Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30 40 50 6 | | | | | 1 MSFDKQNLIWIDLEMTGLDPEK.ERIIEIATIVTDKNLNILA.....EGPVLAVHQSDELLNKMN 2 MSFDKQNLIWIDLEMTGLDPEK.ERIIEIATIVTDKNLNILA.....EGPVLAVHQSDELLNKMN 3 MSANENNLIWIDLEMTGLDPER.DRIIEIATLVTDANLNILA.....EGPTIAVHQSDEQLALMD 4 MSANENNLIWIDLEMTGLDPER.DRIIEIATLVTDANLNILA.....EGPTIAVHQSDEQLALMD 5 -ESMAQRMVWVDLEMTGLDIEK.DQIIEMACLITDSDLNILA.....EGPNLIIKQPDELLDSMS 6 ----KNNLCWLDMEMTGLNPET.DRIIEVAMIITDSDLNVLA.....QSEVYAIHQSDELLDNMD 7 ----KNNLCWLDMEMTGLNPET.DRIIEVAMIITDSDLNVLA.....QSEVYAVHQSDDVLNKMD 8 -ESMAQRMVWVDLEMTGLDIEK.DQIIEMACLITDSDLNILA.....EGPNLIIKQPDELLDSMS 9 CDKIEQRIIWIDCEMTGLDVEK.QTLCEIALIVTDSELNTIA.....TGPDIVIHQPKEVLDNME 10 --KLFKPLVWIDCEMTGLDHVN.DRIIEICCIITDGHLAPVKaa7gdSHYESVIHYGPEVMNKMN 11 ----QDELVWIDCEMTGLDLGS.DKLIEIAALVTDADLNILG.....DGVDVVMHADDAALSGMI 12 ----HDELVWIDCEMTGLDLGS.DQLIEIAALVTDADLNILG.....DGVDVVIHIDSTALSSMI 13 -GDYKQPLVWIDLEMTGLNVEV.DRILEIACIITNGDLTQSV.....EGPDLVVRQTKDCLDKMD 14 -CGLDTDIVWMDLEMTGLDIEK.DKILEVACIITDQDLNVKS.....EGPCFAINHPQEVYDSMN 15 MSNLKQPLVWIDCEMTGLEVGK.HVLMEVAAIITDGNLRPVE.....EKFDAVIKLDEKQLSEMN 16 ----NDRMVWIDCEMTGLSLAD.DALIEVAALVTDSELNVLG.....EGVDIVIRPPDAALETMP 17 -TKLFKPLVWIDCEMTGLDHVN.DRIIEICCIITDGHLAPVKaa7gdSHYETVIHYGPEVMNKMN 18 ----DVEFVCLDCETTGLDVKK.DRVIEFAAIRF--TFDEII.....DSVEFLIHPERAV----- 19 ----DIEFVCLDCETTGLDVKK.DRVIEFAAIRF--TFDEVI.....DSVEFLIHPERAV----- 20 SSQTMDVLIFYDTETTGTQIER.DRIIEIAAYNS-----VTD.....ESFLTYVNPEIPI----- 21 -NLLDGTFVVIDLEATGFDVEK.SEVIDLAAVRVEGG--IIT.....EKFSTLVYPGYFI----- 22 ------ALIFYDTETTGTQIDK.DRIVELAAYNG-----TTS.....ESFQTLVNPEIPI----- 23 -----PDLIFYDTETTGTQIDK.DRIVEIAAYNG-----TTG.....ESFQTLVNPEIPI----- 24 GSLRKVQFLSIDLETTGLNQKK.DEIIAIGAVPIIGTRILAG.....ESYYRLLRPEKFK----- 25 -TFGDATFVVLDFETTGLDPQV.DEIIEIGAVKIQGG--QIV.....DEYHTLIKPSREI----- 26 ---KDTVFTCLDCEMTGLDVKK.DRIIEIAAVRF--TFDSVI.....SSIEFLINPERVV----- 27 -------FTAFDTETTGLKAEE.DRIIEIGAVTFDRK--GII.....ARFSTLIFPDRAI----- 28 TSWFEGPLAAFDTETTGVDTET.DRIVSAALVVQDAP-GLRP.....RVTRWLVNPGVPV----- 29 ----KQRFVVIDVETTGNSPKKgDKIIQIAAVVIENG--QIT.....ERFSKYINPNKSI----- 30 -DARELDTLVLDFETTGFNPEV.DRVISIGWVEIRNSNIRLN.....SARHVFINHAIDI----- 31 -SHQDRGWAVIDVETSGFRPGQ.ARIISLAVLGLDAA-GRLE.....QSVVSLLNPKVDP----- 32 --------IILDTETTGLDPQQgHRIVEIGAIEMVNKV-LTG.....KHFHFYINPERDM----- 33 ----TRQLVVVDCETTGL-HDG.AAILEVAAVNIDTG---AE.....LHFVPFVTREQLAQAQPM 0 70 80 90 100 110 120 | | | | | | | 1 DWCQKTHSENGLIERIK.ASKLTERA.AELQTLDFLKKWVP.KGASPICGNSIAQDKRFLVKYMP 2 DWCQKTHSENGLIERIK.ASKLTERA.AELQTLDFLKKWVP.KGASPICGNSIAQDKRFLVKYMP 3 DWNVRTHTASGLVERVK.ASTMGDRE.AELATLEFLKQWVP.AGKSPICGNSIGQDRRFLFKYMP 4 DWNVRTHTASGLVERVK.ASTMGDRE.AELATLEFLKQWVP.AGKSPICGNSIGQDRRFLFKYMP 5 DWCKEHHGKSGLTKAVK.ESTITLQQ.AEYEFLSFVRQQTP.PGLCPLAGNSVHEDKKFLDKYMP 6 EWNTATHGRTGLTQRVR.ESSHTEAE.VEQKLLDFMSEWVP.RRATPMCGNSIHQDRRFMVKYMP 7 EWNTATHGRTGLTQRVR.ESSHTEAE.VEQKLLDFMSEWVP.GRATPMCGNSIHQDRRFMVKYMP 8 DWCKEHHGRSGLTKAVK.ESTITLQQ.AEYEFLSFVRQQTP.PGLCPLAGNSVHEDKKFLDKYMP 9 EWPRNTFHENGLMEKII.ASKYSMAD.AENEVIDFLKLHAL.PGKSPIAGNSIYMDRLFIKKYMP 10 EWCIEHHGNSGLTAKVL.ASEKTLAQ.VEDELLEYIQRYIPdKNVGVLAGNSVHMDRLFMVREFP 11 DVVAEMHSRSGLIDEVK.ASTVDLAT.AEAMVLDYINEHVKqPKTAPLAGNSIATDRAFIARDMP 12 DVVAEMHSRSGLINEVE.SSIVDLVT.AESIVLDYINNHVKqPKTAPLAGNSIATDRSFIARDMP 13 DWCQTHHGASGLTKKVL.LSAITERE.AEQKVIEFVKKHVG.SGNPLLAGNSVYVDFLFLKKYMP 14 EWCMKHHYNSGLIDRCK.SSDVNLEE.ASNLVLSYLEKNIP.KRACPLGGNSVYTDRLFIMKFMP 15 DWCIEQHGKSGLTERCR.QSNLTVKD.VENQLLAYIKKYIPkKREALIAGNSVHADVRFLSVEMP 16 EVVRQMHTASGLLDE-L.AGGTTLAD.AEEQVLAYVREHVKePGKAPLCGNSVGTDRGFLARDMR 17 EWCIEHHGNSESHPKVL.ASEKTLAQ.VEDELLEYIQRYIPdKNVGVLAGNSVHMDRLFMVREFP 18 --SAESQKIHKISDAML.RDKPKFGE.VFSRIKGFFKE---.--RDHIVGHHVGFDLQVLSQESE 19 --SAESQKIHKISDAML.KDKPKFSE.VFSTIKGFFKE---.--RDYIVGHHVGFDLQVLSQESE 20 --PDEASKIHGITTDAV.LSAPKFPE.AYEGFRKFCGE---.-DSILVAHNNDGFDFPLLGKECR 21 --PERIKKLTGITNAML.VGQPTIEE.VLPEFLEFVGD---.---NIVVGHFVEQDIKFINKYTK 22 --PAEATKIHGITTAEV.ADAPRFPE.AYQKFIEFCGT---.-DNILVAHNNNAFDYPLLVRECR 23 --PAEATKIHGITTSEV.ANAPKFPE.AYQQFSDFCGT---.-DNILVAHNNNAFDYPLLLRECR 24 ---HESMKFHGLDPARL.KTAHDFSE.IAEEVADLLRG---.---KVLVGYAIELDYGFLKRALK 25 --SRKSSEITGITQEML.ENKRSIEE.VLPEFLGFLED---.---SIIVAHNANFDYRFLRLWIK 26 --SAESQRVHHISNAML.RDQPKIAE.VFPQIKAFFKE---.--GDYIVGHSVGFDLQVLAQEME 27 --PPDVSKINHITDDML.VNKPRFCE.IVSDFSRFIKG---.---TVLVAHNANFDVEFLNAELS 28 --PESATAVHGLTEEYV.QRHGRWPApVMYEMAEALTEQAR.AG-RPLVVMNAPFDLTLLDRELR 29 --PAFIEQLTGISNQMV.ENEQPFEA.VAEEVFQLLDG---.---AYFVAHNIHFDLGFVKYELH 30 --CHESVKVHHIRPETLhVSGISEQA.AFTQLLDVIAG---.---KILVAHGCIMEQRFLEQYIK 31 ----GPTHVHGLTAAML.DGQPQFAD.IAGEVVDVLRG---.---RTLVAHNVAFDYAFLAAEAE 32 --PFEAYKIHGISGEFL.KDKPLFKT.IANDFLKFIAD---.---STLIIHNAPFDIKFLNHELS 33 AMQMNRYYERGIWQRRL.SPDST-DA.AYWKLANMLAG---.---NTFGGSNPAFDSRLLAAAMP 130 140 150 160 170 | | | | | 1 DLADY...FHYRHLDVSTLKELAARWKPEI.....LEG.FKKENTHLALDDIRESIKELAYYREH 2 DLADY...FHYRHLDVSTLKELAARWKPEI.....LEG.FKKENTHLALDDIRESIKELAYYREH 3 ELEAY...FHYRYLDVSTLKELARRWKPEI.....LDG.FTKQGTHQAMDDIRESVAELAYYREH 4 ELEAY...FHYRYLDVSTLKELARRWKPEI.....LDG.FTKQGTHQAMDDIRESVAELAYYREH 5 QFMKH...LHYRIIDVSTVKELCRRWYPEEy....EFA.PKKAASHRALDDISESIKELQFYRNN 6 KLENY...FHYRNLDVSTLKELAKRWNPPV.....AKS.VVKRGSHKALDDILESIEEMRHYREH 7 KLENY...FHYRNLDVSTLKELAKRWNPPV.....AKS.VVKRGSHKALDDILESIEEMRHYREH 8 QFMKH...LHYRIIDVSTVKELCRRWYPEEy....EFA.PKKAASHRALDDISESIKELQFYRNN 9 KLDKF...AHYRCIDVSTIKGLVQRWYPDY.....-KH.PKKQCTHRAFDDIMESIAELKNYRES 10 KVIDH...LFYRIVDVSSIMEVARRHNPALq....ARN.PKKEAAHTAYSDIKESIAQLQWYMDN 11 TLDSF...LHYRMIDVSSIKELCRRWYPRI.....YFGqPPKGLTHRALADIHESIRELRFYRRT 12 TLDSF...LHYRMIDVSSIKELCRRWYPRI.....YFGqPAKGLTHRALADIHESIRELRFYRRT 13 ELAAL...FPHILVDVSSVKALCARWFPIEr....RKA.PAKKNNHRAMDDIRESIKELKYYKKT 14 LVDAY...LHYRIVDVSTIKELAKRWHPAIl....DSA.PKKSFTHRSLDDIRESIKELAYYKAN 15 KIIEH...LHYRIIDVSTIKELAKRWCPDI.....-PA.YDKKGDHRALSDILESIGELQHYRSY 16 ELEGY...LHYRIVDVSSVKELARRWYPRA.....YFNsPAKNGNHRALADIRDSITELRYYREA 17 KVIDH...LFYRIVDVSSIMEVARRHNPALq....ARN.PKKEAAHTAYSDIK------------ 18 RLGET...LLPKHHYVIDTLRLAKGYGDSPnn9arHFN.VPHQGNHRAMKDVEMNVKVFKHLTKR 19 RLGET...LLPKQHYVIDTLRLAKEYGDSPnn9arHFN.VPHQGNHRAMKDVEMNVKVFKHLTKR 20 RH-SL...EPLTNRTIDSLK-WAQKYRPDLp10rqVYG.FAENQAHRALDDVVILHKVFT----- 21 QY-RG...KKFRNPSLCTLK-LARKVFPGLk10aeNFG.FETNGVHRALKDATLTAEIFIKI--- 22 RH-GL...SEPQLRTIDSLK-WAKKYRTDLp10rqVYG.FEENQAHRALDDVITLYRVF------ 23 RH-GL...PEPQLRTIDSLK-WAKKYRTDLp10rqVYG.FEENNAHRALDDVITLHRVF------ 24 REGYK...VENKRIDVIDFEKAVCYILGERp12akKYR.VEVSYRHNALADAFITAQIFQVQ--- 25 KVMG-...LDWERPYIDTLA-LAKSLLKLRsy9veKLG.LGPFRHHRALDDARVTAQVFLRFVE- 26 RIGET...FLSKYTIIDTLR-LAKEYGDSPnn9avHFN.VPYDGNHRAMKDVEININIFKHLCKR 27 LC-KK...QPLSHKVVDTYA-MAQAVFPGLg12alQFG.LTVHAAHRAEDDARVCMELFTT---- 28 RHRAS...SLGRWLERTPLHVLDPHVLDKHl16caHYG.VELAGAHDAAADAQAALEVVRAVGRR 29 KA-GF...QLPDCEVLDTVE-LSRIVFPGFe10seELQ.LRHDQPHRADSDAEVTGLI------- 30 MKYQN...LKLPLIWLDTLK--IEQYRTQLr14rkELN.LPTYQAHNALNDAIATAEL------- 31 IAEAE...LPVDF--VMCTVELARRLQLGVd10aaHWG.VPQQRPHDAFDDVRVLTGIL------ 32 LLKRTeikFLELTNTIDTLV-MARNMFPGAr11rfKVD.NSGRQLHGALKDAAL----------- 33 DGAPE...WHHRLADLAAFT--AGKLNLDPv11ceRLG.VTVSDRHSALADAHATATCFTILR-- 180 | 1 FMKLD 2 FMKL- 3 FI--- 4 FI--- 5 IFK-- 6 FL--- 7 FL--- 8 IFK-- 9 IFV-- 10 YLKPP 11 AFVPQ 12 AFVPP 13 IFK-- 14 L---- 15 ----- 16 VFVPQ 17 ----- 18 F---- 19 F---- 20 ----- 21 ----- 22 ----- 23 ----- 24 ----- 25 ----- 26 F---- 27 ----- 28 ----- 29 ----- 30 ----- 31 ----- 32 ----- 33 -----