# TARGET T0115 # Using neural net overrep-2500-IDaa13-5-10-7-10-5-10-11-ehl2-seeded9-stride-trained.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 10 # 7 10 # 5 10 # 11 3 (1 EHL2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0115-family.a2m.gz # with weighted counts, using EntropyWeight(1.4 bits/column, 10) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 21.56 # # CHAIN 1 Pos AA E H C 10N 1S 5N 5N 5N 1 M 0.077 0.067 0.856 2 R 0.216 0.069 0.716 3 E 0.440 0.044 0.515 4 I 0.609 0.020 0.371 5 M 0.817 0.009 0.174 6 K 0.944 0.002 0.054 7 V 0.978 0.001 0.022 8 R 0.985 0.001 0.015 9 V 0.990 0.001 0.009 10 K 0.981 0.001 0.019 11 A 0.896 0.001 0.103 12 P 0.545 0.004 0.451 13 C 0.254 0.044 0.701 14 T 0.191 0.108 0.701 15 S 0.273 0.176 0.551 16 A 0.302 0.137 0.561 17 N 0.222 0.151 0.627 18 L 0.179 0.144 0.678 19 G 0.122 0.111 0.768 20 V 0.089 0.113 0.798 21 G 0.099 0.167 0.733 22 F 0.132 0.357 0.510 23 D 0.125 0.453 0.422 24 V 0.250 0.576 0.174 25 F 0.324 0.539 0.137 26 G 0.299 0.500 0.201 27 L 0.294 0.446 0.260 28 C 0.247 0.323 0.430 29 L 0.235 0.216 0.549 30 K 0.067 0.072 0.861 31 E 0.017 0.064 0.920 32 P 0.033 0.036 0.931 33 Y 0.047 0.015 0.938 34 D 0.110 0.003 0.887 35 V 0.872 0.002 0.126 36 I 0.976 0.001 0.024 37 E 0.990 0.001 0.009 38 V 0.989 0.001 0.010 39 E 0.954 0.001 0.046 40 A 0.886 0.001 0.113 41 I 0.579 0.002 0.419 42 D 0.255 0.006 0.738 43 D 0.104 0.036 0.860 44 K 0.213 0.045 0.742 45 E 0.622 0.036 0.343 46 I 0.846 0.017 0.137 47 I 0.865 0.016 0.119 48 I 0.811 0.017 0.171 49 E 0.566 0.030 0.404 50 V 0.419 0.030 0.551 51 D 0.325 0.050 0.625 52 D 0.196 0.054 0.751 53 K 0.154 0.066 0.780 54 N 0.116 0.056 0.828 55 I 0.143 0.053 0.805 56 P 0.157 0.051 0.793 57 T 0.129 0.070 0.801 58 D 0.108 0.082 0.811 59 P 0.037 0.136 0.827 60 D 0.013 0.305 0.682 61 K 0.014 0.541 0.446 62 N 0.026 0.668 0.305 63 V 0.020 0.938 0.042 64 A 0.013 0.976 0.011 65 G 0.004 0.992 0.004 66 I 0.001 0.997 0.002 67 V 0.001 0.998 0.002 68 A 0.001 0.998 0.002 69 K 0.001 0.998 0.001 70 K 0.001 0.996 0.003 71 M 0.001 0.992 0.007 72 I 0.001 0.988 0.011 73 D 0.001 0.974 0.025 74 D 0.002 0.953 0.046 75 F 0.003 0.849 0.149 76 N 0.004 0.053 0.943 77 I 0.030 0.047 0.923 78 G 0.065 0.042 0.893 79 K 0.044 0.025 0.931 80 G 0.099 0.004 0.898 81 V 0.654 0.002 0.344 82 K 0.957 0.001 0.042 83 I 0.994 0.001 0.005 84 T 0.993 0.001 0.006 85 I 0.972 0.001 0.027 86 K 0.747 0.006 0.247 87 K 0.295 0.016 0.688 88 G 0.172 0.018 0.810 89 V 0.218 0.008 0.773 90 K 0.273 0.010 0.717 91 A 0.116 0.224 0.660 92 G 0.043 0.286 0.671 93 S 0.022 0.328 0.650 94 G 0.032 0.270 0.698 95 L 0.057 0.322 0.621 96 G 0.042 0.381 0.577 97 S 0.017 0.725 0.258 98 S 0.006 0.927 0.067 99 A 0.001 0.992 0.007 100 A 0.001 0.998 0.002 101 S 0.001 0.999 0.001 102 S 0.001 0.999 0.001 103 A 0.001 0.999 0.001 104 G 0.001 0.999 0.001 105 T 0.001 0.999 0.001 106 A 0.001 0.999 0.001 107 Y 0.001 0.999 0.001 108 A 0.001 0.999 0.001 109 I 0.001 0.994 0.006 110 N 0.001 0.985 0.015 111 E 0.001 0.955 0.044 112 L 0.001 0.908 0.091 113 F 0.002 0.830 0.169 114 K 0.003 0.285 0.712 115 L 0.008 0.155 0.837 116 N 0.009 0.040 0.951 117 L 0.015 0.045 0.940 118 D 0.014 0.057 0.929 119 K 0.001 0.912 0.086 120 L 0.001 0.943 0.056 121 K 0.001 0.971 0.028 122 L 0.003 0.972 0.025 123 V 0.004 0.974 0.022 124 D 0.004 0.980 0.017 125 Y 0.003 0.976 0.021 126 A 0.005 0.970 0.024 127 S 0.005 0.965 0.030 128 Y 0.007 0.932 0.062 129 G 0.016 0.830 0.154 130 E 0.014 0.712 0.274 131 L 0.007 0.772 0.220 132 A 0.012 0.707 0.281 133 S 0.026 0.597 0.377 134 S 0.024 0.453 0.523 135 G 0.010 0.093 0.896 136 A 0.022 0.167 0.811 137 K 0.035 0.105 0.860 138 H 0.026 0.043 0.931 139 A 0.029 0.083 0.888 140 D 0.032 0.117 0.851 141 N 0.031 0.367 0.602 142 V 0.026 0.814 0.161 143 A 0.028 0.846 0.126 144 P 0.020 0.882 0.098 145 A 0.022 0.890 0.088 146 I 0.059 0.812 0.129 147 F 0.075 0.710 0.215 148 G 0.104 0.213 0.683 149 G 0.183 0.078 0.739 150 F 0.585 0.053 0.362 151 T 0.844 0.030 0.126 152 M 0.923 0.016 0.061 153 V 0.901 0.015 0.084 154 T 0.794 0.014 0.192 155 N 0.498 0.019 0.483 156 Y 0.200 0.026 0.773 157 E 0.054 0.029 0.917 158 P 0.071 0.023 0.906 159 L 0.380 0.021 0.599 160 E 0.719 0.014 0.267 161 V 0.817 0.016 0.168 162 L 0.815 0.021 0.164 163 H 0.776 0.022 0.203 164 I 0.660 0.018 0.322 165 P 0.434 0.024 0.542 166 I 0.212 0.068 0.721 167 D 0.100 0.093 0.808 168 F 0.057 0.175 0.768 169 K 0.132 0.087 0.781 170 L 0.347 0.023 0.630 171 D 0.763 0.006 0.231 172 I 0.964 0.003 0.033 173 L 0.976 0.004 0.020 174 I 0.983 0.003 0.014 175 A 0.948 0.003 0.049 176 I 0.668 0.005 0.327 177 P 0.228 0.012 0.760 178 N 0.073 0.051 0.877 179 I 0.146 0.120 0.733 180 S 0.204 0.158 0.638 181 I 0.205 0.109 0.686 182 N 0.098 0.116 0.786 183 T 0.015 0.833 0.152 184 K 0.003 0.968 0.029 185 E 0.002 0.982 0.017 186 A 0.003 0.976 0.020 187 R 0.005 0.974 0.021 188 E 0.012 0.890 0.098 189 I 0.012 0.875 0.113 190 L 0.018 0.598 0.384 191 P 0.009 0.538 0.454 192 K 0.012 0.509 0.479 193 A 0.048 0.251 0.701 194 V 0.081 0.091 0.828 195 G 0.069 0.068 0.863 196 L 0.003 0.956 0.041 197 K 0.001 0.973 0.026 198 D 0.002 0.974 0.024 199 L 0.009 0.947 0.044 200 V 0.009 0.939 0.052 201 N 0.008 0.946 0.047 202 N 0.003 0.929 0.068 203 V 0.001 0.969 0.030 204 G 0.001 0.983 0.017 205 K 0.001 0.988 0.012 206 A 0.001 0.993 0.006 207 C 0.001 0.997 0.002 208 G 0.001 0.999 0.001 209 M 0.001 0.999 0.001 210 V 0.001 0.999 0.001 211 Y 0.001 0.998 0.001 212 A 0.001 0.997 0.002 213 L 0.001 0.991 0.008 214 Y 0.001 0.967 0.031 215 N 0.003 0.809 0.188 216 K 0.002 0.100 0.898 217 D 0.005 0.177 0.818 218 K 0.004 0.814 0.182 219 S 0.005 0.889 0.106 220 L 0.010 0.916 0.075 221 F 0.015 0.898 0.087 222 G 0.013 0.911 0.076 223 R 0.010 0.896 0.094 224 Y 0.013 0.843 0.144 225 M 0.018 0.698 0.284 226 M 0.009 0.737 0.253 227 S 0.010 0.688 0.302 228 D 0.017 0.528 0.455 229 K 0.072 0.574 0.355 230 V 0.117 0.621 0.262 231 I 0.125 0.655 0.219 232 E 0.101 0.685 0.213 233 P 0.044 0.811 0.145 234 V 0.043 0.802 0.155 235 R 0.025 0.820 0.155 236 G 0.011 0.840 0.150 237 K 0.006 0.833 0.161 238 L 0.006 0.806 0.188 239 I 0.006 0.684 0.311 240 P 0.005 0.808 0.187 241 N 0.004 0.896 0.100 242 Y 0.002 0.960 0.038 243 F 0.002 0.982 0.017 244 K 0.001 0.989 0.010 245 I 0.001 0.990 0.009 246 K 0.002 0.987 0.012 247 E 0.002 0.979 0.019 248 E 0.003 0.965 0.032 249 V 0.004 0.931 0.065 250 K 0.005 0.854 0.141 251 D 0.004 0.709 0.287 252 K 0.013 0.075 0.912 253 V 0.172 0.045 0.783 254 Y 0.519 0.055 0.425 255 G 0.771 0.045 0.183 256 I 0.867 0.040 0.094 257 T 0.819 0.065 0.116 258 I 0.702 0.071 0.227 259 S 0.333 0.067 0.600 260 G 0.110 0.147 0.742 261 S 0.062 0.202 0.736 262 G 0.080 0.246 0.673 263 P 0.143 0.359 0.498 264 S 0.391 0.332 0.277 265 I 0.544 0.370 0.086 266 I 0.530 0.421 0.050 267 A 0.601 0.341 0.058 268 F 0.511 0.254 0.235 269 P 0.147 0.196 0.658 270 K 0.035 0.147 0.818 271 E 0.010 0.257 0.734 272 E 0.006 0.335 0.659 273 F 0.003 0.640 0.357 274 I 0.002 0.895 0.103 275 D 0.001 0.963 0.036 276 E 0.001 0.982 0.017 277 V 0.001 0.992 0.008 278 E 0.001 0.994 0.006 279 N 0.001 0.994 0.006 280 I 0.001 0.990 0.010 281 L 0.001 0.980 0.019 282 R 0.001 0.963 0.037 283 D 0.001 0.935 0.064 284 Y 0.006 0.847 0.148 285 Y 0.010 0.753 0.237 286 E 0.012 0.733 0.255 287 N 0.031 0.628 0.342 288 T 0.109 0.571 0.320 289 I 0.220 0.414 0.366 290 R 0.311 0.324 0.365 291 T 0.303 0.233 0.464 292 E 0.202 0.178 0.621 293 V 0.066 0.120 0.814 294 G 0.050 0.040 0.909 295 K 0.294 0.040 0.666 296 G 0.532 0.035 0.433 297 V 0.706 0.031 0.262 298 E 0.759 0.024 0.217 299 V 0.584 0.024 0.392 300 V 0.286 0.016 0.698