# TARGET T0487 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0487.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 64 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 G 0.540 0.142 0.034 0.078 0.057 0.039 0.048 0.029 0.017 0.010 0.006 2 L 0.107 0.060 0.027 0.081 0.081 0.095 0.135 0.108 0.133 0.098 0.074 3 G 0.141 0.107 0.030 0.089 0.094 0.089 0.124 0.101 0.101 0.073 0.051 4 T 0.089 0.149 0.051 0.156 0.132 0.100 0.115 0.081 0.063 0.040 0.023 5 P 0.269 0.160 0.055 0.157 0.119 0.075 0.070 0.045 0.026 0.015 0.008 6 E 0.427 0.144 0.046 0.133 0.080 0.051 0.052 0.032 0.019 0.010 0.006 7 A 0.127 0.120 0.048 0.162 0.128 0.100 0.118 0.079 0.059 0.039 0.021 8 V 0.030 0.038 0.024 0.056 0.070 0.108 0.171 0.131 0.154 0.138 0.080 9 R 0.137 0.213 0.152 0.241 0.126 0.054 0.038 0.020 0.011 0.006 0.002 10 A 0.148 0.096 0.102 0.156 0.116 0.103 0.114 0.075 0.046 0.031 0.014 11 Q 0.092 0.105 0.077 0.178 0.135 0.114 0.123 0.080 0.051 0.031 0.015 12 A 0.079 0.075 0.062 0.131 0.128 0.126 0.152 0.110 0.069 0.046 0.022 13 Y 0.083 0.066 0.090 0.122 0.116 0.126 0.143 0.099 0.076 0.053 0.028 14 R 0.091 0.131 0.109 0.174 0.128 0.099 0.120 0.066 0.043 0.026 0.012 15 L 0.085 0.059 0.053 0.100 0.107 0.108 0.156 0.118 0.098 0.073 0.045 16 S 0.234 0.258 0.108 0.166 0.092 0.050 0.043 0.025 0.013 0.008 0.004 17 I 0.124 0.100 0.054 0.160 0.136 0.110 0.120 0.087 0.055 0.035 0.019 18 P 0.204 0.107 0.051 0.107 0.094 0.090 0.123 0.094 0.063 0.044 0.023 19 K 0.104 0.137 0.097 0.235 0.156 0.105 0.083 0.042 0.023 0.011 0.006 20 L 0.045 0.036 0.041 0.055 0.064 0.092 0.141 0.128 0.150 0.140 0.108 21 M 0.049 0.073 0.050 0.143 0.152 0.135 0.157 0.099 0.075 0.044 0.025 22 G 0.163 0.119 0.085 0.136 0.107 0.084 0.112 0.076 0.059 0.039 0.020 23 R 0.112 0.090 0.085 0.182 0.149 0.114 0.120 0.069 0.042 0.025 0.013 24 R 0.190 0.154 0.091 0.177 0.112 0.083 0.088 0.052 0.029 0.017 0.008 25 A 0.099 0.098 0.063 0.132 0.117 0.118 0.136 0.096 0.068 0.046 0.026 26 V 0.132 0.123 0.085 0.158 0.133 0.096 0.110 0.075 0.045 0.028 0.015 27 S 0.150 0.129 0.100 0.148 0.111 0.097 0.110 0.066 0.044 0.031 0.014 28 K 0.131 0.162 0.118 0.185 0.132 0.093 0.083 0.046 0.027 0.015 0.008 29 P 0.285 0.143 0.076 0.137 0.100 0.070 0.082 0.053 0.029 0.017 0.008 30 A 0.153 0.097 0.072 0.131 0.111 0.105 0.133 0.085 0.057 0.037 0.019 31 D 0.121 0.144 0.115 0.191 0.133 0.090 0.091 0.055 0.032 0.019 0.009 32 A 0.099 0.095 0.089 0.166 0.139 0.106 0.118 0.084 0.051 0.034 0.017 33 L 0.073 0.081 0.091 0.144 0.123 0.112 0.138 0.100 0.069 0.046 0.022 34 R 0.050 0.075 0.092 0.159 0.134 0.139 0.143 0.091 0.061 0.040 0.018 35 V 0.059 0.056 0.074 0.120 0.120 0.134 0.157 0.114 0.083 0.053 0.030 36 G 0.116 0.089 0.072 0.122 0.109 0.102 0.143 0.095 0.075 0.049 0.028 37 F 0.035 0.028 0.030 0.061 0.075 0.088 0.157 0.143 0.163 0.133 0.087 38 Y 0.105 0.100 0.087 0.161 0.135 0.107 0.122 0.076 0.054 0.035 0.017 39 R 0.094 0.108 0.105 0.185 0.140 0.108 0.113 0.068 0.042 0.024 0.013 40 A 0.101 0.102 0.063 0.128 0.119 0.110 0.135 0.098 0.066 0.048 0.030 41 Q 0.115 0.120 0.057 0.140 0.120 0.101 0.127 0.089 0.063 0.043 0.024 42 E 0.177 0.109 0.070 0.151 0.124 0.096 0.108 0.070 0.046 0.031 0.017 43 T 0.092 0.074 0.068 0.140 0.123 0.118 0.143 0.096 0.072 0.049 0.025 44 A 0.037 0.068 0.054 0.145 0.140 0.136 0.166 0.105 0.079 0.047 0.024 45 L 0.006 0.008 0.012 0.026 0.041 0.069 0.120 0.137 0.209 0.196 0.177 46 A 0.013 0.020 0.038 0.078 0.103 0.118 0.168 0.143 0.139 0.109 0.071 47 L 0.010 0.015 0.033 0.067 0.092 0.125 0.174 0.131 0.151 0.124 0.079 48 L 0.005 0.005 0.011 0.019 0.033 0.053 0.104 0.122 0.216 0.217 0.215 49 R 0.017 0.035 0.039 0.100 0.120 0.133 0.202 0.125 0.113 0.077 0.038 50 L 0.047 0.055 0.066 0.119 0.117 0.140 0.188 0.101 0.085 0.051 0.031 51 D 0.303 0.236 0.100 0.166 0.085 0.040 0.035 0.018 0.009 0.005 0.003 52 G 0.179 0.127 0.041 0.110 0.091 0.090 0.128 0.092 0.066 0.048 0.028 53 A 0.204 0.221 0.054 0.135 0.101 0.084 0.087 0.051 0.031 0.021 0.011 54 Q 0.305 0.152 0.107 0.168 0.107 0.065 0.049 0.025 0.012 0.006 0.003 55 G 0.308 0.151 0.088 0.136 0.096 0.075 0.070 0.038 0.019 0.012 0.006 56 W 0.015 0.062 0.029 0.067 0.077 0.101 0.165 0.141 0.156 0.120 0.068 57 P 0.051 0.059 0.043 0.111 0.148 0.164 0.211 0.109 0.060 0.032 0.013 58 E 0.391 0.124 0.277 0.144 0.039 0.013 0.007 0.003 0.001 0.001 0.001 59 F 0.047 0.043 0.065 0.143 0.157 0.185 0.209 0.087 0.038 0.019 0.009 60 L 0.005 0.016 0.016 0.027 0.038 0.043 0.105 0.157 0.224 0.220 0.150 61 R 0.007 0.012 0.044 0.073 0.137 0.220 0.287 0.120 0.059 0.032 0.010 62 R 0.033 0.048 0.738 0.134 0.033 0.008 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 63 A 0.016 0.020 0.063 0.098 0.132 0.204 0.281 0.114 0.043 0.021 0.008 64 L 0.004 0.006 0.012 0.014 0.019 0.030 0.094 0.139 0.250 0.255 0.176 65 L 0.016 0.020 0.114 0.113 0.152 0.170 0.217 0.101 0.053 0.033 0.011 66 R 0.014 0.051 0.700 0.151 0.052 0.018 0.008 0.003 0.001 0.001 0.001 67 A 0.031 0.029 0.063 0.079 0.110 0.127 0.252 0.164 0.077 0.044 0.024 68 F 0.024 0.019 0.020 0.034 0.045 0.075 0.170 0.176 0.180 0.168 0.089 69 G 0.093 0.155 0.254 0.233 0.127 0.056 0.042 0.022 0.010 0.005 0.002 70 A 0.121 0.113 0.184 0.180 0.138 0.088 0.082 0.047 0.023 0.015 0.009 71 S 0.099 0.073 0.043 0.070 0.077 0.102 0.189 0.130 0.107 0.067 0.042 72 G 0.328 0.210 0.061 0.158 0.099 0.050 0.045 0.025 0.013 0.007 0.004 73 A 0.059 0.025 0.029 0.044 0.058 0.080 0.139 0.132 0.168 0.146 0.121 74 S 0.125 0.201 0.096 0.234 0.150 0.072 0.062 0.030 0.017 0.009 0.005 75 L 0.024 0.020 0.022 0.044 0.060 0.097 0.171 0.150 0.175 0.138 0.099 76 R 0.161 0.265 0.120 0.233 0.118 0.045 0.028 0.016 0.008 0.004 0.002 77 L 0.044 0.035 0.025 0.071 0.079 0.095 0.167 0.150 0.145 0.114 0.075 78 H 0.181 0.123 0.074 0.172 0.137 0.092 0.086 0.058 0.037 0.026 0.014 79 T 0.128 0.150 0.104 0.201 0.124 0.098 0.090 0.049 0.030 0.018 0.007 80 L 0.047 0.049 0.040 0.095 0.099 0.135 0.168 0.124 0.111 0.086 0.048 81 H 0.084 0.066 0.042 0.096 0.098 0.116 0.177 0.118 0.101 0.069 0.035 82 A 0.146 0.147 0.122 0.208 0.129 0.084 0.073 0.042 0.026 0.015 0.008 83 H 0.079 0.085 0.052 0.100 0.102 0.117 0.158 0.108 0.092 0.067 0.040 84 P 0.198 0.142 0.046 0.134 0.111 0.086 0.117 0.074 0.048 0.029 0.015 85 S 0.394 0.226 0.078 0.132 0.067 0.037 0.031 0.017 0.009 0.006 0.003 86 Q 0.231 0.157 0.063 0.155 0.120 0.088 0.085 0.051 0.027 0.016 0.008 87 G 0.216 0.225 0.059 0.136 0.095 0.078 0.086 0.051 0.029 0.018 0.007 88 L 0.110 0.059 0.057 0.123 0.131 0.149 0.174 0.095 0.057 0.031 0.015 89 A 0.248 0.214 0.166 0.201 0.089 0.036 0.025 0.013 0.005 0.003 0.001 90 F 0.006 0.017 0.021 0.040 0.058 0.107 0.197 0.158 0.180 0.144 0.072 91 R 0.032 0.043 0.064 0.127 0.173 0.170 0.201 0.102 0.051 0.027 0.011 92 E 0.118 0.078 0.420 0.217 0.089 0.036 0.024 0.011 0.004 0.002 0.001 93 A 0.016 0.029 0.102 0.125 0.131 0.198 0.227 0.090 0.047 0.025 0.010 94 L 0.002 0.003 0.008 0.011 0.020 0.034 0.114 0.147 0.246 0.246 0.170 95 R 0.023 0.039 0.268 0.184 0.173 0.123 0.111 0.046 0.019 0.011 0.003 96 K 0.015 0.052 0.609 0.195 0.077 0.028 0.015 0.006 0.002 0.001 0.001 97 A 0.023 0.022 0.039 0.043 0.065 0.109 0.226 0.183 0.126 0.106 0.058 98 K 0.081 0.138 0.074 0.122 0.112 0.103 0.162 0.101 0.058 0.036 0.014 99 E 0.214 0.244 0.256 0.163 0.066 0.027 0.016 0.008 0.003 0.002 0.001 100 E 0.371 0.147 0.113 0.132 0.088 0.057 0.054 0.023 0.008 0.004 0.002 101 G 0.331 0.248 0.055 0.130 0.074 0.050 0.055 0.030 0.015 0.008 0.003 102 V 0.008 0.008 0.009 0.021 0.038 0.082 0.160 0.156 0.206 0.180 0.131 103 Q 0.030 0.103 0.139 0.274 0.207 0.110 0.073 0.035 0.017 0.009 0.004 104 A 0.001 0.002 0.010 0.014 0.023 0.050 0.107 0.132 0.233 0.243 0.186 105 V 0.001 0.005 0.007 0.024 0.047 0.095 0.161 0.147 0.207 0.174 0.131 106 L 0.001 0.002 0.005 0.012 0.022 0.027 0.063 0.109 0.209 0.271 0.280 107 V 0.002 0.002 0.008 0.014 0.033 0.069 0.103 0.118 0.205 0.252 0.195 108 L 0.005 0.009 0.014 0.038 0.061 0.092 0.180 0.155 0.201 0.160 0.086 109 T 0.008 0.019 0.016 0.042 0.056 0.108 0.186 0.148 0.181 0.145 0.092 110 P 0.134 0.170 0.064 0.179 0.134 0.097 0.110 0.051 0.033 0.016 0.011 111 P 0.557 0.164 0.042 0.091 0.046 0.030 0.032 0.018 0.010 0.006 0.003 112 M 0.240 0.134 0.037 0.119 0.102 0.103 0.111 0.065 0.043 0.028 0.018 113 A 0.208 0.327 0.058 0.136 0.083 0.061 0.057 0.033 0.018 0.013 0.006 114 W 0.102 0.085 0.045 0.109 0.115 0.158 0.156 0.089 0.068 0.046 0.026 115 E 0.480 0.232 0.083 0.111 0.047 0.019 0.014 0.008 0.003 0.002 0.001 116 D 0.058 0.083 0.049 0.125 0.115 0.138 0.168 0.107 0.079 0.053 0.024 117 R 0.081 0.085 0.056 0.132 0.149 0.145 0.159 0.095 0.053 0.031 0.015 118 N 0.217 0.145 0.188 0.202 0.103 0.058 0.047 0.023 0.010 0.005 0.002 119 R 0.039 0.040 0.099 0.158 0.154 0.148 0.174 0.092 0.052 0.030 0.014 120 L 0.007 0.016 0.030 0.044 0.059 0.077 0.157 0.158 0.181 0.177 0.093 121 K 0.004 0.024 0.087 0.138 0.176 0.178 0.169 0.105 0.064 0.042 0.015 122 A 0.019 0.026 0.184 0.124 0.118 0.147 0.153 0.103 0.061 0.048 0.017 123 L 0.015 0.016 0.057 0.083 0.096 0.184 0.262 0.134 0.085 0.049 0.018 124 L 0.007 0.013 0.032 0.038 0.045 0.056 0.125 0.134 0.196 0.190 0.164 125 L 0.003 0.004 0.013 0.017 0.035 0.060 0.130 0.124 0.211 0.209 0.194 126 R 0.070 0.185 0.276 0.211 0.118 0.054 0.044 0.019 0.013 0.007 0.004 127 E 0.053 0.054 0.081 0.147 0.148 0.151 0.178 0.096 0.048 0.025 0.019 128 G 0.295 0.161 0.069 0.118 0.080 0.072 0.090 0.052 0.032 0.020 0.012 129 L 0.019 0.023 0.022 0.049 0.056 0.079 0.162 0.151 0.195 0.137 0.109 130 P 0.031 0.050 0.049 0.091 0.104 0.084 0.126 0.131 0.132 0.106 0.096 131 S 0.013 0.020 0.025 0.045 0.055 0.074 0.123 0.131 0.196 0.181 0.135 132 Q 0.010 0.014 0.016 0.044 0.077 0.093 0.181 0.215 0.156 0.116 0.077 133 I 0.006 0.007 0.014 0.031 0.051 0.036 0.078 0.179 0.188 0.216 0.195 134 L 0.006 0.005 0.011 0.022 0.042 0.051 0.109 0.156 0.226 0.210 0.162 135 N 0.021 0.070 0.071 0.141 0.140 0.120 0.177 0.096 0.089 0.053 0.023 136 V 0.023 0.029 0.042 0.093 0.113 0.143 0.228 0.129 0.107 0.060 0.033 137 P 0.568 0.197 0.093 0.087 0.028 0.011 0.009 0.003 0.002 0.001 0.001 138 L 0.091 0.084 0.059 0.120 0.115 0.114 0.169 0.099 0.072 0.047 0.030 139 R 0.116 0.133 0.070 0.134 0.123 0.100 0.122 0.082 0.055 0.041 0.022 140 E 0.213 0.248 0.159 0.165 0.083 0.054 0.043 0.018 0.009 0.005 0.002 141 E 0.210 0.199 0.168 0.194 0.103 0.051 0.036 0.022 0.009 0.005 0.003 142 E 0.279 0.205 0.071 0.132 0.083 0.063 0.073 0.047 0.024 0.016 0.006 143 R 0.128 0.095 0.066 0.152 0.140 0.129 0.128 0.080 0.046 0.025 0.012 144 H 0.247 0.110 0.152 0.145 0.104 0.073 0.077 0.049 0.023 0.014 0.007 145 R 0.033 0.079 0.097 0.184 0.162 0.148 0.148 0.072 0.043 0.023 0.012 146 W 0.009 0.011 0.020 0.032 0.053 0.057 0.128 0.170 0.188 0.178 0.154 147 E 0.033 0.047 0.098 0.169 0.164 0.155 0.165 0.087 0.047 0.027 0.009 148 N 0.027 0.059 0.201 0.246 0.168 0.108 0.094 0.049 0.026 0.014 0.008 149 A 0.006 0.007 0.018 0.024 0.041 0.071 0.159 0.149 0.186 0.175 0.164 150 L 0.005 0.011 0.021 0.049 0.077 0.084 0.148 0.141 0.185 0.160 0.121 151 L 0.002 0.003 0.013 0.014 0.025 0.051 0.113 0.126 0.232 0.239 0.182 152 G 0.008 0.026 0.071 0.155 0.218 0.140 0.160 0.099 0.062 0.034 0.027 153 L 0.002 0.002 0.009 0.010 0.014 0.021 0.068 0.123 0.221 0.271 0.259 154 L 0.003 0.006 0.010 0.038 0.073 0.099 0.159 0.152 0.179 0.145 0.137 155 A 0.002 0.002 0.006 0.007 0.012 0.015 0.039 0.071 0.196 0.257 0.392 156 K 0.006 0.019 0.039 0.079 0.140 0.142 0.175 0.118 0.113 0.092 0.077 157 A 0.012 0.021 0.029 0.051 0.074 0.091 0.178 0.162 0.171 0.130 0.082 158 G 0.231 0.141 0.064 0.168 0.096 0.076 0.087 0.050 0.044 0.026 0.018 159 L 0.047 0.033 0.023 0.064 0.071 0.080 0.142 0.140 0.155 0.127 0.117 160 Q 0.046 0.098 0.050 0.165 0.152 0.128 0.132 0.095 0.066 0.045 0.025 161 V 0.016 0.023 0.022 0.052 0.071 0.089 0.124 0.131 0.161 0.154 0.156 162 V 0.027 0.020 0.023 0.051 0.074 0.097 0.147 0.152 0.158 0.140 0.111 163 A 0.031 0.044 0.044 0.138 0.129 0.117 0.161 0.107 0.108 0.078 0.044 164 L 0.006 0.007 0.007 0.015 0.022 0.048 0.094 0.100 0.219 0.235 0.248 165 S 0.148 0.214 0.074 0.201 0.143 0.070 0.066 0.036 0.025 0.014 0.009 166 G 0.370 0.122 0.047 0.124 0.088 0.063 0.075 0.047 0.032 0.020 0.013 167 A 0.304 0.173 0.041 0.108 0.078 0.068 0.073 0.048 0.043 0.036 0.028 168 Y 0.097 0.140 0.030 0.128 0.114 0.122 0.135 0.090 0.069 0.049 0.027 169 P 0.239 0.177 0.050 0.149 0.112 0.087 0.073 0.048 0.030 0.021 0.013 170 A 0.086 0.072 0.050 0.135 0.123 0.132 0.167 0.102 0.068 0.042 0.023 171 E 0.025 0.050 0.049 0.152 0.141 0.162 0.190 0.096 0.072 0.041 0.021 172 L 0.001 0.003 0.009 0.015 0.025 0.054 0.126 0.121 0.237 0.202 0.206 173 A 0.001 0.005 0.018 0.030 0.052 0.063 0.124 0.121 0.195 0.194 0.197 174 V 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.009 0.029 0.062 0.215 0.329 0.345 175 G 0.001 0.002 0.003 0.011 0.030 0.029 0.071 0.147 0.212 0.245 0.250 176 F 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.007 0.023 0.106 0.184 0.294 0.375 177 D 0.003 0.004 0.013 0.040 0.095 0.081 0.168 0.244 0.149 0.125 0.078 178 A 0.001 0.002 0.008 0.011 0.019 0.025 0.064 0.128 0.222 0.280 0.239 179 G 0.003 0.004 0.010 0.020 0.035 0.077 0.132 0.108 0.239 0.207 0.165 180 G 0.029 0.055 0.050 0.101 0.114 0.138 0.246 0.098 0.092 0.049 0.030 181 R 0.112 0.207 0.108 0.176 0.114 0.099 0.093 0.037 0.026 0.016 0.012 182 E 0.485 0.204 0.044 0.097 0.056 0.036 0.039 0.018 0.010 0.006 0.005 183 S 0.436 0.178 0.035 0.116 0.068 0.048 0.049 0.029 0.018 0.013 0.010 184 F 0.024 0.037 0.027 0.082 0.105 0.152 0.174 0.121 0.113 0.091 0.074 185 R 0.010 0.033 0.045 0.102 0.127 0.191 0.215 0.111 0.085 0.054 0.028 186 F 0.001 0.004 0.011 0.020 0.031 0.079 0.170 0.135 0.226 0.177 0.146 187 G 0.001 0.001 0.006 0.009 0.018 0.025 0.072 0.102 0.213 0.238 0.315 188 G 0.001 0.001 0.003 0.005 0.012 0.012 0.040 0.097 0.213 0.288 0.329 189 A 0.001 0.001 0.001 0.003 0.009 0.009 0.026 0.086 0.187 0.291 0.388 190 A 0.001 0.001 0.001 0.003 0.009 0.008 0.025 0.102 0.180 0.282 0.389 191 C 0.001 0.002 0.007 0.020 0.054 0.060 0.141 0.224 0.193 0.179 0.119 192 A 0.001 0.002 0.011 0.014 0.028 0.031 0.081 0.149 0.218 0.259 0.205 193 V 0.002 0.005 0.012 0.023 0.038 0.095 0.175 0.129 0.230 0.182 0.110 194 G 0.044 0.102 0.089 0.157 0.124 0.121 0.186 0.068 0.060 0.030 0.019 195 G 0.130 0.137 0.097 0.151 0.122 0.118 0.129 0.052 0.033 0.018 0.014 196 D 0.433 0.260 0.056 0.104 0.053 0.031 0.031 0.016 0.008 0.005 0.003 197 G 0.320 0.161 0.035 0.104 0.078 0.066 0.078 0.059 0.042 0.033 0.024 198 G 0.178 0.136 0.041 0.121 0.109 0.114 0.114 0.073 0.052 0.037 0.025 199 H 0.099 0.127 0.084 0.191 0.145 0.122 0.090 0.059 0.039 0.028 0.015 200 L 0.020 0.023 0.022 0.046 0.058 0.130 0.186 0.148 0.166 0.130 0.069 201 L 0.038 0.065 0.048 0.161 0.150 0.127 0.150 0.106 0.078 0.050 0.028 202 W 0.029 0.018 0.030 0.051 0.067 0.090 0.148 0.156 0.169 0.144 0.099 203 T 0.085 0.175 0.115 0.233 0.160 0.087 0.071 0.037 0.021 0.011 0.006 204 L 0.017 0.017 0.017 0.038 0.059 0.064 0.142 0.175 0.178 0.152 0.140 205 P 0.286 0.152 0.080 0.162 0.119 0.065 0.062 0.037 0.020 0.011 0.006 206 E 0.234 0.184 0.117 0.212 0.107 0.053 0.050 0.023 0.011 0.005 0.003 207 A 0.068 0.037 0.039 0.070 0.089 0.096 0.161 0.137 0.127 0.099 0.077 208 Q 0.102 0.128 0.093 0.159 0.136 0.107 0.128 0.068 0.042 0.025 0.012 209 A 0.099 0.259 0.193 0.211 0.102 0.054 0.041 0.021 0.011 0.006 0.003 210 G 0.247 0.151 0.074 0.139 0.107 0.077 0.093 0.056 0.030 0.019 0.008 211 E 0.547 0.158 0.072 0.108 0.046 0.024 0.023 0.013 0.006 0.003 0.001 212 R 0.161 0.153 0.154 0.207 0.122 0.086 0.063 0.030 0.014 0.008 0.003 213 I 0.031 0.056 0.045 0.074 0.096 0.146 0.178 0.136 0.109 0.083 0.046 214 P 0.079 0.179 0.080 0.137 0.123 0.097 0.137 0.087 0.045 0.026 0.009 215 Q 0.153 0.088 0.142 0.182 0.134 0.110 0.102 0.048 0.024 0.012 0.005 216 E 0.329 0.111 0.192 0.189 0.082 0.040 0.033 0.016 0.006 0.003 0.001 217 V 0.013 0.030 0.032 0.101 0.129 0.175 0.238 0.138 0.083 0.043 0.019 218 V 0.001 0.002 0.005 0.005 0.011 0.020 0.059 0.100 0.227 0.277 0.294 219 W 0.011 0.021 0.135 0.168 0.219 0.174 0.156 0.065 0.031 0.015 0.006 220 D 0.047 0.061 0.490 0.216 0.094 0.044 0.031 0.011 0.004 0.002 0.001 221 L 0.002 0.003 0.009 0.013 0.029 0.064 0.154 0.160 0.213 0.192 0.162 222 L 0.003 0.005 0.008 0.020 0.037 0.058 0.170 0.183 0.223 0.200 0.093 223 E 0.021 0.040 0.376 0.208 0.139 0.097 0.072 0.025 0.013 0.007 0.002 224 E 0.035 0.059 0.440 0.211 0.124 0.063 0.044 0.016 0.005 0.002 0.001 225 T 0.009 0.014 0.028 0.038 0.056 0.087 0.214 0.195 0.163 0.127 0.068 226 L 0.005 0.007 0.015 0.022 0.043 0.097 0.213 0.162 0.194 0.162 0.081 227 W 0.025 0.043 0.456 0.199 0.126 0.070 0.048 0.018 0.009 0.004 0.002 228 A 0.036 0.038 0.298 0.169 0.139 0.115 0.130 0.046 0.017 0.009 0.003 229 F 0.004 0.006 0.018 0.018 0.028 0.076 0.205 0.160 0.219 0.185 0.081 230 R 0.011 0.022 0.072 0.096 0.120 0.144 0.225 0.133 0.091 0.063 0.023 231 R 0.024 0.047 0.526 0.181 0.098 0.055 0.037 0.018 0.007 0.005 0.002 232 K 0.040 0.125 0.238 0.176 0.122 0.112 0.107 0.046 0.019 0.011 0.004 233 A 0.051 0.050 0.032 0.056 0.065 0.086 0.178 0.170 0.141 0.107 0.064 234 G 0.491 0.125 0.100 0.110 0.070 0.036 0.033 0.019 0.009 0.005 0.002 235 R 0.159 0.154 0.235 0.190 0.106 0.066 0.049 0.021 0.010 0.006 0.003 236 L 0.023 0.073 0.040 0.070 0.093 0.128 0.204 0.129 0.108 0.077 0.054 237 P 0.098 0.078 0.034 0.090 0.109 0.105 0.165 0.122 0.097 0.064 0.039 238 S 0.253 0.162 0.182 0.196 0.085 0.043 0.036 0.021 0.012 0.007 0.003 239 R 0.014 0.030 0.040 0.136 0.145 0.171 0.211 0.114 0.074 0.046 0.020 240 V 0.001 0.003 0.004 0.009 0.015 0.034 0.073 0.117 0.231 0.261 0.252 241 L 0.003 0.007 0.016 0.041 0.078 0.095 0.158 0.178 0.174 0.144 0.106 242 L 0.001 0.002 0.013 0.015 0.025 0.033 0.070 0.106 0.204 0.262 0.268 243 L 0.001 0.002 0.007 0.017 0.037 0.053 0.102 0.125 0.217 0.238 0.200 244 R 0.006 0.012 0.018 0.041 0.061 0.108 0.206 0.159 0.186 0.136 0.066 245 D 0.030 0.067 0.056 0.171 0.173 0.132 0.153 0.099 0.060 0.036 0.024 246 G 0.206 0.060 0.041 0.070 0.071 0.091 0.160 0.106 0.092 0.064 0.039 247 R 0.255 0.225 0.049 0.164 0.099 0.073 0.073 0.030 0.018 0.009 0.005 248 V 0.025 0.077 0.020 0.033 0.039 0.055 0.100 0.100 0.167 0.179 0.205 249 P 0.339 0.320 0.052 0.136 0.084 0.031 0.021 0.009 0.004 0.002 0.001 250 Q 0.829 0.087 0.026 0.034 0.011 0.005 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 251 D 0.146 0.126 0.064 0.197 0.156 0.113 0.099 0.053 0.025 0.014 0.007 252 E 0.025 0.062 0.035 0.119 0.131 0.129 0.182 0.156 0.086 0.057 0.018 253 F 0.006 0.010 0.034 0.051 0.074 0.219 0.281 0.145 0.100 0.065 0.017 254 A 0.024 0.059 0.540 0.228 0.083 0.034 0.020 0.008 0.003 0.001 0.001 255 L 0.008 0.010 0.051 0.067 0.100 0.149 0.234 0.164 0.103 0.076 0.038 256 A 0.002 0.004 0.012 0.013 0.025 0.041 0.115 0.142 0.241 0.252 0.153 257 L 0.007 0.012 0.075 0.092 0.147 0.195 0.253 0.110 0.062 0.036 0.010 258 E 0.024 0.039 0.644 0.160 0.071 0.033 0.019 0.007 0.002 0.001 0.001 259 A 0.025 0.031 0.093 0.131 0.142 0.145 0.256 0.111 0.039 0.019 0.008 260 L 0.001 0.001 0.003 0.003 0.005 0.018 0.064 0.085 0.229 0.337 0.253 261 A 0.029 0.125 0.261 0.265 0.180 0.063 0.044 0.019 0.007 0.004 0.002 262 R 0.061 0.148 0.414 0.184 0.092 0.049 0.027 0.014 0.006 0.004 0.002 263 E 0.215 0.099 0.055 0.085 0.091 0.117 0.171 0.088 0.043 0.022 0.012 264 G 0.552 0.241 0.033 0.082 0.034 0.019 0.019 0.011 0.005 0.003 0.001 265 I 0.040 0.019 0.018 0.029 0.042 0.075 0.125 0.118 0.183 0.181 0.170 266 A 0.170 0.335 0.112 0.210 0.102 0.034 0.022 0.009 0.004 0.002 0.001 267 Y 0.011 0.010 0.014 0.032 0.052 0.090 0.158 0.169 0.183 0.154 0.129 268 D 0.087 0.187 0.112 0.219 0.158 0.089 0.070 0.041 0.020 0.010 0.006 269 L 0.009 0.011 0.016 0.057 0.078 0.093 0.158 0.168 0.170 0.132 0.108 270 V 0.014 0.011 0.018 0.028 0.040 0.060 0.107 0.134 0.199 0.199 0.190 271 S 0.032 0.068 0.060 0.217 0.195 0.113 0.139 0.075 0.054 0.028 0.018 272 V 0.002 0.001 0.005 0.005 0.010 0.011 0.029 0.075 0.171 0.241 0.449 273 R 0.025 0.046 0.055 0.169 0.209 0.115 0.140 0.101 0.070 0.045 0.026 274 K 0.015 0.034 0.064 0.095 0.096 0.117 0.176 0.136 0.123 0.093 0.050 275 S 0.065 0.124 0.094 0.196 0.157 0.128 0.105 0.059 0.037 0.022 0.015 276 G 0.231 0.125 0.046 0.095 0.067 0.068 0.120 0.087 0.079 0.055 0.028 277 G 0.218 0.114 0.047 0.125 0.091 0.072 0.087 0.071 0.077 0.057 0.041 278 G 0.111 0.095 0.050 0.118 0.103 0.107 0.127 0.095 0.089 0.066 0.038 279 R 0.056 0.083 0.051 0.155 0.146 0.143 0.137 0.094 0.067 0.042 0.026 280 V 0.018 0.018 0.016 0.034 0.051 0.065 0.116 0.154 0.182 0.168 0.179 281 Y 0.030 0.024 0.023 0.076 0.102 0.096 0.153 0.154 0.148 0.114 0.080 282 P 0.079 0.089 0.056 0.138 0.118 0.108 0.135 0.088 0.087 0.067 0.035 283 V 0.099 0.110 0.048 0.146 0.119 0.114 0.137 0.083 0.069 0.047 0.027 284 Q 0.408 0.221 0.040 0.127 0.069 0.044 0.040 0.023 0.014 0.009 0.005 285 G 0.382 0.116 0.036 0.100 0.073 0.061 0.072 0.058 0.046 0.034 0.022 286 R 0.202 0.212 0.043 0.163 0.118 0.093 0.077 0.041 0.026 0.015 0.010 287 L 0.025 0.027 0.012 0.036 0.046 0.057 0.089 0.110 0.176 0.183 0.238 288 A 0.157 0.160 0.048 0.151 0.147 0.095 0.093 0.069 0.039 0.026 0.014 289 D 0.189 0.165 0.057 0.223 0.127 0.080 0.067 0.040 0.028 0.016 0.008 290 G 0.064 0.031 0.015 0.050 0.057 0.070 0.101 0.120 0.165 0.175 0.154 291 L 0.030 0.049 0.016 0.108 0.123 0.170 0.181 0.121 0.103 0.066 0.034 292 Y 0.009 0.016 0.012 0.030 0.038 0.056 0.084 0.101 0.202 0.228 0.223 293 V 0.014 0.009 0.008 0.030 0.065 0.085 0.150 0.159 0.187 0.147 0.145 294 P 0.247 0.270 0.077 0.172 0.090 0.044 0.045 0.022 0.017 0.010 0.005 295 L 0.051 0.056 0.019 0.091 0.107 0.118 0.174 0.119 0.112 0.081 0.072 296 E 0.589 0.242 0.024 0.071 0.032 0.014 0.012 0.007 0.004 0.003 0.002 297 D 0.361 0.222 0.036 0.144 0.074 0.053 0.048 0.028 0.017 0.011 0.006 298 K 0.113 0.100 0.040 0.132 0.130 0.144 0.131 0.084 0.059 0.043 0.023 299 T 0.086 0.113 0.070 0.193 0.142 0.123 0.123 0.073 0.042 0.025 0.009 300 F 0.004 0.010 0.020 0.043 0.055 0.161 0.208 0.137 0.172 0.135 0.056 301 L 0.004 0.010 0.019 0.037 0.046 0.083 0.136 0.130 0.202 0.204 0.129 302 L 0.003 0.007 0.017 0.036 0.053 0.111 0.163 0.146 0.193 0.181 0.090 303 L 0.007 0.010 0.021 0.039 0.062 0.096 0.162 0.162 0.178 0.164 0.100 304 T 0.007 0.008 0.013 0.026 0.043 0.064 0.126 0.156 0.206 0.204 0.147 305 V 0.028 0.037 0.038 0.091 0.112 0.120 0.185 0.141 0.119 0.081 0.048 306 H 0.079 0.105 0.066 0.132 0.112 0.111 0.147 0.091 0.075 0.051 0.031 307 R 0.231 0.180 0.060 0.155 0.107 0.076 0.083 0.049 0.030 0.018 0.012 308 D 0.442 0.193 0.046 0.117 0.063 0.038 0.039 0.026 0.017 0.011 0.007 309 F 0.094 0.082 0.034 0.093 0.089 0.118 0.153 0.109 0.098 0.079 0.051 310 R 0.106 0.150 0.072 0.180 0.146 0.124 0.094 0.056 0.036 0.022 0.014 311 G 0.127 0.090 0.052 0.093 0.087 0.104 0.140 0.106 0.093 0.068 0.041 312 T 0.055 0.059 0.034 0.101 0.101 0.104 0.153 0.120 0.125 0.090 0.059 313 P 0.048 0.032 0.021 0.060 0.066 0.082 0.128 0.134 0.166 0.161 0.102 314 R 0.047 0.104 0.083 0.201 0.158 0.131 0.109 0.071 0.052 0.029 0.015 315 P 0.019 0.021 0.023 0.064 0.101 0.086 0.157 0.193 0.142 0.102 0.092 316 L 0.012 0.010 0.013 0.028 0.038 0.046 0.091 0.141 0.206 0.217 0.198 317 K 0.048 0.070 0.066 0.199 0.190 0.129 0.136 0.071 0.050 0.025 0.016 318 L 0.012 0.008 0.018 0.027 0.040 0.038 0.085 0.128 0.194 0.208 0.243 319 V 0.019 0.038 0.045 0.117 0.139 0.117 0.160 0.118 0.111 0.082 0.054 320 H 0.070 0.059 0.076 0.126 0.123 0.111 0.158 0.100 0.087 0.057 0.033 321 E 0.116 0.115 0.091 0.178 0.130 0.108 0.111 0.063 0.043 0.027 0.017 322 A 0.077 0.125 0.047 0.113 0.098 0.108 0.150 0.098 0.085 0.063 0.034 323 G 0.386 0.192 0.045 0.111 0.075 0.051 0.062 0.037 0.022 0.013 0.007 324 D 0.505 0.235 0.057 0.099 0.043 0.024 0.018 0.009 0.005 0.003 0.002 325 T 0.258 0.100 0.036 0.093 0.094 0.090 0.109 0.081 0.063 0.045 0.031 326 P 0.157 0.421 0.047 0.147 0.088 0.049 0.042 0.025 0.013 0.008 0.004 327 L 0.014 0.017 0.012 0.040 0.073 0.129 0.199 0.165 0.165 0.108 0.078 328 E 0.495 0.120 0.129 0.140 0.063 0.024 0.017 0.008 0.003 0.001 0.001 329 A 0.022 0.039 0.082 0.226 0.180 0.162 0.172 0.064 0.031 0.015 0.006 330 L 0.001 0.001 0.004 0.004 0.008 0.018 0.047 0.072 0.230 0.307 0.308 331 A 0.002 0.006 0.022 0.057 0.114 0.166 0.269 0.145 0.112 0.079 0.028 332 H 0.005 0.024 0.597 0.178 0.079 0.056 0.030 0.015 0.008 0.006 0.002 333 Q 0.003 0.008 0.038 0.054 0.089 0.220 0.325 0.136 0.072 0.040 0.013 334 I 0.002 0.003 0.008 0.009 0.013 0.023 0.074 0.125 0.246 0.278 0.219 335 F 0.006 0.008 0.030 0.044 0.072 0.136 0.217 0.156 0.149 0.120 0.063 336 H 0.022 0.056 0.292 0.190 0.132 0.109 0.108 0.042 0.028 0.014 0.007 337 L 0.002 0.003 0.016 0.016 0.031 0.040 0.124 0.180 0.201 0.187 0.201 338 T 0.001 0.003 0.005 0.007 0.012 0.024 0.053 0.085 0.212 0.284 0.314 339 R 0.015 0.026 0.055 0.110 0.149 0.136 0.187 0.123 0.099 0.061 0.039 340 L 0.009 0.010 0.036 0.038 0.057 0.074 0.148 0.180 0.178 0.158 0.111 341 Y 0.010 0.016 0.023 0.052 0.068 0.083 0.166 0.181 0.171 0.138 0.091 342 P 0.056 0.036 0.034 0.064 0.059 0.079 0.150 0.136 0.166 0.131 0.089 343 A 0.056 0.056 0.053 0.122 0.138 0.126 0.162 0.115 0.083 0.050 0.039 344 S 0.052 0.046 0.042 0.073 0.077 0.068 0.126 0.145 0.148 0.128 0.095 345 G 0.127 0.092 0.047 0.115 0.101 0.090 0.130 0.092 0.089 0.065 0.051 346 F 0.157 0.104 0.062 0.135 0.111 0.098 0.112 0.076 0.067 0.045 0.033 347 A 0.135 0.118 0.062 0.133 0.104 0.104 0.122 0.078 0.068 0.047 0.029 348 F 0.080 0.081 0.042 0.117 0.107 0.106 0.144 0.104 0.096 0.069 0.054 349 P 0.150 0.092 0.056 0.107 0.086 0.092 0.130 0.088 0.092 0.067 0.042 350 R 0.074 0.109 0.075 0.157 0.120 0.111 0.126 0.074 0.076 0.049 0.028 351 L 0.015 0.020 0.020 0.042 0.049 0.067 0.133 0.153 0.200 0.172 0.129 352 P 0.057 0.065 0.047 0.117 0.108 0.106 0.136 0.113 0.108 0.082 0.061 353 A 0.009 0.011 0.015 0.028 0.043 0.048 0.106 0.172 0.208 0.195 0.164 354 P 0.009 0.016 0.023 0.053 0.091 0.058 0.128 0.204 0.172 0.149 0.098 355 L 0.004 0.004 0.011 0.021 0.032 0.042 0.089 0.135 0.219 0.238 0.203 356 H 0.024 0.029 0.060 0.119 0.154 0.130 0.189 0.127 0.087 0.049 0.032 357 L 0.004 0.010 0.026 0.046 0.083 0.063 0.157 0.200 0.181 0.139 0.090 358 A 0.001 0.002 0.006 0.009 0.018 0.029 0.080 0.112 0.227 0.262 0.255 359 D 0.038 0.041 0.141 0.171 0.159 0.141 0.153 0.060 0.051 0.031 0.015 360 R 0.015 0.027 0.106 0.132 0.152 0.167 0.203 0.098 0.055 0.030 0.016 361 L 0.002 0.006 0.016 0.019 0.031 0.038 0.094 0.122 0.211 0.230 0.231 362 V 0.001 0.002 0.006 0.010 0.023 0.045 0.130 0.121 0.217 0.232 0.215 363 K 0.030 0.076 0.482 0.226 0.109 0.039 0.021 0.008 0.005 0.002 0.001 364 E 0.016 0.031 0.085 0.138 0.161 0.170 0.218 0.101 0.044 0.024 0.012 365 V 0.007 0.008 0.010 0.015 0.020 0.035 0.084 0.113 0.212 0.246 0.248 366 G 0.103 0.091 0.105 0.182 0.164 0.107 0.124 0.065 0.033 0.017 0.009 367 R 0.048 0.080 0.255 0.203 0.131 0.106 0.080 0.042 0.026 0.018 0.009 368 L 0.034 0.035 0.035 0.056 0.077 0.126 0.201 0.140 0.134 0.096 0.067 369 G 0.199 0.131 0.050 0.111 0.094 0.081 0.128 0.087 0.062 0.037 0.019 370 I 0.099 0.103 0.093 0.154 0.122 0.112 0.131 0.075 0.055 0.037 0.019 371 R 0.224 0.154 0.110 0.165 0.116 0.081 0.075 0.036 0.020 0.012 0.006 372 H 0.282 0.246 0.080 0.162 0.085 0.050 0.048 0.026 0.012 0.006 0.003 373 L 0.075 0.091 0.039 0.088 0.092 0.113 0.155 0.122 0.102 0.080 0.044 374 K 0.209 0.156 0.085 0.170 0.127 0.087 0.085 0.044 0.021 0.011 0.005 375 E 0.278 0.218 0.181 0.184 0.069 0.032 0.021 0.009 0.004 0.002 0.001 376 V 0.048 0.033 0.034 0.058 0.075 0.130 0.197 0.135 0.131 0.100 0.059 377 D 0.114 0.203 0.093 0.177 0.120 0.082 0.090 0.057 0.034 0.022 0.009 378 R 0.050 0.063 0.106 0.164 0.144 0.152 0.146 0.084 0.050 0.030 0.013 379 E 0.172 0.142 0.199 0.194 0.106 0.064 0.059 0.035 0.016 0.009 0.004 380 K 0.032 0.045 0.061 0.135 0.122 0.143 0.199 0.126 0.077 0.043 0.017 381 L 0.017 0.019 0.035 0.049 0.059 0.100 0.153 0.153 0.167 0.150 0.096 382 F 0.020 0.028 0.055 0.081 0.096 0.136 0.186 0.137 0.126 0.086 0.048 383 F 0.029 0.035 0.070 0.089 0.109 0.103 0.173 0.149 0.115 0.079 0.050 384 V 0.032 0.023 0.034 0.056 0.077 0.082 0.163 0.161 0.161 0.122 0.090