a2m2html output for tmp.a2m

Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
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A. Krogh et al., Hidden Markov models in computational biology: Applications to protein modeling, JMB 235:1501-1531, Feb 1994.
Sequence numbers correspond to the following labels:

- T0500 CSKI1_HUMAN Caskin-1, Human, 829 residues
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- gi|61213003|sp|Q8WXD9|CSKI1_HUMAN Caskin-1 (CASK-interacting protein 1) [Taxonomy]
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- gi|119605951|gb|EAW85545.1| CASK interacting protein 1, isoform CRA_a [Homo sapiens]
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- gi|119912755|ref|XP_001255913.1|_499:1193 PREDICTED: similar to cask-interacting protein 2 [Bos taurus]
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- gi|148226138|ref|NP_001086927.1|_479:1205 CASK interacting protein 2 [Xenopus laevis]
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- gi|50417662|gb|AAH77777.1| Caskin2-prov protein [Xenopus laevis]
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- gi|55962741|emb|CAI11563.1|_10:772 novel protein similar to human and mouse CASK interacting protein 2 (CASKIN2) [Danio rerio]
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- gi|170065583|ref|XP_001867999.1|_678:699 conserved hypothetical protein [Culex pipiens quinquefasciatus]
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- gi|157116596|ref|XP_001658568.1|_699:720 hypothetical protein AaeL_AAEL007667 [Aedes aegypti]
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- gi|7303110|gb|AAF58176.1| CG12424-PA, isoform A [Drosophila melanogaster]
- gi|21627168|gb|AAM68541.1| CG12424-PB, isoform B [Drosophila melanogaster]
- gi|21627169|gb|AAM68542.1| CG12424-PC, isoform C [Drosophila melanogaster]
- gi|33589558|gb|AAQ22546.1| LD09801p [Drosophila melanogaster]
- gi|190658743|gb|EDV55956.1|_885:910 GG20494 [Drosophila erecta]
- gi|47210928|emb|CAF92727.1|_8:115 unnamed protein product [Tetraodon nigroviridis]
- gi|156403794|ref|XP_001640093.1|_8:135 predicted protein [Nematostella vectensis]
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- gi|110775604|ref|XP_624394.2|_73:196 PREDICTED: similar to CG12424-PA, isoform A, partial [Apis mellifera]
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  15 ----------.--..-------------.....--.--...--.--..-..-..---.------.
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  40 ...RsQG...SG..H.S..QE-.....--...----..-..----.....-.-..-----.....
  41 ...RsQG...SG..H.S..QE-.....--...----..-..----.....-.-..-----.....
  42 ...R.ES...QD..K.S..QISpv8vlPL...QPHP..N..SSSS.....S.PsrTPPILt12pi
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  50 ...Y.TT...TD..Y.G..HFG.....PP...TTAA..A..AAAM.....A.A..AATLQ.....
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  52 ...Y.TT...TD..Y.G..HFG.....PP...TTAA..A..AAAM.....A.A..AATLQ.....
  53 ...R.KH...SGvrS.S..RES.....LSs..DISN..R..SAGS.....S.S..QDTTT.....
  54 6yrR.SS...YD..D.S..DIT.....PT...NELG..D..AHHL.....A.Q..MHQQH.....
  55 ...RgTH...RG..K.S..LES.....LHe..NINS..T..TGGTssfvgP.P..QWRHQ.....
  56 6yrR.SS...YD..D.S..DIT.....PT...NEMS..SlmSGEH.....H.G..TAANA.....
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   1 PA.G....AD..KN.VNR..SQSFA.VRPRKKG....PPPP....PPKRSSSALAS..ANLADEP
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  20 Q-.-....-D..KS.ASRnqTQSFA.LRQKKKG....PPPP....PPKRSSSAISSsnSNLADAN
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  22 SGeS....LD..INsVNR..SQSFAtARPRRRT....RPPT....PPKRSCSSIST..GNLTDEA
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  48 KS.S....PE..KN.VGR..SQSFA.VRARKKG....PPPP....PPKRLSSVSSS..TSG----
  49 PA.Y....PS..--.---..SDSLS.ISLDNQGdlplPPPPapgtPPGNVQSKMNS..S-----Q
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  51 --.-....--..--.---..-----.-------....----....-----------..-------
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   1 V.PDAE.....P.E..DG.....LLG.V....RA.Q.CRRASDLA.GS.....V.DTGSAGSVKS
   2 A.PDVE.....A.E..DG.....RLG.V....RA.Q.RRRASDLA.GS.....V.DTGSAGSVKS
   3 V.PDAE.....P.E..DG.....LLG.V....RA.Q.CRRASDLA.GS.....V.DTGSAGSVKS
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   5 V.PDAE.....P.E..DG.....LLG.V....RA.Q.CRRASDLA.GS.....V.DTGSAGSVKS
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   7 V.PDAE.....P.E..DG.....LLG.V....RA.Q.CRRASDLA.GS.....V.DTGSAGSVKS
   8 A.PDVE.....A.E..DG.....RLG.V....RA.Q.RRRASDLA.GS.....V.DTGSAGSVKS
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  10 S.PDVE.....A.E..DG.....RLG.V....RA.Q.RRRASDLA.GS.....V.DTGSAGSVKS
  11 S.PDVE.....T.E..DG.....RLG.V....RA.Q.RRRASDLA.GS.....V.DTGSAGSVKS
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  19 V.PKET.....N.S..GP.....LLD.I....PY.QpQRRASDLG.GT.....V.DTGSAGSVRS
  20 AqPQTH.....AtA..GG.....LLD.V....PYhQ.QRRASDLG.VSvetapV.ETNSAGSVRS
  21 VaDDAR.....L.S..ENrannlLLN.V....TY.R.ERRRSDCGiAS.....E.KTSSGGSVRD
  22 VaDDAR.....L.S..ENrannlLLN.V....TY.R.ERRRSDCGiAS.....E.KTSSGGSVRD
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  37 S.PDVE.....T.E..DG.....RLG.V....RA.Q.RRRASDLA.GS.....V.DTGSAGSVKS
  38 -.PEPP.....P.P..DG.....SPG.-....--.-.--------.--.....P.KEGAAGPRRR
  39 V.SESP.....P.S..GG.....VEN.C....K-.-.--------.--.....-.------SVKS
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  41 -.----.....-.-..--.....---.-....--.-.-------G.QS.....P.EGQS--SVKT
  42 -.----.....-.-..--.....--G.V....TS.-.------CG.--.....V.ETESAGSVRS
  43 -.----.....-.-..--.....--G.V....TS.-.------CG.--.....V.ETESAGSVRS
  44 F.SLVP.....H.-..--.....--G.T....IA.Y.VKPVHDRG.--.....-.-TGASRRTE-
  45 -.----.....-.-..--.....---.-....--.-.--------.--.....-.----------
  46 -.----.....-.-..--.....---.-....--.-.--------.--.....-.----------
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  48 -.----.....-.-..--.....---.-....--.-.--------.--.....-.----------
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  54 -.----.....-.-..--.....---.-....--.-.--------.--.....-.----------
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                   |           |           |           |              
   1 I.....AAMLE.LSSIGGGGRAA..RRP..PEGHPTPRPASPEPG..RVAT.V...L..ASVKHK
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  36 I.....AAMLE.LSSIGGGGRAI..RRP..PEGPPHTSSCQSRPGqsSYRV.G...L..CKAQRG
  37 I.....AAMLE.LSSIGGGGRAI..RRP..PEGPPHTSSCQSRPGqsSYRV.G...L..CKAQRG
  38 -.....----T.LSEPTGPSEPS..GPP..T---PAG--------..----.-...A..ASDTEE
  39 I.....AAALE.--------TVL..PVP..TAELLQETSTSASEG..SKRR.P...L..SESESK
  40 I.....AAQLEdM----GSGTGF..SAS..TSKAPHTEVLDVSGT..RRRT.V...-..----SE
  41 I.....AAQLK.--DI-GRGTGF..SAS..TSKATDTEVLEGSGT..RRRT.V...-..----SE
  42 I.....AARLE.-SSTGSPSKTC..NSPvfKAMSPATPPKNTENR..RRTT.S...D..CSTY--
  43 I.....AARLE.-SSTGSPSKTC..NSPvfKAMSPATPPKNTENR..RRTT.S...D..CSTY--
  44 -.....-----.-SERTGESK--..---..----------SQRFG..----.-...-..------
  45 M.....AASLE.-GRTGGENDPApsQNP..PAISAAG-PGSREGS..GLRRrVqseC..VSTQTS
  46 M.....AASLE.-GRTGGENDPApsQNP..PAISAAG-PGSREGS..GLRR.-...-..-RVQSE
  47 I.....YANYA.-----------..---..---------------..----.-...-..------
  48 -.....-----.-----------..---..---------------..----.-...-..------
  49 Lpf6enAGTIR.-TRAGGNSRPA..DYS..PAKPRAGLPPHPSPT..PNRQ.P...S..ARNQRS
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  53 I.....-----.-----------..---..---------------..----.-...-..------
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  19 DAIGL.....DGEVVN....RRRTISGP.....VTDLVAAAKR.GPe16ssGS...SA...ENLP
  20 EAIGL.....DGEVVN....RRRTISGP.....VTELVEAARReQP.....AP...SA...PPPP
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  22 EVLNL.....DAD--S....RRRTISEF.....YDSQKQSADV.QEae6qdTA...HH...KPEP
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  42 -----.....--ETKH....ADQNVS-P.....LRHQ-----Q.GS.....GS...SQ...ESIP
  43 -----.....--ETKH....ADQNVS-P.....LRHQ-----Q.GS.....GS...SQ...ESIP
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  45 ...FAEEGnlTIKQR.PK..-.-------VP...G..P.P.....RAE----AV.LEPPE..KAP
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  37 ---.--.--------.-------.....--------------.--------.------..-----
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       |           |            |          |           |           |  
   1 QGS.PTPTS.KKVPLPGP.GSPE..VKRAHGTPPP.VSPKPPPP..PTAPKPVKA..VAGLPSGS
   2 QGS.PTPAS.KKVPLPGP.GSPE..VKRAHGTPPP.VSPKPPPP..PTAPKPAKA..LAGLQSSS
   3 QGS.PTPTS.KKVPLPGP.GSPE..VKRAHGTPPP.VSPKPPPP..PTAPKPVKA..VAGLPSGS
   4 QGS.PTPTS.KKVPLPGP.GSPE..VKRAHGTPPP.VSPKPPPP..PTAPKPVKA..VAGLPSGS
   5 QGS.PTPTS.KKVPLPGP.GSPE..VKRAHGTPPP.VSPKPPPP..PTAPKPVKA..VAGLPSGS
   6 QGS.PTPTS.KKVPLPGP.GSPE..VKRAHGTPPP.VSPKPPPP..PTAPKPVKA..VAGLPSGS
   7 QGS.PTPTS.KKVPLPGP.GSPE..VKRAHGTPPP.VSPKPPPP..PTAPKPAKV..AAGLPSGS
   8 QGS.PTPAS.KKVPLPGP.GSPE..VKRAHGTPPP.VSPKPPPP..PTAPKPAKA..LAGLQSSS
   9 QGS.PTPAS.KKVPLPGP.GSPE..VKRAHGTPPP.VSPKPPPP..PTAPKPAKA..LAGLQSSS
  10 QGS.PTPAS.KKVPLPGP.GSPE..VKRAHGTPPP.VSPKPPPP..PTAPKPAKA..LAGLQSSS
  11 QGS.PTPAS.KKVPLPGP.GSPE..VKRAHGTPPP.VSPKPPPP..PTAPKPAKA..LAGLQSSS
  12 QGS.PTPAS.KKVPLPGP.GSP-..----------.--------..---------..--------
  13 QGS.PTPAS.KKVPLPGP.GSPE..VKRAHGTPPP.VSPKPPPP..PTAPKP---..--------
  14 QGS.PTPAS.KKVPLPGP.SSPE..VKRAHGTPPP.VSPKPPPP..PTAPKPAKA..AAGLQSGS
  15 QGS.PTPAS.KKVPLPGP.GSPE..VKRAHGTPPP.VSPKPPPP..PTAPKPAKA..LAGLQSSS
  16 QGS.PTPTS.KKVPLPGP.GSPG..--RCMG----.-------P..ARAEA----..-----DGD
  17 QGS.PTPAS.KKVPLPGP.GSPE..VKRAHGTPPP.VSPKPPPP..PTAPKPAKA..AAGLQSGS
  18 PGP.PVPIP.KKMPVPSP.GSPE..VKRVHGTPPP.VSPKPTPP..PTAPKPPKP..HATIQSVS
  19 QGP.TAAIT.KKAPFPGPaGAPGs.PVEGKKVPPP.ISPKPTPP..PTAPKPSKN..VLQSLNAT
  20 QTP.PHPASnKSIPLPGP.GTPGs.PVEGKKIPPP.VSPKPAPP..PTAPKPAKL..VHSMTSPS
  21 -DP.PTP-T.RRVPLPGPeGQHS..PVEVRKIPPP.VSPKPSPP..PTLPKPVKI..KPIHTIGT
  22 -DP.PTP-T.RRVPLPGPeGQHS..PVEVRKIPPP.VSPKPSPP..PTLPKPVKI..KPIHTIGT
  23 -QP.PVP--.---PCPGP.GLESsaASRWNGE---.-----TEP..PAAPAALLK..VPG--AGT
  24 -QP.PVP--.---PCPGP.GLESsaASRWNGE---.-----TEP..PAAPAALLK..VPG--AGT
  25 -QP.PVP--.---PCPGP.GLESsaASRWNGE---.-----TEP..PTAPAALLK..VPG--AGT
  26 TQS.P----.-GHPGPSA.G-PA..LANSTGSKPN.VETEPPAP..PAA---LLK..VPG--AGT
  27 TQS.P----.-GHPGPSA.G-PA..LANSTGSKPN.VETEPPAP..PAA---LLK..VPG--AGT
  28 TQS.P----.-GHPGPSA.G-PA..LANSTGSKPN.VETEPPAP..PAA---LLK..VPG--AGT
  29 TQS.P----.-GHPGPSA.G-PA..LANSTGSKPN.VETEPPAP..PAA---LLK..VPG--AGT
  30 TQS.P----.-GHPGPSA.G-PA..LANSTGSKPN.VETEPPAP..PAA---LLK..VPG--AGT
  31 TQP.PVP--.---PCPGP.GLESsaASRWNGE---.-----TEP..PAAPAALLK..VPG--AGT
  32 TQP.P----.-GHPGPSA.G-PG..LETSTGSRQN.VDTEPPAP..PAA---LLK..VPG--AGT
  33 --P.TQP--.--HVCPCP.G-PT..LENSAGNRRH.GETETPTP..PAA---LIK..VPG--AGT
  34 NKA.PSP--.--VKAPSP.----..-TELLGT--A.VVRMPA--..PDVPAKHTS..VASTKLVF
  35 TQP.SAP--.-----PCP.G-PA..LESSTGDWRH.GETEPPAS..PAA---LIK..VPG--AGT
  36 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  37 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  38 AQP.LGPAL.ENNRRPGE.----..----------.-----TEP..PAAPATLIK..VPG--AGT
  39 -PS.PLSLS.RHASQPAP.AHPT..VV--------.--------..---------..------GS
  40 IPP.QEPLT.QDTL----.-RAK..IADIDKRLLS.FEV-----..--VEDPVKT..SGINTRST
  41 IPS.QEPLT.QDTLI---.--AK..IADIDKRLLS.LG------..-EVEDSVKK..TGIDTRST
  42 ---.-----.-------P.GS--..----------.----PHKP..PTPSKPIRH..SAAATSG-
  43 ---.-----.-------P.GS--..----------.----PHKP..PTPSKPIRH..SAAATSG-
  44 SNP.TTP-P.KSLSASLS.GAHTa.IPNLTNIQIHtVSPKLGSSvqTQASKSVLN..-PGKLGKT
  45 ---.-----.-----PAA.GSP-..------VKPA.VPSKP--P..ATAPKPVRHslLAAQAAGL
  46 RSPcLTSAR.SQVHLQGR.GLGT..EV----VQQR.LDQTSWSL..AAALKAVES..KLSQEEDS
  47 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  48 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  49 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  50 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  51 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  52 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  53 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  54 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  55 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  56 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  57 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  58 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  59 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  60 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  61 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  62 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  63 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  64 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  65 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  66 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  67 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  68 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------
  69 ---.-----.--------.----..----------.--------..---------..--------


                700       710          720             730           74
                 |         |            |               |             
   1 A.G...PSPA.PSPARQPPAALAK...PPGTPPSLGASP...AK.P.PSP.GAPAL...H.VPAK
   2 A.T...PSPV.PSPARQPPAALIK...PASSPPSQSASP...VK.P.PSP.GTPAL...H.VPAK
   3 A.G...PSPA.PSPARQPPAALAK...PPGTPPSLGASP...AK.P.PSP.GAPAL...H.VPAK
   4 A.G...PSPA.PSPARQPPAALAK...PPGTPPSLGASP...AK.P.PSP.GAPAL...H.VPAK
   5 A.G...PSPA.PSPARQPPAALAK...PPGTPPSLGASP...AK.P.PSP.GAPAL...H.VPAK
   6 A.G...PSPA.PSPARQPPAALAK...PPGTPPSLGASP...AK.P.PSP.GAPAL...H.VPAK
   7 A.G...PSPA.PSPARQPPAALAK...PPGTPPSLGTSP...VK.P.PSP.GAPAL...H.VPAK
   8 A.T...PSPV.PSPARQPPAALIK...PASSPPSQSASP...VK.P.PSP.GTPAL...H.VPAK
   9 A.T...PSPV.PSPARQPPAALIK...PASSPPSQSASP...AK.P.PSP.GAPAL...Q.VPTK
  10 A.T...PSPV.PSPARQPPAALIK...PASSPPSQSASP...VK.P.PSP.GTPAL...H.VPAK
  11 A.T...PSPV.PSPARQPPAALIK...PASSPPSQSASP...AK.P.PSP.GAPAL...Q.VPTK
  12 -.-...----.---ARQPPAALIK...PASSPPSQSASP...VK.P.PSP.GTPAL...H.VPAK
  13 -.-...----.-------------...-----PRAAASV...V-.-.---.-----...-.----
  14 S.S...PSPA.PSPARQQPAALAK...PASTPPALSASPaspAR.P.PSP.GAPAL...H.VPAK
  15 A.T...PSPV.PSPARQPPAALIK...PASSPPSQSASP...VK.P.PSP.GTPAL...H.VPAK
  16 A.G...RGRV.LVEV---GVA---...----------RP...AP.P.---.----T...H.AP-C
  17 A.S...PSPA.PSPARQPPAALAK...PASTRPSLSAST...AK.P.---.-----...-.----
  18 A.G...STPT.PSPARQLGAA-AK...PSSTPPSLCSSP...AK.P.LSP.GTQPQ...Q.VPVK
  19 P.N...PTPT.PSPAKQT---VTR...MASTASAQTNHP...VK.A.TTP.PALIVqtpH.TPQS
  20 ChS...TTTA.PAPVRQHSLASRQsssPPGLPPTNIPSPpn.AK.P.LSP.SPQSP...H.TPQT
  21 P.GspqPDVVsPFSASFSPVSIEQ...LEHPPQTL--SP...VT.PkPME.GNMLS...P.RPAT
  22 P.GspqPDVVsPFSASFSPVSIEQ...LEHPPQTL--SP...VT.PkPME.GSMLS...P.RPAT
  23 A.-...PKPV.SVACTQ--LAFSG...PK-LAPRLGPRP...VP.P.PRP.ESTGT...-.--VG
  24 A.-...PKPV.SVACTQ--LAFSG...PK-LAPRLGPRP...VP.P.PRP.ESTGT...-.--VG
  25 A.-...PKPV.SVACTQ--LAFSG...PK-LAPRLGPRP...VP.P.PRP.ESTGT...-.--VG
  26 A.-...PKPV.SVACTQ--LAFSG...PK-LAPRLGPRP...VP.P.PRP.ENT--...-.GPVC
  27 A.-...PKPV.SVACTQ--LAFSG...PK-LAPRLGPRP...VP.P.PRP.ENT--...-.GPVC
  28 A.-...PKPV.SVACTQ--LAFSG...PK-LAPRLGPRP...VP.P.PRP.ENT--...-.GPVC
  29 A.-...PKPV.SVACTQ--LAFSG...PK-LAPRLGPRP...VP.P.PRP.ENT--...-.GPVC
  30 A.-...PKPV.SVACTQ--LAFSG...PK-LAPRLGPRP...VP.P.PRP.ENT--...-.GPVC
  31 A.-...PKPV.SVACTQ--LAFSG...PK-LASRLGPRP...VP.P.PRP.ESTGT...-.--VG
  32 A.-...PKPV.SVACTQ--LAFSG...PK-LAPRLGPRP...VP.P.PRP.ENT--...-.GPVC
  33 A.-...PKPV.SVACTQ--LAFSG...PK-LAPRPGPRP...VP.P.PRP.EST--...-.GATG
  34 S.G...PKTI.YQQVLQPSRHTIA...P------WAATE...VV.P.NVI.GSLA-...-.GP--
  35 A.-...PKPV.SVACTQ--LAFSG...PK-LAPRLGPRP...VP.P.PRP.EST--...-.GAVG
  36 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  37 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  38 A.-...PKPV.SVACTQ--LAFSG...PK-LAPRLGPRP...VP.P.PRP.EST--...-.GAAG
  39 S.-...---V.TLSVVQS-VAFAA...PP--------SP...I-.P.YCP.SAENT...T.QGVT
  40 G.-...----.-ISVSQTHLVISG...PQQVLQKPSRAV...TG.P.LLPaGSILW...DkESVA
  41 G.-...----.-VSISQTHLVISG...PQQVLQKPSRAV...TG.P.LFPaGSILW...D.E---
  42 -.-...---V.SMSVVQS-VAF--...--------AVSP...--.P.CSP.LAC--...-.---C
  43 -.-...---V.SMSVVQS-VAF--...--------AVSP...--.P.CSP.LAC--...-.---C
  44 V.M...P-PV.EKCTALSDLMESQ...---SCSTIGKGK...FK.R.IQD.GPAAA...S.FPQG
  45 S.G...PSVT.ISGV-QT-LAFTA...PS--------SP...VHgP.PAP.GPGWV...S.APQS
  46 S.S...GWTL.G-SLRDHQRGSRP...LAFTAPS---SP...VHgP.PAP.GPGWV...S.APQS
  47 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  48 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  49 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  50 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  51 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  52 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  53 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  54 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  55 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  56 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  57 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  58 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  59 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  60 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  61 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  62 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  63 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  64 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  65 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  66 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  67 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  68 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----
  69 -.-...----.-------------...------------...--.-.---.-----...-.----


      0         750           760             770       780       790  
     |           |             |               |         |         |  
   1 P.PR.AAAAAAAAAAAP...PAP.PEGASPG.DS.....ARQKLEETSACLAAALQAVEEKIRQE
   2 P.PR.---AAASVVSGP...PVA.SDCASPG.DS.....ARQKLEETSACLAAALQAVEEKIRQE
   3 P.PR.AAAAAAAAAAAP...PAP.PEGASPG.DS.....ARQKLEETSACLAAALQAVEEKIRQE
   4 P.PR.AAAAAAAAAAAP...PAP.PEGASPG.DS.....ARQKLEETSACLAAALQAVEEKIRQE
   5 P.PR.AAAAAAAAAAAP...PAP.PEGASPG.DS.....ARQKLEETSACLAAALQAVEEKIRQE
   6 P.PR.AAAAAAAAAAAP...PAP.PEGASPG.DS.....ARQKLEETSACLAAALQAVEEKIRQE
   7 P.PR.AAAAAAAA---P...PAP.TEGASPG.DS.....ARQKLEETSACLAAALQAVEEKIRQE
   8 P.PR.---AAASVVSGP...PVA.SDCASPG.DS.....ARQKLEETSACLAAALQAVEEKIRQE
   9 P.PR.---AAASVVSGP...PVA.SDCASPG.DS.....ARQKLEETSACLAAALQAVEEKIRQE
  10 P.PR.---AAASVVSGP...PVA.SDCASPG.DS.....ARQKLEETSACLAAALQAVEEKIRQE
  11 P.PR.---AAASVVSGP...PVA.SDCASPG.DS.....ARQKLEETSACLAAALQAVEEKIRQE
  12 P.PR.---AAASVVSGP...PVA.SDCASPG.DS.....ARQKLEETSACLAAALQAVEEKIRQE
  13 -.--.---------SGP...PVA.SDCASPG.DS.....ARQKLEETSACLAAALQAVEEKIRQE
  14 P.PR.AAAAA----TGP...PAA.PDGASPG.DS.....ARQKLEETSACLAAALQAVEEKIRQE
  15 P.PR.---AAASVVSGP...PVA.SDCASPG.DS.....ARQKLEETSACLAAALQAVEEKIRQE
  16 PaPR.------------...---.-------.--.....--------SDS------AAE------
  17 P.P-.------------...---.-------.--.....--------SS--------AEEK----
  18 P.PR.------SAIAGP...SV-.-DSASP-.EL.....VQQKLEETSASLAAALQAVEEKIKQE
  19 P.HTpQTPQTPQTPQTP...PTP.TPTPPPV.KPp27daVHQKIEETSASLAAALQAVEQKIK-E
  20 P.PT.PQTPATPSPTPP...PVK.PPRSSIG.GVs26flVQQKLEETSASLAAALQAVEDKILHQ
  21 S.PA.QSPQTPQTPQTPqtpSTP.GSGSAPV.KPp140vMQLRLDETSASLAAALEVVEEKIKKD
  22 S.PA.QSPQTPQTPQTPqtpSTP.GSGSAPV.KPp140vMQLRLDETSASLAAALEVVEEKIKKD
  23 P.GQ.------------...---.-------.--.....AQQRLEQTSSSLAAALRAAEKSIGTK
  24 P.GQ.------------...---.-------.--.....AQQRLEQTSSSLAAALRAAEKSIGTK
  25 P.GQ.------------...---.-------.--.....AQQRLEQTSSSLAAALRAAEKSIGTK
  26 P.SR.------------...---.-------.--.....AQQRLEQTSSSLEAALRAAEKSIGTE
  27 P.SR.------------...---.-------.--.....AQQRLEQTSSSLEAALRAAEKSIGTE
  28 P.SR.------------...---.-------.--.....AQQRLEQTSSSLEAALRAAEKSIGTE
  29 P.SR.------------...---.-------.--.....AQQRLEQTSSSLEAALRAAEKSIGTE
  30 P.GR.------------...---.-------.--.....AQQRLEQTSSSLEAALRAAEKSIGTE
  31 P.GQ.------------...---.-------.--.....AQQRLEQTSSSLAAALRAAEKSIGTE
  32 P.GR.------------...---.-------.--.....AQQRLEQTSSSLEAALRAAEKNIGSE
  33 S.GR.------------...---.-------.--.....AQQRLEQTSSSLAAALRAAEKSIGTE
  34 S.PL.TLEASGKVFVKP...LAS.APGAAL-.--.....VQQQLEHTSII---TLQAAEKKITVE
  35 S.GR.------------...---.-------.--.....AQQRLEQTSSSLAAALRAAEKSIGAE
  36 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  37 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  38 P.GR.------------...---.-------.--.....AQQRLEQTSSSLAAALRAAEKSIGAE
  39 S.GN.--------VQTP...TEG.GQGATL-.--.....KHQRLEKTSSTLEEALKAVERKLTLK
  40 P.SR.ERT----CISQQ...SIS.ISDQGP-.PV.....FTSSLQNT-----GELQ---------
  41 E.SE.ASSREQTCIPQQ...SIS.NSDKGP-.PV.....FTSSLQNT-----EELQ---------
  42 P.PN.ATPQGQSALT--...---.AEGQNV-.-L.....VHKRLEQTSTSLQAALQVVERKLAQD
  43 P.PN.ATPQGQSALT--...---.AEGQNV-.-L.....VHKRLEQTSTSLQAALQVVERKLAQD
  44 P.G-.---------SPP...GLPlMNAAQLE.AL.....AQRRLEQTSTSLEAALRVVENKLSQD
  45 P.CL.TSARSQVHLQ--...---.--GRGLGtEV.....VQQRLDQTSWSLAAALKAVESKLSQE
  46 P.CL.TSARSQVHLQ--...---.--GRGLGtEV.....VQQRLDQTSWSLAAALKAVESKLSQE
  47 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  48 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  49 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  50 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  51 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  52 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  53 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  54 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  55 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  56 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  57 -.--.------------...---.-------.--.....---------TKL--AVEAVEHKIKEE
  58 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  59 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  60 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  61 -.--.------------...---.-------.--.....-------------GA-PIAETSLTSP
  62 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  63 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  64 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  65 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  66 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  67 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  68 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------
  69 -.--.------------...---.-------.--.....--------------------------


            800           810       820            
             |             |         |            
   1 DAQGPR.DSAAE....KSTGSILDDIGSMFDDLADQLDAMLE...
   2 DGQGPRpSSIEE....KSTGSILEDIGSMFDDLADQLDAMLE...
   3 DAQGPR.DSAAE....KSTGSILDDIGSMFDDLADQLDAMLE...
   4 DAQGPR.DSAAE....KSTGSILDDIGSMFDDLADQLDAMLE...
   5 DAQGPR.DSAAE....KSTGSILDDIGSMFDDLADQLDAMLE...
   6 DAQGPR.DSAAE....KSTGSILDDIGSMFDDLADQLDAMLE...
   7 DAQGPR.DSAAE....KSTGSILDDIGSMFDDLADQLDAMLE...
   8 DGQGPRpSSIEE....KSTGSILEDIGSMFDDLADQLDAMLE...
   9 DGQGPRpSSIEE....KSTGSILEDIGSMFDDLADQLDAMLE...
  10 DGQGPRpSSIEE....KSTGSILEDIGSMFDDLADQLDAMLE...
  11 DGQGPRpSSIEE....KSTGSILEDIGSMFDDLADQLDAMLE...
  12 DGQGPRpSSIEE....KSTGSILEDIGSMFDDLADQLDAMLE...
  13 DGQGPRpSSIEE....KSTGSILEDIGSMFDDLADQLDAMLE...
  14 DAQGSR.PSAAE....KSTGSILDDIGSMFDDLADQLDAMLE...
  15 DGQGPRpSSIEE....KSTGSILEDIGSMFDDLADQLDAMLE...
  16 ------.-----....KSTGSILDDIGSMFDDLADQLDAMLE...
  17 ------.-----....-STGSILDDIGSMFDDLADQLDAMLE...
  18 DSQAAD.STAEA....KSTGSILDDIGSMFDDLADQLDAMLE...
  19 DGQ-KD.SIAEN....KSTVSILDDIGSMFDDLADQLDAMLE...
  20 E----D.SVAEQ....KTTVSILDDIGSMFDDLADQLDAMLE...
  21 D----S.STVDN....KSTVNILDDIGSMFDDLADQLDAMLD...
  22 D----S.STVDN....KSTVNILDDIGSMFDDLADQLDAMLD...
  23 EQEGTP.SA---....-STKHILDDISTMFDALADQLDAMLD...
  24 EQEGTP.SA---....-STKHILDDISTMFDALADQLDAMLD...
  25 EQEGTP.SA---....-STKHILDDISTMFDALADQLDAMLD...
  26 ERDGPT.GT---....-STKHILDDISTMFDALADQLDAMLD...
  27 ERDGPT.GT---....-STKHILDDISTMFDALADQLDAMLD...
  28 ERDGPT.GT---....-STKHILDDISTMFDALADQLDAMLD...
  29 ERDGPT.GT---....-STKHILDDISTMFDALADQLDAMLD...
  30 ERDGPT.GT---....-STKHILDDISTMFDALADQLDAMLD...
  31 EQEGAP.SA---....-STKHILDDISTMFDALADQLDAMLD...
  32 EQDGPT.GP---....-STKHILDDISTMFDALADQLDAMLD...
  33 EREGPP.GT---....-STKHILDDISTMFDALADQLDAMLD...
  34 EVQSPP.--RAT....HSAKNILEDISNMFDDLADQLDAMLD...
  35 EREGPP.ST---....-SAKHILDDISTMFDALADQLDAMLD...
  36 ------.-----....--------------------------...
  37 ------.-----....--------------------------...
  38 EREGAP.GA---....-STKHILDDISTMFDALADQLDAMLD...
  39 NNNNVG.VSHAV....KSAGNILDDIGNMFDDLADQLDAMLD...
  40 DPREKS.CRETV....QLTKNILDDISTMFDDLAEQLEAMLD...
  41 DTRGKS.CRETV....QLTKNILDDISTMFDDLAEQLEAMLD...
  42 DP-ASR.GINTV....KSAGNILDDIGNMFDDLADQLDAMLD...
  43 DP-ASR.GINTV....KSAGNILDDIGNMFDDLADQLDAMLD...
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