# TARGET T0101 # Using neural net overrep-2500-IDaa13-5-10-7-10-5-10-11-ehl2-seeded9-stride-trained.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 10 # 7 10 # 5 10 # 11 3 (1 EHL2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0101.t2k.a2m.gz # with weighted counts, using EntropyWeight(1.4 bits/column, 10) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 10.0589 # # CHAIN 1 Pos AA E H C 10N 1S 5N 5N 5N 1 A 0.090 0.136 0.775 2 D 0.094 0.122 0.784 3 C 0.061 0.286 0.653 4 S 0.058 0.287 0.655 5 S 0.064 0.328 0.608 6 D 0.080 0.326 0.594 7 L 0.099 0.440 0.461 8 T 0.111 0.429 0.461 9 S 0.113 0.437 0.450 10 G 0.142 0.373 0.485 11 I 0.221 0.301 0.479 12 S 0.244 0.186 0.570 13 T 0.226 0.150 0.624 14 K 0.160 0.153 0.687 15 R 0.234 0.115 0.651 16 I 0.596 0.057 0.347 17 Y 0.838 0.024 0.138 18 Y 0.932 0.012 0.056 19 V 0.891 0.012 0.098 20 A 0.641 0.013 0.346 21 P 0.335 0.015 0.651 22 N 0.107 0.023 0.869 23 G 0.141 0.042 0.817 24 N 0.166 0.048 0.786 25 S 0.126 0.072 0.802 26 S 0.078 0.068 0.855 27 N 0.043 0.036 0.921 28 N 0.037 0.049 0.914 29 G 0.081 0.071 0.849 30 S 0.159 0.112 0.729 31 S 0.134 0.157 0.709 32 F 0.142 0.144 0.714 33 N 0.078 0.120 0.801 34 A 0.033 0.102 0.865 35 P 0.030 0.480 0.491 36 M 0.060 0.598 0.342 37 S 0.057 0.680 0.263 38 F 0.005 0.972 0.023 39 S 0.003 0.981 0.016 40 A 0.002 0.985 0.013 41 A 0.006 0.971 0.023 42 M 0.007 0.961 0.032 43 A 0.006 0.946 0.048 44 A 0.009 0.860 0.130 45 V 0.022 0.648 0.330 46 N 0.016 0.225 0.758 47 P 0.015 0.138 0.847 48 G 0.049 0.065 0.886 49 E 0.228 0.026 0.746 50 L 0.762 0.018 0.220 51 I 0.927 0.006 0.067 52 L 0.928 0.004 0.068 53 L 0.794 0.005 0.201 54 K 0.394 0.007 0.599 55 P 0.193 0.012 0.795 56 G 0.281 0.015 0.705 57 T 0.657 0.013 0.330 58 Y 0.775 0.011 0.215 59 T 0.704 0.012 0.283 60 I 0.614 0.009 0.377 61 P 0.364 0.018 0.618 62 Y 0.157 0.058 0.785 63 T 0.077 0.061 0.862 64 Q 0.066 0.058 0.876 65 G 0.053 0.045 0.903 66 K 0.169 0.039 0.792 67 G 0.261 0.018 0.720 68 N 0.392 0.018 0.590 69 T 0.736 0.024 0.240 70 I 0.828 0.033 0.139 71 T 0.820 0.041 0.139 72 F 0.783 0.034 0.183 73 N 0.542 0.057 0.402 74 K 0.364 0.072 0.564 75 S 0.135 0.068 0.797 76 G 0.072 0.015 0.913 77 K 0.240 0.023 0.737 78 D 0.271 0.026 0.704 79 G 0.209 0.013 0.778 80 A 0.256 0.009 0.734 81 P 0.469 0.008 0.523 82 I 0.837 0.008 0.155 83 Y 0.949 0.003 0.047 84 V 0.965 0.002 0.033 85 A 0.897 0.004 0.099 86 A 0.681 0.009 0.310 87 A 0.157 0.022 0.821 88 N 0.054 0.024 0.922 89 C 0.060 0.016 0.924 90 G 0.108 0.003 0.889 91 R 0.646 0.002 0.352 92 A 0.908 0.001 0.091 93 V 0.960 0.002 0.038 94 F 0.963 0.004 0.033 95 D 0.910 0.005 0.084 96 F 0.760 0.007 0.232 97 S 0.448 0.014 0.538 98 F 0.184 0.027 0.789 99 P 0.045 0.093 0.862 100 D 0.033 0.259 0.708 101 S 0.039 0.474 0.487 102 Q 0.066 0.568 0.366 103 W 0.168 0.539 0.293 104 V 0.271 0.495 0.234 105 Q 0.216 0.521 0.263 106 A 0.154 0.553 0.293 107 S 0.153 0.373 0.473 108 Y 0.134 0.269 0.597 109 G 0.223 0.088 0.689 110 F 0.616 0.019 0.365 111 Y 0.817 0.009 0.174 112 V 0.867 0.007 0.126 113 T 0.627 0.009 0.364 114 G 0.444 0.028 0.527 115 D 0.583 0.033 0.384 116 Y 0.650 0.042 0.309 117 W 0.582 0.042 0.376 118 Y 0.491 0.052 0.457 119 F 0.396 0.059 0.545 120 K 0.242 0.060 0.698 121 G 0.333 0.039 0.627 122 V 0.573 0.041 0.386 123 E 0.698 0.032 0.270 124 V 0.663 0.037 0.300 125 T 0.560 0.035 0.405 126 R 0.439 0.074 0.487 127 A 0.363 0.075 0.562 128 G 0.382 0.066 0.552 129 Y 0.282 0.035 0.683 130 Q 0.248 0.026 0.726 131 G 0.424 0.009 0.567 132 A 0.766 0.007 0.227 133 Y 0.887 0.006 0.108 134 V 0.894 0.006 0.100 135 I 0.758 0.006 0.237 136 G 0.439 0.009 0.552 137 S 0.135 0.022 0.843 138 H 0.046 0.491 0.463 139 N 0.043 0.708 0.249 140 T 0.050 0.811 0.139 141 F 0.062 0.852 0.085 142 E 0.069 0.871 0.061 143 N 0.044 0.904 0.052 144 T 0.044 0.888 0.068 145 A 0.045 0.866 0.090 146 F 0.022 0.880 0.098 147 H 0.035 0.749 0.216 148 H 0.063 0.581 0.356 149 N 0.110 0.394 0.496 150 R 0.157 0.267 0.576 151 N 0.117 0.058 0.825 152 T 0.190 0.061 0.749 153 G 0.415 0.045 0.540 154 L 0.734 0.034 0.232 155 E 0.859 0.024 0.116 156 I 0.759 0.026 0.215 157 N 0.439 0.039 0.522 158 N 0.101 0.047 0.852 159 G 0.096 0.031 0.873 160 G 0.368 0.049 0.584 161 S 0.352 0.061 0.587 162 Y 0.358 0.113 0.529 163 N 0.384 0.088 0.528 164 T 0.565 0.146 0.289 165 V 0.710 0.152 0.138 166 I 0.771 0.120 0.108 167 N 0.730 0.082 0.188 168 S 0.359 0.195 0.445 169 D 0.314 0.234 0.451 170 A 0.240 0.324 0.437 171 Y 0.249 0.297 0.454 172 R 0.152 0.193 0.655 173 N 0.103 0.039 0.858 174 Y 0.186 0.037 0.777 175 D 0.077 0.014 0.909 176 P 0.035 0.047 0.918 177 K 0.022 0.059 0.919 178 K 0.029 0.082 0.889 179 N 0.012 0.039 0.950 180 G 0.023 0.048 0.929 181 S 0.069 0.074 0.857 182 M 0.074 0.103 0.822 183 A 0.073 0.162 0.765 184 D 0.127 0.143 0.730 185 G 0.111 0.261 0.629 186 F 0.121 0.336 0.543 187 G 0.347 0.370 0.283 188 P 0.410 0.349 0.241 189 K 0.511 0.279 0.210 190 Q 0.461 0.222 0.317 191 K 0.380 0.155 0.465 192 Q 0.237 0.113 0.650 193 G 0.040 0.012 0.948 194 P 0.037 0.012 0.951 195 G 0.080 0.016 0.904 196 N 0.433 0.010 0.556 197 R 0.764 0.006 0.230 198 F 0.869 0.005 0.126 199 V 0.814 0.006 0.181 200 G 0.827 0.007 0.166 201 C 0.896 0.004 0.101 202 R 0.924 0.004 0.073 203 A 0.922 0.007 0.071 204 W 0.878 0.007 0.114 205 E 0.755 0.017 0.227 206 N 0.505 0.031 0.463 207 S 0.338 0.057 0.605 208 D 0.203 0.062 0.735 209 D 0.137 0.087 0.776 210 G 0.136 0.031 0.833 211 F 0.246 0.026 0.728 212 D 0.151 0.015 0.833 213 L 0.086 0.063 0.852 214 F 0.053 0.049 0.898 215 D 0.050 0.055 0.895 216 S 0.063 0.041 0.895 217 P 0.302 0.026 0.672 218 Q 0.599 0.010 0.392 219 K 0.782 0.006 0.212 220 V 0.965 0.005 0.030 221 V 0.982 0.004 0.014 222 I 0.965 0.002 0.033 223 E 0.804 0.004 0.193 224 N 0.207 0.009 0.784 225 S 0.156 0.029 0.815 226 W 0.534 0.065 0.401 227 A 0.605 0.074 0.321 228 F 0.539 0.072 0.388 229 R 0.360 0.064 0.576 230 N 0.146 0.091 0.763 231 G 0.133 0.094 0.773 232 I 0.402 0.111 0.487 233 N 0.525 0.087 0.388 234 Y 0.444 0.076 0.480 235 W 0.368 0.070 0.563 236 N 0.245 0.069 0.686 237 D 0.303 0.099 0.598 238 S 0.621 0.066 0.313 239 A 0.696 0.044 0.260 240 F 0.692 0.029 0.279 241 A 0.544 0.028 0.428 242 G 0.267 0.031 0.702 243 N 0.101 0.030 0.869 244 G 0.110 0.018 0.872 245 N 0.439 0.013 0.548 246 G 0.580 0.010 0.410 247 F 0.807 0.009 0.184 248 K 0.825 0.009 0.166 249 L 0.657 0.020 0.323 250 G 0.346 0.018 0.636 251 G 0.200 0.019 0.780 252 N 0.167 0.041 0.792 253 Q 0.197 0.054 0.749 254 A 0.430 0.053 0.518 255 V 0.515 0.047 0.438 256 G 0.424 0.053 0.523 257 N 0.325 0.044 0.631 258 H 0.536 0.058 0.407 259 R 0.828 0.029 0.143 260 I 0.895 0.019 0.086 261 T 0.891 0.014 0.096 262 R 0.667 0.021 0.312 263 S 0.564 0.011 0.425 264 V 0.854 0.012 0.134 265 A 0.898 0.014 0.089 266 F 0.910 0.013 0.077 267 G 0.772 0.013 0.215 268 N 0.519 0.020 0.461 269 V 0.240 0.039 0.721 270 S 0.210 0.043 0.747 271 K 0.335 0.039 0.625 272 G 0.268 0.024 0.708 273 F 0.411 0.027 0.562 274 D 0.454 0.030 0.516 275 Q 0.468 0.039 0.493 276 N 0.568 0.016 0.417 277 N 0.497 0.010 0.493 278 N 0.243 0.007 0.750 279 A 0.164 0.036 0.800 280 G 0.186 0.031 0.783 281 G 0.468 0.023 0.509 282 V 0.783 0.012 0.205 283 T 0.913 0.005 0.082 284 V 0.902 0.004 0.094 285 I 0.700 0.006 0.294 286 N 0.409 0.008 0.582 287 N 0.334 0.011 0.655 288 T 0.727 0.017 0.256 289 S 0.776 0.020 0.204 290 Y 0.669 0.020 0.310 291 K 0.361 0.025 0.614 292 N 0.068 0.039 0.892 293 G 0.061 0.020 0.919 294 I 0.493 0.016 0.492 295 N 0.753 0.008 0.239 296 Y 0.769 0.009 0.222 297 G 0.471 0.013 0.516 298 F 0.206 0.061 0.733 299 G 0.346 0.053 0.600 300 S 0.784 0.030 0.186 301 N 0.832 0.018 0.150 302 V 0.738 0.027 0.236 303 Q 0.283 0.056 0.661 304 S 0.025 0.062 0.913 305 G 0.036 0.047 0.917 306 Q 0.329 0.045 0.626 307 K 0.466 0.040 0.494 308 H 0.626 0.030 0.344 309 Y 0.667 0.032 0.301 310 F 0.608 0.070 0.322 311 R 0.464 0.116 0.420 312 N 0.418 0.097 0.485 313 N 0.608 0.072 0.321 314 V 0.749 0.044 0.208 315 S 0.813 0.029 0.158 316 L 0.733 0.032 0.235 317 S 0.458 0.031 0.510 318 A 0.286 0.055 0.658 319 S 0.243 0.080 0.677 320 V 0.436 0.125 0.439 321 T 0.539 0.111 0.350 322 V 0.471 0.135 0.394 323 S 0.276 0.122 0.602 324 N 0.172 0.202 0.626 325 A 0.216 0.279 0.505 326 D 0.336 0.241 0.424 327 A 0.448 0.158 0.394 328 K 0.371 0.115 0.514 329 S 0.223 0.094 0.683 330 N 0.102 0.058 0.841 331 S 0.105 0.053 0.843 332 W 0.209 0.040 0.750 333 D 0.247 0.034 0.719 334 T 0.361 0.084 0.555 335 G 0.486 0.074 0.441 336 P 0.506 0.101 0.393 337 A 0.632 0.122 0.246 338 A 0.722 0.094 0.185 339 S 0.744 0.063 0.193 340 A 0.541 0.099 0.360 341 S 0.263 0.105 0.632 342 D 0.235 0.144 0.621 343 F 0.351 0.231 0.417 344 V 0.485 0.218 0.297 345 S 0.512 0.210 0.277 346 L 0.398 0.211 0.391 347 D 0.157 0.260 0.583 348 T 0.058 0.445 0.497 349 S 0.056 0.501 0.444 350 L 0.083 0.581 0.336 351 A 0.111 0.570 0.319 352 T 0.112 0.585 0.303 353 V 0.085 0.570 0.345 354 S 0.071 0.483 0.445 355 R 0.051 0.382 0.567 356 D 0.030 0.344 0.626 357 N 0.049 0.358 0.593 358 D 0.052 0.344 0.604 359 G 0.064 0.137 0.799 360 T 0.133 0.113 0.755 361 L 0.093 0.039 0.868 362 P 0.143 0.065 0.792 363 E 0.339 0.147 0.515 364 T 0.608 0.125 0.267 365 S 0.748 0.109 0.143 366 L 0.785 0.092 0.122 367 F 0.767 0.071 0.162 368 R 0.656 0.069 0.275 369 L 0.509 0.075 0.416 370 S 0.246 0.087 0.667 371 A 0.057 0.132 0.811 372 N 0.024 0.095 0.882 373 S 0.051 0.110 0.839 374 K 0.172 0.096 0.733 375 L 0.468 0.092 0.440 376 I 0.528 0.086 0.386 377 N 0.367 0.146 0.487 378 A 0.278 0.150 0.573 379 G 0.419 0.114 0.468 380 T 0.591 0.073 0.336 381 K 0.662 0.070 0.268 382 E 0.523 0.093 0.384 383 S 0.373 0.124 0.503 384 N 0.361 0.117 0.522 385 I 0.523 0.107 0.369 386 S 0.571 0.086 0.342 387 Y 0.549 0.072 0.379 388 S 0.361 0.073 0.566 389 G 0.236 0.037 0.727 390 S 0.234 0.048 0.718 391 A 0.174 0.217 0.609 392 P 0.102 0.321 0.577 393 D 0.075 0.472 0.453 394 L 0.090 0.395 0.515 395 G 0.116 0.391 0.493 396 A 0.183 0.376 0.440 397 F 0.160 0.370 0.470 398 E 0.201 0.261 0.537 399 R 0.116 0.133 0.752 400 N 0.023 0.026 0.951