# TARGET T0100 # Using neural net overrep-2500-IDaa13-5-10-7-10-5-10-11-ehl2-seeded9-stride-trained.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 10 # 7 10 # 5 10 # 11 3 (1 EHL2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0100.remote-t2k.a2m.gz # with weighted counts, using EntropyWeight(1.4 bits/column, 10) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 42.0242 # # CHAIN 1 Pos AA E H C 10N 1S 5N 5N 5N 1 A 0.132 0.017 0.851 2 T 0.320 0.013 0.667 3 T 0.481 0.007 0.512 4 Y 0.605 0.007 0.388 5 N 0.789 0.005 0.206 6 A 0.943 0.003 0.054 7 V 0.970 0.003 0.027 8 V 0.947 0.002 0.050 9 S 0.797 0.004 0.199 10 K 0.422 0.010 0.567 11 S 0.178 0.023 0.799 12 S 0.173 0.047 0.780 13 S 0.081 0.078 0.842 14 D 0.041 0.062 0.896 15 G 0.045 0.145 0.811 16 K 0.087 0.146 0.767 17 T 0.144 0.139 0.717 18 F 0.154 0.326 0.520 19 K 0.186 0.204 0.611 20 T 0.106 0.343 0.551 21 I 0.001 0.984 0.014 22 A 0.001 0.986 0.014 23 D 0.001 0.983 0.017 24 A 0.004 0.934 0.062 25 I 0.007 0.905 0.089 26 A 0.017 0.790 0.193 27 S 0.023 0.610 0.367 28 A 0.072 0.240 0.688 29 P 0.076 0.135 0.789 30 A 0.033 0.101 0.866 31 G 0.023 0.043 0.934 32 S 0.027 0.017 0.957 33 T 0.056 0.005 0.939 34 P 0.374 0.002 0.625 35 F 0.854 0.001 0.146 36 V 0.981 0.001 0.019 37 I 0.997 0.001 0.003 38 L 0.996 0.001 0.003 39 I 0.963 0.001 0.036 40 K 0.695 0.002 0.303 41 N 0.250 0.004 0.746 42 G 0.286 0.002 0.713 43 V 0.820 0.002 0.179 44 Y 0.849 0.003 0.148 45 N 0.811 0.004 0.185 46 E 0.857 0.004 0.139 47 R 0.887 0.003 0.110 48 L 0.944 0.002 0.055 49 T 0.916 0.002 0.082 50 I 0.717 0.003 0.280 51 T 0.294 0.007 0.699 52 R 0.073 0.011 0.917 53 N 0.082 0.009 0.909 54 N 0.399 0.005 0.596 55 L 0.836 0.003 0.161 56 H 0.949 0.003 0.049 57 L 0.952 0.003 0.045 58 K 0.860 0.005 0.135 59 G 0.656 0.005 0.339 60 E 0.278 0.009 0.713 61 S 0.116 0.011 0.873 62 R 0.159 0.014 0.827 63 N 0.256 0.012 0.732 64 G 0.528 0.007 0.464 65 A 0.870 0.004 0.126 66 V 0.949 0.004 0.047 67 I 0.948 0.004 0.048 68 A 0.891 0.006 0.104 69 A 0.705 0.013 0.282 70 A 0.494 0.032 0.474 71 T 0.477 0.073 0.450 72 A 0.507 0.096 0.397 73 A 0.469 0.148 0.383 74 G 0.399 0.182 0.420 75 T 0.349 0.222 0.429 76 L 0.315 0.229 0.456 77 K 0.246 0.241 0.513 78 S 0.195 0.222 0.583 79 D 0.125 0.181 0.694 80 G 0.090 0.135 0.775 81 S 0.070 0.093 0.837 82 K 0.088 0.050 0.863 83 W 0.178 0.043 0.779 84 G 0.243 0.021 0.737 85 T 0.442 0.021 0.538 86 A 0.498 0.017 0.484 87 G 0.508 0.009 0.483 88 S 0.681 0.009 0.310 89 S 0.872 0.004 0.124 90 T 0.955 0.003 0.042 91 I 0.974 0.003 0.023 92 T 0.970 0.004 0.026 93 I 0.932 0.004 0.064 94 S 0.803 0.008 0.189 95 A 0.441 0.019 0.540 96 K 0.139 0.022 0.839 97 D 0.269 0.024 0.707 98 F 0.682 0.013 0.306 99 S 0.860 0.006 0.134 100 A 0.932 0.005 0.063 101 Q 0.877 0.007 0.116 102 S 0.845 0.005 0.150 103 L 0.891 0.004 0.105 104 T 0.908 0.004 0.088 105 I 0.920 0.007 0.073 106 R 0.801 0.017 0.182 107 N 0.592 0.031 0.377 108 D 0.260 0.057 0.683 109 F 0.132 0.063 0.804 110 D 0.105 0.059 0.836 111 F 0.089 0.056 0.855 112 P 0.081 0.059 0.860 113 A 0.033 0.054 0.913 114 N 0.019 0.120 0.860 115 Q 0.026 0.164 0.809 116 A 0.060 0.171 0.769 117 K 0.115 0.172 0.714 118 S 0.171 0.122 0.707 119 D 0.157 0.117 0.726 120 S 0.093 0.138 0.769 121 D 0.099 0.117 0.784 122 S 0.092 0.129 0.779 123 S 0.070 0.080 0.850 124 K 0.074 0.101 0.826 125 I 0.068 0.125 0.807 126 K 0.076 0.131 0.793 127 D 0.144 0.081 0.774 128 T 0.153 0.042 0.804 129 Q 0.469 0.028 0.504 130 A 0.799 0.014 0.186 131 V 0.881 0.020 0.099 132 A 0.967 0.016 0.017 133 L 0.981 0.007 0.012 134 Y 0.956 0.006 0.038 135 V 0.861 0.008 0.131 136 T 0.646 0.008 0.346 137 K 0.348 0.005 0.648 138 S 0.097 0.003 0.900 139 G 0.079 0.138 0.784 140 D 0.105 0.134 0.761 141 R 0.382 0.191 0.427 142 A 0.785 0.062 0.153 143 Y 0.915 0.025 0.059 144 F 0.905 0.017 0.078 145 K 0.788 0.017 0.195 146 D 0.684 0.015 0.301 147 V 0.589 0.014 0.397 148 S 0.716 0.010 0.273 149 L 0.729 0.011 0.261 150 V 0.654 0.012 0.335 151 G 0.400 0.059 0.541 152 Y 0.423 0.039 0.538 153 Q 0.260 0.057 0.683 154 D 0.100 0.008 0.892 155 T 0.761 0.019 0.220 156 L 0.918 0.010 0.071 157 Y 0.890 0.016 0.094 158 V 0.793 0.018 0.189 159 S 0.402 0.043 0.555 160 G 0.185 0.061 0.754 161 G 0.174 0.051 0.774 162 R 0.491 0.044 0.465 163 S 0.813 0.034 0.153 164 F 0.900 0.026 0.074 165 F 0.769 0.056 0.176 166 S 0.512 0.083 0.405 167 D 0.338 0.096 0.566 168 C 0.550 0.054 0.396 169 R 0.791 0.048 0.160 170 I 0.879 0.026 0.095 171 S 0.856 0.020 0.124 172 G 0.690 0.062 0.248 173 T 0.705 0.044 0.251 174 V 0.636 0.060 0.304 175 D 0.573 0.046 0.380 176 F 0.921 0.026 0.054 177 I 0.945 0.017 0.038 178 F 0.928 0.011 0.061 179 G 0.692 0.016 0.292 180 D 0.431 0.022 0.547 181 G 0.641 0.029 0.331 182 T 0.815 0.027 0.158 183 A 0.943 0.016 0.040 184 L 0.957 0.012 0.031 185 F 0.901 0.010 0.089 186 N 0.685 0.009 0.306 187 N 0.390 0.003 0.607 188 C 0.608 0.001 0.392 189 D 0.938 0.001 0.061 190 L 0.981 0.001 0.018 191 V 0.980 0.002 0.018 192 S 0.892 0.006 0.102 193 R 0.636 0.010 0.355 194 Y 0.180 0.023 0.797 195 R 0.026 0.026 0.949 196 A 0.065 0.202 0.733 197 D 0.130 0.317 0.553 198 V 0.142 0.335 0.523 199 K 0.170 0.232 0.597 200 S 0.061 0.103 0.836 201 G 0.037 0.134 0.829 202 N 0.055 0.098 0.847 203 V 0.232 0.049 0.719 204 S 0.448 0.014 0.539 205 G 0.645 0.004 0.351 206 Y 0.908 0.005 0.088 207 L 0.966 0.006 0.028 208 T 0.947 0.006 0.047 209 A 0.817 0.006 0.177 210 P 0.389 0.008 0.604 211 S 0.207 0.009 0.784 212 T 0.194 0.011 0.795 213 N 0.058 0.008 0.934 214 I 0.016 0.166 0.818 215 N 0.036 0.151 0.813 216 Q 0.065 0.193 0.741 217 K 0.104 0.040 0.856 218 Y 0.367 0.020 0.613 219 G 0.576 0.006 0.418 220 L 0.887 0.005 0.108 221 V 0.974 0.004 0.022 222 I 0.959 0.003 0.038 223 T 0.911 0.002 0.087 224 N 0.740 0.004 0.256 225 S 0.539 0.005 0.457 226 R 0.804 0.004 0.192 227 V 0.918 0.003 0.079 228 I 0.842 0.007 0.151 229 R 0.649 0.009 0.341 230 E 0.217 0.020 0.763 231 S 0.041 0.045 0.914 232 D 0.032 0.079 0.889 233 S 0.172 0.099 0.729 234 V 0.275 0.094 0.630 235 P 0.285 0.083 0.632 236 A 0.292 0.084 0.624 237 K 0.374 0.089 0.537 238 S 0.627 0.045 0.328 239 Y 0.827 0.030 0.144 240 G 0.816 0.027 0.157 241 L 0.678 0.033 0.289 242 G 0.393 0.031 0.577 243 R 0.283 0.018 0.699 244 P 0.177 0.038 0.786 245 W 0.079 0.262 0.659 246 H 0.108 0.286 0.606 247 P 0.101 0.259 0.640 248 T 0.121 0.192 0.686 249 T 0.171 0.160 0.670 250 T 0.196 0.088 0.716 251 F 0.212 0.101 0.688 252 S 0.241 0.068 0.691 253 D 0.220 0.065 0.714 254 G 0.173 0.063 0.764 255 R 0.277 0.045 0.678 256 Y 0.269 0.040 0.691 257 A 0.156 0.035 0.809 258 D 0.175 0.029 0.796 259 P 0.328 0.035 0.637 260 N 0.453 0.023 0.524 261 A 0.360 0.019 0.621 262 I 0.135 0.011 0.854 263 G 0.220 0.007 0.773 264 Q 0.649 0.003 0.348 265 T 0.870 0.003 0.127 266 V 0.962 0.004 0.034 267 F 0.955 0.005 0.041 268 L 0.872 0.009 0.118 269 N 0.609 0.023 0.367 270 T 0.357 0.056 0.587 271 S 0.247 0.119 0.634 272 M 0.104 0.444 0.452 273 D 0.064 0.560 0.376 274 N 0.072 0.617 0.310 275 H 0.152 0.523 0.325 276 I 0.176 0.437 0.388 277 Y 0.115 0.351 0.534 278 G 0.077 0.209 0.714 279 W 0.146 0.165 0.689 280 D 0.195 0.118 0.686 281 K 0.228 0.100 0.672 282 M 0.248 0.065 0.687 283 S 0.220 0.063 0.717 284 G 0.171 0.064 0.764 285 K 0.158 0.062 0.780 286 D 0.179 0.112 0.709 287 K 0.134 0.134 0.732 288 N 0.083 0.127 0.790 289 G 0.037 0.167 0.796 290 N 0.075 0.263 0.662 291 T 0.214 0.288 0.498 292 I 0.339 0.204 0.457 293 W 0.359 0.177 0.464 294 F 0.223 0.179 0.598 295 N 0.125 0.168 0.707 296 P 0.100 0.125 0.775 297 E 0.139 0.081 0.780 298 D 0.387 0.028 0.585 299 S 0.672 0.011 0.317 300 R 0.867 0.008 0.125 301 F 0.939 0.013 0.048 302 F 0.930 0.016 0.054 303 E 0.891 0.017 0.092 304 Y 0.795 0.018 0.187 305 K 0.334 0.021 0.645 306 S 0.235 0.014 0.752 307 Y 0.179 0.027 0.794 308 G 0.056 0.009 0.935 309 A 0.061 0.020 0.919 310 G 0.063 0.027 0.910 311 A 0.057 0.078 0.865 312 A 0.065 0.093 0.843 313 V 0.103 0.169 0.728 314 S 0.133 0.121 0.745 315 K 0.272 0.114 0.614 316 D 0.429 0.093 0.478 317 R 0.403 0.108 0.489 318 R 0.326 0.071 0.603 319 Q 0.190 0.132 0.678 320 L 0.098 0.208 0.694 321 T 0.101 0.311 0.589 322 D 0.165 0.350 0.485 323 A 0.236 0.329 0.436 324 Q 0.254 0.318 0.428 325 A 0.183 0.402 0.415 326 A 0.119 0.433 0.447 327 E 0.140 0.443 0.417 328 Y 0.196 0.415 0.388 329 T 0.280 0.341 0.379 330 Q 0.380 0.280 0.340 331 S 0.398 0.286 0.316 332 K 0.484 0.249 0.266 333 V 0.436 0.266 0.298 334 L 0.394 0.219 0.387 335 G 0.202 0.220 0.578 336 D 0.131 0.207 0.662 337 W 0.105 0.296 0.599 338 T 0.082 0.239 0.679 339 P 0.035 0.210 0.755 340 T 0.033 0.146 0.821 341 L 0.037 0.064 0.900 342 P 0.010 0.010 0.980