# TARGET T0466 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0466.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 11.5051 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.034 0.471 0.019 0.041 0.106 0.037 0.072 0.219 2 M 0.072 0.087 0.075 0.084 0.105 0.068 0.257 0.251 3 R 0.112 0.025 0.079 0.120 0.119 0.071 0.174 0.298 4 L 0.222 0.011 0.023 0.030 0.042 0.080 0.068 0.524 5 A 0.096 0.006 0.036 0.022 0.040 0.130 0.051 0.619 6 N 0.010 0.004 0.039 0.022 0.090 0.132 0.023 0.681 7 G 0.007 0.004 0.082 0.088 0.147 0.092 0.024 0.555 8 I 0.005 0.005 0.184 0.231 0.127 0.078 0.043 0.326 9 V 0.015 0.007 0.224 0.106 0.159 0.081 0.066 0.342 10 L 0.032 0.006 0.167 0.070 0.131 0.082 0.076 0.436 11 D 0.262 0.020 0.063 0.026 0.027 0.062 0.249 0.290 12 K 0.065 0.022 0.062 0.017 0.023 0.115 0.063 0.632 13 D 0.048 0.015 0.051 0.026 0.038 0.134 0.055 0.634 14 T 0.032 0.023 0.044 0.050 0.059 0.154 0.046 0.593 15 T 0.061 0.103 0.026 0.054 0.088 0.117 0.112 0.439 16 F 0.040 0.153 0.021 0.050 0.075 0.115 0.060 0.486 17 G 0.029 0.279 0.037 0.080 0.172 0.067 0.077 0.257 18 E 0.026 0.190 0.039 0.079 0.142 0.055 0.216 0.252 19 L 0.024 0.296 0.061 0.117 0.195 0.041 0.108 0.157 20 K 0.037 0.426 0.037 0.103 0.131 0.033 0.072 0.161 21 F 0.058 0.222 0.069 0.108 0.177 0.039 0.115 0.211 22 S 0.069 0.122 0.061 0.124 0.141 0.063 0.119 0.302 23 A 0.148 0.050 0.044 0.075 0.101 0.078 0.082 0.422 24 L 0.127 0.047 0.020 0.033 0.042 0.095 0.089 0.547 25 R 0.049 0.023 0.008 0.009 0.021 0.110 0.054 0.726 26 R 0.024 0.056 0.027 0.052 0.077 0.104 0.042 0.618 27 E 0.022 0.038 0.039 0.063 0.166 0.091 0.070 0.512 28 V 0.021 0.018 0.077 0.200 0.133 0.073 0.094 0.384 29 R 0.031 0.022 0.129 0.105 0.241 0.060 0.074 0.338 30 I 0.042 0.009 0.099 0.151 0.141 0.082 0.063 0.413 31 Q 0.026 0.008 0.113 0.068 0.129 0.077 0.040 0.538 32 N 0.294 0.017 0.024 0.026 0.031 0.066 0.134 0.408 33 E 0.082 0.014 0.023 0.024 0.032 0.106 0.050 0.669 34 D 0.032 0.011 0.015 0.022 0.032 0.108 0.040 0.740 35 G 0.019 0.017 0.024 0.055 0.078 0.115 0.050 0.642 36 S 0.039 0.064 0.021 0.070 0.077 0.114 0.072 0.543 37 V 0.059 0.141 0.016 0.071 0.086 0.083 0.086 0.459 38 S 0.071 0.216 0.014 0.032 0.074 0.068 0.085 0.441 39 D 0.031 0.181 0.033 0.109 0.181 0.065 0.052 0.349 40 E 0.025 0.069 0.050 0.129 0.231 0.058 0.100 0.337 41 I 0.057 0.030 0.047 0.150 0.110 0.068 0.172 0.367 42 K 0.041 0.026 0.067 0.151 0.284 0.056 0.078 0.296 43 E 0.040 0.017 0.032 0.065 0.112 0.080 0.054 0.601 44 R 0.015 0.019 0.069 0.268 0.270 0.056 0.027 0.276 45 T 0.020 0.046 0.036 0.084 0.168 0.075 0.040 0.532 46 Y 0.018 0.021 0.055 0.220 0.287 0.065 0.066 0.268 47 D 0.024 0.042 0.059 0.154 0.217 0.063 0.156 0.286 48 L 0.044 0.032 0.038 0.195 0.244 0.067 0.070 0.311 49 K 0.040 0.016 0.050 0.128 0.175 0.060 0.083 0.449 50 S 0.094 0.008 0.021 0.123 0.178 0.061 0.094 0.422 51 K 0.075 0.002 0.014 0.043 0.074 0.078 0.047 0.667 52 G 0.081 0.001 0.009 0.039 0.034 0.091 0.034 0.711 53 Q 0.044 0.001 0.016 0.019 0.058 0.111 0.031 0.720 54 G 0.023 0.001 0.013 0.012 0.024 0.120 0.014 0.795 55 R 0.001 0.001 0.099 0.185 0.309 0.063 0.019 0.322 56 M 0.001 0.001 0.140 0.086 0.175 0.068 0.059 0.469 57 I 0.001 0.001 0.157 0.384 0.284 0.030 0.027 0.116 58 Q 0.001 0.001 0.217 0.283 0.374 0.013 0.030 0.081 59 V 0.001 0.001 0.170 0.409 0.316 0.015 0.018 0.071 60 S 0.002 0.001 0.272 0.314 0.210 0.032 0.029 0.141 61 I 0.013 0.001 0.224 0.118 0.243 0.065 0.031 0.305 62 P 0.426 0.006 0.034 0.025 0.027 0.061 0.156 0.265 63 A 0.020 0.003 0.036 0.051 0.075 0.085 0.015 0.715 64 S 0.015 0.006 0.011 0.019 0.036 0.071 0.029 0.814 65 V 0.017 0.011 0.015 0.065 0.041 0.141 0.028 0.681 66 P 0.178 0.067 0.013 0.031 0.036 0.080 0.150 0.444 67 L 0.223 0.035 0.007 0.029 0.036 0.075 0.057 0.537 68 K 0.048 0.027 0.023 0.047 0.068 0.085 0.026 0.677 69 E 0.023 0.012 0.020 0.029 0.062 0.093 0.051 0.711 70 F 0.031 0.019 0.024 0.046 0.046 0.106 0.053 0.677 71 D 0.181 0.049 0.009 0.027 0.023 0.072 0.124 0.515 72 Y 0.075 0.058 0.012 0.022 0.031 0.100 0.065 0.636 73 N 0.082 0.032 0.011 0.010 0.027 0.089 0.070 0.679 74 A 0.021 0.045 0.046 0.105 0.086 0.102 0.043 0.553 75 R 0.006 0.061 0.091 0.055 0.217 0.072 0.048 0.451 76 V 0.013 0.017 0.107 0.143 0.100 0.086 0.103 0.431 77 E 0.009 0.035 0.385 0.153 0.140 0.042 0.084 0.153 78 L 0.007 0.035 0.353 0.073 0.167 0.044 0.098 0.223 79 I 0.010 0.059 0.220 0.105 0.075 0.056 0.076 0.399 80 N 0.088 0.218 0.218 0.029 0.046 0.054 0.151 0.195 81 P 0.014 0.044 0.135 0.016 0.028 0.053 0.530 0.180 82 I 0.009 0.403 0.097 0.025 0.049 0.067 0.060 0.291 83 A 0.026 0.603 0.053 0.019 0.030 0.039 0.058 0.172 84 D 0.013 0.081 0.056 0.023 0.021 0.019 0.710 0.077 85 T 0.037 0.298 0.027 0.020 0.039 0.040 0.429 0.111 86 V 0.034 0.063 0.098 0.022 0.018 0.036 0.651 0.076 87 A 0.043 0.160 0.123 0.045 0.077 0.088 0.177 0.287 88 T 0.124 0.134 0.032 0.025 0.044 0.064 0.096 0.481 89 A 0.037 0.023 0.151 0.087 0.090 0.091 0.097 0.424 90 T 0.160 0.019 0.024 0.029 0.048 0.124 0.095 0.502 91 Y 0.227 0.005 0.013 0.012 0.010 0.095 0.058 0.579 92 Q 0.019 0.006 0.033 0.015 0.039 0.115 0.031 0.743 93 G 0.033 0.003 0.022 0.011 0.027 0.116 0.035 0.753 94 A 0.008 0.003 0.137 0.213 0.146 0.093 0.025 0.375 95 D 0.007 0.006 0.126 0.048 0.090 0.084 0.067 0.572 96 V 0.011 0.007 0.140 0.143 0.141 0.103 0.073 0.382 97 D 0.007 0.012 0.303 0.072 0.238 0.048 0.060 0.260 98 W 0.003 0.007 0.300 0.216 0.233 0.035 0.049 0.157 99 Y 0.004 0.005 0.527 0.124 0.131 0.033 0.043 0.134 100 I 0.013 0.007 0.422 0.116 0.146 0.055 0.027 0.214 101 K 0.075 0.025 0.264 0.076 0.137 0.067 0.110 0.246 102 A 0.061 0.033 0.081 0.053 0.087 0.124 0.076 0.484 103 D 0.054 0.041 0.078 0.070 0.095 0.148 0.097 0.416 104 D 0.026 0.026 0.096 0.090 0.202 0.110 0.137 0.314 105 I 0.023 0.025 0.094 0.119 0.214 0.107 0.091 0.326 106 V 0.025 0.013 0.097 0.187 0.229 0.082 0.101 0.267 107 L 0.034 0.009 0.078 0.102 0.155 0.090 0.102 0.431 108 T 0.165 0.014 0.041 0.057 0.080 0.097 0.124 0.423 109 K 0.087 0.013 0.027 0.024 0.033 0.111 0.062 0.644 110 D 0.106 0.031 0.016 0.017 0.027 0.092 0.054 0.657 111 S 0.121 0.044 0.012 0.015 0.019 0.090 0.046 0.653 112 S 0.088 0.040 0.018 0.030 0.037 0.111 0.042 0.634 113 S 0.138 0.037 0.013 0.026 0.043 0.091 0.062 0.589 114 F 0.136 0.031 0.012 0.024 0.027 0.101 0.073 0.596 115 K 0.017 0.024 0.012 0.023 0.033 0.133 0.028 0.728 116 A 0.024 0.061 0.013 0.013 0.024 0.089 0.027 0.749 117 Q 0.418 0.138 0.012 0.013 0.011 0.046 0.112 0.250 118 P 0.260 0.064 0.014 0.009 0.011 0.069 0.058 0.515 119 Q 0.124 0.022 0.009 0.007 0.010 0.073 0.028 0.727 120 A 0.124 0.017 0.009 0.007 0.010 0.095 0.046 0.692 121 K 0.029 0.010 0.008 0.011 0.014 0.123 0.030 0.775 122 K 0.031 0.015 0.008 0.015 0.020 0.090 0.032 0.789 123 E 0.121 0.036 0.014 0.021 0.024 0.100 0.070 0.614 124 P 0.092 0.018 0.021 0.015 0.022 0.099 0.045 0.689 125 T 0.176 0.012 0.015 0.013 0.019 0.080 0.049 0.636 126 Q 0.116 0.007 0.012 0.008 0.014 0.096 0.035 0.712 127 D 0.046 0.005 0.014 0.009 0.015 0.117 0.040 0.754 128 K 0.022 0.005 0.021 0.015 0.027 0.122 0.037 0.751