>therKoda1 ./Tk_mismatch/therKoda1_chromSizes.txt WT_minusAlkB ./Tk_mismatch/pileups/Tko_Ctrl_minusAlkB_1_dedup.genomic.mpileup.txt ./Tk_mismatch/pileups/Tko_Ctrl_minusAlkB_2_dedup.genomic.mpileup.txt WT_plusAlkB ./Tk_mismatch/pileups/Tko_Ctrl_plusAlkB_1_dedup.genomic.mpileup.txt ./Tk_mismatch/pileups/Tko_Ctrl_plusAlkB_2_dedup.genomic.mpileup.txt Delta_minusAlkB ./Tk_mismatch/pileups/Tko_Delta_minusAlkB_1_dedup.genomic.mpileup.txt ./Tk_mismatch/pileups/Tko_Delta_minusAlkB_2_dedup.genomic.mpileup.txt Delta_plusAlkB ./Tk_mismatch/pileups/Tko_Delta_plusAlkB_1_dedup.genomic.mpileup.txt ./Tk_mismatch/pileups/Tko_Delta_plusAlkB_2_dedup.genomic.mpileup.txt