# TARGET T0100 # Using neural net overrep-2500-IDaa13-5-10-7-10-5-10-11-ehl2-seeded9-stride-trained.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 10 # 7 10 # 5 10 # 11 3 (1 EHL2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0100.t2k.a2m.gz # with weighted counts, using EntropyWeight(1.4 bits/column, 10) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 30.0563 # # CHAIN 1 Pos AA E H C 10N 1S 5N 5N 5N 1 A 0.14 0.02 0.84 2 T 0.32 0.01 0.66 3 T 0.45 0.01 0.54 4 Y 0.55 0.01 0.44 5 N 0.77 0.00 0.23 6 A 0.94 0.00 0.06 7 V 0.97 0.00 0.03 8 V 0.95 0.00 0.04 9 S 0.81 0.00 0.18 10 K 0.49 0.01 0.51 11 S 0.22 0.02 0.77 12 S 0.20 0.04 0.77 13 S 0.14 0.06 0.80 14 D 0.07 0.05 0.88 15 G 0.04 0.14 0.82 16 K 0.08 0.16 0.76 17 T 0.13 0.18 0.69 18 F 0.18 0.30 0.52 19 K 0.24 0.18 0.58 20 T 0.13 0.31 0.56 21 I 0.00 0.98 0.02 22 A 0.00 0.99 0.01 23 D 0.00 0.99 0.01 24 A 0.01 0.95 0.05 25 I 0.01 0.93 0.06 26 A 0.03 0.82 0.16 27 S 0.04 0.62 0.34 28 A 0.13 0.24 0.63 29 P 0.08 0.10 0.82 30 A 0.02 0.10 0.88 31 G 0.01 0.04 0.95 32 S 0.01 0.01 0.97 33 T 0.04 0.00 0.96 34 P 0.43 0.00 0.57 35 F 0.91 0.00 0.09 36 V 0.99 0.00 0.01 37 I 1.00 0.00 0.00 38 L 1.00 0.00 0.00 39 I 0.97 0.00 0.03 40 K 0.74 0.00 0.26 41 N 0.26 0.00 0.74 42 G 0.25 0.00 0.75 43 V 0.80 0.00 0.20 44 Y 0.83 0.00 0.16 45 N 0.80 0.01 0.20 46 E 0.85 0.00 0.14 47 R 0.88 0.00 0.12 48 L 0.94 0.00 0.06 49 T 0.93 0.00 0.07 50 I 0.76 0.00 0.24 51 T 0.38 0.01 0.61 52 R 0.09 0.01 0.90 53 N 0.07 0.01 0.92 54 N 0.38 0.00 0.62 55 L 0.82 0.00 0.18 56 H 0.95 0.00 0.05 57 L 0.96 0.00 0.03 58 K 0.90 0.00 0.09 59 G 0.72 0.00 0.28 60 E 0.35 0.01 0.64 61 S 0.15 0.01 0.84 62 R 0.12 0.01 0.86 63 N 0.15 0.01 0.84 64 G 0.37 0.01 0.62 65 A 0.81 0.00 0.19 66 V 0.95 0.00 0.04 67 I 0.97 0.00 0.03 68 A 0.94 0.00 0.05 69 A 0.84 0.01 0.15 70 A 0.62 0.02 0.36 71 T 0.57 0.03 0.39 72 A 0.53 0.06 0.42 73 A 0.42 0.11 0.47 74 G 0.30 0.14 0.56 75 T 0.25 0.16 0.58 76 L 0.22 0.18 0.60 77 K 0.18 0.19 0.63 78 S 0.18 0.19 0.64 79 D 0.12 0.16 0.72 80 G 0.08 0.13 0.79 81 S 0.06 0.09 0.85 82 K 0.08 0.06 0.86 83 W 0.17 0.05 0.78 84 G 0.20 0.02 0.78 85 T 0.42 0.02 0.56 86 A 0.48 0.02 0.50 87 G 0.45 0.02 0.53 88 S 0.69 0.01 0.30 89 S 0.88 0.01 0.11 90 T 0.95 0.00 0.04 91 I 0.97 0.00 0.02 92 T 0.97 0.01 0.03 93 I 0.93 0.01 0.06 94 S 0.80 0.01 0.18 95 A 0.39 0.02 0.59 96 K 0.15 0.03 0.83 97 D 0.26 0.03 0.70 98 F 0.64 0.02 0.35 99 S 0.83 0.01 0.16 100 A 0.92 0.01 0.07 101 Q 0.88 0.01 0.11 102 S 0.84 0.01 0.14 103 L 0.89 0.01 0.10 104 T 0.90 0.01 0.10 105 I 0.91 0.01 0.08 106 R 0.80 0.03 0.16 107 N 0.62 0.06 0.32 108 D 0.36 0.08 0.56 109 F 0.18 0.07 0.75 110 D 0.11 0.06 0.83 111 F 0.09 0.05 0.86 112 P 0.08 0.06 0.86 113 A 0.04 0.07 0.90 114 N 0.02 0.12 0.86 115 Q 0.03 0.16 0.81 116 A 0.07 0.16 0.76 117 K 0.15 0.16 0.69 118 S 0.21 0.10 0.69 119 D 0.17 0.09 0.74 120 S 0.09 0.11 0.81 121 D 0.09 0.11 0.80 122 S 0.08 0.14 0.78 123 S 0.06 0.10 0.84 124 K 0.06 0.12 0.82 125 I 0.07 0.12 0.81 126 K 0.06 0.15 0.79 127 D 0.12 0.10 0.78 128 T 0.11 0.08 0.81 129 Q 0.38 0.08 0.54 130 A 0.73 0.05 0.22 131 V 0.77 0.08 0.15 132 A 0.92 0.06 0.02 133 L 0.96 0.02 0.02 134 Y 0.94 0.02 0.04 135 V 0.87 0.02 0.11 136 T 0.66 0.03 0.32 137 K 0.47 0.02 0.51 138 S 0.11 0.01 0.87 139 G 0.06 0.19 0.75 140 D 0.09 0.18 0.73 141 R 0.29 0.27 0.45 142 A 0.63 0.15 0.23 143 Y 0.82 0.08 0.10 144 F 0.82 0.05 0.13 145 K 0.70 0.05 0.26 146 D 0.61 0.03 0.36 147 V 0.58 0.02 0.41 148 S 0.74 0.01 0.25 149 L 0.76 0.01 0.23 150 V 0.68 0.01 0.31 151 G 0.44 0.05 0.51 152 Y 0.46 0.04 0.50 153 Q 0.29 0.05 0.66 154 D 0.11 0.01 0.88 155 T 0.73 0.02 0.24 156 L 0.90 0.01 0.09 157 Y 0.87 0.02 0.11 158 V 0.77 0.02 0.21 159 S 0.38 0.05 0.57 160 G 0.16 0.08 0.76 161 G 0.14 0.07 0.79 162 R 0.47 0.06 0.47 163 S 0.78 0.04 0.17 164 F 0.88 0.03 0.09 165 F 0.74 0.07 0.19 166 S 0.49 0.10 0.41 167 D 0.35 0.11 0.54 168 C 0.56 0.06 0.39 169 R 0.79 0.05 0.16 170 I 0.87 0.03 0.10 171 S 0.85 0.02 0.13 172 G 0.68 0.06 0.26 173 T 0.69 0.04 0.27 174 V 0.61 0.06 0.33 175 D 0.55 0.04 0.40 176 F 0.92 0.03 0.06 177 I 0.95 0.02 0.04 178 F 0.93 0.01 0.06 179 G 0.69 0.02 0.30 180 D 0.42 0.02 0.56 181 G 0.62 0.03 0.35 182 T 0.80 0.03 0.17 183 A 0.94 0.02 0.04 184 L 0.95 0.01 0.03 185 F 0.90 0.01 0.09 186 N 0.68 0.01 0.31 187 N 0.40 0.00 0.60 188 C 0.61 0.00 0.38 189 D 0.93 0.00 0.07 190 L 0.98 0.00 0.02 191 V 0.98 0.00 0.02 192 S 0.88 0.01 0.12 193 R 0.61 0.01 0.37 194 Y 0.18 0.03 0.79 195 R 0.02 0.01 0.96 196 A 0.07 0.17 0.76 197 D 0.15 0.29 0.56 198 V 0.16 0.33 0.51 199 K 0.19 0.22 0.59 200 S 0.07 0.10 0.83 201 G 0.04 0.14 0.83 202 N 0.05 0.10 0.84 203 V 0.23 0.05 0.72 204 S 0.44 0.01 0.54 205 G 0.65 0.00 0.35 206 Y 0.91 0.00 0.09 207 L 0.96 0.01 0.03 208 T 0.95 0.01 0.05 209 A 0.82 0.01 0.17 210 P 0.40 0.01 0.59 211 S 0.22 0.01 0.77 212 T 0.19 0.01 0.80 213 N 0.06 0.01 0.94 214 I 0.02 0.16 0.83 215 N 0.04 0.15 0.81 216 Q 0.07 0.19 0.74 217 K 0.12 0.04 0.84 218 Y 0.37 0.02 0.61 219 G 0.57 0.01 0.42 220 L 0.88 0.01 0.11 221 V 0.97 0.00 0.02 222 I 0.96 0.00 0.04 223 T 0.91 0.00 0.09 224 N 0.74 0.00 0.26 225 S 0.54 0.00 0.46 226 R 0.80 0.00 0.20 227 V 0.91 0.00 0.09 228 I 0.83 0.01 0.17 229 R 0.62 0.01 0.37 230 E 0.20 0.02 0.77 231 S 0.04 0.05 0.91 232 D 0.04 0.09 0.88 233 S 0.18 0.11 0.71 234 V 0.28 0.10 0.62 235 P 0.27 0.09 0.64 236 A 0.26 0.09 0.65 237 K 0.33 0.09 0.58 238 S 0.59 0.05 0.37 239 Y 0.81 0.03 0.16 240 G 0.81 0.03 0.17 241 L 0.67 0.03 0.30 242 G 0.38 0.03 0.59 243 R 0.27 0.02 0.71 244 P 0.17 0.04 0.79 245 W 0.08 0.26 0.66 246 H 0.10 0.27 0.63 247 P 0.09 0.24 0.68 248 T 0.10 0.18 0.73 249 T 0.13 0.14 0.73 250 T 0.13 0.08 0.79 251 F 0.13 0.12 0.74 252 S 0.17 0.08 0.75 253 D 0.17 0.08 0.74 254 G 0.14 0.07 0.79 255 R 0.23 0.05 0.72 256 Y 0.24 0.04 0.71 257 A 0.15 0.04 0.81 258 D 0.19 0.03 0.78 259 P 0.31 0.04 0.65 260 N 0.43 0.02 0.54 261 A 0.36 0.02 0.62 262 I 0.13 0.01 0.85 263 G 0.21 0.01 0.78 264 Q 0.60 0.00 0.39 265 T 0.85 0.00 0.15 266 V 0.96 0.00 0.04 267 F 0.95 0.00 0.04 268 L 0.88 0.01 0.11 269 N 0.63 0.02 0.35 270 T 0.38 0.06 0.56 271 S 0.26 0.12 0.61 272 M 0.11 0.44 0.45 273 D 0.07 0.57 0.37 274 N 0.08 0.62 0.30 275 H 0.15 0.53 0.31 276 I 0.17 0.45 0.38 277 Y 0.11 0.36 0.53 278 G 0.07 0.19 0.74 279 W 0.15 0.14 0.71 280 D 0.20 0.10 0.70 281 K 0.23 0.09 0.68 282 M 0.27 0.05 0.68 283 S 0.27 0.05 0.69 284 G 0.22 0.04 0.74 285 K 0.16 0.03 0.80 286 D 0.14 0.09 0.77 287 K 0.10 0.11 0.79 288 N 0.06 0.13 0.81 289 G 0.03 0.18 0.80 290 N 0.07 0.31 0.62 291 T 0.19 0.34 0.47 292 I 0.32 0.24 0.44 293 W 0.34 0.21 0.45 294 F 0.21 0.20 0.59 295 N 0.12 0.19 0.69 296 P 0.09 0.15 0.75 297 E 0.12 0.10 0.78 298 D 0.33 0.04 0.64 299 S 0.63 0.01 0.36 300 R 0.85 0.01 0.14 301 F 0.94 0.01 0.05 302 F 0.93 0.02 0.05 303 E 0.90 0.02 0.09 304 Y 0.82 0.02 0.17 305 K 0.37 0.02 0.60 306 S 0.25 0.01 0.74 307 Y 0.18 0.03 0.79 308 G 0.06 0.01 0.93 309 A 0.06 0.02 0.92 310 G 0.06 0.03 0.91 311 A 0.06 0.09 0.85 312 A 0.07 0.11 0.82 313 V 0.10 0.20 0.70 314 S 0.11 0.16 0.73 315 K 0.20 0.13 0.67 316 D 0.38 0.11 0.51 317 R 0.41 0.12 0.47 318 R 0.34 0.09 0.57 319 Q 0.20 0.13 0.66 320 L 0.10 0.23 0.67 321 T 0.10 0.33 0.56 322 D 0.17 0.39 0.44 323 A 0.26 0.35 0.39 324 Q 0.28 0.33 0.38 325 A 0.21 0.39 0.41 326 A 0.12 0.39 0.49 327 E 0.12 0.39 0.49 328 Y 0.18 0.38 0.44 329 T 0.28 0.31 0.41 330 Q 0.35 0.35 0.30 331 S 0.39 0.33 0.28 332 K 0.47 0.30 0.23 333 V 0.43 0.31 0.26 334 L 0.42 0.24 0.34 335 G 0.17 0.21 0.62 336 D 0.09 0.23 0.68 337 W 0.07 0.26 0.67 338 T 0.07 0.16 0.78 339 P 0.04 0.15 0.82 340 T 0.04 0.11 0.85 341 L 0.04 0.05 0.91 342 P 0.01 0.01 0.98