# TARGET T0465 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0465.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 25.3763 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.046 0.017 0.019 0.016 0.027 0.060 0.006 0.808 2 S 0.026 0.022 0.013 0.025 0.051 0.293 0.007 0.564 3 E 0.042 0.023 0.013 0.009 0.024 0.070 0.007 0.812 4 N 0.020 0.046 0.005 0.008 0.012 0.494 0.006 0.409 5 Q 0.269 0.056 0.009 0.013 0.017 0.319 0.035 0.282 6 N 0.107 0.485 0.007 0.009 0.015 0.095 0.010 0.270 7 E 0.130 0.434 0.016 0.026 0.044 0.072 0.018 0.261 8 K 0.135 0.359 0.018 0.028 0.038 0.064 0.028 0.331 9 V 0.091 0.303 0.042 0.061 0.123 0.032 0.022 0.326 10 Y 0.045 0.176 0.092 0.168 0.186 0.041 0.013 0.280 11 D 0.031 0.134 0.048 0.040 0.045 0.144 0.016 0.541 12 L 0.076 0.192 0.134 0.053 0.172 0.037 0.015 0.322 13 S 0.036 0.205 0.081 0.076 0.092 0.222 0.017 0.272 14 F 0.267 0.092 0.035 0.046 0.043 0.155 0.074 0.287 15 F 0.277 0.285 0.050 0.035 0.058 0.046 0.028 0.221 16 M 0.141 0.190 0.037 0.068 0.090 0.083 0.014 0.377 17 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 18 G 0.021 0.013 0.011 0.012 0.032 0.100 0.008 0.803 19 Q 0.539 0.022 0.009 0.011 0.015 0.056 0.018 0.329 20 T 0.213 0.077 0.036 0.026 0.035 0.093 0.011 0.509 21 I 0.089 0.082 0.068 0.075 0.093 0.152 0.007 0.435 22 D 0.049 0.110 0.023 0.058 0.082 0.169 0.008 0.499 23 A 0.043 0.153 0.028 0.031 0.080 0.047 0.010 0.609 24 E 0.057 0.123 0.020 0.026 0.037 0.405 0.025 0.307 25 E 0.459 0.081 0.016 0.025 0.021 0.061 0.084 0.254 26 V 0.220 0.294 0.034 0.059 0.068 0.068 0.019 0.237 27 E 0.029 0.042 0.020 0.024 0.033 0.056 0.012 0.784 28 V 0.077 0.025 0.074 0.121 0.233 0.078 0.012 0.380 29 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 30 I 0.012 0.003 0.040 0.092 0.184 0.097 0.003 0.567 31 S 0.071 0.014 0.056 0.072 0.099 0.092 0.005 0.590 32 K 0.029 0.029 0.020 0.046 0.120 0.038 0.004 0.714 33 R 0.040 0.038 0.033 0.084 0.111 0.304 0.009 0.379 34 F 0.249 0.053 0.026 0.115 0.119 0.080 0.030 0.328 35 V 0.070 0.134 0.047 0.205 0.286 0.033 0.008 0.217 36 D 0.015 0.129 0.027 0.248 0.220 0.112 0.006 0.244 37 K 0.026 0.096 0.024 0.087 0.170 0.043 0.013 0.540 38 E 0.036 0.041 0.015 0.020 0.038 0.453 0.053 0.344 39 G 0.673 0.003 0.007 0.005 0.006 0.020 0.208 0.076 40 N 0.378 0.014 0.092 0.039 0.025 0.279 0.024 0.149 41 V 0.002 0.001 0.010 0.007 0.007 0.037 0.001 0.937 42 V 0.008 0.001 0.078 0.187 0.537 0.063 0.001 0.126 43 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 44 F 0.006 0.001 0.127 0.157 0.373 0.060 0.001 0.275 45 I 0.037 0.001 0.393 0.098 0.184 0.048 0.002 0.236 46 F 0.016 0.004 0.252 0.132 0.145 0.025 0.003 0.424 47 K 0.008 0.002 0.440 0.145 0.239 0.046 0.002 0.119 48 A 0.011 0.004 0.066 0.035 0.042 0.051 0.003 0.788 49 I 0.043 0.008 0.251 0.067 0.206 0.082 0.008 0.336 50 T 0.019 0.018 0.034 0.027 0.047 0.474 0.005 0.376 51 T 0.017 0.021 0.017 0.005 0.025 0.056 0.003 0.855 52 D 0.006 0.022 0.003 0.001 0.003 0.319 0.002 0.644 53 R 0.043 0.024 0.001 0.001 0.001 0.834 0.006 0.089 54 I 0.026 0.875 0.002 0.001 0.002 0.035 0.001 0.058 55 D 0.002 0.966 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.028 56 E 0.004 0.956 0.001 0.001 0.001 0.009 0.002 0.028 57 L 0.010 0.973 0.001 0.001 0.001 0.005 0.004 0.007 58 E 0.010 0.981 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 59 K 0.010 0.967 0.002 0.001 0.001 0.001 0.005 0.013 60 E 0.040 0.884 0.008 0.002 0.002 0.003 0.029 0.031 61 N 0.222 0.566 0.020 0.009 0.008 0.008 0.103 0.064 62 T 0.116 0.272 0.197 0.077 0.034 0.057 0.044 0.203 63 T 0.041 0.067 0.189 0.127 0.073 0.132 0.020 0.352 64 Y 0.032 0.048 0.088 0.127 0.184 0.046 0.009 0.466 65 K 0.016 0.039 0.071 0.196 0.254 0.057 0.005 0.361 66 N 0.021 0.033 0.054 0.118 0.133 0.073 0.008 0.560 67 V 0.042 0.059 0.076 0.165 0.289 0.051 0.010 0.308 68 K 0.025 0.052 0.043 0.098 0.118 0.096 0.012 0.555 69 G 0.048 0.021 0.028 0.038 0.065 0.128 0.038 0.635 70 R 0.312 0.021 0.048 0.039 0.063 0.110 0.050 0.358 71 G 0.082 0.010 0.051 0.046 0.052 0.101 0.014 0.643 72 R 0.026 0.005 0.067 0.103 0.145 0.216 0.005 0.434 73 V 0.017 0.005 0.062 0.123 0.243 0.066 0.003 0.480 74 K 0.012 0.010 0.054 0.170 0.280 0.062 0.003 0.410 75 E 0.037 0.019 0.047 0.076 0.131 0.098 0.007 0.585 76 L 0.096 0.038 0.131 0.100 0.176 0.092 0.011 0.357 77 D 0.022 0.066 0.034 0.060 0.089 0.355 0.007 0.367 78 S 0.017 0.038 0.021 0.008 0.037 0.081 0.007 0.791 79 Q 0.015 0.024 0.004 0.002 0.004 0.591 0.010 0.349 80 R 0.117 0.027 0.004 0.002 0.002 0.724 0.023 0.101 81 F 0.038 0.751 0.005 0.002 0.003 0.090 0.002 0.108 82 Y 0.009 0.893 0.003 0.002 0.006 0.028 0.001 0.058 83 A 0.007 0.920 0.004 0.003 0.010 0.011 0.002 0.044 84 R 0.006 0.966 0.001 0.002 0.006 0.003 0.002 0.013 85 I 0.009 0.973 0.001 0.002 0.003 0.002 0.002 0.008 86 A 0.005 0.966 0.008 0.004 0.004 0.002 0.002 0.010 87 V 0.008 0.915 0.030 0.010 0.015 0.002 0.005 0.016 88 E 0.020 0.848 0.023 0.019 0.028 0.009 0.015 0.037 89 T 0.073 0.761 0.027 0.026 0.025 0.008 0.027 0.053 90 T 0.097 0.639 0.048 0.054 0.043 0.009 0.024 0.087 91 V 0.049 0.252 0.239 0.100 0.143 0.026 0.024 0.167 92 Y 0.057 0.114 0.085 0.131 0.191 0.057 0.015 0.350 93 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 94 T 0.009 0.006 0.024 0.021 0.046 0.227 0.005 0.662 95 F 0.280 0.019 0.055 0.007 0.018 0.031 0.010 0.580 96 K 0.046 0.025 0.011 0.004 0.009 0.421 0.007 0.477 97 A 0.142 0.025 0.020 0.005 0.022 0.209 0.023 0.553 98 K 0.030 0.152 0.014 0.002 0.010 0.049 0.003 0.741 99 E 0.013 0.095 0.004 0.002 0.005 0.459 0.004 0.418 100 L 0.035 0.265 0.005 0.002 0.006 0.518 0.007 0.162 101 R 0.112 0.785 0.003 0.003 0.006 0.021 0.005 0.065 102 E 0.092 0.820 0.001 0.001 0.002 0.006 0.010 0.067 103 A 0.116 0.777 0.007 0.001 0.003 0.003 0.035 0.058 104 Y 0.248 0.580 0.010 0.005 0.005 0.005 0.100 0.047 105 K 0.299 0.198 0.115 0.019 0.008 0.043 0.095 0.223 106 T 0.120 0.062 0.365 0.020 0.015 0.049 0.034 0.335 107 E 0.084 0.031 0.124 0.009 0.011 0.086 0.019 0.636 108 D 0.019 0.014 0.048 0.004 0.008 0.280 0.004 0.622 109 P 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.003 0.001 0.991 110 V 0.002 0.007 0.001 0.001 0.001 0.227 0.001 0.761 111 E 0.039 0.025 0.002 0.001 0.001 0.824 0.003 0.105 112 V 0.044 0.870 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.077 113 A 0.007 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 114 K 0.017 0.951 0.001 0.001 0.001 0.004 0.005 0.021 115 R 0.064 0.879 0.001 0.001 0.001 0.003 0.035 0.016 116 V 0.131 0.822 0.003 0.002 0.001 0.003 0.018 0.021 117 L 0.059 0.797 0.053 0.007 0.004 0.006 0.022 0.052 118 S 0.075 0.472 0.175 0.017 0.012 0.022 0.042 0.184 119 V 0.141 0.207 0.122 0.031 0.026 0.061 0.037 0.375 120 G 0.010 0.027 0.018 0.003 0.003 0.032 0.007 0.900 121 G 0.116 0.034 0.090 0.011 0.015 0.172 0.037 0.524 122 E 0.386 0.036 0.080 0.013 0.009 0.164 0.025 0.288 123 Y 0.057 0.127 0.064 0.020 0.039 0.107 0.006 0.579 124 A 0.041 0.187 0.044 0.038 0.098 0.115 0.005 0.471 125 N 0.077 0.182 0.015 0.011 0.026 0.173 0.009 0.509 126 W 0.134 0.372 0.029 0.016 0.031 0.090 0.011 0.317 127 L 0.081 0.525 0.022 0.013 0.027 0.110 0.010 0.212 128 N 0.038 0.575 0.017 0.009 0.019 0.056 0.011 0.276 129 K 0.050 0.666 0.016 0.005 0.010 0.042 0.010 0.202 130 A 0.028 0.837 0.018 0.005 0.008 0.028 0.004 0.072 131 I 0.013 0.847 0.054 0.015 0.016 0.009 0.003 0.041 132 E 0.030 0.815 0.032 0.009 0.015 0.012 0.012 0.076 133 I 0.079 0.567 0.154 0.020 0.039 0.012 0.023 0.106 134 N 0.053 0.464 0.109 0.032 0.037 0.039 0.039 0.227 135 G 0.183 0.091 0.126 0.031 0.034 0.044 0.049 0.442 136 F 0.113 0.054 0.246 0.040 0.037 0.152 0.021 0.336 137 D 0.073 0.077 0.086 0.037 0.078 0.166 0.011 0.473 138 D 0.014 0.019 0.008 0.003 0.009 0.060 0.003 0.885 139 D 0.014 0.012 0.003 0.002 0.002 0.771 0.006 0.189 140 L 0.312 0.064 0.013 0.002 0.006 0.244 0.024 0.335 141 E 0.018 0.115 0.001 0.001 0.001 0.620 0.004 0.239 142 D 0.086 0.140 0.002 0.001 0.002 0.562 0.014 0.193 143 L 0.016 0.919 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.055 144 E 0.005 0.938 0.001 0.001 0.001 0.017 0.001 0.036 145 E 0.005 0.920 0.001 0.001 0.001 0.039 0.001 0.033 146 A 0.003 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 147 A 0.004 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 148 K 0.012 0.967 0.003 0.001 0.001 0.004 0.005 0.009 149 N 0.016 0.958 0.002 0.001 0.001 0.001 0.009 0.013 150 L 0.024 0.947 0.003 0.001 0.001 0.001 0.005 0.017 151 E 0.033 0.797 0.021 0.004 0.003 0.024 0.024 0.094 152 H 0.092 0.557 0.084 0.009 0.007 0.046 0.035 0.170 153 H 0.151 0.563 0.034 0.011 0.013 0.030 0.024 0.175 154 H 0.146 0.341 0.041 0.012 0.016 0.038 0.034 0.373 155 H 0.102 0.125 0.088 0.015 0.017 0.059 0.031 0.562 156 H 0.131 0.057 0.052 0.018 0.022 0.072 0.028 0.619 157 H 0.087 0.028 0.033 0.017 0.020 0.098 0.017 0.700