Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 | | 1 ...P..A...R...Q...P...PAAL....AK.....PPG.TP.....PSLGAS.....P...A. 2 apsP..A...R...Q...P...PAAL....AK.....PPG.TP.....PSLGAS.....P...A. 3 apsP..A...R...Q...P...PAAL....AK.....PPG.TP.....PSLGAS.....P...A. 4 apsP..A...R...Q...P...PAAL....AK.....PPG.TP.....PSLGAS.....P...A. 5 apsP..A...R...Q...P...PAAL....AK.....PPG.TP.....PSLGAS.....P...A. 6 apsP..A...R...Q...P...PAAL....AK.....PPG.TP.....PSLGTS.....P...V. 7 pgsP..A...R...Q...P...PAAL....IK.....PAS.SP.....PSQSAS.....P...V. 8 vpsP..A...R...Q...P...PAAL....IK.....PAS.SP.....PSQSAS.....P...V. 9 vpsP..A...R...Q...P...PAAL....IK.....PAS.SP.....PSQSAS.....P...V. 10 vpsP..A...R...Q...P...PAAL....IK.....PAS.SP.....PSQSAS.....P...V. 11 vpsP..A...R...Q...P...PAAL....IK.....PAS.SP.....PSQSAS.....P...V. 12 vpsP..A...R...Q...P...PAAL....IK.....PAS.SP.....PSQSAS.....P...A. 13 vpsP..A...R...Q...P...PAAL....IK.....PAS.SP.....PSQSAS.....P...A. 14 apsP..A...R...Q...Q...PAAL....AK.....PAS.TP.....PALSAS.....PaspA. 15 qgsP..T...P...A...S...KKVP....LP.....GPG.SP.....EVKRAH.....G...T. 16 ...L..AnstG...S...K...PNVE....TE.....PPA.PP.....AALLKV.....PgagT. 17 ...L..AnstG...S...K...PNVE....TE.....PPA.PP.....AALLKV.....PgagT. 18 ...L..AnstG...S...K...PNVE....TE.....PPA.PP.....AALLKV.....PgagT. 19 ...L..AnstG...S...K...PNVE....TE.....PPA.PP.....AALLKV.....PgagT. 20 ...L..AnstG...S...K...PNVE....TE.....PPA.PP.....AALLKV.....PgagT. 21 ...L..E...N...SagnR...RHGE....TE.....TPT.PP.....AALIKV.....PgagT. 22 ...L..E...S...S...TgdwRHGE....TE.....PPA.SP.....AALIKV.....PgagT. 23 h..P..V...K...Att.P...PALI....VQ.....TPH.TPqsphtPQTPQT.....P...Q. 24 ...L..EtstG...S...R...QNVD....TE.....PPA.PP.....AALLKV.....PgagT. 25 ...L..E...SsaaS...R...WNGE....TE.....PPA.AP.....AALLKV.....PgagT. 26 ...L..E...SsaaS...R...WNGE....TE.....PPA.AP.....AALLKV.....PgagT. 27 ...L..E...SsaaS...R...WNGE....TE.....PPA.AP.....AALLKV.....PgagT. 28 ...L..E...SsaaS...R...WNGE....TE.....PPT.AP.....AALLKV.....PgagT. 29 g..PalE...N...N...R...RPGE....TE.....PPA.AP.....ATLIKV.....PgagT. 30 t..P..T...P...S...P...ARQLgaa.AK.....PSS.TP.....PSLCSS.....P...A. 31 k..LsqE...E...D...S...SSGW....TL.....GSL.RD.....HQRGSR.....P...L. 32 ataP..K...P...V...R...HSLLaaqaAG.....LSG.PS.....VTISGV.....Q...Tl 33 emvL..Q...C...M...Q...NGGL....RK.....NPL.KSgl...APKPGS.....P...H. 34 emvL..Q...C...M...Q...NGGL....RK.....NPL.KSgl...APKPGS.....P...H. 35 pakP..V...K...A...P...PPLA....PK.....PPS.-P.....LSLSRHasqpaP...A. 36 ttaP..A...P...V...R...QHSL....ASrqsssPPG.LP.....PTNIPS.....Ppn.A. 37 vlnP..G...K...L...G...KTVM....PP.....VEKcTA.....LSDLME.....S...Q. 38 rakI..A...D...I...D...KRLLs...FE.....VVE.DP.....VKTSGI.....N...T. 39 rmtP..E...D...L...T...AIGV....MK.....-PG.HR.....KKLMSE.....V...S. 40 iakI..A...D...I...D...KRLLs...LG.....EVE.DS.....VKKTGI.....D...T. 41 pppP..A...E...P...P...PTDL....AH.....LPP.LP.....PPEGEArk...P...A. 42 stkL..V...F...S...G...PKTI....YQ.....QVL.QP.....SRHTIA.....P...W. 43 ...-..-...-...-...-...----....--.....---.--.....------.....-...-. 44 ...-..-...-...-...-...----....--.....---.--.....------.....-...-. 45 qgsP..T...P...A...S...KKVP....LP.....GPG.SP.....EVKRAH.....G...T. 30 40 50 60 | | | | 1 KPP.SPGAP.ALHVPAKP.PRA...AAAAAAA.AAAP...PA..PP.E.GA....SPG.DS.... 2 KPP.SPGAP.ALHVPAKP.PRA...AAAAAAA.AAAP...PA..PP.E.GA....SPG.DS.... 3 KPP.SPGAP.ALHVPAKP.PRA...AAAAAAA.AAAP...PA..PP.E.GA....SPG.DS.... 4 KPP.SPGAP.ALHVPAKP.PRA...AAAAAAA.AAAP...PA..PP.E.GA....SPG.DS.... 5 KPP.SPGAP.ALHVPAKP.PRA...AAAAAAA.AAAP...PA..PP.E.GA....SPG.DS.... 6 KPP.SPGAP.ALHVPAKP.PRA...AAAA---.AAAP...PA..PT.E.GA....SPG.DS.... 7 KPP.SPGTP.ALHVPAKP.PRA...AASVVS-.--GP...PV..AS.D.CA....SPG.DS.... 8 KPP.SPGTP.ALHVPAKP.PRA...AASVVS-.--GP...PV..AS.D.CA....SPG.DS.... 9 KPP.SPGTP.ALHVPAKP.PRA...AASVVS-.--GP...PV..AS.D.CA....SPG.DS.... 10 KPP.SPGTP.ALHVPAKP.PRA...AASVVS-.--GP...PV..AS.D.CA....SPG.DS.... 11 KPP.SPGTP.ALHVPAKP.PRA...AASVVS-.--GP...PV..AS.D.CA....SPG.DS.... 12 KPP.SPGAP.ALQVPTKP.PRA...AASVVS-.--GP...PV..AS.D.CA....SPG.DS.... 13 KPP.SPGAP.ALQVPTKP.PRA...AASVVS-.--GP...PV..AS.D.CA....SPG.DS.... 14 RPP.SPGAP.ALHVPAKP.PRA...AAAAT--.--GP...PA..AP.D.GA....SPG.DS.... 15 PPPvSPKPP.PPPTAPKP.PRA...AASVVS-.--GP...PV..AS.D.CA....SPG.DS.... 16 APK.PVSVA.CTQLAFSG.PKL...APRLGPR.PVPP...PR..PE.NtGP....VCP.GR.... 17 APK.PVSVA.CTQLAFSG.PKL...APRLGPR.PVPP...PR..PE.NtGP....VCP.SR.... 18 APK.PVSVA.CTQLAFSG.PKL...APRLGPR.PVPP...PR..PE.NtGP....VCP.SR.... 19 APK.PVSVA.CTQLAFSG.PKL...APRLGPR.PVPP...PR..PE.NtGP....VCP.SR.... 20 APK.PVSVA.CTQLAFSG.PKL...APRLGPR.PVPP...PR..PE.NtGP....VCP.SR.... 21 APK.PVSVA.CTQLAFSG.PKL...APRPGPR.PVPP...PR..PE.StGA....TGS.GR.... 22 APK.PVSVA.CTQLAFSG.PKL...APRLGPR.PVPP...PR..PE.StGA....VGS.GR.... 23 TPQ.TPPTPtPTPPPVKP.PRS...SISGVSMdSSTG...SA..LV.A.GV....VTA.DA.... 24 APK.PVSVA.CTQLAFSG.PKL...APRLGPR.PVPP...PR..PE.NtGP....VCP.GR.... 25 APK.PVSVA.CTQLAFSG.PKL...ASRLGPR.PVPP...PR..PE.StGT....VGP.GQ.... 26 APK.PVSVA.CTQLAFSG.PKL...APRLGPR.PVPP...PR..PE.StGT....VGP.GQ.... 27 APK.PVSVA.CTQLAFSG.PKL...APRLGPR.PVPP...PR..PE.StGT....VGP.GQ.... 28 APK.PVSVA.CTQLAFSG.PKL...APRLGPR.PVPP...PR..PE.StGT....VGP.GQ.... 29 APK.PVSVA.CTQLAFSG.PKL...APRLGPR.PVPP...PR..PE.StGA....AGP.GR.... 30 KPL.SPGTQ.PQQVPVKP.PRS...AIAGPSV.DSAS...P-..--.-.--....---.EL.... 31 AFT.APSSP.VHGPPAPG.PGW...VSAPQSP.CLTSarsQV..HL.Q.GR....GLGtEV.... 32 AFT.APSSP.VHGPPAPG.PGW...VSAPQSP.CLTSarsQV..HL.Q.GR....GLGtEV.... 33 KPP.TPSKP.IRHSAAAT.SGVsmsVVQSVAF.AVSP...PCs.PL.A.CC....PPN.ATp15v 34 KPP.TPSKP.IRHSAAAT.SGVsmsVVQSVAF.AVSP...PCs.PL.A.CC....PPN.ATp15v 35 HPT.VVGSS.VTLSVVQS.VAF...AAPPSPI.PYCP...SAenTT.Q.GV....TSG.NVq12t 36 KPL.SPSPQ.SPHTPQTP.PTP...QTPATPS.PTPP...PV..KP.P.RS....SIG.GVs26f 37 SCS.TIGKG.KFKRIQDG.PAA...ASFPQGP.GSPP...GL..PLmN.AA....QLE.AL.... 38 RST.GISVS.QTHLVISG.PQQ...VLQKPSR.AVTG...PL..LP.A.GS....ILW.DKesva 39 KLP.ATDWL.PDHKPANL.ADW...LAHLGLS.QYYQ...VL..VQ.N.GYenidFIS.DI.... 40 RST.GVSIS.QTHLVISG.PQQ...VLQKPSR.AVTG...PL..FP.A.GS....ILW.DEesea 41 KPP.VSPKP.VLTQPV--.PKL...QGSPTPT.SKKV...PL..PG.P.GSpg..RCM.GP.... 42 AAT.EVVPN.VIGSLAGPsPLT...LEASGKV.FVKP...LA..SA.P.GA....---.AL.... 43 ---.-----.--------.---...-------.----...-A..ET.G.GS....SCG.DV.... 44 ---.-----.--------.---...-------.----...-A..ET.G.GS....SCG.DV.... 45 PPPvSPKPP.PPPTAPKP.AKA...AAGLQSG.SASPs..PA..PS.P.AR....QPP.--.... 70 80 90 100 110 12 | | | | | 1 .ARQK..LEET...SACL.AAALQAVEEKI.RQEDAQGPR.DSAAEKS...TGSILDDIGSMFDD 2 .ARQK..LEET...SACL.AAALQAVEEKI.RQEDAQGPR.DSAAEKS...TGSILDDIGSMFDD 3 .ARQK..LEET...SACL.AAALQAVEEKI.RQEDAQGPR.DSAAEKS...TGSILDDIGSMFDD 4 .ARQK..LEET...SACL.AAALQAVEEKI.RQEDAQGPR.DSAAEKS...TGSILDDIGSMFDD 5 .ARQK..LEET...SACL.AAALQAVEEKI.RQEDAQGPR.DSAAEKS...TGSILDDIGSMFDD 6 .ARQK..LEET...SACL.AAALQAVEEKI.RQEDAQGPR.DSAAEKS...TGSILDDIGSMFDD 7 .ARQK..LEET...SACL.AAALQAVEEKI.RQEDGQGPRpSSIEEKS...TGSILEDIGSMFDD 8 .ARQK..LEET...SACL.AAALQAVEEKI.RQEDGQGPRpSSIEEKS...TGSILEDIGSMFDD 9 .ARQK..LEET...SACL.AAALQAVEEKI.RQEDGQGPRpSSIEEKS...TGSILEDIGSMFDD 10 .ARQK..LEET...SACL.AAALQAVEEKI.RQEDGQGPRpSSIEEKS...TGSILEDIGSMFDD 11 .ARQK..LEET...SACL.AAALQAVEEKI.RQEDGQGPRpSSIEEKS...TGSILEDIGSMFDD 12 .ARQK..LEET...SACL.AAALQAVEEKI.RQEDGQGPRpSSIEEKS...TGSILEDIGSMFDD 13 .ARQK..LEET...SACL.AAALQAVEEKI.RQEDGQGPRpSSIEEKS...TGSILEDIGSMFDD 14 .ARQK..LEET...SACL.AAALQAVEEKI.RQEDAQGSR.PSAAEKS...TGSILDDIGSMFDD 15 .ARQK..LEET...SACL.AAALQAVEEKI.RQEDGQGPRpSSIEEKS...TGSILEDIGSMFDD 16 .AQQR..LEQT...SSSL.EAALRAAEKSI.GTEERDGPT.GT----S...TKHILDDISTMFDA 17 .AQQR..LEQT...SSSL.EAALRAAEKSI.GTEERDGPT.GT----S...TKHILDDISTMFDA 18 .AQQR..LEQT...SSSL.EAALRAAEKSI.GTEERDGPT.GT----S...TKHILDDISTMFDA 19 .AQQR..LEQT...SSSL.EAALRAAEKSI.GTEERDGPT.GT----S...TKHILDDISTMFDA 20 .AQQR..LEQT...SSSL.EAALRAAEKSI.GTEERDGPT.GT----S...TKHILDDISTMFDA 21 .AQQR..LEQT...SSSL.AAALRAAEKSI.GTEEREGPP.GT----S...TKHILDDISTMFDA 22 .AQQR..LEQT...SSSL.AAALRAAEKSI.GAEEREGPP.ST----S...AKHILDDISTMFDA 23 .VHQK..IEET...SASL.AAALQAVEQKI.K-EDGQK-D.SIAENKS...TVSILDDIGSMFDD 24 .AQQR..LEQT...SSSL.EAALRAAEKNI.GSEEQDGPT.GP----S...TKHILDDISTMFDA 25 .AQQR..LEQT...SSSL.AAALRAAEKSI.GTEEQEGAP.SA----S...TKHILDDISTMFDA 26 .AQQR..LEQT...SSSL.AAALRAAEKSI.GTKEQEGTP.SA----S...TKHILDDISTMFDA 27 .AQQR..LEQT...SSSL.AAALRAAEKSI.GTKEQEGTP.SA----S...TKHILDDISTMFDA 28 .AQQR..LEQT...SSSL.AAALRAAEKSI.GTKEQEGTP.SA----S...TKHILDDISTMFDA 29 .AQQR..LEQT...SSSL.AAALRAAEKSI.GAEEREGAP.GA----S...TKHILDDISTMFDA 30 .VQQK..LEET...SASL.AAALQAVEEKI.KQEDSQAAD.STAEAKS...TGSILDDIGSMFDD 31 .VQQR..LDQT...SWSL.AAALKAVESKL.SQEE-DSSR.N--AVTS...ARTILDDIGNMFDD 32 .VQQR..LDQT...SWSL.AAALKAVESKL.SQEE-DSSR.N--AVTS...ARTILDDIGNMFDD 33 lVHKR..LEQT...STSL.QAALQVVERKL.AQDD-PASR.GINTVKS...AGNILDDIGNMFDD 34 lVHKR..LEQT...STSL.QAALQVVERKL.AQDD-PASR.GINTVKS...AGNILDDIGNMFDD 35 lKHQR..LEKT...SSTL.EEALKAVERKL.TLKNNNNVG.VSHAVKS...AGNILDDIGNMFDD 36 lVQQK..LEET...SASL.AAALQAVEDKI.LHQE----D.SVAEQKT...TVSILDDIGSMFDD 37 .AQRR..LEQT...STSL.EAALRVVENKL.SQDSLD--R.ST--VKA...AGNILDDIGSMFDD 38 pSRERtcISQQ...SISIsDQGPPVFTSSLqNTGELQDPR.EKSCRETvqlTKNILDDISTMFDD 39 .SLED..LQEI...GIT-.KLAVEAVEHKI.KEEDAEN--.---EKKT...TVSILDDIGSMFDD 40 sSREQtcIPQQ...SISNsDKGPPVFTSSLqNTEELQDTR.GKSCRETvqlTKNILDDISTMFDD 41 .ARAE..ADGDagrGRVL.VEVGVARPAPP.THAPCPAPRsDSAAEKS...TGSILDDIGSMFDD 42 .VQQQ..LEHT...SII-.--TLQAAEKKI.TVEEVQSPP.R--ATHS...AKNILEDISNMFDD 43 .MQLR..LDET...SASL.AAALEVVEEKI.KKDD----S.STVDNKS...TVNILDDIGSMFDD 44 .MQLR..LDET...SASL.AAALEVVEEKI.KKDD----S.STVDNKS...TVNILDDIGSMFDD 45 .----..----...-AAL.AK-PASTRPSL.SASTAKPPP.SSAEEKS...TGSILDDIGSMFDD 0 | 1 LADQLDAMLE 2 LADQLDAMLE 3 LADQLDAMLE 4 LADQLDAMLE 5 LADQLDAMLE 6 LADQLDAMLE 7 LADQLDAMLE 8 LADQLDAMLE 9 LADQLDAMLE 10 LADQLDAMLE 11 LADQLDAMLE 12 LADQLDAMLE 13 LADQLDAMLE 14 LADQLDAMLE 15 LADQLDAMLE 16 LADQLDAMLD 17 LADQLDAMLD 18 LADQLDAMLD 19 LADQLDAMLD 20 LADQLDAMLD 21 LADQLDAMLD 22 LADQLDAMLD 23 LADQLDAMLE 24 LADQLDAMLD 25 LADQLDAMLD 26 LADQLDAMLD 27 LADQLDAMLD 28 LADQLDAMLD 29 LADQLDAMLD 30 LADQLDAMLE 31 LADQLDAMLD 32 LADQLDAMLD 33 LADQLDAMLD 34 LADQLDAMLD 35 LADQLDAMLD 36 LADQLDAMLE 37 LADQLDAMLE 38 LAEQLEAMLD 39 LADQLDAMLD 40 LAEQLEAMLD 41 LADQLDAMLE 42 LADQLDAMLD 43 LADQLDAMLD 44 LADQLDAMLD 45 LADQLDAMLE