(c) 1992-2000 Regents of the University of California, Santa Cruz
Sequence Alignment and Modeling Software System
http://www.cse.ucsc.edu/research/compbio/sam.html

Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)

Sequence numbers correspond to the following labels:

    • T0500
    • gi|55962741|emb|CAI11563.1|_131:328 novel protein similar to human and mouse CASK interacting protein 2 (CASKIN2) [Danio rerio]
                    10              20            30               40  
                    |               |             |                |  
   1 ....AELQKA..EYAKY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....PPPEP..TPADC
   2 rkl.AELQKA..EYAKY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....PPPEP..TPADC
   3 rkl.AELQKA..EYAKY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....PPPEP..TPADC
   4 rkl.AELQKA..EYAKY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....PPPEP..TPADC
   5 rkl.AELQKA..EYAKY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....PPPEP..TPADC
   6 rkl.AELQKA..EYAKY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....PPPEP..TPADC
   7 rkl.AELQKA..EYAKY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....PPPEP..TPADC
   8 rkl.AELQKA..EYAKY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMT.IESP.....PPPEP..TPADC
   9 rkl.AELQKA..EYSKY...EG.GPL..RRKAP...QSLEMMA.IESP.....PPSEP..AAAEC
  10 rkl.AELQKA..EYSKY...EG.GPL..RRKAP...QSLEMMA.IESP.....PPSEP..AAAEC
  11 rkl.AELQKA..EYSKY...EG.GPL..RRKAP...QSLEMMA.IESP.....PPSEP..AAAEC
  12 rkl.AELQKA..EYSKY...EG.GPL..RRKAP...QSLEMMA.IESP.....PPSEP..AAAEC
  13 rkl.AELQKA..EYSKY...EG.GPL..RRKTP...QSLEMMA.IESP.....PPSEP..AAAEC
  14 rkl.AELQKA..EYSKY...EG.GPL..RRKTP...QSLEMMA.IESP.....PPSEP..AAAEC
  15 rkl.AELQKA..EYSKY...EG.GPL..RRKTP...QSLEMMA.IESP.....PPSEP..AAAEC
  16 rkl.AELQKA..EYSKY...EG.GPL..RRKTP...QSLEMMA.IESP.....PPSEP..AAAEC
  17 rkl.AELQKA..EYAKY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....TPPEP..APADC
  18 rkl.AELQKA..EYAKY...EG.GPL..RRKAP...HSLEVMA.IESP.....PPPEL..APADC
  19 krl.AELRRG..LLQGEvpvEG.GG-..-RRLA...RGPELMA.IEGL.....ENGD-..-GPAA
  20 krl.AELRRG..LLQGEslgEG.G--..-RRLA...RGPELMA.IEGL.....ENGDG..PPA--
  21 kkl.AELQRA..ELGKY...EP.GTL..KRKAA...ACPEVLA.IESP.....PPE--..-PPEC
  22 krl.AELRRG..LLQGEalsEG.G--..-RRLA...KGPELMA.IEGL.....ENGE-..---GP
  23 krl.AELRRG..LLQGEalsEG.G--..-RRLA...KGPELMA.IEGL.....ENGE-..---GP
  24 krl.AELRRG..LLQGEalsEG.G--..-RRLA...KGPELMA.IEGL.....ENGE-..---GP
  25 krl.AELRRG..LLQGEalgEG.G--..-RRMT...RGPELMA.IEGL.....ENGE-..---GP
  26 krl.AELRRG..LLQGEalsEG.G--..-RRLA...KGPELMA.IEGL.....ENGE-..---GP
  27 krl.AELRRG..LLHGEalgEG.G--..-RRMT...RGPELMA.IEGL.....ENGE-..---GP
  28 krl.AELRRG..LLHGEalgEG.G--..-RRMT...RGPELMA.IEGL.....ENGE-..---GP
  29 krl.AELRRG..LLHGEalgEG.G--..-RRMT...RGPELMA.IEGL.....ENGE-..---GP
  30 krl.AELRRG..LLHGEalgEG.G--..-RRMT...RGPELMA.IEGL.....ENGE-..---GP
  31 krl.AELRRG..LLQGEapgEG.GC-..--RLA...RGPELMA.IEGL.....ENGD-..-GPAA
  32 krl.AELRRG..LLHGEalgEG.G--..-RRMT...RGPELMA.IEGL.....ENGD-..---SP
  33 krls-DVQKA..RKTQA...EG.QALlqHRKAP...PALELVA.IEHH.....DTSD-..CPSSP
  34 krls-DVQKA..RKTQA...EG.QALlqHRKAP...PALELVA.IEHH.....DTSD-..CPSSP
  35 krl.LDLQKG..YPI--...-G.GTL..RRRIL...GSQDTVAvVEPP.....ENGDL..----P
  36 krl.LDLQKG..YPI--...-G.GTL..RRRIL...GSQDTVAvVESP.....ENGDF..----P
  37 kkl.CDIQKV..LLQAE...SGpGTL..RRKAP...RALQLVA.IEAP.....DSSGE..C-SSP
  38 kklr-DLRKS..-LSQA...EA.-TLt.RHKVP...GALHIVT.IESL.....ENGEC..--QSP
  39 kkl.CDIHKA..LLQTE...SGqGTL..RRKTP...AALDLVA.IE-P.....PSESC..DLPSP
  40 krl.AEMQRS..SEGR-...--.SSF..KKKPPpitQQQEVMS.MDSP.....PPDVVpsFSAEV
  41 kkl.AEIKKA..SDGR-...--.NTL..RKKPP...AAQEVMA.IESP.....PHDS-..--GEC
  42 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  43 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  44 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  45 krl.CDLQRShnHPDKT...GG.GPL..QQNPP...TALELVA.IEHNvlrhiQSETP..SDGGC
  46 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  47 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  48 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  49 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  50 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  51 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  52 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  53 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  54 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  55 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  56 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  57 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  58 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  59 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  60 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  61 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----
  62 ....------..-----...--.---..-----...-------.----.....-----..-----


                       50        60                70                  
                       |         |                 |                  
   1 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..PT.....T.EKPSS.H
   2 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..TT.....A.EKPSS.H
   3 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..PT.....T.EKPSS.H
   4 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..PT.....T.EKPSS.H
   5 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..PT.....T.EKPSS.H
   6 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..PT.....T.EKPSS.H
   7 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..PT.....T.EKPSS.H
   8 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..PT.....A.EKPSS.H
   9 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....A.EKSSN.H
  10 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....A.EKSSN.H
  11 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....A.EKSSN.H
  12 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....A.EKSSN.H
  13 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....V.EKSSN.H
  14 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....V.EKSSN.H
  15 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....V.EKSSN.H
  16 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....V.EKSSN.H
  17 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAM...TG.PAEGA..AAaa6ttA.EKPPN.H
  18 QS..PK....MVlp6asHFTPPQTPTKPRpsspQAL...GG.PHGPApaTA.....K.VKPTP.Q
  19 TG..PR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  20 AS..PR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  21 QS..PK....MT.....TFQDSELSSELQ....VAM...TG.EGPEE..AP.....-.EKPAN.-
  22 ATagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  23 ATagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  24 ATagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  25 TTagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGSEP..LP.....L.--PPA.R
  26 ATtgPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  27 TTagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGSEP..LP.....L.--PPA.R
  28 TTagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGSEP..LP.....L.--PPA.R
  29 TTagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGSEP..LP.....L.--PPA.R
  30 TTagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGSEP..LP.....L.--PPA.R
  31 AG..PR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  32 ATagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  33 LS..PK....ML.....TFQDSELSMELQ....NAMar.SG.YSGGQ..DG.....L.SMSGI.A
  34 LS..PK....ML.....TFQDSELSMELQ....NAMar.SG.YSGGQ..DG.....L.SMSGI.A
  35 VT..PK....LL.....TFQGAELSQELQ....SAL...TR.GNE-Q..LC.....T.GRRSF.-
  36 IT..PK....LL.....TFQGAELSRELQ....SAL...TR.GNE-P..LC.....T.GRRSF.-
  37 RT..PR....MQ.....TFQDSELSAELQ....TAMsshSG.GCEQS..LA.....I.KKAAG.M
  38 NT..PK....MT.....TFQDSELSYELQ....TAM...SN.SCHET..LS.....I.KNSQG.M
  39 HT..PK....MM.....TFQDSELSTELQ....SAMs..SQ.YSGCQ..DG.....LaIKSAVgM
  40 MS..PK....MS.....TFQDSELSSELQ....NAM...SQpGHEIS..KA.....Q.RARSF.S
  41 MS..PK....MS.....TFQDSELSGELQ....AAL...TR.PADVQ..DG.....T.E----.-
  42 --..--....--.....-------SP--Q....-AL...GG.PHGPA..TA.....K.VKPTP.Q
  43 --..--....--.....-------SP--Q....-AL...GG.PHGPA..TA.....K.VKPTP.Q
  44 --..--....--.....------------....AAL...SG.PAEAGa.AA.....V.EKSSN.H
  45 TS..PRtaraLL.....SFQDSELSAELQ....NAM...TG.HAGVG..GP.....F.-----.-
  46 --..--....--.....------------....---...--.-----..--.....K.VKPTP.Q
  47 --..--....--.....------------....---...--.----A..TA.....K.VKPTP.Q
  48 --..--....--.....------------....---...--.----A..TA.....K.VKPTP.Q
  49 --..--....--.....------------....---...--.----A..TA.....K.VKPTP.Q
  50 --..--....--.....------------....---...--.----A..TA.....K.VKPTP.Q
  51 --..--....--.....------------....---...--.-----..--.....K.VKPTP.Q
  52 --..--....--.....------------....---...--.-----..--.....K.VKPTP.Q
  53 --..--....--.....------------....---...--.-----..--.....K.VKPTP.Q
  54 --..--....--.....------------....---...--.-----..--.....K.VKPTP.Q
  55 --..--....--.....------------....---...--.-----..--.....K.VKPTP.Q
  56 --..--....--.....------------....---...--.-----..--.....K.VKPTP.Q
  57 --..--....--.....------------....---...--.-----..--.....K.VKPTP.Q
  58 --..--....--.....------------....---...--.----A..TA.....K.VKPTP.Q
  59 --..--....--.....------------....---...--.----A..TA.....K.VKPTP.Q
  60 --..--....--.....------------....---...--.----A..TA.....K.VKPTP.Q
  61 --..--....--.....------------....---...--.-----..--.....-.---PQ.L
  62 --..--....--.....------------....---...--.-----..--.....-.---QT.E


      80             90           100                110               
      |              |             |                  |               
   1 .LP.PTPR.ATTR...QDSSLGG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGP.S.....S
   2 .LP.PTPR.ATTR...QESSLSG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGP.S.....S
   3 .LP.PTPR.ATTR...QDSSLGG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGP.S.....S
   4 .LP.PTPR.ATTR...QDSSLGG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGP.S.....S
   5 .LP.PTPR.ATTR...QDSSLGG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGP.S.....S
   6 .LP.PTPR.ATTR...QDSSLGG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGP.S.....S
   7 .LP.PTPR.ATTR...QDSSLGG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGP.S.....S
   8 .LP.PTPR.ATTR...QDSSLGG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGP.S.....S
   9 .LP.ATPR.TTSR...QESSLSG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PQGP.G.....S
  10 .LP.ATPR.TTSR...QESSLSG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PQGP.G.....S
  11 .LP.ATPR.TTSR...QESSLSG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PQGP.G.....S
  12 .LP.ATPR.TTSR...QESSLSG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PQGP.G.....S
  13 .LP.PTPR.TTSR...-ESSLSG...R.ARHISS.S.QE.L.LG.....DG..PPGP.G.....S
  14 .LP.PTPR.TTSR...-ESSLSG...R.ARHISS.S.QE.L.LG.....DG..PPGP.G.....S
  15 .LP.PTPR.TTSR...-ESSLSG...R.ARHISS.S.QE.L.LG.....DG..PPGP.G.....S
  16 .LP.PTPR.TTSR...-ESSLSG...R.ARHISS.S.QE.L.LG.....DG..PPGP.G.....S
  17 .LP.PTPR.ASLR...QEPSLGG...Q.ARHMSS.S.QE.L.LG.....EG..PPGP.G.....S
  18 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEsE.AG.....PA..APGP.A.....P
  19 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPA.P.QP.S.GG.....DSstPQER.N.....L
  20 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPA.P.QP.S.GG.....DPntPQER.N.....L
  21 .-P.AAP-.-GYR...SPPALGG...R.TRQMSS.S.QE.L.LG.....DG..PRAPaS.....T
  22 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPA.P.QP.S.GG.....DPspPQER.N.....L
  23 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPA.P.QP.S.GG.....DPspPQER.N.....L
  24 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPA.P.QP.S.GG.....DPspPQER.N.....L
  25 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPV.P.QP.S.VG.....DPsaPQER.N.....L
  26 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEPPA.P.QP.S.SG.....DPsnPQER.N.....L
  27 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPV.P.QP.S.VG.....DPsaPQER.N.....L
  28 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPV.P.QP.S.VG.....DPsaPQER.N.....L
  29 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPV.P.QP.S.VG.....DPsaPQER.N.....L
  30 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPV.P.QP.S.VG.....DPsaPQER.N.....L
  31 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPA.P.QP.N.GG.....DPstPQER.N.....L
  32 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQGQPG.S.QP.N.AG.....EPsaPQER.N.....L
  33 .MRlSQES.IGIR...--SGGSG...R.SQE---.-.--.-.--.....-R..PMAS.V.....T
  34 .MRlSQES.IGIR...--SGGSG...R.SQE---.-.--.-.--.....-R..PMAS.V.....T
  35 .--.SQES.ISSRs..QGSGHSQ...EsASSYPVlP.VH.L.QGvd8erNH..PEGT.D.....Q
  36 .--.SQES.ISSRs..QGSGHSQ...EsASSFPVlP.LH.P.QGvd8erNH..PEGT.D.....Q
  37 .SR.SQES.MDTR...--SRGSG...R.SQ----.-.--.-.--.....-D..PTAS.S.....T
  38 .SQ.SQES.IGVRs..RGSGHSQdnvL.SWHLSS.PsQE.S.LG.....SG..ESSS.Sss7cmP
  39 .SS.SQES.IDTR...--SRGSG...R.SQEPPS.-.--.-.--.....-T..PSST.S.....A
  40 .KD.HDEA.MTGG...GGP-PKK...E.ARTMRQ.-.QS.S.QG.....SS..SSSR.G.....S
  41 .--.----.--VR...TNSGPQH...R.ARSLH-.-.--.-.--.....--..--EN.S.....I
  42 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PP..APGP.A.....P
  43 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PP..APGP.A.....P
  44 .LP.PTPR.TTSR...-ESSLSG...R.ARHISS.S.QE.L.LG.....DG..PPGP.G.....S
  45 .--.----.-DFR...-----GG...A.SAAMSV.S.QE.S.IG.....TR..SRGS.G.....T
  46 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.AG.....PP..APGP.V.....P
  47 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PA..APGP.A.....P
  48 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PA..APGP.A.....P
  49 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PA..APGP.A.....P
  50 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PA..APGP.A.....P
  51 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.AG.....PP..APGP.V.....P
  52 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.AG.....PP..APGP.V.....P
  53 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.AG.....PP..APGP.V.....P
  54 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PP..APGP.A.....P
  55 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PP..APGP.A.....P
  56 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PP..APGP.A.....P
  57 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PP..APGP.A.....P
  58 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PA..APGP.A.....P
  59 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PA..ALGP.A.....P
  60 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VE.SdAG.....PP..PPTA.A.....P
  61 .LP.PGERpASPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.TD.G.EG.....VP..PGVP.V.....L
  62 .KP.ITPR.-GHP...QSPTQRS...H.PHPAAQ.P.VE.S.IE.....AP..PQGP.A.....V


      120         130                  140            150              
       |           |                    |              |              
   1 PMSRSQEYLL.DE.G.PA.PG.....TP...P.REA.RPG...RH.GHSIK.RAS..V.....PP
   2 PMSRSQEYLL.DE.G.PA.PG.....TP...P.KEA.RPG...RH.GHSVK.RAS..V.....PP
   3 PMSRSQEYLL.DE.G.PA.PG.....TP...P.REA.RPG...RH.GHSIK.RAS..V.....PP
   4 PMSRSQEYLL.DE.G.PA.PG.....TP...P.REA.RPG...RH.GHSIK.RAS..V.....PP
   5 PMSRSQEYLL.DE.G.PA.PG.....TP...P.REA.RPG...RH.GHSIK.RAS..V.....PP
   6 PMSRSQEYLL.DE.G.PA.PG.....TP...P.REA.RPG...RH.GHSIK.RAS..V.....PP
   7 PMSRSQEYLL.DE.G.PA.PG.....TP...P.REA.RPG...RH.GHSIK.RAS..V.....PP
   8 PMSRSQEYLL.DE.G.PA.PG.....TP...P.REA.RPG...RH.GHSIK.RAS..V.....PP
   9 PMSRSQEYLL.DE.G.PA.PG.....TP...P.KEV.RSS...RH.GHSVK.RAS..V.....PP
  10 PMSRSQEYLL.DE.G.PA.PG.....TP...P.KEV.RSS...RH.GHSVK.RAS..V.....PP
  11 PMSRSQEYLL.DE.G.PA.PG.....TP...P.KEV.RSS...RH.GHSVK.RAS..V.....PP
  12 PMSRSQEYLL.DE.G.PA.PG.....TP...P.KEV.RSS...RH.GHSVK.RAS..V.....PP
  13 PMSRSQEYLL.DE.G.MA.PG.....TP...P.KEV.RSS...RH.GHSVK.RAS..V.....PP
  14 PMSRSQEYLL.DE.G.MA.PG.....TP...P.KEV.RSS...RH.GHSVK.RAS..V.....PP
  15 PMSRSQEYLL.DE.G.MA.PG.....TP...P.KEV.RSS...RH.GHSVK.RAS..V.....PP
  16 PMSRSQEYLL.DE.G.MA.PG.....TP...P.KEV.RSS...RH.GHSVK.RAS..V.....PP
  17 PLSRSQEYLL.DE.G.PA.SG.....TP...P.KET.RPS...RH.SHGVK.RAS..V.....PP
  18 AAVPTPVPTL.CL.P.PE.AD.....AE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  19 PEGTERPSKL.CS.PpPG.QG.....PP...P.Y-V.FMH...PQ.ASPSS.PAP..G.....PP
  20 PEGTERPPKL.CS.PlPS.QG.....PP...P.Y-V.FMY...PQ.ASPSS.PAP..G.....PP
  21 AISKSQEYLA.EG.T.PEgPP.....VP...PtKEL.RQP...RH.GHSIK.RAS..V.....PP
  22 PEGTERPPKL.CS.SlPG.QG.....PP...P.Y-V.FMY...PQ.GSPSS.PAP..G.....PP
  23 PEGTERPPKL.CS.SlPG.QG.....PP...P.Y-V.FMY...PQ.GSPSS.PAP..G.....PP
  24 PEGTERPPKL.CS.SlPG.QG.....PP...P.Y-V.FMY...PQ.GSPSS.PAP..G.....PP
  25 PEGTERPSKL.CS.PlPG.QG.....PA...P.Y-V.FMC...PQ.NLPSS.PAP..G.....PP
  26 PEGTERPPKL.CS.SlPG.QG.....PP...P.Y-V.FMY...PQ.ASPSS.PAPggA.....PP
  27 PEGTERPSKL.CS.PlPG.QG.....PA...P.Y-V.FMC...PQ.NLPSS.PAP..G.....PP
  28 PEGTERPSKL.CS.PlPG.QG.....PA...P.Y-V.FMC...PQ.NLPSS.PAP..G.....PP
  29 PEGTERPSKL.CS.PlPG.QG.....PA...P.Y-V.FMC...PQ.NLPSS.PAP..G.....PP
  30 PEGTERPSKL.CS.PlPG.QG.....PA...P.Y-V.FMC...PQ.NLPSS.PAP..G.....PP
  31 PEGTERPPKL.CP.PlPS.QG.....-P...P.AYV.FMY...PQ.SSPSS.PAP..G.....PP
  32 PEGTERPFKP.CS.PlPG.QG.....PA...P.Y-V.FMC...PQ.SLPSS.PAP..A.....PP
  33 PHSRSQESLG.SS.D.SS.PS.....KE...Q.YAI.RES...QD.KSQIS.PVR..M.....AP
  34 PHSRSQESLG.SS.D.SS.PS.....KE...Q.YAI.RES...QD.KSQIS.PVR..M.....AP
  35 ILQNHWVPNG.CLiQ.PE.PP.....AP...P.PKP.ALK...KR.SLSAC.RYA..L.....SD
  36 TLHHHQVTNG.CLiQ.PE.PP.....AP...P.PKP.ALK...KR.SLSAC.RYA..L.....SD
  37 PHSWSQESLDpSL.G.KE.RD.....LP...EgYDQ.RPL...QQ.QVQPK.QVP..Lgt8kyPA
  38 PHSKESLASL.PR.Q.PS.PEpygklTS...P.EGL.NSFtngSG.GSPLK.ERN..L.....PE
  39 PYSCSRESLT.SP.D.SS.PA.....KErniP.EGR.DQG...PR.PQQLPfSFK..Y.....PT
  40 VSSQGKRHSHsHS.Q.PA.PPy....TP...P.HTP.TKT...RT.SSSSS.TSS..AqsiasPQ
  41 NKSRDTEE--.HS.G.P-.--.....-P...K.KEA.RTM...RQ.SSQGG.QRN..V.....SS
  42 PPVPAAVPTL.CL.P.PE.TD.....VE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  43 PPVPAAVPTL.CL.P.PE.TD.....VE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  44 PMSRSQEYLL.DE.G.MA.PG.....TP...P.KEV.RSS...RH.GHSVK.RAS..V.....PP
  45 SSSGNSVP--.PK.S.KH.VH.....LP...N.RLH.QPH...HTsSSSSS.PSS..Q.....PS
  46 PPVPAAVPTL.CL.P.PE.AD.....VE...P.--R.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  47 PPVPTAVPTL.CL.P.PE.AD.....AE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  48 PPVPTAVPTL.CL.P.PE.AD.....AE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  49 PPVPTAVPTL.CL.P.PE.AD.....AE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  50 PPVPTAVPTL.CL.P.PE.AD.....AE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  51 PPVPAAVPTL.CL.P.PE.AD.....VE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  52 PPVPAAVPTL.CL.P.PE.AD.....VE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  53 PPVPAAVPTL.CL.P.PE.AD.....VE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  54 PPVPAAVPTL.CL.P.PE.TD.....VE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  55 PPVPAAVPTL.CL.P.PE.TD.....VE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  56 PPVPAAVPTL.CL.P.PE.TD.....VE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  57 PPVPAAVPTL.CL.P.PE.TD.....VE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  58 PPVPTAVPTL.CL.P.PE.AD.....AE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  59 LPVPTAVPTL.CL.P.PE.AD.....AE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  60 PP----VPTL.CL.P.PE.AD.....VE...P.--G.RPK...KR.AHSLN.RYT..A.....SD
  61 PVS---VPVL.CL.P.PA.GE.....GE...E.EPG.RPK...KR.AHSLN.RYA..A.....SD
  62 -----SVPLL.CL.P.PD.GD.....EA...C.DEYgLPK...KR.AHSLN.RYA..V.....SD


        160                  170           180                     190 
         |                    |             |                       | 
   1 VPG.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.A....LGG
   2 VPG.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.A....LGG
   3 VPG.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.A....LGG
   4 VPG.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.A....LGG
   5 VPG.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.A....LGG
   6 VPG.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.A....LGG
   7 VPG.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.A....LGG
   8 VPG.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.A....LGG
   9 VPG.KPR.QVL.....PS..GV...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.A....LGG
  10 VPG.KPR.QVL.....PS..GV...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.A....LGG
  11 VPG.KPR.QVL.....PS..GV...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.A....LGG
  12 VPG.KPR.QVL.....PS..GV...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.A....LGG
  13 VPG.KPR.QVL.....PS..GA...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.A....LGG
  14 VPG.KPR.QVL.....PS..GA...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.A....LGG
  15 VPG.KPR.QVL.....PS..GA...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.A....LGG
  16 VPG.KPR.QVL.....PS..GA...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.A....LGG
  17 VPG.KPR.QVL.....PP..GA...SP.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.A....LGV
  18 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  19 -PG.APR.AFS.....YL..AG...PP.A.T..PPDPPRP.KR....--..RS..H.S....LSR
  20 -PG.APR.AFS.....YL..AG...PP.A.T..PPDPPRP.KR....--..RS..H.S....LSR
  21 VPG.KPR.QPF.....PP..AA...GH.L.T..PPQTPGK.PR....PP..SP..Q.G....PSA
  22 -PG.APW.AFS.....YL..AG...PP.A.T..PPDPPRP.KR....--..RS..H.S....LSR
  23 -PG.APW.AFS.....YL..AG...PP.A.T..PPDPPRP.KR....--..RS..H.S....LSR
  24 -PG.APW.AFS.....YL..AG...PP.A.T..PPDPPRP.KR....--..RS..H.S....LSR
  25 -PG.VPR.AFS.....YL..AG...SP.A.A..PPDPPRP.KR....--..RS..H.S....LSR
  26 -PG.APW.AFS.....YL..AG...PP.A.T..PPDPPRP.KR....--..RS..H.S....LSR
  27 -PG.VPR.AFS.....YL..AG...SP.A.A..PPDPPRP.KR....--..RS..H.S....LSR
  28 -PG.VPR.AFS.....YL..AG...SP.A.A..PPDPPRP.KR....--..RS..H.S....LSR
  29 -PG.VPR.AFS.....YL..AG...SP.A.A..PPDPPRP.KR....--..RS..H.S....LSR
  30 -PG.VPR.AFS.....YL..AG...SP.A.A..PPDPPRP.KR....--..RS..H.S....LSR
  31 -PG.PPR.AFS.....YL..AG...PS.A.T..PPDPPRP.KR....--..RS..H.S....LSR
  32 -PG.VPR.AFS.....YL..AG...SS.A.A..PPDPPRP.KR....--..RS..H.S....LSR
  33 VLPlQPH.PNS.....SS..SS...PS.R.T..PPILTGKtTR....FA..YPpiH.T....QSR
  34 VLPlQPH.PNS.....SS..SS...PS.R.T..PPILTGKtTR....FA..YPpiH.T....QSR
  35 GEP.EEE.EEK.....KI..AT...AG.TgTl.STYATLT.RR....PG..RS..C.L....TNG
  36 GEP.EEE.EEK.....KI..AT...PG.T.AtlSSYATLT.RR....PG..RS..S.L....TNG
  37 VPA.KPK.---.....LA..GT...SG.V.A..PRGSPAL.RG....FSylRS..H.SgstdMSP
  38 GTD.QYA.QLTaq6agPV..GTlmvTP.S.T..PPQTPSM.ATapyvFM..YP..HvS....LKS
  39 ITA.KPNlQVL.....NY..HR...AQ.Y.S..S--AT--.--....--..--..-.-....---
  40 SKP.KP-.AHF.....GQ..GE...RP.Q.S..PRSHSNQ.SP....TH..RG..A.L....CTQ
  41 SQP.KPR.QSY.....PQ..GT...GPpY.T..PPQTPTK.TK....PP..AS..Q.T....TSN
  42 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  43 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  44 VPG.KPR.QVL.....PS..GA...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.A....LG-
  45 PPP.KTY.TYI.....HPckAS...TN.E.T..PSMQPSK.--....--..LP..E.A....VGL
  46 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  47 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  48 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  49 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  50 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  51 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  52 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  53 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  54 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  55 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  56 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  57 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  58 SEP.ERD.ELL.....VP..TA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  59 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  60 SEP.ERD.ELL.....VP..AA...VG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  61 SEQ.ERD.ELL.....VP..DA...G-.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.S....VRA
  62 GEQ.ERD.ELN.....VP..DS...GG.-.-..-KYATVQ.PR....VG..RS..N.S....MKG


                    200  
                     |  
   1 .PH..GPA.....PATA..
   2 .PH..GPApata.KVK-..
   3 .PH..GPApata.EVK-..
   4 .PH..GPApata.KVK-..
   5 .PH..GPApata.KVK-..
   6 .PH..GPApata.KVK-..
   7 .PH..GPApata.KVK-..
   8 .PH..GPApata.KVK-..
   9 .PH..GPAta...KVKPtp
  10 .PH..GPAta...KVKPtp
  11 .PH..GPAta...KVKPtp
  12 .PH..GPAta...KVKPtp
  13 .PH..GPAta...KVKPtp
  14 .PH..GPAta...KVKPtp
  15 .PH..GPAta...KVKPtp
  16 .PH..GPAta...KVKPtp
  17 .PH..GPTpata.KVK-..
  18 .PA..GADkn6rsQ---..
  19 .PG..PAEg....EAEGe.
  20 .PG..PAEg....EADGe.
  21 .PH..ATAkv6tpQLLP..
  22 .PG..PTEgda..EGEA..
  23 .PG..PTEgda..EGEA..
  24 .PG..PTEgda..EGEA..
  25 .PG..PAEg....EAEGe.
  26 .PG..PTEgda..EGEA..
  27 .PG..PAEg....EAEGe.
  28 .PG..PAEg....EAEGe.
  29 .PG..PAEg....EAEGe.
  30 .PG..PAEg....EAEGe.
  31 .PG..PAEg....EAEGe.
  32 .PG..PAEg....EAEGe.
  33 .PVvsPSQpnqgsPL--..
  34 .PVvsPSQpnqgsPL--..
  35 kPE..KKVqrsqsF---..
  36 qPE..KKVqrsqsF---..
  37 .PL..KDRes...N---..
  38 .PR..APSsqgae--QP..
  39 .--..---.....----..
  40 .PQ..PQQfhpqhQTHP..
  41 .PP..GKPkpsp.QI--..
  42 .PA..GTDkn6rsQ---..
  43 .PA..GTDkn6rsQ---..
  44 .--..---.....----..
  45 .PE..PQHdq7hyDLK-..
  46 .PA..GTDkn6rsQ---..
  47 .PA..GADkn6rsQ---..
  48 .PA..GADkn6rsQ---..
  49 .PA..GADkn6rsQ---..
  50 .PA..GADkn6rsQ---..
  51 .PA..GTDkn6rsQ---..
  52 .PA..GTDkn6rsQ---..
  53 .PA..GTDkn6rsQ---..
  54 .PA..GTDkn6rsQ---..
  55 .PA..GTDkn6rsQ---..
  56 .PA..GTDkn6rsQ---..
  57 .PA..GTDkn6rsQ---..
  58 .PA..GADkn6rsQ---..
  59 .PA..GADkn6rsQ---..
  60 .PA..GADkn6rsQ---..
  61 .PA..GGDkn6rsQ---..
  62 .QA..DKNvn6qsF---..