# TARGET T0466 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0466.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 15.9667 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.046 0.445 0.028 0.039 0.045 0.051 0.120 0.225 2 M 0.028 0.146 0.054 0.106 0.113 0.054 0.335 0.163 3 R 0.073 0.050 0.083 0.045 0.051 0.100 0.236 0.362 4 L 0.604 0.016 0.028 0.013 0.014 0.049 0.083 0.192 5 A 0.070 0.004 0.011 0.008 0.011 0.090 0.043 0.763 6 N 0.005 0.001 0.035 0.005 0.026 0.124 0.017 0.787 7 G 0.004 0.001 0.168 0.040 0.112 0.110 0.050 0.515 8 I 0.008 0.003 0.210 0.179 0.092 0.090 0.038 0.379 9 V 0.009 0.004 0.329 0.078 0.102 0.090 0.039 0.349 10 L 0.017 0.002 0.094 0.045 0.045 0.096 0.082 0.619 11 D 0.170 0.017 0.043 0.024 0.017 0.068 0.481 0.180 12 K 0.130 0.059 0.024 0.011 0.021 0.114 0.117 0.524 13 D 0.057 0.026 0.026 0.017 0.059 0.126 0.040 0.648 14 T 0.044 0.028 0.039 0.054 0.068 0.118 0.073 0.576 15 T 0.086 0.092 0.025 0.042 0.099 0.170 0.051 0.436 16 F 0.064 0.093 0.044 0.044 0.099 0.101 0.041 0.514 17 G 0.032 0.138 0.052 0.130 0.203 0.085 0.040 0.320 18 E 0.018 0.092 0.087 0.065 0.181 0.065 0.175 0.317 19 L 0.015 0.176 0.062 0.241 0.212 0.034 0.129 0.132 20 K 0.046 0.237 0.084 0.160 0.201 0.038 0.085 0.150 21 F 0.037 0.251 0.064 0.112 0.137 0.051 0.077 0.271 22 S 0.030 0.227 0.071 0.137 0.194 0.047 0.071 0.222 23 A 0.079 0.249 0.048 0.081 0.102 0.065 0.094 0.282 24 L 0.102 0.265 0.023 0.052 0.068 0.065 0.092 0.333 25 R 0.106 0.294 0.015 0.036 0.050 0.059 0.080 0.361 26 R 0.040 0.252 0.012 0.031 0.066 0.062 0.069 0.468 27 E 0.058 0.127 0.027 0.074 0.138 0.089 0.089 0.397 28 V 0.023 0.038 0.038 0.161 0.194 0.079 0.120 0.348 29 R 0.048 0.027 0.033 0.130 0.151 0.107 0.075 0.428 30 I 0.039 0.013 0.038 0.119 0.144 0.108 0.088 0.450 31 Q 0.025 0.005 0.016 0.031 0.054 0.109 0.034 0.725 32 N 0.552 0.008 0.008 0.019 0.023 0.057 0.064 0.270 33 E 0.118 0.007 0.005 0.018 0.020 0.110 0.024 0.697 34 D 0.011 0.003 0.008 0.009 0.043 0.108 0.011 0.806 35 G 0.016 0.008 0.014 0.036 0.082 0.142 0.034 0.668 36 S 0.020 0.026 0.022 0.155 0.102 0.155 0.029 0.491 37 V 0.049 0.185 0.017 0.036 0.042 0.066 0.029 0.578 38 S 0.108 0.681 0.008 0.019 0.022 0.023 0.025 0.114 39 D 0.043 0.589 0.029 0.049 0.054 0.026 0.042 0.168 40 E 0.075 0.357 0.020 0.063 0.111 0.053 0.115 0.206 41 I 0.117 0.093 0.033 0.070 0.087 0.050 0.406 0.144 42 K 0.070 0.123 0.010 0.089 0.157 0.068 0.158 0.325 43 E 0.022 0.047 0.008 0.027 0.089 0.055 0.034 0.718 44 R 0.011 0.063 0.022 0.181 0.294 0.117 0.025 0.288 45 T 0.023 0.080 0.029 0.092 0.238 0.076 0.033 0.429 46 Y 0.027 0.061 0.034 0.257 0.204 0.060 0.079 0.276 47 D 0.032 0.098 0.057 0.122 0.146 0.071 0.242 0.232 48 L 0.080 0.093 0.049 0.167 0.126 0.062 0.154 0.270 49 K 0.105 0.041 0.042 0.119 0.126 0.070 0.090 0.407 50 S 0.133 0.014 0.028 0.048 0.063 0.064 0.119 0.531 51 K 0.145 0.005 0.015 0.032 0.068 0.112 0.056 0.568 52 G 0.090 0.001 0.007 0.015 0.023 0.065 0.034 0.765 53 Q 0.040 0.001 0.012 0.022 0.057 0.148 0.032 0.687 54 G 0.008 0.001 0.022 0.021 0.061 0.086 0.037 0.765 55 R 0.004 0.001 0.129 0.170 0.303 0.088 0.037 0.270 56 M 0.001 0.001 0.148 0.111 0.210 0.036 0.038 0.456 57 I 0.001 0.001 0.288 0.346 0.268 0.017 0.016 0.065 58 Q 0.001 0.001 0.464 0.173 0.226 0.010 0.028 0.098 59 V 0.001 0.001 0.400 0.307 0.197 0.012 0.025 0.057 60 S 0.002 0.001 0.610 0.093 0.112 0.017 0.039 0.126 61 I 0.098 0.004 0.204 0.211 0.159 0.052 0.061 0.211 62 P 0.101 0.004 0.109 0.045 0.055 0.076 0.076 0.533 63 A 0.019 0.007 0.053 0.033 0.080 0.175 0.025 0.608 64 S 0.025 0.006 0.019 0.011 0.030 0.084 0.025 0.800 65 V 0.043 0.010 0.045 0.100 0.042 0.131 0.055 0.574 66 P 0.118 0.034 0.030 0.033 0.054 0.095 0.063 0.574 67 L 0.271 0.020 0.021 0.023 0.033 0.067 0.053 0.513 68 K 0.067 0.021 0.034 0.056 0.064 0.104 0.043 0.612 69 E 0.010 0.005 0.014 0.011 0.027 0.063 0.029 0.842 70 F 0.045 0.014 0.030 0.058 0.068 0.140 0.062 0.583 71 D 0.151 0.027 0.047 0.043 0.042 0.092 0.142 0.457 72 Y 0.162 0.032 0.016 0.023 0.041 0.076 0.037 0.613 73 N 0.068 0.019 0.026 0.022 0.052 0.078 0.049 0.687 74 A 0.012 0.011 0.041 0.092 0.133 0.117 0.036 0.560 75 R 0.011 0.011 0.064 0.085 0.238 0.086 0.062 0.443 76 V 0.021 0.022 0.051 0.160 0.163 0.055 0.079 0.449 77 E 0.012 0.021 0.149 0.282 0.282 0.046 0.055 0.152 78 L 0.008 0.035 0.099 0.108 0.165 0.057 0.063 0.465 79 I 0.041 0.151 0.126 0.169 0.147 0.050 0.100 0.216 80 N 0.117 0.214 0.087 0.076 0.088 0.048 0.122 0.247 81 P 0.032 0.167 0.053 0.056 0.072 0.080 0.219 0.322 82 I 0.033 0.329 0.084 0.040 0.066 0.060 0.155 0.231 83 A 0.067 0.352 0.034 0.040 0.063 0.074 0.113 0.257 84 D 0.024 0.164 0.064 0.068 0.095 0.060 0.275 0.251 85 T 0.039 0.277 0.049 0.051 0.128 0.066 0.188 0.201 86 V 0.044 0.086 0.089 0.098 0.139 0.076 0.257 0.210 87 A 0.033 0.059 0.101 0.162 0.187 0.074 0.133 0.251 88 T 0.065 0.049 0.054 0.071 0.144 0.098 0.114 0.406 89 A 0.022 0.013 0.076 0.110 0.137 0.122 0.087 0.434 90 T 0.123 0.011 0.041 0.041 0.098 0.115 0.083 0.489 91 Y 0.247 0.006 0.020 0.029 0.027 0.084 0.080 0.508 92 Q 0.031 0.005 0.031 0.030 0.083 0.148 0.027 0.645 93 G 0.005 0.003 0.027 0.015 0.060 0.083 0.027 0.780 94 A 0.007 0.005 0.131 0.179 0.165 0.142 0.053 0.319 95 D 0.022 0.017 0.151 0.091 0.116 0.073 0.091 0.440 96 V 0.039 0.034 0.088 0.175 0.137 0.082 0.093 0.351 97 D 0.013 0.026 0.214 0.099 0.205 0.057 0.091 0.296 98 W 0.014 0.045 0.188 0.184 0.284 0.035 0.081 0.168 99 Y 0.008 0.028 0.241 0.189 0.241 0.035 0.067 0.191 100 I 0.006 0.017 0.334 0.244 0.184 0.039 0.058 0.118 101 K 0.123 0.097 0.153 0.105 0.140 0.071 0.090 0.222 102 A 0.288 0.086 0.070 0.040 0.051 0.072 0.082 0.311 103 D 0.068 0.052 0.029 0.026 0.061 0.096 0.039 0.628 104 D 0.035 0.017 0.075 0.039 0.100 0.086 0.153 0.495 105 I 0.020 0.017 0.053 0.151 0.147 0.104 0.086 0.422 106 V 0.042 0.011 0.062 0.116 0.145 0.087 0.038 0.500 107 L 0.031 0.005 0.025 0.059 0.077 0.095 0.044 0.663 108 T 0.063 0.010 0.024 0.039 0.051 0.117 0.092 0.605 109 K 0.080 0.013 0.011 0.016 0.023 0.133 0.056 0.668 110 D 0.065 0.028 0.011 0.012 0.017 0.125 0.040 0.703 111 S 0.161 0.079 0.010 0.012 0.017 0.095 0.042 0.584 112 S 0.108 0.105 0.016 0.018 0.025 0.102 0.054 0.572 113 S 0.090 0.096 0.020 0.024 0.038 0.093 0.053 0.585 114 F 0.171 0.098 0.021 0.028 0.033 0.104 0.058 0.488 115 K 0.045 0.068 0.024 0.028 0.039 0.112 0.056 0.628 116 A 0.058 0.086 0.021 0.017 0.028 0.096 0.043 0.650 117 Q 0.168 0.113 0.032 0.039 0.037 0.098 0.081 0.431 118 P 0.138 0.062 0.021 0.021 0.026 0.088 0.044 0.600 119 Q 0.266 0.048 0.014 0.018 0.029 0.070 0.049 0.507 120 A 0.084 0.016 0.006 0.012 0.018 0.100 0.027 0.738 121 K 0.018 0.007 0.008 0.014 0.026 0.104 0.050 0.773 122 K 0.037 0.012 0.009 0.019 0.028 0.124 0.048 0.721 123 E 0.095 0.018 0.016 0.049 0.054 0.120 0.060 0.587 124 P 0.051 0.008 0.012 0.021 0.033 0.102 0.025 0.749 125 T 0.104 0.010 0.014 0.028 0.046 0.106 0.051 0.641 126 Q 0.067 0.007 0.009 0.023 0.033 0.109 0.034 0.717 127 D 0.049 0.012 0.010 0.024 0.044 0.098 0.042 0.722 128 K 0.035 0.011 0.015 0.040 0.070 0.116 0.035 0.676