# TARGET T0120 # Using neural net overrep-2500-IDaa13-5-10-7-10-5-10-11-ehl2-seeded9-stride-trained.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 10 # 7 10 # 5 10 # 11 3 (1 EHL2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0120.remote-t2k.a2m.gz # with weighted counts, using EntropyWeight(1.4 bits/column, 10) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 18.8943 # # CHAIN 1 Pos AA E H C 10N 1S 5N 5N 5N 1 M 0.074 0.198 0.728 2 E 0.149 0.255 0.596 3 R 0.232 0.260 0.508 4 K 0.381 0.188 0.432 5 I 0.400 0.254 0.346 6 S 0.460 0.183 0.356 7 R 0.598 0.156 0.247 8 I 0.659 0.136 0.205 9 H 0.724 0.102 0.174 10 L 0.634 0.113 0.253 11 V 0.442 0.092 0.466 12 S 0.248 0.067 0.685 13 E 0.085 0.068 0.848 14 P 0.100 0.083 0.817 15 S 0.167 0.082 0.751 16 I 0.249 0.199 0.552 17 T 0.344 0.170 0.485 18 H 0.483 0.182 0.335 19 F 0.607 0.151 0.242 20 L 0.665 0.143 0.192 21 Q 0.649 0.149 0.202 22 V 0.673 0.117 0.210 23 S 0.538 0.143 0.319 24 W 0.166 0.692 0.142 25 E 0.164 0.664 0.171 26 K 0.131 0.659 0.210 27 T 0.129 0.588 0.283 28 L 0.133 0.488 0.379 29 E 0.127 0.349 0.524 30 S 0.111 0.183 0.706 31 G 0.201 0.016 0.783 32 F 0.548 0.005 0.447 33 V 0.911 0.003 0.086 34 I 0.987 0.001 0.012 35 T 0.987 0.001 0.012 36 L 0.937 0.001 0.062 37 T 0.630 0.003 0.367 38 D 0.186 0.007 0.807 39 G 0.108 0.029 0.863 40 H 0.302 0.040 0.658 41 S 0.517 0.045 0.438 42 A 0.653 0.033 0.314 43 W 0.632 0.033 0.335 44 T 0.508 0.052 0.440 45 G 0.343 0.035 0.621 46 T 0.289 0.015 0.696 47 V 0.348 0.026 0.626 48 S 0.181 0.027 0.792 49 E 0.030 0.700 0.270 50 S 0.026 0.678 0.295 51 E 0.035 0.667 0.298 52 I 0.045 0.463 0.492 53 S 0.033 0.391 0.576 54 Q 0.041 0.560 0.398 55 E 0.047 0.557 0.396 56 A 0.074 0.436 0.490 57 D 0.095 0.453 0.453 58 D 0.097 0.536 0.367 59 M 0.247 0.616 0.137 60 A 0.327 0.524 0.149 61 M 0.395 0.454 0.152 62 E 0.268 0.403 0.329 63 K 0.117 0.125 0.758 64 G 0.208 0.069 0.722 65 K 0.380 0.058 0.562 66 Y 0.531 0.114 0.354 67 V 0.572 0.250 0.178 68 G 0.419 0.427 0.154 69 E 0.289 0.543 0.169 70 L 0.085 0.798 0.117 71 R 0.051 0.827 0.122 72 K 0.020 0.891 0.090 73 A 0.020 0.867 0.113 74 L 0.018 0.843 0.139 75 L 0.014 0.752 0.234 76 S 0.012 0.531 0.457 77 G 0.016 0.108 0.876 78 A 0.039 0.062 0.900 79 G 0.029 0.023 0.948 80 P 0.039 0.295 0.666 81 A 0.118 0.184 0.697 82 D 0.302 0.145 0.553 83 V 0.541 0.079 0.380 84 Y 0.704 0.055 0.241 85 T 0.804 0.026 0.170 86 F 0.819 0.018 0.163 87 N 0.784 0.016 0.200 88 F 0.707 0.068 0.225 89 S 0.575 0.068 0.357 90 K 0.486 0.111 0.404 91 E 0.289 0.109 0.602 92 S 0.286 0.040 0.674 93 C 0.595 0.033 0.373 94 Y 0.786 0.040 0.174 95 F 0.856 0.046 0.098 96 F 0.839 0.054 0.107 97 F 0.780 0.044 0.176 98 E 0.525 0.051 0.424 99 K 0.202 0.069 0.729 100 N 0.057 0.058 0.885 101 L 0.049 0.202 0.749 102 K 0.116 0.250 0.634 103 D 0.383 0.160 0.456 104 V 0.693 0.058 0.249 105 S 0.884 0.020 0.095 106 F 0.944 0.016 0.040 107 R 0.961 0.012 0.026 108 L 0.931 0.011 0.057 109 G 0.735 0.017 0.248 110 S 0.617 0.019 0.364 111 F 0.593 0.015 0.391 112 N 0.727 0.016 0.257 113 L 0.731 0.024 0.245 114 E 0.572 0.032 0.395 115 K 0.433 0.050 0.518 116 V 0.279 0.058 0.664 117 E 0.158 0.051 0.791 118 N 0.046 0.069 0.884 119 P 0.012 0.537 0.452 120 A 0.009 0.862 0.129 121 E 0.011 0.905 0.084 122 V 0.019 0.911 0.070 123 I 0.018 0.932 0.049 124 R 0.021 0.923 0.056 125 E 0.017 0.924 0.059 126 L 0.036 0.840 0.124 127 I 0.061 0.737 0.202 128 C 0.067 0.649 0.284 129 Y 0.154 0.467 0.380 130 C 0.169 0.345 0.485 131 L 0.122 0.277 0.601 132 D 0.138 0.165 0.696 133 T 0.429 0.175 0.396 134 I 0.627 0.140 0.233 135 A 0.597 0.159 0.243 136 E 0.355 0.222 0.423 137 N 0.221 0.289 0.490 138 Q 0.170 0.325 0.505 139 A 0.125 0.234 0.641 140 K 0.075 0.300 0.625 141 N 0.027 0.516 0.457 142 E 0.019 0.621 0.360 143 H 0.021 0.689 0.290 144 L 0.021 0.702 0.277 145 Q 0.017 0.698 0.286 146 K 0.004 0.900 0.096 147 E 0.002 0.926 0.073 148 N 0.001 0.954 0.045 149 E 0.001 0.972 0.027 150 R 0.001 0.955 0.043 151 L 0.001 0.956 0.043 152 L 0.001 0.926 0.072 153 R 0.001 0.904 0.095 154 D 0.001 0.926 0.074 155 W 0.001 0.951 0.048 156 N 0.001 0.965 0.034 157 D 0.002 0.974 0.024 158 V 0.004 0.980 0.016 159 Q 0.005 0.982 0.013 160 G 0.003 0.988 0.010 161 R 0.002 0.982 0.015 162 F 0.002 0.962 0.036 163 E 0.001 0.976 0.023 164 K 0.001 0.970 0.029 165 C 0.004 0.945 0.052 166 V 0.003 0.959 0.037 167 S 0.002 0.971 0.027 168 A 0.001 0.983 0.016 169 K 0.001 0.987 0.012 170 E 0.001 0.986 0.012 171 A 0.002 0.986 0.012 172 L 0.002 0.980 0.018 173 E 0.002 0.973 0.024 174 T 0.003 0.970 0.028 175 D 0.005 0.944 0.050 176 L 0.010 0.867 0.123 177 Y 0.013 0.903 0.084 178 K 0.016 0.934 0.050 179 R 0.022 0.929 0.049 180 F 0.025 0.935 0.040 181 I 0.021 0.929 0.051 182 L 0.017 0.921 0.062 183 V 0.014 0.895 0.091 184 L 0.015 0.813 0.172 185 N 0.012 0.797 0.191 186 E 0.020 0.758 0.222 187 K 0.026 0.744 0.230 188 K 0.026 0.733 0.241 189 T 0.033 0.625 0.342 190 K 0.031 0.382 0.587 191 I 0.028 0.637 0.334 192 R 0.033 0.614 0.353 193 S 0.023 0.620 0.356 194 L 0.011 0.610 0.380 195 H 0.005 0.668 0.326 196 N 0.004 0.669 0.328 197 K 0.005 0.805 0.190 198 L 0.008 0.823 0.170 199 L 0.007 0.890 0.103 200 N 0.011 0.873 0.116 201 A 0.009 0.888 0.103 202 A 0.008 0.858 0.134 203 Q 0.008 0.776 0.216 204 E 0.010 0.729 0.261 205 R 0.019 0.604 0.377 206 E 0.033 0.454 0.513 207 K 0.061 0.361 0.579 208 D 0.070 0.442 0.488 209 I 0.075 0.445 0.480 210 K 0.058 0.469 0.473 211 Q 0.070 0.396 0.534 212 E 0.032 0.439 0.529 213 G 0.022 0.221 0.756 214 E 0.071 0.326 0.603 215 T 0.099 0.489 0.413 216 A 0.259 0.459 0.281 217 I 0.373 0.373 0.254 218 C 0.267 0.454 0.280 219 S 0.178 0.458 0.364 220 E 0.175 0.366 0.460 221 M 0.233 0.260 0.507 222 T 0.221 0.223 0.556 223 A 0.206 0.137 0.657 224 D 0.138 0.074 0.788 225 R 0.086 0.086 0.828 226 D 0.044 0.052 0.903 227 P 0.057 0.061 0.882 228 V 0.201 0.075 0.723 229 Y 0.288 0.080 0.632 230 D 0.154 0.083 0.762 231 E 0.071 0.170 0.758 232 S 0.048 0.185 0.767 233 T 0.054 0.187 0.758 234 D 0.051 0.164 0.785 235 E 0.040 0.327 0.633 236 E 0.031 0.329 0.639 237 S 0.036 0.254 0.710 238 E 0.052 0.243 0.706 239 N 0.055 0.186 0.759 240 Q 0.050 0.420 0.530 241 T 0.077 0.348 0.575 242 D 0.071 0.347 0.582 243 L 0.040 0.411 0.549 244 S 0.065 0.346 0.589 245 G 0.105 0.347 0.547 246 L 0.199 0.278 0.524 247 A 0.241 0.289 0.469 248 S 0.255 0.351 0.395 249 A 0.288 0.353 0.359 250 A 0.382 0.273 0.345 251 V 0.419 0.199 0.383 252 S 0.279 0.119 0.602 253 K 0.113 0.238 0.649 254 D 0.048 0.173 0.779 255 D 0.038 0.243 0.719 256 S 0.125 0.236 0.639 257 I 0.248 0.287 0.465 258 I 0.218 0.282 0.500 259 S 0.179 0.277 0.544 260 S 0.156 0.200 0.644 261 L 0.174 0.060 0.765 262 D 0.137 0.028 0.835 263 V 0.104 0.378 0.517 264 T 0.102 0.326 0.572 265 D 0.074 0.411 0.515 266 I 0.077 0.244 0.678 267 A 0.046 0.228 0.725 268 P 0.021 0.368 0.611 269 S 0.016 0.434 0.549 270 R 0.016 0.610 0.373 271 K 0.020 0.646 0.334 272 R 0.036 0.702 0.262 273 R 0.047 0.756 0.197 274 Q 0.060 0.754 0.186 275 R 0.096 0.689 0.215 276 M 0.167 0.536 0.297 277 Q 0.197 0.391 0.412 278 R 0.139 0.210 0.651 279 N 0.091 0.135 0.773 280 L 0.159 0.140 0.701 281 G 0.194 0.121 0.686 282 T 0.229 0.093 0.678 283 E 0.224 0.056 0.720 284 P 0.177 0.077 0.746 285 K 0.138 0.081 0.781 286 M 0.075 0.092 0.833 287 A 0.047 0.117 0.836 288 P 0.071 0.162 0.767 289 Q 0.097 0.179 0.724 290 E 0.107 0.326 0.567 291 N 0.195 0.329 0.476 292 Q 0.302 0.286 0.413 293 L 0.298 0.213 0.490 294 Q 0.307 0.126 0.567 295 E 0.211 0.281 0.508 296 K 0.194 0.361 0.445 297 E 0.231 0.318 0.451 298 N 0.279 0.225 0.496 299 S 0.278 0.125 0.596 300 R 0.198 0.054 0.747 301 P 0.114 0.239 0.647 302 D 0.117 0.264 0.619 303 S 0.162 0.220 0.617 304 S 0.115 0.081 0.804 305 L 0.080 0.070 0.850 306 P 0.043 0.050 0.907 307 E 0.057 0.088 0.854 308 T 0.147 0.093 0.760 309 S 0.202 0.136 0.662 310 K 0.136 0.245 0.619 311 K 0.151 0.277 0.571 312 E 0.217 0.193 0.590 313 H 0.243 0.079 0.678 314 I 0.351 0.032 0.617 315 S 0.176 0.020 0.803 316 A 0.022 0.595 0.383 317 E 0.020 0.540 0.440 318 N 0.039 0.533 0.428 319 M 0.134 0.168 0.698 320 S 0.175 0.112 0.713 321 L 0.021 0.869 0.110 322 E 0.016 0.872 0.112 323 T 0.025 0.854 0.121 324 L 0.049 0.673 0.278 325 R 0.037 0.476 0.487 326 N 0.027 0.316 0.657 327 S 0.022 0.144 0.834 328 S 0.010 0.030 0.960 329 P 0.002 0.834 0.164 330 E 0.003 0.861 0.137 331 D 0.003 0.893 0.104 332 L 0.015 0.808 0.177 333 F 0.021 0.764 0.214 334 D 0.030 0.652 0.318 335 E 0.021 0.523 0.456 336 I 0.016 0.121 0.863