# TARGET T0115 # Using neural net overrep-2500-IDaa13-5-10-7-10-5-10-11-ehl2-seeded9-stride-trained.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 10 # 7 10 # 5 10 # 11 3 (1 EHL2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0115.t2k.a2m.gz # with weighted counts, using EntropyWeight(1.4 bits/column, 10) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 69.8709 # # CHAIN 1 Pos AA E H C 10N 1S 5N 5N 5N 1 M 0.087 0.092 0.821 2 R 0.084 0.068 0.848 3 E 0.179 0.050 0.770 4 I 0.383 0.022 0.594 5 M 0.663 0.010 0.327 6 K 0.891 0.005 0.104 7 V 0.957 0.003 0.040 8 R 0.967 0.003 0.031 9 V 0.965 0.002 0.033 10 K 0.868 0.004 0.129 11 A 0.490 0.005 0.505 12 P 0.230 0.032 0.737 13 C 0.297 0.105 0.598 14 T 0.424 0.189 0.387 15 S 0.533 0.197 0.270 16 A 0.531 0.192 0.277 17 N 0.387 0.238 0.374 18 L 0.278 0.283 0.439 19 G 0.194 0.222 0.584 20 V 0.187 0.193 0.619 21 G 0.197 0.264 0.540 22 F 0.218 0.325 0.456 23 D 0.247 0.372 0.380 24 V 0.362 0.347 0.291 25 F 0.379 0.391 0.230 26 G 0.307 0.445 0.248 27 L 0.360 0.455 0.186 28 C 0.445 0.309 0.246 29 L 0.439 0.216 0.345 30 K 0.218 0.098 0.683 31 E 0.067 0.072 0.861 32 P 0.121 0.020 0.859 33 Y 0.154 0.006 0.840 34 D 0.547 0.002 0.450 35 V 0.955 0.001 0.044 36 I 0.977 0.001 0.022 37 E 0.990 0.001 0.010 38 V 0.987 0.001 0.013 39 E 0.945 0.001 0.055 40 A 0.848 0.001 0.151 41 I 0.379 0.006 0.615 42 D 0.111 0.012 0.878 43 D 0.048 0.017 0.935 44 K 0.269 0.016 0.716 45 E 0.771 0.010 0.219 46 I 0.946 0.005 0.049 47 I 0.954 0.005 0.041 48 I 0.898 0.007 0.094 49 E 0.706 0.011 0.283 50 V 0.463 0.019 0.518 51 D 0.297 0.044 0.659 52 D 0.147 0.074 0.779 53 K 0.058 0.084 0.858 54 N 0.045 0.083 0.872 55 I 0.101 0.103 0.796 56 P 0.135 0.142 0.722 57 T 0.149 0.161 0.690 58 D 0.138 0.189 0.673 59 P 0.066 0.273 0.661 60 D 0.024 0.459 0.517 61 K 0.014 0.610 0.376 62 N 0.018 0.743 0.240 63 V 0.021 0.886 0.093 64 A 0.010 0.964 0.026 65 G 0.005 0.983 0.012 66 I 0.002 0.992 0.006 67 V 0.001 0.995 0.004 68 A 0.001 0.995 0.004 69 K 0.001 0.997 0.002 70 K 0.001 0.996 0.004 71 M 0.001 0.991 0.008 72 I 0.002 0.985 0.013 73 D 0.003 0.967 0.031 74 D 0.005 0.933 0.062 75 F 0.010 0.783 0.208 76 N 0.011 0.108 0.881 77 I 0.030 0.068 0.902 78 G 0.073 0.041 0.887 79 K 0.079 0.021 0.900 80 G 0.140 0.002 0.858 81 V 0.695 0.001 0.304 82 K 0.962 0.001 0.038 83 I 0.995 0.001 0.004 84 T 0.996 0.001 0.004 85 I 0.984 0.001 0.015 86 K 0.827 0.004 0.170 87 K 0.300 0.014 0.687 88 G 0.164 0.026 0.810 89 V 0.147 0.017 0.836 90 K 0.156 0.020 0.824 91 A 0.122 0.149 0.729 92 G 0.077 0.205 0.718 93 S 0.059 0.288 0.653 94 G 0.058 0.261 0.681 95 L 0.056 0.240 0.705 96 G 0.039 0.218 0.742 97 S 0.016 0.654 0.330 98 S 0.009 0.838 0.152 99 A 0.002 0.965 0.033 100 A 0.001 0.980 0.019 101 S 0.001 0.991 0.008 102 S 0.001 0.996 0.004 103 A 0.001 0.997 0.003 104 G 0.001 0.998 0.002 105 T 0.001 0.998 0.002 106 A 0.001 0.997 0.003 107 Y 0.001 0.996 0.004 108 A 0.001 0.993 0.007 109 I 0.001 0.985 0.014 110 N 0.001 0.978 0.021 111 E 0.001 0.962 0.038 112 L 0.001 0.946 0.054 113 F 0.001 0.873 0.126 114 K 0.002 0.092 0.907 115 L 0.008 0.089 0.903 116 N 0.013 0.028 0.959 117 L 0.016 0.025 0.959 118 D 0.014 0.031 0.956 119 K 0.001 0.950 0.050 120 L 0.001 0.976 0.024 121 K 0.001 0.987 0.013 122 L 0.001 0.983 0.016 123 V 0.001 0.984 0.015 124 D 0.001 0.986 0.013 125 Y 0.001 0.982 0.017 126 A 0.002 0.980 0.018 127 S 0.002 0.974 0.024 128 Y 0.006 0.953 0.041 129 G 0.020 0.904 0.076 130 E 0.043 0.840 0.117 131 L 0.053 0.787 0.160 132 A 0.117 0.671 0.212 133 S 0.272 0.416 0.312 134 S 0.275 0.306 0.419 135 G 0.253 0.204 0.543 136 A 0.185 0.191 0.624 137 K 0.182 0.140 0.678 138 H 0.109 0.102 0.789 139 A 0.083 0.020 0.897 140 D 0.116 0.034 0.850 141 N 0.129 0.038 0.833 142 V 0.230 0.269 0.502 143 A 0.298 0.371 0.330 144 P 0.348 0.515 0.136 145 A 0.449 0.416 0.135 146 I 0.493 0.313 0.194 147 F 0.381 0.290 0.328 148 G 0.103 0.116 0.781 149 G 0.123 0.021 0.856 150 F 0.696 0.028 0.276 151 T 0.910 0.013 0.078 152 M 0.933 0.012 0.056 153 V 0.902 0.012 0.086 154 T 0.690 0.019 0.291 155 N 0.280 0.025 0.695 156 Y 0.095 0.030 0.875 157 E 0.052 0.023 0.926 158 P 0.182 0.024 0.794 159 L 0.380 0.036 0.584 160 E 0.614 0.036 0.350 161 V 0.708 0.032 0.260 162 L 0.650 0.043 0.308 163 H 0.632 0.033 0.335 164 I 0.486 0.034 0.480 165 P 0.361 0.044 0.595 166 I 0.263 0.049 0.688 167 D 0.155 0.048 0.796 168 F 0.062 0.049 0.889 169 K 0.099 0.026 0.875 170 L 0.325 0.010 0.665 171 D 0.673 0.002 0.324 172 I 0.962 0.001 0.037 173 L 0.989 0.001 0.010 174 I 0.990 0.001 0.009 175 A 0.958 0.001 0.041 176 I 0.684 0.003 0.314 177 P 0.210 0.010 0.779 178 N 0.082 0.035 0.883 179 I 0.178 0.078 0.744 180 S 0.190 0.094 0.717 181 I 0.169 0.087 0.745 182 N 0.108 0.098 0.794 183 T 0.012 0.831 0.157 184 K 0.002 0.968 0.030 185 E 0.002 0.975 0.024 186 A 0.004 0.967 0.029 187 R 0.005 0.960 0.035 188 E 0.006 0.943 0.051 189 I 0.004 0.911 0.084 190 L 0.010 0.670 0.320 191 P 0.009 0.589 0.403 192 K 0.010 0.518 0.473 193 A 0.028 0.375 0.597 194 V 0.053 0.181 0.765 195 G 0.046 0.121 0.832 196 L 0.019 0.602 0.379 197 K 0.017 0.729 0.254 198 D 0.021 0.820 0.159 199 L 0.044 0.817 0.139 200 V 0.056 0.822 0.122 201 N 0.041 0.851 0.107 202 N 0.022 0.853 0.125 203 V 0.013 0.873 0.114 204 G 0.007 0.902 0.090 205 K 0.005 0.929 0.066 206 A 0.003 0.956 0.040 207 C 0.002 0.974 0.024 208 G 0.001 0.985 0.014 209 M 0.001 0.991 0.008 210 V 0.001 0.989 0.010 211 Y 0.001 0.991 0.008 212 A 0.001 0.987 0.012 213 L 0.001 0.976 0.023 214 Y 0.001 0.956 0.043 215 N 0.001 0.900 0.098 216 K 0.002 0.298 0.700 217 D 0.005 0.163 0.832 218 K 0.002 0.881 0.117 219 S 0.002 0.936 0.062 220 L 0.003 0.957 0.039 221 F 0.005 0.954 0.040 222 G 0.005 0.966 0.030 223 R 0.005 0.963 0.032 224 Y 0.005 0.960 0.035 225 M 0.010 0.929 0.061 226 M 0.010 0.877 0.112 227 S 0.010 0.827 0.163 228 D 0.017 0.584 0.399 229 K 0.030 0.467 0.503 230 V 0.037 0.498 0.464 231 I 0.067 0.444 0.489 232 E 0.079 0.537 0.384 233 P 0.088 0.624 0.287 234 V 0.078 0.709 0.213 235 R 0.095 0.716 0.190 236 G 0.075 0.720 0.205 237 K 0.047 0.749 0.204 238 L 0.028 0.725 0.247 239 I 0.012 0.523 0.465 240 P 0.005 0.860 0.135 241 N 0.005 0.918 0.077 242 Y 0.002 0.975 0.023 243 F 0.002 0.988 0.011 244 K 0.001 0.991 0.008 245 I 0.001 0.992 0.007 246 K 0.001 0.989 0.010 247 E 0.001 0.980 0.019 248 E 0.002 0.961 0.037 249 V 0.005 0.886 0.108 250 K 0.010 0.747 0.243 251 D 0.010 0.523 0.467 252 K 0.038 0.116 0.846 253 V 0.175 0.072 0.753 254 Y 0.391 0.076 0.533 255 G 0.676 0.068 0.256 256 I 0.792 0.044 0.164 257 T 0.745 0.056 0.198 258 I 0.704 0.052 0.244 259 S 0.478 0.064 0.458 260 G 0.269 0.048 0.684 261 S 0.162 0.060 0.778 262 G 0.167 0.065 0.768 263 P 0.217 0.124 0.659 264 S 0.570 0.087 0.343 265 I 0.818 0.081 0.101 266 I 0.850 0.099 0.051 267 A 0.888 0.076 0.036 268 F 0.794 0.061 0.145 269 P 0.310 0.047 0.643 270 K 0.071 0.026 0.902 271 E 0.011 0.386 0.603 272 E 0.005 0.577 0.418 273 F 0.003 0.794 0.203 274 I 0.001 0.955 0.044 275 D 0.001 0.978 0.021 276 E 0.001 0.988 0.012 277 V 0.001 0.996 0.004 278 E 0.001 0.996 0.004 279 N 0.001 0.995 0.004 280 I 0.001 0.992 0.008 281 L 0.001 0.981 0.019 282 R 0.001 0.966 0.032 283 D 0.001 0.945 0.053 284 Y 0.007 0.860 0.133 285 Y 0.017 0.778 0.205 286 E 0.035 0.732 0.233 287 N 0.064 0.659 0.277 288 T 0.147 0.498 0.355 289 I 0.192 0.292 0.516 290 R 0.136 0.127 0.738 291 T 0.158 0.128 0.713 292 E 0.158 0.096 0.745 293 V 0.147 0.079 0.774 294 G 0.203 0.045 0.752 295 K 0.502 0.037 0.461 296 G 0.755 0.028 0.216 297 V 0.833 0.024 0.143 298 E 0.838 0.018 0.144 299 V 0.663 0.014 0.323 300 V 0.233 0.010 0.757