCAQEVLLAKKTDIPAVFKI.NALDEN...QLFLLDTDYDSHLLLCMENSAS....PEHSL 40 RENDKCAQEVLLAKKTDIPAVFKI.NALDEN...QLFLLDTDYDSHLLLCMENSAS....PEHSL 41 RENDKCAQEVLLAKKTDIPAVFKI.NALDEN...QLFLLDTDYDSHLLLCMENSAS....PEHSL 42 SPFRDSNQCIEEKIIAEKTENPIE.FKINYL...DENRIYLFNTDGSKYLFLCLES....TRR-- 43 WENNSCVEKKVLGEKTENPKKFKI.NYTVAN...EATLLDTDYDNFLFLCLQDTTT....PIQSM 44 WENNSCVEKKVLGEKTENPKKFKI.NYTVAN...EATLLDTDYDNFLFLCLQDTTT....PIQSM 45 WENNSCVEKKVLGEKTGNPKKFKI.NYTVAN...EATLLDTDYDNFLFLCLQDTTT....PIQSM 46 WENNSCVEKKVLGEKTENPKKFKI.NYTVAN...EATLLDTDYDNFLFLCLQDTTT....PIQSM 47 KT-DRCVEKKLLLKKTKKPTEFEI.YISSESsy.TFCVMETDYDSYFLFCLYNISD....REK-M 48 KT-DRCVEKKLLLKKTQKPTEFEI.YISSESasyTFSVMETDYDSYFLFCLYNISD....REK-M 49 KA-DRCVEKKLLLKKTQKPTEFEI.YISSESasyTFSVMETDYDSYFLFCLYNISD....REK-M 50 QT-DSCVEKKFLLKKTEKPAEFEI.YIPSESasyTLSVMETDYDNYILGCLENVNY....REK-M 120 130 140 150 160 | | | | | 1 MCQYLARTLKADNEVMEKFDRALQTLPVDIRIIldLTQGEKQCRV 2 MCQYLARTLKADNEVMEKFDRALQTLPVHIRIIldLTQGKEQCRV 3 MCQYLARTLKADNEVMEKFDRALQTLPVHIRIIldLTQGKEQCRV 4 MCQYLARTLKADNEVMEKFDRALQTLPVHIRIIldLTQGKEQCRV 5 VCQYLARTQKVDEEVMEKFSRALQPLPGHVQIIqdPSGGQERC-- 6 VCQYLARTQKVDEEVMEKFSRALQPLPGRVQIVqdPSGGQERC-- 7 VCQYLARTQKVDEEVMEKFSRALQPLPGRVQIVqdPSGGQERC-- 8 VCQYLARTQMVDEEIMEKFRRALQPLPGRVQIVpdLTRMAERCRI 9 VCQYLARTQMVDEEIMEKFRRALQPLPGRVQIVpdLTRMAERCRI 10 VCQYLARTQMVDEEIMEKFRRALQPLPGRVQIVpdLTRMAERCRI 11 VCQCLTRTLKADNEVMEKFDRALQTLPVDVRLFfdPTQVAEQCRI 12 VCQCLTRTLKADNEVMEKFDRALQTLPVDVRLFfdPTQVAEQCRV 13 VCQCLTRTLKADNEVMEKFDRALQTLPVDVRLFfdPTQVAEQC-- 14 VCQCLTRTLKADNEVMEKFDRALQTLPVHVRLFfdPTQVAEQC-- 15 VCQCLTRTLKADNEVMEKFDRALQTLPVHVRLFfdPTQVAEQCRI 16 VCQCLTRTLKADNEVMEKFDRALQTLPVHVRLFfdPTQVAEQCRI 17 MCQCLARTLEVNNEVIGKFNRALKTLPVHMQLLn.PTQVEEQCL- 18 MCQCLARTLEVNNEVIGKFNRALKTLPVHMQLLn.PTQVEEQCL- 19 MCQCLARTLEVDNEVMEKFNRALKTLPVHMQLLn.PTQAEEQCL- 20 ACQCL----------------------------..---------- 21 VCQCLVRTPEVDDEALEKFDKALKALPMHIRLSfnPTLQEEQCHI 22 VCQCLVRTPEVDDEALEKFDKALKALPMHIRLSfnPTQLEEQCHI 23 VCQCLVRTPEVDDEALEKFDKALKALPMHIRLSfnPTQLEEQCHI 24 VCQCLVRTPEVDDEALEKFDKALKALPMHIRLSfnPTQLEEQCHI 25 VCQCLVRTPEVDDEALEKFDKALKALPMHIRLSfnPTQLEEQCHI 26 VCQCLVRTPEVDDEALEKFDKALKALPMHIRLSfnPTQLEEQCHI 27 ACQCLVRTPEVDDEALEKFDKALKALPMHIRLSfnPTQLEEQCHI 28 ACQCLVRTPEVDDEALEKFDKALKALPMHIRLSfnPTQLEEQCHI 29 ACQCLVRTPEVDDEALEKFDKALKALPMHIRLSfnPTQLEEQCHV 30 ACQCLVRTPEVDDEALEKFDKALKALPMHIRLSfnPTQLEEQCHV 31 ACQCLVRTPEVDKEALEKFDKALKALPMHIRLAfnPTQLEGQCHV 32 ACQCLVRTPEVDNEALEKFDKALKALPMHIRLAfnPTQLEGQCHV 33 ACQCLVRTPEVDNEALEKFDKALKALPMHIRLAfnPTQLEGQCHV 34 ACQCLVRTPEVDNEALEKFDKALKALPMHIRLAfnPTQLEGQCHV 35 ACQCLVRTPEVDNEALEKFDKALKALPMHIRLAfnPTQLEGQCHV 36 TCQYLARTLQVDDGVMEKFNKAIKPLPMHIRLX..---------- 37 -------------AIKEALEKFDKTLPMSVRIR..PALQEEQCL- 38 VQQCLARTLEVDDQIREKFEDALKTLSVPMRIL..PAQLEEQCRV 39 VCQSLARTLEVDDQIREKFEDALKTLSVPMRIL..PAQLEEQCRV 40 VCQSLARTLEVDDQIREKFEDALKTLSVPMRIL..PAQLEEQCRV 41 VCQSLARTLEVDDQIREKFEDALKTLSVPMRIL..PAQLEEQCRV 42 QNLACQYLARTLEVDDKVMAEFISFLKTLPVHM..QIFldMTQAE 43 MCQYLARVLVEDDEIMQGFIRAFRPLPRHLWYLldLKQMEEPCR- 44 MCQYLARVLVEDDEIMQGFIRAFRPLPRHLWYLldLKQMEEPCR- 45 MCQYLARVLVEDDEIMQGFIRAFRPLPRHLWYLldLKQMEEPCR- 46 MCQYLARVLVEDDEIMQGFIRAFRPLPRHLWYLldLKQMEEPCR- 47 ACAHYVRRIEEN-KGMNEFKKILRTLAMPYTVI..EVRTRDMCHV 48 ACAHYVRRIEEN-KGMNEFKKILRTLAMPYTVI..EVRTRDMCHV 49 ACAHYVRRIEEN-KGMNEFKKILRTLAMPYTVI..EVRTRDMCHV 50 ACAHYERRIEEN-KGMEEFKKIVRTLTIPYTMI..EAQTREMCRV