Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30 40 50 | | | | | 1 MSNHQVALQFEDGVTRFICIA.QG.ETLSDAAYRQQ.I.NIPMDCRE.....GECGTC.RAFCES 2 -SNHQVALQFEDGVTRFICIA.QG.ETLSDAAYRQQ.I.NIPMDCRE.....GECGTC.RAFCES 3 -SNHQVALQFEDGVTRFICIA.QG.ETLSDAAYRQQ.I.NIPMDCRE.....GECGTC.RAFCES 4 -------NVTIEPTGEVIEVE.DG.QTILQAALRQG.V.WLPFACGH.....GTCATC.KVQVVE 5 -------NVTIEPTGEVIEVE.DG.QTILQAALRQG.V.WLPFACGH.....GTCATC.KVQVVE 6 -------QVTIEPAGTIIQVE.ED.QTILDAALRQG.V.WLPFACGH.....GTCGTC.KVQVTD 7 -------QVTIEPAGTIIQVE.ED.QTILDAALRQG.V.WLPFACGH.....GTCGTC.KVQVTD 8 ---HTITAVTEDGESLRFECR.SD.EDVITAALRQN.I.FLMSSCRE.....GGCATC.KALCSE 9 ---------LIQPKNRIIPFS.AG.ANLLEVLRENG.V.AISYSCLS.....GRCGTC.RCRVID 10 ---------LIQPNNRLISFS.PG.ANLLEVLRENG.V.AISYSCMS.....GRCGTC.RCRVTD 11 ---------LIQPNNRIIPFS.AG.ANLLEVLRENG.V.AISYSCLS.....GRCGTC.RCRVID 12 --------LTIEPIGQTIPIA.PG.QTVLDACLRNG.V.WLPHACCH.....GLCATC.KVQVVE 13 ---------LIQPNNRLISFS.PG.ANLLEVLRENG.V.AISYSCMS.....GRCGTC.RCRVTD 14 -------QLTLEPLGASIEVE.EG.QTLLDAALRQG.I.YIPHACGH.....GLCGTC.KVQVCD 15 --------LTIEPIGQTIPIA.PG.QTVLDACLRSG.V.WLPHACCH.....GLCATC.KVQVVE 16 ----------VLPNNRRLPFD.SG.ANLLEVLREHR.V.GISYSCMS.....GRCGTC.RCRVID 17 -------QLTLEPLGASIEVE.EG.QTLLDAALRQG.I.YIPHACGH.....GLCGTC.KIQVCD 18 -----IALNFEDGVTRFIEAT.GH.ETVADAAYRQG.I.NIPLDCRD.....GACGTC.KCKAES 19 -------NVTIEPTGEIIEVE.EG.QTILQAALRQG.V.WLPFACGH.....GTCATC.KVQVVE 20 -------NVTIEATGEIIEVE.EG.QTILQAALRQG.V.WLPFPCGH.....GTCATC.KVQVVE 21 ---HTITAVTEDGESLRFECR.SD.EDVITAALRQN.I.FLMSSCRE.....GGCATC.KALCSE 22 ----------VLPNNRRLPFD.SG.ANLLEVLREHR.V.GISYSCMS.....GRCGTC.RCRVID 23 ------ATDFEDGVTRFIDAN.TG.ETVADAAYRQG.I.NLPLDCRD.....GACGAC.KCFAES 24 ---------VVEPLNLHLNAE.TG.STLLDVLRSNE.V.PISYSCMS.....GRCGTC.RCRVIA 25 -----VALNFEDGVTRFIDAN.AG.ETIADAAYRQG.I.NLPMDCRD.....GACGAC.KCFAES 26 ---------VVEPLNLHLNAE.TG.STLLDVLRSNE.V.PISYSCMS.....GRCGTC.RCRVIA 27 -------LRFEDDVTYFITSS.EH.ETVADAAYQHG.I.RIPLDCRN.....GVCGTC.KGFCEH 28 ------------NGEKELTMP.AG.GKLLGALANEG.I.FIPSACGGg....GSCGQC.RVVVKS 29 ------------NGEKELTMP.AG.GKLLGALANEG.I.FIPSACGGg....GSCGQC.RVVVKS 30 -SAHQIKIITQDGEAVCFDCY.ED.EDVITAAVRQD.I.YLMSSCRE.....GGCATC.KGFCAE 31 -------TVSVRGQGFQFKVP.RG.QTILESALHQG.I.AFPHDCKV.....GSCGTC.KYKLIS 32 -------TVSVRGQGFQFKVP.RG.QTILESALHQG.I.AFPHDCKV.....GSCGTC.KYKLIS 33 -------TVSVRGQGFQFKVP.RG.QTILESALHQG.I.AFPHDCKV.....GSCGAC.KYKLIS 34 --------VKLHPSGIIFTSD.GT.STILDAALDSN.I.HIEYSCKD.....GTCGSC.KAILIS 35 ---GDITISVNDDPSLAIVTQ.PG.GKLLSALAGAG.V.FVSSACGGg....GSCGQC.RVKVKS 36 --------VKLHPSGIIFTSD.GT.STILDAALDSN.I.HIEYSCKD.....GTCGSC.KAILIS 37 ----QIVIETEDGETCSFECG.PS.EDVISAGLRQS.V.ILLASCRA.....GACATC.KADCTD 38 --------LTIEPLGRTLDVA.EG.QTLLDAALRSG.V.YIPHACGH.....GLCGTC.KVQVTS 39 --------LHIQPLGQTLSVD.SG.ANLLEALRAAE.V.PISYSCMA.....GRCGTC.RCKVLK 40 ---GDITISINGDPEKAIVTQ.PG.GKLLTALAGAG.V.FVSSACGGg....GSCGQC.RVKIKS 41 ---GDITISVNDDPSLAIVTQ.PG.GKLLSALAGAG.V.FVSSACGGg....GSCGQC.RRKIKS 42 ------ALNFADGKTFFIAVQ.ED.ELLLDAAVRQG.I.NLPLDCRE.....GVCGTC.QGTCET 43 ---GDITIDINDDPEKAITLP.AG.GKLLGALASKG.I.FVSSACGGg....GSCGQC.IVKVKN 44 ---------NVQPFSHEYSCE.DG.ESLLDGALRNS.L.LLKYGCKH.....GGCGTC.KVRLLD 45 MSAHQIKIITQDGESVCFDCY.ED.EDVITAAVRQD.I.YLMSSCRE.....GGCATC.KGFCAE 46 ------------PDQTTFAAG.DG.ETVLAAAARQN.L.NLPHSCKS.....GVCGQC.KAELVS 47 -------QITIEGGSAFSVAA.DE.DTLLRGALRGG.I.ALPHECSV.....GGCGAC.RFDLLS 48 ------KQVQILPQDVTIVLE.PG.QTLLEAALANG.I.AYPHDCTV.....GTCASC.KTRLKQ 49 ----QIVIETEDGETCSFECG.PS.EDVISAGLRQS.V.ILLASCRA.....GGCATC.KADCTD 50 -------QISIEGGAVFTVAA.EE.DTLLRGALRAG.M.ALPHECSV.....GGCGAC.RFDLVD 51 --------IKIFPSNIEFSGR.ED.ESILDAALSAG.I.HLEHSCKA.....GDCGIC.ESDLLA 52 ---RQVTVGYSDGTHKTMPVR.CD.QTVLDAAEEHG.V.AIVNECQS.....GICGTC.VATCTA 53 ------------PDQTTFAAN.DG.ETVLTAAARQN.L.NLPHSCKS.....GVCGQC.KAELVS 54 ------KQLRILPQDITISLN.PG.QTLLEAVLANG.I.AYPHDCTV.....GTCASC.KTRLKQ 55 -----MNTVTVEGSPTTLDIP.AG.KTLLEAMLDAG.L.AMPHDCKV.....GSCGTC.KFKLVS 56 --------RIGAGDTPVFQCS.TD.ETLLAAALKAG.L.GFPYECQS.....GSCSSC.RFQLLE 57 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IKVHPCKLKINDNEELTKTVE.SG.QTLLVSLLSSG.I.PIPSPCGGk....ATCKQC.KVRVVK 72 IKVHPCKLKINNDDSLTKTVD.SG.KTLLSSLLDSG.I.AIPSPCGGk....AACKQC.KVRITK 73 IKVHPCKLRINNDDSLTKTVD.SG.KTLLSSLLDSG.I.AIPSPCGGk....AACKQC.KIRITK 74 ---------------------.--.-----------.-.--------.....------.------ 75 ---------------------.--.-----------.-.--------.....------.------ 76 ---------------------.--.-----------.-.--------.....------.------ 77 ---------------------.--.-----------.-.--------.....------.------ 78 ---------------------.--.-----------.-.--------.....------.------ 79 ---------------------.--.-----------.-.--------.....------.------ 80 ---------------------.--.-----------.-.--------.....------.------ 81 ---------------------.--.-----------.-.--------.....------.------ 82 ---------------------.--.-----------.-.--------.....------.------ 83 ---------------------.--.-----------.-.--------.....------.------ 84 ---------------------.--.-----------.-.--------.....------.------ 85 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.....KSGMTNPILL.YFGVRSQQ.....DLYDAERLHKLAADHP.....QLTVHTVIAT..... 12 .....AAGETLPITL.VQGARNRT.....ELYYDEAFRALAGAHP.....NFRYVPALSD..... 13 .....KLGMTNPILL.YFGVRSQQ.....DLYDAERLHNLAADHP.....QLTVHTVIAM..... 14 .....ANGCEQPITL.VYGQRSRE.....ELYYDDEFRALAAQHP.....HFTYIPAISG..... 15 .....AAGETLPITL.VQGARNRA.....ELYGEDEFRALAERHP.....NFRYVPALSD..... 16 .....KSGMTNPIHL.YFGVRSQQ.....DLYDADRLNQLAAIHP.....QLTVHTVIAT..... 17 .....ANGCEQPITL.VYGQRSRE.....ELYYDDEFRALAAQHP.....HFTYIPAISG..... 18 .....EQGSEHPLHL.IYGVTNDF.....DLVELDRLQALAARIP.....NFTYSACVAN..... 19 .....AQGDTRQITL.FQGARNRA.....ELYNRELFEELAARHS.....NFSYVPALNQah... 20 .....ERGDTRQITL.FQGARNRA.....ELYNRELFEELAARHS.....NFSYVPALNQah... 21 .....EWTAPNETRI.YFGVNHEP.....ELFYIDELKSLERSMR.....NLTVKACVWH..... 22 .....KSGMTNPIHL.YFGVRSQQ.....DLYDADRLNQLAAIHP.....QLTVHTVIAT..... 23 .....EQGGEHPLHL.IYGVTHDH.....DLVEMDKLEAFAARIP.....NFSYSACVAS..... 24 .....ESGMSNPIHL.YFGVRSEQ.....DIYDEERLHALAARFP.....NLKVNVVVAT..... 25 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.....RQGSNRAVHF.YWGARHQD.....DLYALEEAQGLACRLK.....NACFTPVLSR..... 54 .....ANRIKRDCTL.LFGARTQD.....DLYQLDIISNIAANWQg....DFRFIPVLSH..... 55 .....DRGADRAVHL.LYGARRQS.....NLYALDKIAALRQRWMa....PFEFVPALSD..... 56 cn...PAMTERRLLM.FYGGRTPL.....DHCVADVFAGEPELKR.....RVELFSAISDvna.. 57 q....GGGRKPPMLL.SFGCLNPQ.....ALFSLENIELRQQWLP.....SLDVRICVDH..... 58 .....KASDPSPATL.LFGVTNRE.....ELFYVDELKTLAQSMP.....TLGVRIAVVN..... 59 .....AKEDKRNVYI.YWGMRYKN.....EI-YCDELSLLAAENQ.....NIFFNLVLSR..... 60 .....ESGMSYPIHL.YFGVRSEQ.....DIYDEERLHALAARFP.....NLKVNVVVAT..... 61 .....ARGFGGPMDL.YFGVNTAE.....ELFCVPELSALQAAGA.....RVHLALRDGG..... 62 .....AQGYEKPITV.FYGSRLEA.....ELEAAETLFGWKENLK.....LINVSSSVVG..... 63 .....RETD-KPVKL.FYGSRTPR.....DAVRWIDIDIDED---.....KLEVVQAVTE..... 64 .....RETD-KPVKL.FYGSRTPR.....DAVRWIDIDIDEDKL-.....--EVVQAVME..... 65 .....DWGEMLPARL.YFGARYED.....ELFCQEEIRQIQDKLP.....QLQVKICLSR..... 66 k....DPEDCTEMHV.VYANRTED.....DILLKEELDEWAKKYD.....RLKVWYVIQEsi... 67 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m....DPHDTTKVSL.VFGNVHEE.....DILLKKELEALVAMKPs....QFKIVYYLDS..... 180 .....QRGVKREVIF.IHAAINGF.....YHAMHDHLAQTASQQE.....NVHYAVCYER..... 181 .....EHHA--PVTW.VHATENSK.....HHAFKEHVNQLVTAKE.....NMNALIWYNQ..... 182 nee..EVGGAPKCIV.LDGNRREE.....DILCREELDDLVKGNEq....RCRLVHALSQ..... 183 fekydDYKFNGLAWL.FLGVPTSS.....SLLYKEEFDKMKAKAPe....NFRVDYAVSR..... 184 h....NPNDTTPCLV.FNGNRSVD.....DILCKEELDQLEAANPa....RCRVVNALSN..... 185 q....DKQDPTSCVV.LDGNRQEE.....DILCRADLDAYEALDSk....KCKVVHTLTK..... 186 fekhdDYKFNGLAWL.FLGVPTSS.....SLLYKEEFEKMKEKAPe....NFRLDFAVSR..... 187 .....VQQPDRKINF.IFSTHCES.....SQPFKEELKQLEDDYKetg..NLKINLVYSE..... 188 q....DTQDPTTCVV.LDGNRQEE.....DILCRSDLDAYVETDSq....KCTVVHTLTK..... 189 fekhdDYKFNGLAWL.FLGVPTSS.....SLLYKEEFEKMKEKAPd....NFRLDFAVSR..... 190 feeheDYKYTGLAWL.FLGVPTSD.....TLLYKEELEKMKEMAPd....NFRLDFAVSR..... 191 rd...QPEDHTEMHL.VYANRTED.....DILLRDELDRWAAEYPy....RLKVWYVIDQ..... 192 .....QAGSQRPVTF.IHAAQNGS.....VHAFRDDVARLTHEYP.....HFRKVVFYDE..... 193 p....SPEDLTHISL.IYANETED.....DILMKSQLDHMAKEYP.....HFKVHYVIHK..... 194 t....VPEDLTKVSL.LYANETEN.....DILLKDELDEMAEKYP.....HFQVHYVVHY..... 195 s....DAQDGTECLV.LDGNRCEK.....DILCREELDAMVARAPa....RTTLLHKLSR..... 196 .....TAAPDRPVTV.VHADRSPA.....LHAHRLELTALVERLP.....HASLHLWYED..... 197 fekheDYKFNGTAWL.FLGVPTSS.....SLLYKEEFEKMKEKAPe....NFRLDFAVSR..... 198 fekheDYKFNGLAWL.FLGVPTSS.....SLLYKEEFEKMKEKAPe....NFRLDFAVSR..... 199 fekhdDYKFNGLGWL.FLGVPTSS.....SLLYKEEFGKMKERAPe....NFRVDYAVSR..... 200 q....DSADSTHCTV.LNGNRLEE.....DILCREDLDRFAEENGe....RCTLVHTLTQ..... 201 feeheDYKFNGLAWL.FLGVPTSS.....SLLYKEEFEKMKEKNPd....NFRLGFSVSR..... 202 r....DPEDNTKLAL.LFANTHED.....DILLREELDELANNHPe....RFRLWYTVSQ..... 203 medvpKYRFGGLAWL.FLGVANTD.....SLLYDEEFTSYLKQYPd....NFRYDKALSR..... 204 menvpNKTFSGLAWL.FLGVANTD.....SLLYDEEFTKYLKDHPd....NFRFDKALSR..... 205 medvpKYRFGGLAWL.FLGVANTD.....SLLYDEEFTSYLKQYPd....NFRYDKALSR..... 206 medvpNYRFGGLAWL.FLGVANSD.....SLLYDEEFTSYLKQYPd....NFRYDKALSR..... 207 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PANFLFEKFS-- 3 PANFLFEKFS-- 4 ERDIFMERF--- 5 ERDIFMERF--- 6 EKDIHTERF--- 7 EKDIHTERF--- 8 GEQVFFEKFLP- 9 PEHIYADAFYPG 10 PEHIYADAFYPG 11 PEHIYADAFYPG 12 EEDIHTEKF--- 13 PEHIYADAFYPG 14 ERDIYTEKF--- 15 EADIHTEKF--- 16 PEHIYADAFYP- 17 ERDIYTEKF--- 18 PANFYYEKF--- 19 ERDIFMERF--- 20 ERDIFMERF--- 21 GEQVFFEKFLP- 22 PEHIYADAFYP- 23 PANFYYEKF--- 24 PGHIHADAFYP- 25 PANFYYEKF--- 26 PGHIHADAFYP- 27 PVNFYFEKFAP- 28 DENILLDDF--- 29 DENILLDDF--- 30 KERIYLEKFLP- 31 RELVFADRF--- 32 RELVFADRF--- 33 RELVFADRF--- 34 ENKFFSDAFVP- 35 DENILLDDF--- 36 ENKFFSDAFVP- 37 KEQVYLEKF--- 38 EDDIYTEKF--- 39 PEHVYADAF--- 40 EENILLDDF--- 41 DENILLDDF--- 42 DCHIYSEKF--- 43 DENILLDDF--- 44 PRNIYYDAFTP- 45 ------------ 46 ENLFFSDAFTP- 47 FEQMHFDRF--- 48 LEKIFYDKF--- 49 K----------- 50 FGQIRFDRF--- 51 VEHFYSDAF--- 52 RVGLYYEKF--- 53 ENLFFSDAFTP- 54 LERVFYDKF--- 55 RSVISADRF--- 56 SEQLHFDRF--- 57 PANIFAEQF--- 58 KEQVYLEKF--- 59 NDAFFSDAFTP- 60 ------------ 61 ADRVFFDRF--- 62 FEAIHFDRF--- 63 RDQIHFDAF--- 64 RDQIHFDAF--- 65 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