(c) 1992-2000 Regents of the University of California, Santa Cruz
Sequence Alignment and Modeling Software System
http://www.cse.ucsc.edu/research/compbio/sam.html

Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)

Sequence numbers correspond to the following labels:

    • T0500
    • gi|55962741|emb|CAI11563.1|_131:327 novel protein similar to human and mouse CASK interacting protein 2 (CASKIN2) [Danio rerio]
                    10              20            30               40  
                    |               |             |                |  
   1 ...A.ELQKAEYA..KY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....PPP..EPTPADC
   2 rklA.ELQKAEYA..KY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....PPP..EPTPADC
   3 rklA.ELQKAEYA..KY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....PPP..EPTPADC
   4 rklA.ELQKAEYA..KY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....PPP..EPTPADC
   5 rklA.ELQKAEYA..KY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....PPP..EPTPADC
   6 rklA.ELQKAEYA..KY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....PPP..EPTPADC
   7 rklA.ELQKAEYA..KY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....PPP..EPTPADC
   8 rklA.ELQKAEYA..KY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMT.IESP.....PPP..EPTPADC
   9 rklA.ELQKAEYS..KY...EG.GPL..RRKAP...QSLEMMA.IESP.....PPS..EPAAAEC
  10 rklA.ELQKAEYS..KY...EG.GPL..RRKAP...QSLEMMA.IESP.....PPS..EPAAAEC
  11 rklA.ELQKAEYS..KY...EG.GPL..RRKAP...QSLEMMA.IESP.....PPS..EPAAAEC
  12 rklA.ELQKAEYS..KY...EG.GPL..RRKAP...QSLEMMA.IESP.....PPS..EPAAAEC
  13 rklA.ELQKAEYS..KY...EG.GPL..RRKTP...QSLEMMA.IESP.....PPS..EPAAAEC
  14 rklA.ELQKAEYS..KY...EG.GPL..RRKTP...QSLEMMA.IESP.....PPS..EPAAAEC
  15 rklA.ELQKAEYS..KY...EG.GPL..RRKTP...QSLEMMA.IESP.....PPS..EPAAAEC
  16 rklA.ELQKAEYS..KY...EG.GPL..RRKTP...QSLEMMA.IESP.....PPS..EPAAAEC
  17 rklA.ELQKAEYA..KY...EG.GPL..RRKAP...QSLEVMA.IESP.....TPP..EPAPADC
  18 rklA.ELQKAEYA..KY...EG.GPL..RRKAP...HSLEVMA.IESP.....PPP..ELAPADC
  19 krlA.ELRRGLLQ..GEvpvEG.GG-..-RRLA...RGPELMA.IEGL.....ENG..DGPAA--
  20 krlA.ELRRGLLQ..GEslgEG.G--..-RRLA...RGPELMA.IEGL.....ENG..DGPPA--
  21 krlA.ELRRGLLQ..GEalsEG.G--..-RRLA...KGPELMA.IEGL.....ENG..E----GP
  22 krlA.ELRRGLLQ..GEalsEG.G--..-RRLA...KGPELMA.IEGL.....ENG..E----GP
  23 krlA.ELRRGLLQ..GEalsEG.G--..-RRLA...KGPELMA.IEGL.....ENG..E----GP
  24 kklA.ELQRAELG..KY...EP.GTL..KRKAA...ACPEVLA.IESP.....PPE..PP---EC
  25 krlA.ELRRGLLQ..GEalgEG.G--..-RRMT...RGPELMA.IEGL.....ENG..E----GP
  26 krlA.ELRRGLLQ..GEalsEG.G--..-RRLA...KGPELMA.IEGL.....ENG..E----GP
  27 krlA.ELRRGLLH..GEalgEG.G--..-RRMT...RGPELMA.IEGL.....ENG..E----GP
  28 krlA.ELRRGLLH..GEalgEG.G--..-RRMT...RGPELMA.IEGL.....ENG..E----GP
  29 krlA.ELRRGLLH..GEalgEG.G--..-RRMT...RGPELMA.IEGL.....ENG..E----GP
  30 krlA.ELRRGLLH..GEalgEG.G--..-RRMT...RGPELMA.IEGL.....ENG..E----GP
  31 krlA.ELRRGLLQ..GEapgEG.GC-..--RLA...RGPELMA.IEGL.....ENG..DGPAA--
  32 krlA.ELRRGLLH..GEalgEG.G--..-RRMT...RGPELMA.IEGL.....ENG..D----SP
  33 krlS.DVQKARKT..QA...EG.QALlqHRKAP...PALELVA.IEHH.....DTS..D-CPSSP
  34 krlS.DVQKARKT..QA...EG.QALlqHRKAP...PALELVA.IEHH.....DTS..D-CPSSP
  35 krlL.DLQKGYPI..--...-G.GTL..RRRIL...GSQDTVAvVEPP.....ENG..DL----P
  36 krlL.DLQKGYPI..--...-G.GTL..RRRIL...GSQDTVAvVESP.....ENG..DF----P
  37 kk.LrDLRKS-LS..QA...EA.-TLt.RHKVP...GALHIVT.IESL.....ENG..EC--QSP
  38 kklC.DIQKVLLQ..AE...SGpGTL..RRKAP...RALQLVA.IEAP.....DSS..GEC-SSP
  39 kklC.DIHKALLQ..TE...SGqGTL..RRKTP...AALDLVA.IE-P.....PSE..SCDLPSP
  40 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  41 kklA.EIKKASDG..R-...--.NTL..RKKPP...AAQEVMA.IESP.....PHD..S---GEC
  42 krlA.EMQRSSEG..R-...--.SSF..KKKPPpitQQQEVMS.MDSP.....PPDvvPSFSAEV
  43 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  44 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  45 krlC.DLQRSHNHpdKT...GG.GPL..QQNPP...TALELVA.IEHNvlrhiQSE..TPSDGGC
  46 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  47 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  48 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  49 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  50 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  51 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  52 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  53 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  54 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  55 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  56 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  57 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  58 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  59 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  60 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  61 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------
  62 ...-.--------..--...--.---..-----...-------.----.....---..-------


                       50        60                70                  
                       |         |                 |                  
   1 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..PT.....T.EKPSS.H
   2 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..TT.....A.EKPSS.H
   3 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..PT.....T.EKPSS.H
   4 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..PT.....T.EKPSS.H
   5 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..PT.....T.EKPSS.H
   6 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..PT.....T.EKPSS.H
   7 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..PT.....T.EKPSS.H
   8 QS..PK....MT.....TFQDSELSDELQ....AAM...TG.PAEVG..PT.....A.EKPSS.H
   9 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....A.EKSSN.H
  10 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....A.EKSSN.H
  11 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....A.EKSSN.H
  12 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....A.EKSSN.H
  13 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....V.EKSSN.H
  14 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....V.EKSSN.H
  15 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....V.EKSSN.H
  16 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAL...SG.PAEAGa.AA.....V.EKSSN.H
  17 QS..PK....MT.....TFQDSELSGELQ....AAM...TG.PAEGA..AAaa6ttA.EKPPN.H
  18 QS..PK....MVlp6asHFTPPQTPTKPRpsspQAL...GG.PHGPApaTA.....K.VKPTP.Q
  19 TG..PR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  20 AS..PR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  21 ATagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  22 ATagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  23 ATagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  24 QS..PK....MT.....TFQDSELSSELQ....VAM...TG.EGPEE..-A.....P.EKPAN.-
  25 TTagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGSEP..LP.....L.--PPA.R
  26 ATtgPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  27 TTagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGSEP..LP.....L.--PPA.R
  28 TTagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGSEP..LP.....L.--PPA.R
  29 TTagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGSEP..LP.....L.--PPA.R
  30 TTagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGSEP..LP.....L.--PPA.R
  31 AG..PR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  32 ATagPR....LL.....TFQGSELSPELQ....AAM...AG.GGPEP..LP.....L.--PPA.R
  33 LS..PK....ML.....TFQDSELSMELQ....NAMar.SG.YSGGQ..DG.....L.SMSGI.A
  34 LS..PK....ML.....TFQDSELSMELQ....NAMar.SG.YSGGQ..DG.....L.SMSGI.A
  35 VT..PK....LL.....TFQGAELSQELQ....SAL...TR.GNE-Q..LC.....T.GRRSF.-
  36 IT..PK....LL.....TFQGAELSRELQ....SAL...TR.GNE-P..LC.....T.GRRSF.-
  37 NT..PK....MT.....TFQDSELSYELQ....TAM...SN.SCHET..LS.....I.KNSQG.M
  38 RT..PR....MQ.....TFQDSELSAELQ....TAMsshSG.GCEQS..LA.....I.KKAAG.M
  39 HT..PK....MM.....TFQDSELSTELQ....SAMs..SQ.YSGCQ..DG.....LaIKSAVgM
  40 --..--....--.....------------....AAL...SG.PAEAGa.AA.....V.EKSSN.H
  41 MS..PK....MS.....TFQDSELSGELQ....AAL...TR.PADVQ..DG.....T.E----.-
  42 MS..PK....MS.....TFQDSELSSELQ....NAM...SQpGHEIS..KA.....Q.RARSF.S
  43 --..--....--.....-------SP--Q....-AL...GG.PHGPA..TA.....K.VKPTP.Q
  44 --..--....--.....------------....---...--.-----..-A.....K.VKPTP.Q
  45 TS..PRtaraLL.....SFQDSELSAELQ....NAM...TG.HAGVG..GP.....F.-----.-
  46 --..--....--.....------------....---...--.-----..-A.....K.VKPTP.Q
  47 --..--....--.....------------....---...--.-----..-A.....K.VKPTP.Q
  48 --..--....--.....------------....---...--.-----..-A.....K.VKPTP.Q
  49 --..--....--.....------------....---...--.----A..TA.....K.VKPTP.Q
  50 --..--....--.....------------....---...--.----A..TA.....K.VKPTP.Q
  51 --..--....--.....------------....---...--.----A..TA.....K.VKPTP.Q
  52 --..--....--.....------------....---...--.----A..TA.....K.VKPTP.Q
  53 --..--....--.....------------....---...--.-----..-A.....K.VKPTP.Q
  54 --..--....--.....------------....---...--.-----..-A.....K.VKPTP.Q
  55 --..--....--.....------------....---...--.-----..-A.....K.VKPTP.Q
  56 --..--....--.....------------....---...--.-----..-A.....K.VKPTP.Q
  57 --..--....--.....------------....---...--.-----..-A.....K.VKPTP.Q
  58 --..--....--.....------------....---...--.----A..TA.....K.VKPTP.Q
  59 --..--....--.....------------....---...--.----A..TA.....K.VKPTP.Q
  60 --..--....--.....------------....---...--.----A..TA.....K.VKPTP.Q
  61 --..--....--.....------------....---...--.-----..--.....-.--TPQ.L
  62 --..--....--.....------------....---...--.-----..--.....-.--SPQ.I


      80             90           100                110               
      |              |             |                  |               
   1 .LP.PTPR.ATTR...QDSSLGG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGPS.....SP
   2 .LP.PTPR.ATTR...QESSLSG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGPS.....SP
   3 .LP.PTPR.ATTR...QDSSLGG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGPS.....SP
   4 .LP.PTPR.ATTR...QDSSLGG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGPS.....SP
   5 .LP.PTPR.ATTR...QDSSLGG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGPS.....SP
   6 .LP.PTPR.ATTR...QDSSLGG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGPS.....SP
   7 .LP.PTPR.ATTR...QDSSLGG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGPS.....SP
   8 .LP.PTPR.ATTR...QDSSLGG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PPGPS.....SP
   9 .LP.ATPR.TTSR...QESSLSG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PQGPG.....SP
  10 .LP.ATPR.TTSR...QESSLSG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PQGPG.....SP
  11 .LP.ATPR.TTSR...QESSLSG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PQGPG.....SP
  12 .LP.ATPR.TTSR...QESSLSG...R.ARHMSS.S.QE.L.LG.....DG..PQGPG.....SP
  13 .LP.PTPR.TTSR...-ESSLSG...R.ARHISS.S.QE.L.LG.....DG..PPGPG.....SP
  14 .LP.PTPR.TTSR...-ESSLSG...R.ARHISS.S.QE.L.LG.....DG..PPGPG.....SP
  15 .LP.PTPR.TTSR...-ESSLSG...R.ARHISS.S.QE.L.LG.....DG..PPGPG.....SP
  16 .LP.PTPR.TTSR...-ESSLSG...R.ARHISS.S.QE.L.LG.....DG..PPGPG.....SP
  17 .LP.PTPR.ASLR...QEPSLGG...Q.ARHMSS.S.QE.L.LG.....EG..PPGPG.....SP
  18 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEsE.AG.....PA..APGPA.....PA
  19 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPA.P.QP.S.GG.....DSstPQERN.....LP
  20 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPA.P.QP.S.GG.....DPntPQERN.....LP
  21 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPA.P.QP.S.GG.....DPspPQERN.....LP
  22 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPA.P.QP.S.GG.....DPspPQERN.....LP
  23 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPA.P.QP.S.GG.....DPspPQERN.....LP
  24 .-P.AAP-.-GYR...SPPALGG...R.TRQMSS.S.QE.L.LG.....DG..PRAPA.....ST
  25 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPV.P.QP.S.VG.....DPsaPQERN.....LP
  26 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEPPA.P.QP.S.SG.....DPsnPQERN.....LP
  27 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPV.P.QP.S.VG.....DPsaPQERN.....LP
  28 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPV.P.QP.S.VG.....DPsaPQERN.....LP
  29 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPV.P.QP.S.VG.....DPsaPQERN.....LP
  30 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPV.P.QP.S.VG.....DPsaPQERN.....LP
  31 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQEQPA.P.QP.N.GG.....DPstPQERN.....LP
  32 .SP.SQES.IGAR...--SRGSG...H.SQGQPG.S.QP.N.AG.....EPsaPQERN.....LP
  33 .MRlSQES.IGIR...--SGGSG...R.SQE---.-.--.-.--.....-R..PMASV.....TP
  34 .MRlSQES.IGIR...--SGGSG...R.SQE---.-.--.-.--.....-R..PMASV.....TP
  35 .--.SQES.ISSRs..QGSGHSQ...EsASSYPVlP.VH.L.QGvd8erNH..PEGTD.....QI
  36 .--.SQES.ISSRs..QGSGHSQ...EsASSFPVlP.LH.P.QGvd8erNH..PEGTD.....QT
  37 .SQ.SQES.IGVRs..RGSGHSQdnvL.SWHLSS.PsQE.S.LG.....SG..ESSSSss7cmPP
  38 .SR.SQES.MDTR...--SRGSG...R.SQ----.-.--.-.--.....-D..PTASS.....TP
  39 .SS.SQES.IDTR...--SRGSG...R.SQEPPS.-.--.-.--.....-T..PSSTS.....AP
  40 .LP.PTPR.TTSR...-ESSLSG...R.ARHISS.S.QE.L.LG.....DG..PPGPG.....SP
  41 .--.----.--VR...TNSGPQH...R.ARSLH-.-.--.-.--.....--..--ENS.....IN
  42 .KD.HDEA.MTGG...GGP-PKK...E.ARTMRQ.-.QS.S.QG.....SS..SSSRG.....SV
  43 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PP..APGPA.....PP
  44 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.AG.....PP..APGPV.....PP
  45 .--.----.-DFR...-----GG...A.SAAMSV.S.QE.S.IG.....TR..SRGSG.....TS
  46 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.AG.....PP..APGPV.....PP
  47 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.AG.....PP..APGPV.....PP
  48 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.AG.....PP..APGPV.....PP
  49 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PA..APGPA.....PP
  50 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PA..APGPA.....PP
  51 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PA..APGPA.....PP
  52 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PA..APGPA.....PP
  53 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PP..APGPA.....PP
  54 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PP..APGPA.....PP
  55 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PP..APGPA.....PP
  56 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PP..APGPA.....PP
  57 lLP.PTDRpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PP..APGPA.....PP
  58 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PA..APGPA.....PP
  59 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VEgE.VG.....PA..ALGPA.....PL
  60 lLP.PTERpMSPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.VE.SdAG.....PP..PPTAA.....PP
  61 .LP.PGERpASPRslpQSPTHRG...F.AYVLPQ.P.TD.G.EG.....VP..PGVPV.....LP
  62 .VQ.QTEKpITPRghpQSPTQRS...H.PHPAAQ.P.VE.S.IE.....AP..PQGPA.....V-


      120         130                  140          150                
       |           |                    |            |                
   1 .MSRSQEYLL.DE.GPA.PG.....TP...P.RE.ARPGRH...GHSIK.RAS..V.....PPVP
   2 .MSRSQEYLL.DE.GPA.PG.....TP...P.KE.ARPGRH...GHSVK.RAS..V.....PPVP
   3 .MSRSQEYLL.DE.GPA.PG.....TP...P.RE.ARPGRH...GHSIK.RAS..V.....PPVP
   4 .MSRSQEYLL.DE.GPA.PG.....TP...P.RE.ARPGRH...GHSIK.RAS..V.....PPVP
   5 .MSRSQEYLL.DE.GPA.PG.....TP...P.RE.ARPGRH...GHSIK.RAS..V.....PPVP
   6 .MSRSQEYLL.DE.GPA.PG.....TP...P.RE.ARPGRH...GHSIK.RAS..V.....PPVP
   7 .MSRSQEYLL.DE.GPA.PG.....TP...P.RE.ARPGRH...GHSIK.RAS..V.....PPVP
   8 .MSRSQEYLL.DE.GPA.PG.....TP...P.RE.ARPGRH...GHSIK.RAS..V.....PPVP
   9 .MSRSQEYLL.DE.GPA.PG.....TP...P.KE.VRSSRH...GHSVK.RAS..V.....PPVP
  10 .MSRSQEYLL.DE.GPA.PG.....TP...P.KE.VRSSRH...GHSVK.RAS..V.....PPVP
  11 .MSRSQEYLL.DE.GPA.PG.....TP...P.KE.VRSSRH...GHSVK.RAS..V.....PPVP
  12 .MSRSQEYLL.DE.GPA.PG.....TP...P.KE.VRSSRH...GHSVK.RAS..V.....PPVP
  13 .MSRSQEYLL.DE.GMA.PG.....TP...P.KE.VRSSRH...GHSVK.RAS..V.....PPVP
  14 .MSRSQEYLL.DE.GMA.PG.....TP...P.KE.VRSSRH...GHSVK.RAS..V.....PPVP
  15 .MSRSQEYLL.DE.GMA.PG.....TP...P.KE.VRSSRH...GHSVK.RAS..V.....PPVP
  16 .MSRSQEYLL.DE.GMA.PG.....TP...P.KE.VRSSRH...GHSVK.RAS..V.....PPVP
  17 .LSRSQEYLL.DE.GPA.SG.....TP...P.KE.TRPSRH...SHGVK.RAS..V.....PPVP
  18 .AVPTPVPTL.CL.PPE.AD.....AE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  19 .EGTERPSKL.CS.PPP.GQ.....GP...P.PY.VFMHPQ...ASPSS.PAP..G.....PP-P
  20 .EGTERPPKL.CS.PLP.SQ.....GP...P.PY.VFMYPQ...ASPSS.PAP..G.....PP-P
  21 .EGTERPPKL.CS.SLP.GQ.....GP...P.PY.VFMYPQ...GSPSS.PAP..G.....PP-P
  22 .EGTERPPKL.CS.SLP.GQ.....GP...P.PY.VFMYPQ...GSPSS.PAP..G.....PP-P
  23 .EGTERPPKL.CS.SLP.GQ.....GP...P.PY.VFMYPQ...GSPSS.PAP..G.....PP-P
  24 aISKSQEYLA.EG.TPEgPP.....VP...PtKE.LRQPRH...GHSIK.RAS..V.....PPVP
  25 .EGTERPSKL.CS.PLP.GQ.....GP...A.PY.VFMCPQ...NLPSS.PAP..G.....PP-P
  26 .EGTERPPKL.CS.SLP.GQ.....GP...P.PY.VFMYPQ...ASPSS.PAPggA.....PP-P
  27 .EGTERPSKL.CS.PLP.GQ.....GP...A.PY.VFMCPQ...NLPSS.PAP..G.....PP-P
  28 .EGTERPSKL.CS.PLP.GQ.....GP...A.PY.VFMCPQ...NLPSS.PAP..G.....PP-P
  29 .EGTERPSKL.CS.PLP.GQ.....GP...A.PY.VFMCPQ...NLPSS.PAP..G.....PP-P
  30 .EGTERPSKL.CS.PLP.GQ.....GP...A.PY.VFMCPQ...NLPSS.PAP..G.....PP-P
  31 .EGTERPPKL.CP.PLP.SQ.....GP...P.AY.VFMYPQ...SSPSS.PAP..G.....PP-P
  32 .EGTERPFKP.CS.PLP.GQ.....GP...A.PY.VFMCPQ...SLPSS.PAP..A.....PP-P
  33 .HSRSQESLG.SS.DSS.PS.....KE...Q.YA.IRESQD...KSQIS.PVR..M.....APVL
  34 .HSRSQESLG.SS.DSS.PS.....KE...Q.YA.IRESQD...KSQIS.PVR..M.....APVL
  35 .LQNHWVPNG.CLiQPE.PP.....AP...P.PK.PALKKR...SLSAC.RYA..L.....SDGE
  36 .LHHHQVTNG.CLiQPE.PP.....AP...P.PK.PALKKR...SLSAC.RYA..L.....SDGE
  37 .HSKESLASL.PR.QPS.PEpygklTS...P.EG.LNSFTNgsgGSPLK.ERN..L.....PEGT
  38 .HSWSQESLDpSL.GKE.RD.....LP...E.GYdQRPLQQ...QVQPK.QVP..Lgt8kyPAVP
  39 .YSCSRESLT.SP.DSS.PA.....KErniP.EG.RDQGPR...PQQLPfSFK..Y.....PTIT
  40 .MSRSQEYLL.DE.GMA.PG.....TP...P.KE.VRSSRH...GHSVK.RAS..V.....PPVP
  41 .KSRDTEE--.HS.GP-.--.....-P...K.KE.ARTMRQ...SSQGG.QRN..V.....SSSQ
  42 .SSQGKRHSHsHS.QPA.PPy....TP...P.HT.PTKTRT...SSSSS.TSS..AqsiasPQSK
  43 .PVPAAVPTL.CL.PPE.TD.....VE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  44 .PVPAAVPTL.CL.PPE.AD.....VE...P.--.RRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  45 .SSGNSVP--.PK.SKH.VH.....LP...N.RL.HQPHHTs..SSSSS.PSS..Q.....PSPP
  46 .PVPAAVPTL.CL.PPE.AD.....VE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  47 .PVPAAVPTL.CL.PPE.AD.....VE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  48 .PVPAAVPTL.CL.PPE.AD.....VE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  49 .PVPTAVPTL.CL.PPE.AD.....AE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  50 .PVPTAVPTL.CL.PPE.AD.....AE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  51 .PVPTAVPTL.CL.PPE.AD.....AE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  52 .PVPTAVPTL.CL.PPE.AD.....AE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  53 .PVPAAVPTL.CL.PPE.TD.....VE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  54 .PVPAAVPTL.CL.PPE.TD.....VE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  55 .PVPAAVPTL.CL.PPE.TD.....VE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  56 .PVPAAVPTL.CL.PPE.TD.....VE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  57 .PVPAAVPTL.CL.PPE.TD.....VE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  58 .PVPTAVPTL.CL.PPE.AD.....AE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  59 .PVPTAVPTL.CL.PPE.AD.....AE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  60 .P----VPTL.CL.PPE.AD.....VE...P.--.GRPKKR...AHSLN.RYT..A.....SDSE
  61 .VS---VPVL.CL.PPA.GE.....GE...E.EP.GRPKKR...AHSLN.RYA..A.....SDSE
  62 .----SVPLL.CL.PPD.GD.....EA...CdEY.GLPKKR...AHSLN.RYA..V.....SDGE


      160                  170           180                 190       
       |                    |             |                   |       
   1 G.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.ALGGP.....
   2 G.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.ALGGP.....
   3 G.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.ALGGP.....
   4 G.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.ALGGP.....
   5 G.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.ALGGP.....
   6 G.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.ALGGP.....
   7 G.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.ALGGP.....
   8 G.KPR.QVL.....PP..GT...SH.F.T..PPQTPTK.TR....PG..SP..Q.ALGGP.....
   9 G.KPR.QVL.....PS..GV...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.ALGGP.....
  10 G.KPR.QVL.....PS..GV...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.ALGGP.....
  11 G.KPR.QVL.....PS..GV...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.ALGGP.....
  12 G.KPR.QVL.....PS..GV...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.ALGGP.....
  13 G.KPR.QVL.....PS..GA...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.ALGGP.....
  14 G.KPR.QVL.....PS..GA...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.ALGGP.....
  15 G.KPR.QVL.....PS..GA...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.ALGGP.....
  16 G.KPR.QVL.....PS..GA...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.ALGGP.....
  17 G.KPR.QVL.....PP..GA...SP.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.ALGVP.....
  18 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  19 G.APR.AFS.....YL..AG...PP.A.T..PPDPPRP.KR....--..RS..H.SLSRP.....
  20 G.APR.AFS.....YL..AG...PP.A.T..PPDPPRP.KR....--..RS..H.SLSRP.....
  21 G.APW.AFS.....YL..AG...PP.A.T..PPDPPRP.KR....--..RS..H.SLSRP.....
  22 G.APW.AFS.....YL..AG...PP.A.T..PPDPPRP.KR....--..RS..H.SLSRP.....
  23 G.APW.AFS.....YL..AG...PP.A.T..PPDPPRP.KR....--..RS..H.SLSRP.....
  24 G.KPR.QPF.....PP..AA...GH.L.T..PPQTPGK.PR....PP..SP..Q.GPSAP.....
  25 G.VPR.AFS.....YL..AG...SP.A.A..PPDPPRP.KR....--..RS..H.SLSRP.....
  26 G.APW.AFS.....YL..AG...PP.A.T..PPDPPRP.KR....--..RS..H.SLSRP.....
  27 G.VPR.AFS.....YL..AG...SP.A.A..PPDPPRP.KR....--..RS..H.SLSRP.....
  28 G.VPR.AFS.....YL..AG...SP.A.A..PPDPPRP.KR....--..RS..H.SLSRP.....
  29 G.VPR.AFS.....YL..AG...SP.A.A..PPDPPRP.KR....--..RS..H.SLSRP.....
  30 G.VPR.AFS.....YL..AG...SP.A.A..PPDPPRP.KR....--..RS..H.SLSRP.....
  31 G.PPR.AFS.....YL..AG...PS.A.T..PPDPPRP.KR....--..RS..H.SLSRP.....
  32 G.VPR.AFS.....YL..AG...SS.A.A..PPDPPRP.KR....--..RS..H.SLSRP.....
  33 PlQPH.PNS.....SS..SS...PS.R.T..PPILTGKtTR....FA..YPpiH.TQSRPv....
  34 PlQPH.PNS.....SS..SS...PS.R.T..PPILTGKtTR....FA..YPpiH.TQSRPv....
  35 P.EEE.EEK.....KI..AT...AG.TgTl.STYATLT.RR....PG..RS..-.CLTN-.....
  36 P.EEE.EEK.....KI..AT...PG.T.AtlSSYATLT.RR....PG..RS..-.SLTN-.....
  37 D.QYA.QLTaq6agPV..GTlmvTP.S.T..PPQTPSM.ATapyvFM..YP..HvSLKSP.....
  38 A.KPK.---.....LA..GT...SG.V.A..PRGSPAL.RG....FSylRS..H.SGSTD.....
  39 A.KPNlQVL.....NY..HR...AQ.Y.S..S--AT--.--....--..--..-.-----.....
  40 G.KPR.QVL.....PS..GA...SH.F.T..PPQTPTK.AQ....PG..SP..Q.ALGGP.....
  41 P.KPR.QSY.....PQ..GT...GPpY.T..PPQTPTK.TK....PP..AS..Q.TTSNP.....
  42 P.KP-.AHF.....GQ..GE...RP.Q.S..PRSHSNQ.SP....TH..RG..A.LCTQPqpqqf
  43 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  44 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  45 P.KTY.TYI.....HPckAS...TN.E.T..PSMQPSK.--....--..LP..E.AVGLP.....
  46 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  47 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  48 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  49 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  50 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  51 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  52 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  53 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  54 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  55 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  56 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  57 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  58 P.ERD.ELL.....VP..TA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  59 P.ERD.ELL.....VP..AA...AG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  60 P.ERD.ELL.....VP..AA...VG.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  61 Q.ERD.ELL.....VP..DA...G-.-.-..-PYATVQ.RR....VG..RS..H.SVRAP.....
  62 Q.ERD.ELN.....VP..DS...GG.-.-..-KYATVQ.PR....VG..RS..N.SMK--.....


              200     
               |     
   1 HG...PAPATA.....
   2 HG...PAPATAkvk..
   3 HG...PAPATAkvk..
   4 HG...PAPATAkvk..
   5 HG...PAPATAkvk..
   6 HG...PAPATAkvk..
   7 HG...PAPATAevk..
   8 HG...PAPATAkvk..
   9 HG...PATAKVkpt..
  10 HG...PATAKVkpt..
  11 HG...PATAKVkpt..
  12 HG...PATAKVkpt..
  13 HG...PATAKVkpt..
  14 HG...PATAKVkpt..
  15 HG...PATAKVkpt..
  16 HG...PATAKVkpt..
  17 HG...PTPATAkvk..
  18 AG...-ADKNVnrs..
  19 -G...PAEGEAege..
  20 -G...PAEGEAdge..
  21 -G...PTEGDAege..
  22 -G...PTEGDAege..
  23 -G...PTEGDAege..
  24 H-...-ATAKVkptpq
  25 -G...PAEGEAege..
  26 -G...PTEGDAege..
  27 -G...PAEGEAege..
  28 -G...PAEGEAege..
  29 -G...PAEGEAege..
  30 -G...PAEGEAege..
  31 -G...PAEGEAege..
  32 -G...PAEGEAege..
  33 VS...PSQPNQgsp..
  34 VS...PSQPNQgsp..
  35 -G...KPEKKVqrs..
  36 -G...QPEKKVqrs..
  37 RA...PSSQGAeqp..
  38 MS...PPLKDResn..
  39 --...------.....
  40 HG...PATAKVkpt..
  41 PGkpkPSPQIV.....
  42 HP...QHQTHP.....
  43 AG...-TDKNVnrs..
  44 AG...-TDKNVnrs..
  45 EP...QHDQNPthy..
  46 AG...-TDKNVnrs..
  47 AG...-TDKNVnrs..
  48 AG...-TDKNVnrs..
  49 AG...-ADKNVnrs..
  50 AG...-ADKNVnrs..
  51 AG...-ADKNVnrs..
  52 AG...-ADKNVnrs..
  53 AG...-TDKNVnrs..
  54 AG...-TDKNVnrs..
  55 AG...-TDKNVnrs..
  56 AG...-TDKNVnrs..
  57 AG...-TDKNVnrs..
  58 AG...-ADKNVnrs..
  59 AG...-ADKNVnrs..
  60 AG...-ADKNVnrs..
  61 AG...-GDKNVnrs..
  62 -G...QADKNVnrs..