This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA E A 3 3 NATAA R A 4 4 NATAA A A 5 5 NATAA S A 6 6 NATAA L A 7 7 NATAA N A 8 8 NATAA R A 9 9 NATAA I A 10 10 NATAA G A 11 11 NATAA K A 12 12 NATAA D A 13 13 NATAA V A 14 14 NATAA Y A 15 15 NATAA Y A 16 16 NATAA M A 17 17 NATAA Q A 18 18 NATAA I A 19 19 NATAA K A 20 20 NATAA G A 21 21 NATAA E A 22 22 NATAA G A 23 23 NATAA T A 24 24 NATAA I A 25 25 NATAA E A 26 26 NATAA K A 27 27 NATAA V A 28 28 NATAA D A 29 29 NATAA G A 30 30 NATAA R A 31 31 NATAA N A 32 32 NATAA L A 33 33 NATAA R A 34 34 NATAA N A 35 35 NATAA Y A 36 36 NATAA T A 37 37 NATAA L A 38 38 NATRO P A 39 39 NATAA A A 40 40 NATAA Y A 41 41 NATAA D A 42 42 NATAA E A 43 43 NATAA D A 44 44 NATAA G A 45 45 NATAA V A 46 46 NATAA K A 47 47 NATAA K A 48 48 NATAA Q A 49 49 NATAA I A 50 50 NATAA T A 51 51 NATAA F A 52 52 NATAA R A 53 53 NATAA S A 54 54 NATAA T A 55 55 NATAA K A 56 56 NATAA K A 57 57 NATAA E A 58 58 NATAA N A 59 59 NATAA D A 60 60 NATAA H A 61 61 NATAA K A 62 62 NATAA L A 63 63 NATAA N A 64 64 NATAA K A 65 65 NATAA Y A 66 66 NATAA A A 67 67 NATAA F A 68 68 NATAA L A 69 69 NATAA R A 70 70 NATAA L A 71 71 NATAA Y A 72 72 NATAA V A 73 73 NATAA D A 74 74 NATAA Q A 75 75 NATAA D A 76 76 NATAA D A 77 77 NATAA N A 78 78 NATAA S A 79 79 NATAA K A 80 80 NATAA N A 81 81 NATAA E A 82 82 NATAA I A 83 83 NATAA S A 84 84 NATAA S A 85 85 NATAA I A 86 86 NATAA E A 87 87 NATAA V A 88 88 NATAA K A 89 89 NATAA S A 90 90 NATAA Y A 91 91 NATAA E A 92 92 NATAA E A 93 93 NATAA I A 94 94 NATAA Q A 95 95 NATAA K A 96 96 NATAA A A 97 97 NATAA D A 98 98 NATAA L A 99 99 NATRO P A 100 100 NATAA E A 101 101 NATAA K A 102 102 NATAA V A 103 103 NATAA K A 104 104 NATAA D A 105 105 NATAA K A 106 106 NATAA F A 107 107 NATAA T A 108 108 NATAA I A 109 109 NATAA K