; SAM: prettyalign v2.1.1 (Apr 24, 1998) compiled 04/27/98_12:32:27. ; SAM: Sequence Alignment and Modeling Software System ; (c) 1992-1998 Regents of the University of California, Santa Cruz ; http://www.cse.ucsc.edu/research/compbio/sam.html ; ; ------ Citations (HMMs, SAM) ------ ; A. Krogh et al., Hidden Markov models in computational biology: ; Applications to protein modeling, JMB 235:1501-1531, Feb 1994. ; R. Hughey, A. Krogh, Hidden Markov models for sequence analysis: ; Extension and analysis of the basic method, CABIOS 12:95-107, 1996. ; ----------------------- ; Sequence numbers correspond to the following labels: ; 1 SW:YJI3_YEAST_463:553 ; 2 SW:YKZ9_YEAST_498:571 ; 3 SW:YBE7_YEAST_128:221 ; 4 GP:SC22KBF_1_128:221 ; 5 SW:END3_YEAST_8:96 ; 6 PIR2:S57952_6:98 ; 7 GP:SPAC27F1_1_276:371 ; 8 SW:YAV1_SCHPO_276:371 ; 9 SW:PAN1_YEAST_265:361 ; 10 GP:YSCPAN1A_1_275:362 ; 11 GP:YSCPAN1A_1_580:673 ; 12 SW:PAN1_YEAST_593:691 ; 13 SW:YAV1_SCHPO_814:911 ; 14 GP:SPAC27F1_1_814:911 ; 15 GP:AF054612_1_7:96 ; 16 GP:AF053957_1_7:96 ; 17 GP:AF032118_1_14:104 ; 18 GP:DMU70135_1_400:495 ; 19 GP:HSAF001434_1_437:531 ; 20 PIR2:S43074_121:218 ; 21 SW:EP15_HUMAN_121:218 ; 22 T0074_1:98 ; 23 T0074_1:98 ; 24 SW:EP15_MOUSE_121:218 ; 25 GP:MMU29156_1_120:214 ; 26 GP:CELZK1248_7_110:206 ; 27 GP:AF032118_1_213:308 ; 28 GP:AF053957_1_184:281 ; 29 GP:AF054612_1_184:281 ; 30 SW:EP15_MOUSE_220:313 ; 31 SW:EP15_HUMAN_220:313 ; 32 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