Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30 40 50 6
| | | | |
1 MSFDKQNLIWIDLEMTGLDPEK.ERIIEIATIVTDKNLNILA.....EGPVLAVHQSDELLNKMN
2 MSFDKQNLIWIDLEMTGLDPEK.ERIIEIATIVTDKNLNILA.....EGPVLAVHQSDELLNKMN
3 MSANENNLIWIDLEMTGLDPER.DRIIEIATLVTDANLNILA.....EGPTIAVHQSDEQLALMD
4 MSANENNLIWIDLEMTGLDPER.DRIIEIATLVTDANLNILA.....EGPTIAVHQSDEQLALMD
5 -ESMAQRMVWVDLEMTGLDIEK.DQIIEMACLITDSDLNILA.....EGPNLIIKQPDELLDSMS
6 ----KNNLCWLDMEMTGLNPET.DRIIEVAMIITDSDLNVLA.....QSEVYAIHQSDELLDNMD
7 ----KNNLCWLDMEMTGLNPET.DRIIEVAMIITDSDLNVLA.....QSEVYAVHQSDDVLNKMD
8 -ESMAQRMVWVDLEMTGLDIEK.DQIIEMACLITDSDLNILA.....EGPNLIIKQPDELLDSMS
9 CDKIEQRIIWIDCEMTGLDVEK.QTLCEIALIVTDSELNTIA.....TGPDIVIHQPKEVLDNME
10 --KLFKPLVWIDCEMTGLDHVN.DRIIEICCIITDGHLAPVKaa7gdSHYESVIHYGPEVMNKMN
11 ----QDELVWIDCEMTGLDLGS.DKLIEIAALVTDADLNILG.....DGVDVVMHADDAALSGMI
12 ----HDELVWIDCEMTGLDLGS.DQLIEIAALVTDADLNILG.....DGVDVVIHIDSTALSSMI
13 -GDYKQPLVWIDLEMTGLNVEV.DRILEIACIITNGDLTQSV.....EGPDLVVRQTKDCLDKMD
14 -CGLDTDIVWMDLEMTGLDIEK.DKILEVACIITDQDLNVKS.....EGPCFAINHPQEVYDSMN
15 MSNLKQPLVWIDCEMTGLEVGK.HVLMEVAAIITDGNLRPVE.....EKFDAVIKLDEKQLSEMN
16 ----NDRMVWIDCEMTGLSLAD.DALIEVAALVTDSELNVLG.....EGVDIVIRPPDAALETMP
17 -TKLFKPLVWIDCEMTGLDHVN.DRIIEICCIITDGHLAPVKaa7gdSHYETVIHYGPEVMNKMN
18 ----DVEFVCLDCETTGLDVKK.DRVIEFAAIRF--TFDEII.....DSVEFLIHPERAV-----
19 ----DIEFVCLDCETTGLDVKK.DRVIEFAAIRF--TFDEVI.....DSVEFLIHPERAV-----
20 SSQTMDVLIFYDTETTGTQIER.DRIIEIAAYNS-----VTD.....ESFLTYVNPEIPI-----
21 -NLLDGTFVVIDLEATGFDVEK.SEVIDLAAVRVEGG--IIT.....EKFSTLVYPGYFI-----
22 ------ALIFYDTETTGTQIDK.DRIVELAAYNG-----TTS.....ESFQTLVNPEIPI-----
23 -----PDLIFYDTETTGTQIDK.DRIVEIAAYNG-----TTG.....ESFQTLVNPEIPI-----
24 GSLRKVQFLSIDLETTGLNQKK.DEIIAIGAVPIIGTRILAG.....ESYYRLLRPEKFK-----
25 -TFGDATFVVLDFETTGLDPQV.DEIIEIGAVKIQGG--QIV.....DEYHTLIKPSREI-----
26 ---KDTVFTCLDCEMTGLDVKK.DRIIEIAAVRF--TFDSVI.....SSIEFLINPERVV-----
27 -------FTAFDTETTGLKAEE.DRIIEIGAVTFDRK--GII.....ARFSTLIFPDRAI-----
28 TSWFEGPLAAFDTETTGVDTET.DRIVSAALVVQDAP-GLRP.....RVTRWLVNPGVPV-----
29 ----KQRFVVIDVETTGNSPKKgDKIIQIAAVVIENG--QIT.....ERFSKYINPNKSI-----
30 -DARELDTLVLDFETTGFNPEV.DRVISIGWVEIRNSNIRLN.....SARHVFINHAIDI-----
31 -SHQDRGWAVIDVETSGFRPGQ.ARIISLAVLGLDAA-GRLE.....QSVVSLLNPKVDP-----
32 --------IILDTETTGLDPQQgHRIVEIGAIEMVNKV-LTG.....KHFHFYINPERDM-----
33 ----TRQLVVVDCETTGL-HDG.AAILEVAAVNIDTG---AE.....LHFVPFVTREQLAQAQPM
0 70 80 90 100 110 120
| | | | | | |
1 DWCQKTHSENGLIERIK.ASKLTERA.AELQTLDFLKKWVP.KGASPICGNSIAQDKRFLVKYMP
2 DWCQKTHSENGLIERIK.ASKLTERA.AELQTLDFLKKWVP.KGASPICGNSIAQDKRFLVKYMP
3 DWNVRTHTASGLVERVK.ASTMGDRE.AELATLEFLKQWVP.AGKSPICGNSIGQDRRFLFKYMP
4 DWNVRTHTASGLVERVK.ASTMGDRE.AELATLEFLKQWVP.AGKSPICGNSIGQDRRFLFKYMP
5 DWCKEHHGKSGLTKAVK.ESTITLQQ.AEYEFLSFVRQQTP.PGLCPLAGNSVHEDKKFLDKYMP
6 EWNTATHGRTGLTQRVR.ESSHTEAE.VEQKLLDFMSEWVP.RRATPMCGNSIHQDRRFMVKYMP
7 EWNTATHGRTGLTQRVR.ESSHTEAE.VEQKLLDFMSEWVP.GRATPMCGNSIHQDRRFMVKYMP
8 DWCKEHHGRSGLTKAVK.ESTITLQQ.AEYEFLSFVRQQTP.PGLCPLAGNSVHEDKKFLDKYMP
9 EWPRNTFHENGLMEKII.ASKYSMAD.AENEVIDFLKLHAL.PGKSPIAGNSIYMDRLFIKKYMP
10 EWCIEHHGNSGLTAKVL.ASEKTLAQ.VEDELLEYIQRYIPdKNVGVLAGNSVHMDRLFMVREFP
11 DVVAEMHSRSGLIDEVK.ASTVDLAT.AEAMVLDYINEHVKqPKTAPLAGNSIATDRAFIARDMP
12 DVVAEMHSRSGLINEVE.SSIVDLVT.AESIVLDYINNHVKqPKTAPLAGNSIATDRSFIARDMP
13 DWCQTHHGASGLTKKVL.LSAITERE.AEQKVIEFVKKHVG.SGNPLLAGNSVYVDFLFLKKYMP
14 EWCMKHHYNSGLIDRCK.SSDVNLEE.ASNLVLSYLEKNIP.KRACPLGGNSVYTDRLFIMKFMP
15 DWCIEQHGKSGLTERCR.QSNLTVKD.VENQLLAYIKKYIPkKREALIAGNSVHADVRFLSVEMP
16 EVVRQMHTASGLLDE-L.AGGTTLAD.AEEQVLAYVREHVKePGKAPLCGNSVGTDRGFLARDMR
17 EWCIEHHGNSESHPKVL.ASEKTLAQ.VEDELLEYIQRYIPdKNVGVLAGNSVHMDRLFMVREFP
18 --SAESQKIHKISDAML.RDKPKFGE.VFSRIKGFFKE---.--RDHIVGHHVGFDLQVLSQESE
19 --SAESQKIHKISDAML.KDKPKFSE.VFSTIKGFFKE---.--RDYIVGHHVGFDLQVLSQESE
20 --PDEASKIHGITTDAV.LSAPKFPE.AYEGFRKFCGE---.-DSILVAHNNDGFDFPLLGKECR
21 --PERIKKLTGITNAML.VGQPTIEE.VLPEFLEFVGD---.---NIVVGHFVEQDIKFINKYTK
22 --PAEATKIHGITTAEV.ADAPRFPE.AYQKFIEFCGT---.-DNILVAHNNNAFDYPLLVRECR
23 --PAEATKIHGITTSEV.ANAPKFPE.AYQQFSDFCGT---.-DNILVAHNNNAFDYPLLLRECR
24 ---HESMKFHGLDPARL.KTAHDFSE.IAEEVADLLRG---.---KVLVGYAIELDYGFLKRALK
25 --SRKSSEITGITQEML.ENKRSIEE.VLPEFLGFLED---.---SIIVAHNANFDYRFLRLWIK
26 --SAESQRVHHISNAML.RDQPKIAE.VFPQIKAFFKE---.--GDYIVGHSVGFDLQVLAQEME
27 --PPDVSKINHITDDML.VNKPRFCE.IVSDFSRFIKG---.---TVLVAHNANFDVEFLNAELS
28 --PESATAVHGLTEEYV.QRHGRWPApVMYEMAEALTEQAR.AG-RPLVVMNAPFDLTLLDRELR
29 --PAFIEQLTGISNQMV.ENEQPFEA.VAEEVFQLLDG---.---AYFVAHNIHFDLGFVKYELH
30 --CHESVKVHHIRPETLhVSGISEQA.AFTQLLDVIAG---.---KILVAHGCIMEQRFLEQYIK
31 ----GPTHVHGLTAAML.DGQPQFAD.IAGEVVDVLRG---.---RTLVAHNVAFDYAFLAAEAE
32 --PFEAYKIHGISGEFL.KDKPLFKT.IANDFLKFIAD---.---STLIIHNAPFDIKFLNHELS
33 AMQMNRYYERGIWQRRL.SPDST-DA.AYWKLANMLAG---.---NTFGGSNPAFDSRLLAAAMP
130 140 150 160 170
| | | | |
1 DLADY...FHYRHLDVSTLKELAARWKPEI.....LEG.FKKENTHLALDDIRESIKELAYYREH
2 DLADY...FHYRHLDVSTLKELAARWKPEI.....LEG.FKKENTHLALDDIRESIKELAYYREH
3 ELEAY...FHYRYLDVSTLKELARRWKPEI.....LDG.FTKQGTHQAMDDIRESVAELAYYREH
4 ELEAY...FHYRYLDVSTLKELARRWKPEI.....LDG.FTKQGTHQAMDDIRESVAELAYYREH
5 QFMKH...LHYRIIDVSTVKELCRRWYPEEy....EFA.PKKAASHRALDDISESIKELQFYRNN
6 KLENY...FHYRNLDVSTLKELAKRWNPPV.....AKS.VVKRGSHKALDDILESIEEMRHYREH
7 KLENY...FHYRNLDVSTLKELAKRWNPPV.....AKS.VVKRGSHKALDDILESIEEMRHYREH
8 QFMKH...LHYRIIDVSTVKELCRRWYPEEy....EFA.PKKAASHRALDDISESIKELQFYRNN
9 KLDKF...AHYRCIDVSTIKGLVQRWYPDY.....-KH.PKKQCTHRAFDDIMESIAELKNYRES
10 KVIDH...LFYRIVDVSSIMEVARRHNPALq....ARN.PKKEAAHTAYSDIKESIAQLQWYMDN
11 TLDSF...LHYRMIDVSSIKELCRRWYPRI.....YFGqPPKGLTHRALADIHESIRELRFYRRT
12 TLDSF...LHYRMIDVSSIKELCRRWYPRI.....YFGqPAKGLTHRALADIHESIRELRFYRRT
13 ELAAL...FPHILVDVSSVKALCARWFPIEr....RKA.PAKKNNHRAMDDIRESIKELKYYKKT
14 LVDAY...LHYRIVDVSTIKELAKRWHPAIl....DSA.PKKSFTHRSLDDIRESIKELAYYKAN
15 KIIEH...LHYRIIDVSTIKELAKRWCPDI.....-PA.YDKKGDHRALSDILESIGELQHYRSY
16 ELEGY...LHYRIVDVSSVKELARRWYPRA.....YFNsPAKNGNHRALADIRDSITELRYYREA
17 KVIDH...LFYRIVDVSSIMEVARRHNPALq....ARN.PKKEAAHTAYSDIK------------
18 RLGET...LLPKHHYVIDTLRLAKGYGDSPnn9arHFN.VPHQGNHRAMKDVEMNVKVFKHLTKR
19 RLGET...LLPKQHYVIDTLRLAKEYGDSPnn9arHFN.VPHQGNHRAMKDVEMNVKVFKHLTKR
20 RH-SL...EPLTNRTIDSLK-WAQKYRPDLp10rqVYG.FAENQAHRALDDVVILHKVFT-----
21 QY-RG...KKFRNPSLCTLK-LARKVFPGLk10aeNFG.FETNGVHRALKDATLTAEIFIKI---
22 RH-GL...SEPQLRTIDSLK-WAKKYRTDLp10rqVYG.FEENQAHRALDDVITLYRVF------
23 RH-GL...PEPQLRTIDSLK-WAKKYRTDLp10rqVYG.FEENNAHRALDDVITLHRVF------
24 REGYK...VENKRIDVIDFEKAVCYILGERp12akKYR.VEVSYRHNALADAFITAQIFQVQ---
25 KVMG-...LDWERPYIDTLA-LAKSLLKLRsy9veKLG.LGPFRHHRALDDARVTAQVFLRFVE-
26 RIGET...FLSKYTIIDTLR-LAKEYGDSPnn9avHFN.VPYDGNHRAMKDVEININIFKHLCKR
27 LC-KK...QPLSHKVVDTYA-MAQAVFPGLg12alQFG.LTVHAAHRAEDDARVCMELFTT----
28 RHRAS...SLGRWLERTPLHVLDPHVLDKHl16caHYG.VELAGAHDAAADAQAALEVVRAVGRR
29 KA-GF...QLPDCEVLDTVE-LSRIVFPGFe10seELQ.LRHDQPHRADSDAEVTGLI-------
30 MKYQN...LKLPLIWLDTLK--IEQYRTQLr14rkELN.LPTYQAHNALNDAIATAEL-------
31 IAEAE...LPVDF--VMCTVELARRLQLGVd10aaHWG.VPQQRPHDAFDDVRVLTGIL------
32 LLKRTeikFLELTNTIDTLV-MARNMFPGAr11rfKVD.NSGRQLHGALKDAAL-----------
33 DGAPE...WHHRLADLAAFT--AGKLNLDPv11ceRLG.VTVSDRHSALADAHATATCFTILR--
180
|
1 FMKLD
2 FMKL-
3 FI---
4 FI---
5 IFK--
6 FL---
7 FL---
8 IFK--
9 IFV--
10 YLKPP
11 AFVPQ
12 AFVPP
13 IFK--
14 L----
15 -----
16 VFVPQ
17 -----
18 F----
19 F----
20 -----
21 -----
22 -----
23 -----
24 -----
25 -----
26 F----
27 -----
28 -----
29 -----
30 -----
31 -----
32 -----
33 -----