# TARGET T0465 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0465.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 35.5806 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.076 0.121 0.019 0.040 0.044 0.101 0.092 0.507 2 S 0.146 0.168 0.013 0.025 0.035 0.069 0.183 0.363 3 E 0.063 0.154 0.007 0.010 0.014 0.100 0.049 0.603 4 N 0.057 0.194 0.013 0.015 0.023 0.103 0.072 0.523 5 Q 0.085 0.316 0.011 0.014 0.018 0.071 0.081 0.404 6 N 0.121 0.378 0.012 0.012 0.021 0.053 0.109 0.295 7 E 0.040 0.263 0.038 0.035 0.037 0.083 0.097 0.405 8 K 0.035 0.313 0.029 0.026 0.048 0.090 0.053 0.405 9 V 0.046 0.174 0.055 0.023 0.035 0.104 0.159 0.405 10 Y 0.038 0.294 0.043 0.034 0.034 0.085 0.199 0.273 11 D 0.086 0.506 0.031 0.014 0.018 0.038 0.113 0.193 12 L 0.144 0.572 0.016 0.012 0.015 0.033 0.048 0.161 13 S 0.276 0.214 0.027 0.012 0.014 0.051 0.107 0.299 14 F 0.047 0.102 0.030 0.018 0.016 0.100 0.115 0.573 15 F 0.091 0.066 0.017 0.005 0.008 0.113 0.035 0.666 16 M 0.349 0.052 0.015 0.007 0.007 0.090 0.150 0.329 17 P 0.072 0.081 0.005 0.002 0.004 0.088 0.052 0.697 18 G 0.056 0.146 0.010 0.003 0.006 0.068 0.047 0.664 19 Q 0.060 0.349 0.017 0.015 0.014 0.083 0.032 0.429 20 T 0.157 0.317 0.029 0.010 0.016 0.070 0.068 0.334 21 I 0.086 0.153 0.083 0.027 0.021 0.098 0.080 0.453 22 D 0.211 0.157 0.030 0.016 0.024 0.058 0.093 0.411 23 A 0.138 0.053 0.043 0.013 0.016 0.069 0.112 0.554 24 E 0.076 0.037 0.036 0.036 0.075 0.101 0.043 0.595 25 E 0.061 0.009 0.019 0.020 0.039 0.062 0.044 0.747 26 V 0.013 0.009 0.020 0.051 0.064 0.129 0.018 0.695 27 E 0.012 0.008 0.028 0.038 0.106 0.091 0.034 0.683 28 V 0.019 0.021 0.026 0.091 0.071 0.115 0.045 0.611 29 P 0.057 0.092 0.058 0.079 0.083 0.083 0.046 0.502 30 I 0.115 0.156 0.032 0.065 0.077 0.055 0.070 0.429 31 S 0.120 0.296 0.021 0.050 0.073 0.046 0.049 0.344 32 K 0.042 0.118 0.037 0.090 0.147 0.059 0.062 0.445 33 R 0.031 0.105 0.024 0.178 0.178 0.081 0.030 0.374 34 F 0.027 0.028 0.040 0.215 0.263 0.061 0.091 0.275 35 V 0.019 0.005 0.046 0.162 0.141 0.069 0.103 0.455 36 D 0.776 0.003 0.007 0.015 0.020 0.014 0.068 0.097 37 K 0.623 0.001 0.002 0.004 0.003 0.018 0.010 0.339 38 E 0.015 0.001 0.003 0.003 0.020 0.070 0.003 0.886 39 G 0.001 0.001 0.006 0.005 0.034 0.057 0.007 0.890 40 N 0.002 0.001 0.056 0.333 0.312 0.077 0.023 0.198 41 V 0.002 0.001 0.081 0.107 0.089 0.031 0.027 0.662 42 V 0.009 0.001 0.127 0.440 0.156 0.029 0.033 0.205 43 P 0.004 0.002 0.370 0.081 0.150 0.025 0.037 0.332 44 F 0.003 0.002 0.387 0.215 0.222 0.018 0.037 0.116 45 I 0.008 0.005 0.401 0.171 0.227 0.022 0.034 0.131 46 F 0.028 0.007 0.178 0.172 0.172 0.044 0.090 0.309 47 K 0.020 0.017 0.169 0.154 0.166 0.067 0.130 0.276 48 A 0.020 0.030 0.068 0.034 0.073 0.121 0.050 0.604 49 I 0.027 0.044 0.064 0.049 0.039 0.106 0.048 0.621 50 T 0.155 0.460 0.024 0.015 0.015 0.037 0.109 0.185 51 T 0.157 0.568 0.009 0.004 0.006 0.032 0.051 0.172 52 D 0.028 0.426 0.019 0.017 0.013 0.065 0.041 0.392 53 R 0.026 0.853 0.003 0.002 0.002 0.012 0.023 0.079 54 I 0.027 0.950 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.012 55 D 0.009 0.942 0.004 0.002 0.002 0.004 0.008 0.028 56 E 0.027 0.862 0.010 0.002 0.002 0.009 0.023 0.065 57 L 0.195 0.322 0.027 0.007 0.006 0.024 0.337 0.082 58 E 0.141 0.062 0.013 0.004 0.005 0.029 0.616 0.130 59 K 0.042 0.051 0.004 0.002 0.003 0.046 0.182 0.670 60 E 0.025 0.067 0.005 0.004 0.007 0.076 0.028 0.787 61 N 0.054 0.070 0.008 0.011 0.025 0.120 0.037 0.674 62 T 0.040 0.044 0.018 0.026 0.038 0.135 0.053 0.645 63 T 0.045 0.068 0.034 0.059 0.083 0.104 0.095 0.511 64 Y 0.076 0.070 0.034 0.063 0.053 0.109 0.080 0.516 65 K 0.021 0.020 0.098 0.104 0.092 0.097 0.074 0.492 66 N 0.091 0.016 0.038 0.032 0.041 0.085 0.048 0.650 67 V 0.465 0.019 0.029 0.027 0.022 0.065 0.069 0.306 68 K 0.046 0.008 0.010 0.011 0.020 0.107 0.013 0.785 69 G 0.050 0.019 0.006 0.006 0.019 0.063 0.020 0.817 70 R 0.040 0.052 0.014 0.041 0.050 0.129 0.031 0.644 71 G 0.019 0.041 0.047 0.078 0.114 0.101 0.048 0.553 72 R 0.075 0.069 0.033 0.127 0.136 0.066 0.075 0.418 73 V 0.131 0.048 0.059 0.079 0.085 0.077 0.106 0.415 74 K 0.042 0.063 0.037 0.066 0.077 0.085 0.090 0.540 75 E 0.019 0.058 0.021 0.025 0.048 0.102 0.045 0.682 76 L 0.037 0.122 0.023 0.022 0.024 0.120 0.082 0.571 77 D 0.094 0.681 0.005 0.009 0.008 0.027 0.069 0.107 78 S 0.036 0.860 0.001 0.001 0.002 0.009 0.031 0.060 79 Q 0.006 0.939 0.001 0.002 0.002 0.006 0.013 0.031 80 R 0.007 0.866 0.004 0.003 0.006 0.012 0.061 0.040 81 F 0.006 0.832 0.003 0.008 0.008 0.011 0.108 0.023 82 Y 0.009 0.857 0.003 0.003 0.007 0.006 0.101 0.014 83 A 0.004 0.835 0.003 0.007 0.011 0.007 0.106 0.026 84 R 0.007 0.595 0.023 0.033 0.066 0.020 0.205 0.049 85 I 0.017 0.204 0.049 0.063 0.095 0.037 0.475 0.060 86 A 0.022 0.070 0.093 0.068 0.112 0.049 0.503 0.085 87 V 0.058 0.057 0.072 0.109 0.138 0.080 0.210 0.277 88 E 0.025 0.020 0.051 0.067 0.143 0.123 0.076 0.495 89 T 0.018 0.010 0.084 0.074 0.159 0.131 0.059 0.465 90 T 0.009 0.008 0.108 0.121 0.171 0.129 0.076 0.380 91 V 0.025 0.012 0.090 0.061 0.084 0.125 0.063 0.539 92 Y 0.141 0.033 0.074 0.101 0.067 0.104 0.079 0.401 93 P 0.043 0.053 0.048 0.026 0.034 0.092 0.041 0.663 94 T 0.189 0.207 0.023 0.008 0.013 0.082 0.038 0.440 95 F 0.054 0.164 0.038 0.027 0.017 0.107 0.047 0.545 96 K 0.026 0.576 0.004 0.003 0.003 0.031 0.021 0.337 97 A 0.044 0.939 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.006 98 K 0.010 0.953 0.003 0.001 0.001 0.005 0.007 0.022 99 E 0.036 0.892 0.006 0.001 0.001 0.005 0.018 0.041 100 L 0.183 0.604 0.022 0.003 0.003 0.015 0.126 0.045 101 R 0.270 0.272 0.029 0.005 0.006 0.035 0.192 0.191 102 E 0.215 0.050 0.008 0.003 0.004 0.042 0.152 0.527 103 A 0.042 0.017 0.007 0.003 0.004 0.075 0.059 0.793 104 Y 0.034 0.010 0.009 0.007 0.012 0.105 0.022 0.801 105 K 0.054 0.013 0.008 0.005 0.007 0.126 0.030 0.757 106 T 0.027 0.034 0.007 0.004 0.005 0.146 0.023 0.753 107 E 0.015 0.058 0.008 0.004 0.003 0.102 0.019 0.792 108 D 0.034 0.892 0.001 0.001 0.001 0.008 0.017 0.046 109 P 0.014 0.978 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 110 V 0.006 0.970 0.002 0.001 0.001 0.001 0.013 0.007 111 E 0.007 0.964 0.003 0.001 0.001 0.002 0.013 0.010 112 V 0.050 0.898 0.008 0.001 0.001 0.005 0.027 0.010 113 A 0.115 0.712 0.009 0.002 0.003 0.012 0.101 0.048 114 K 0.083 0.205 0.016 0.004 0.004 0.031 0.317 0.340 115 R 0.027 0.282 0.013 0.004 0.005 0.057 0.094 0.518 116 V 0.091 0.181 0.062 0.012 0.017 0.127 0.080 0.430 117 L 0.041 0.040 0.086 0.020 0.014 0.144 0.074 0.582 118 S 0.246 0.070 0.022 0.003 0.004 0.079 0.032 0.543 119 V 0.506 0.160 0.013 0.003 0.002 0.045 0.043 0.226 120 G 0.039 0.144 0.012 0.002 0.006 0.110 0.016 0.672 121 G 0.027 0.110 0.041 0.007 0.014 0.075 0.127 0.599 122 E 0.025 0.714 0.018 0.028 0.013 0.036 0.046 0.118 123 Y 0.078 0.685 0.025 0.006 0.009 0.023 0.051 0.123 124 A 0.027 0.488 0.028 0.028 0.020 0.033 0.210 0.164 125 N 0.023 0.760 0.011 0.007 0.009 0.021 0.070 0.098 126 W 0.027 0.889 0.003 0.002 0.003 0.007 0.029 0.041 127 L 0.022 0.695 0.009 0.009 0.018 0.024 0.152 0.070 128 N 0.016 0.634 0.008 0.010 0.013 0.022 0.196 0.102 129 K 0.023 0.742 0.011 0.017 0.025 0.021 0.072 0.088 130 A 0.094 0.300 0.060 0.036 0.065 0.064 0.213 0.169 131 I 0.037 0.091 0.073 0.111 0.090 0.096 0.171 0.331 132 E 0.097 0.038 0.037 0.023 0.034 0.106 0.036 0.630 133 I 0.128 0.025 0.031 0.025 0.024 0.126 0.084 0.555 134 N 0.048 0.028 0.026 0.017 0.032 0.154 0.038 0.658 135 G 0.037 0.038 0.021 0.011 0.021 0.103 0.040 0.729 136 F 0.065 0.162 0.019 0.026 0.017 0.099 0.045 0.567 137 D 0.226 0.375 0.013 0.007 0.009 0.054 0.062 0.253 138 D 0.035 0.340 0.011 0.009 0.008 0.084 0.067 0.446 139 D 0.019 0.815 0.003 0.002 0.002 0.016 0.035 0.108 140 L 0.014 0.969 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.007 141 E 0.004 0.950 0.001 0.001 0.001 0.003 0.024 0.016 142 D 0.002 0.967 0.001 0.001 0.001 0.002 0.020 0.007 143 L 0.004 0.975 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.003 144 E 0.013 0.956 0.002 0.001 0.001 0.001 0.020 0.006 145 E 0.022 0.765 0.011 0.003 0.003 0.010 0.125 0.060 146 A 0.039 0.820 0.008 0.002 0.002 0.013 0.046 0.071 147 A 0.138 0.528 0.023 0.005 0.005 0.035 0.075 0.192 148 K 0.051 0.173 0.019 0.007 0.006 0.078 0.084 0.582 149 N 0.132 0.173 0.020 0.005 0.006 0.068 0.127 0.470 150 L 0.175 0.092 0.032 0.011 0.009 0.122 0.079 0.481 151 E 0.099 0.027 0.025 0.010 0.012 0.108 0.051 0.669 152 H 0.079 0.016 0.012 0.005 0.007 0.098 0.036 0.746 153 H 0.075 0.014 0.018 0.010 0.014 0.129 0.043 0.696 154 H 0.093 0.010 0.013 0.010 0.015 0.120 0.033 0.705 155 H 0.089 0.009 0.009 0.012 0.018 0.112 0.039 0.712 156 H 0.038 0.010 0.013 0.018 0.034 0.126 0.036 0.725 157 H 0.036 0.011 0.018 0.031 0.064 0.110 0.042 0.688